倪春苗 張靜 沈靜 金宏飛 唐漪靈 王姍
(上海市虹口區(qū)疾病預(yù)防控制中心 上海 200080)
致瀉性大腸桿菌是一種重要的腹瀉病病原菌,主要包括腸粘附性大腸桿菌(EAEC),出血性大腸桿菌(EHEC),產(chǎn)毒性大腸桿菌(ETEC),致病性大腸桿菌(EPEC),侵襲性大腸桿菌(EIEC),由它們引起的各類腹瀉很大程度地影響著的人類健康,而一旦疏于監(jiān)控,暴發(fā)嚴重疫情,會對公共衛(wèi)生造成巨大威脅。為此,現(xiàn)將2017 年—2019 年上海市虹口區(qū)分離到的致瀉性大腸桿菌進行脈沖場凝膠電泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型及藥敏性分析,通過其PFGE 型別特征和耐藥特點,為臨床用藥和制定有效防控措施提供依據(jù)。
醫(yī)院根據(jù)《上海市腹瀉病監(jiān)測試點實施方案》,采集標本后,保存于Cary-Blair 運送培養(yǎng)基,按生物安全運送要求于采樣當天送至監(jiān)測實驗室。
麥康凱培養(yǎng)基(科馬嘉);雙糖(科馬嘉);檢測試劑盒:腸粘附性大腸桿菌(EAEC),出血性大腸桿菌(EHEC),產(chǎn)毒性大腸桿菌(ETEC),致病性大腸桿菌(EPEC),侵襲性大腸桿菌(EIEC)檢測試劑盒,(之江生物有限公司)藥敏板:革蘭氏陰性菌藥敏板GN4F(ThermoFisher)蛋白酶K(TaKaRa);限制性內(nèi)切酶Xba Ⅰ(TaKaRa)
PCR 儀:宏石實時熒光PCR;水浴培養(yǎng)箱(天能科技);濁度儀(法國生物梅里埃);生物安全柜(美國Baker);GFL 型水浴搖床;凝膠成像系統(tǒng)和PFGE及配套設(shè)備(美國Bio-Rad公司)。全自動微生物藥敏鑒定儀(Sensititre)
標本直接麥康凱(MAC)平板上,36 度培養(yǎng)18 ~24h,挑取5 個可疑菌落進行生化初篩。生化初篩符合后進行熒光定量PC R檢測(上海之江科技公司)確證實驗。;反應(yīng)體系:檢測混合液35μl,酶0.4μl,H2O1μl,樣品4μl。條件:37℃2m,94℃2m,再按93℃15s ~60℃s,進行40 個循環(huán)),反應(yīng)體系40μl。實驗結(jié)果判定按照檢測試劑盒說明書。PFGE 分型按照美國CDC PulseNet 制定的PFGE 標準,沙門標準菌株H9812 作為分子質(zhì)量標記,選用限制性內(nèi)切酶Xba Ⅰ進行酶切。PFGE 圖像用BioNumerics 軟件根據(jù)UPGMA 方法進行聚類分析。實驗參數(shù):電壓梯度6V/cm,電場夾角120°,脈沖時間6.76 ~35.38s,電泳時間18±1h。
確認致瀉性大腸桿菌的菌株進行肉湯增菌,用比濁儀調(diào)到0.5 麥氏單位,在全自動藥敏鑒定儀上按照操作規(guī)程完成加樣、判讀.
2.1 致瀉性大腸在2017 年送檢318 份樣品,2018 年133 份樣品2019 年10 為止是170 份,一共為621 份。在這些感染性腹瀉患者糞便標本中,檢出85 株致瀉性大腸,檢出率為13.68%,其中EPEC(30 株)ETEC(41 株)和EAEC(14 株)。
2.2 對80 株菌株做了PFGE 分子分型檢測、
其中2017 年44 株,2018 年5 株(2018 年收集的菌株樣本比較少,)2019 年31 株。在2017 年出現(xiàn)2 株ETEC 菌株100%的聚類和2019 年出現(xiàn)了2 株EAEC 菌株100%的聚類。其他每個帶型僅有1 株菌。PFGE 條帶型相似性60%~ 100% 分型結(jié)果表明本區(qū)致瀉性大腸呈高度多態(tài)性。如圖1
2.3 對60 株菌株做了藥敏檢測,采用了MIC 法
共做了24 種抗生素的藥敏實驗,致瀉性大腸桿菌對美羅培南(MEM)、亞胺培南(IMP)、阿米卡星(AMI)多粘菌素E和B(CT、PB)完全敏感;對氨芐西林(AMP)、四環(huán)素(TET)耐藥率高分別為70%和60%,對頭孢烯類抗生素(CTX、CEC、CFX、CAZ)中、只有22.%的菌株對CFZ 耐藥,其他均敏感。對氨基糖苷類抗生素(KAN、GEN)絕大多數(shù)菌株敏感。
3.1 在621 份糞便標本中,檢出85 株致瀉性大腸,檢出率為13.68%,與國內(nèi)相關(guān)報道基本符合[1-2]。
3.2 近年來,由于抗生素的廣泛使用,致瀉性大腸桿菌耐藥性問題日益嚴重,已經(jīng)出現(xiàn)了許多多重耐藥菌株[3]而虹口地亞安培南(IMI)、美羅培南(MEM)、阿米卡星(AMI)多粘菌素E 和B(CT、P B)完全敏感;孢烯類抗生素(C TX、CEC、CFX、CAZ)中、只有22.%的菌株對CFZ 耐藥,其他均敏感。對氨芐西林(AMP)、四環(huán)素(TET)耐藥率高分別為70%和60%,對氨基糖苷類抗生素(KAN、GEN)絕大多數(shù)菌株敏感(這與一些地區(qū)報道不一致)[4]。所以由致瀉性大腸桿菌引起的腹瀉中,在治療過程中應(yīng)結(jié)合《抗菌藥物臨床應(yīng)用指導(dǎo)原則》和本地區(qū)該菌耐藥特點進行選擇,以減少耐藥株的產(chǎn)生。
3.3 80 株大腸桿菌出現(xiàn)78 個PFGE 帶型,表明虹口區(qū)致瀉性大腸帶型呈現(xiàn)高度多態(tài)性,這與其他地區(qū)情況一致[5].其中在2017 年和2019 年中分別出現(xiàn)兩株P(guān)FGE 帶型中100%的聚類情況,并且耐藥性也很相近,提醒相關(guān)部門關(guān)注,可能會引起小規(guī)模的暴發(fā)。。
3.4 通過藥敏實驗和PFGE 建立本地區(qū)的致瀉性大腸桿菌基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫,結(jié)合臨床特征、流行病學(xué)調(diào)查,深入認識虹口地區(qū)致瀉性大腸桿菌分群特征及整體狀況,對本地區(qū)致病性的大腸桿菌長期監(jiān)測、耐藥情況的發(fā)現(xiàn)、指導(dǎo)臨床用藥及疫情的預(yù)測預(yù)防等工作具有重要價值。