李枳蒙,張 婷,李 典,黃 俊,賴怡帆,吳婷婷,李博文,劉雄倫,2,3*
(1 湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,長沙 410128;2 作物基因工程湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,長沙 410128;3 水稻油菜抗病育種湖南省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,長沙 410128)
水稻(Oryzasativa)是我國乃至世界最主要的糧食作物之一,地球一半以上人口以稻米為食。由子囊真菌Magnaporthegrisea引起的水稻稻瘟病嚴(yán)重危害水稻正常的生長發(fā)育,影響稻米產(chǎn)量和品質(zhì),稻瘟病爆發(fā)年份可造成10%~30%的產(chǎn)量損失,嚴(yán)重時(shí)甚至絕收[1,2]。目前,防治稻瘟病的主要途徑是化學(xué)防治和種植抗病水稻品種,但化學(xué)防治成本較高且不環(huán)保,培育和推廣抗瘟水稻新品種是降低稻瘟病危害的上策[3,4]。稻瘟病抗性屬典型的質(zhì)量—數(shù)量性狀,利用已克隆或精細(xì)定位的主效抗性基因,開發(fā)高效分子標(biāo)記進(jìn)行輔助選擇,能最大限度地提高稻瘟病抗性育種的效率[5,6]。Pi9是一個(gè)廣譜持久抗稻瘟病基因,來源于小粒野生稻(Oryzaminuta),經(jīng)遠(yuǎn)緣雜交導(dǎo)入到秈稻品系75-1-127,被定位在水稻第6號(hào)染色體的Pi2/9位點(diǎn)且被成功克隆[7,8]。本研究以75-1-127為Pi9基因供體親本,以高感稻瘟病的優(yōu)質(zhì)常規(guī)晚稻品種湘晚秈11號(hào)為受體親本及輪回親本,利用Pi9基因特異高效分子標(biāo)記,開展標(biāo)記輔助選擇育種實(shí)踐,改良湘晚秈11號(hào)的稻瘟病抗性。
水稻材料:Pi9基因供體親本75-1-127;受體及輪回親本湘晚秈11號(hào);感病對(duì)照品系及稻瘟病誘發(fā)品種CO39。
稻瘟菌菌株:來自國內(nèi)外不同稻區(qū)的24份稻瘟菌菌株,用于室內(nèi)人工接種。
室內(nèi)接種抗性鑒定和抗菌譜分析:將水稻材料75-1-127、湘晚秈11號(hào)、CO39播種于育秧基質(zhì),26~28 ℃生長至4葉期,用0.2‰的 Tween 20水溶液將稻瘟菌菌株分生孢子配成濃度約1×105個(gè)/mL的懸浮液,活體噴霧接種;接種后用黑布覆蓋,于26 ℃、相對(duì)濕度>90%條件下培養(yǎng)24 h后,繼續(xù)在同溫濕度、12 h光照下誘導(dǎo)發(fā)病5~7 d;當(dāng)CO39葉片出現(xiàn)明顯病斑時(shí)觀察統(tǒng)計(jì)各材料抗性表型,參照文獻(xiàn)[9]中苗瘟調(diào)查分級(jí)標(biāo)準(zhǔn),將0~2級(jí)劃分為抗病類型,3~5級(jí)劃分為感病類型,并計(jì)算各供試材料對(duì)不同菌株的抗性頻率(抗性頻率=接種后不致病菌株數(shù)÷接種總菌株數(shù)×100%)。
田間病圃抗性鑒定:5月中旬將供試水稻材料和誘發(fā)品種CO39浸種催芽后播于湖南瀏陽大圍山自然病圃。6月中旬鑒定苗瘟抗性表型,9月中旬鑒定穗瘟抗性表型。
利用課題組已開發(fā)的Pi9基因內(nèi)的功能標(biāo)記Ins2-1(引物序列為Forward:5′-AACTGTTTTAAACACTCGGGTGGATA-3′;Reverse:5′-CACGATGATAACTTGGGCTAGGGCG-3′)[10],分析75-1-127與湘晚秈11號(hào)之間的多態(tài)性,并將其用于標(biāo)記輔助選擇育種實(shí)踐中基因型的鑒定。抽穗前取水稻葉片約0.2 g于2.0 mL 滅菌離心管中,加入液氮研磨成粉末狀,采用CATB法[11]提取總DNA;利用標(biāo)記引物對(duì)各樣品DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增;擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1.0%瓊脂糖凝膠電泳后分析標(biāo)記基因型。10 μL PCR反應(yīng)體系組成:DNA模板1.2 μL,2 pmol/μL primer pairs 1.0 μL,10×Buffer 1.0 μL,2.5 mmol/L dNTPs 0.2 μL,5 U/μL Taq酶0.1 μL,ddH2O 6.5 μL。PCR反應(yīng)程序:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性50 s,56 ℃退火50 s,72 ℃延伸40 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸3 min;16 ℃保存。
用湘晚秈11號(hào)作母本,75-1-127作父本,雜交獲得F1代;用湘晚秈11號(hào)作輪回親本,在長沙和三亞兩地連續(xù)回交直至獲得BC6F1代,自交兩代獲得BC6F3群體?;亟蝗后w構(gòu)建具體方法:自BC1F1代起,每世代田間種植約60株,取單株葉片做標(biāo)記基因型分析,選農(nóng)藝性狀與受體親本接近的陽性單株回交,混合收種,獲得下一世代。
根據(jù)室內(nèi)接種結(jié)果(表1),75-1-127除了對(duì)湘2007A-7、ROR1這2份菌株感病外,其余均為抗病,抗性頻率為91.7%;湘晚秈11號(hào)對(duì)24份稻瘟菌菌株中的7份表現(xiàn)為抗病,其余17份均為感病,抗性頻率為29.2%;感病對(duì)照CO39對(duì)所有菌株均表現(xiàn)感病,抗性頻率為0。由田間病圃抗性鑒定結(jié)果(圖1)可以看出:受體親本湘晚秈11號(hào)高感苗瘟和穗瘟;而75-1-127高抗苗瘟和穗瘟。湘晚秈11號(hào)抗菌譜窄、抗性水平低,其稻瘟病抗性急需改良;75-1-127抗菌譜廣、抗性水平高,Pi9基因具有很好的育種價(jià)值。
表1 供試材料對(duì)24份稻瘟菌菌株的抗譜比較
圖1 供試水稻材料田間病圃稻瘟病抗性表型
雙親間多態(tài)性分析結(jié)果表明,Ins2-1是一個(gè)顯性DNA標(biāo)記,利用該標(biāo)記引物可從75-1-127基因組中擴(kuò)增出1條532 bp的清晰條帶,而在湘晚秈11號(hào)基因組中無擴(kuò)增產(chǎn)物(圖2A)。并且該標(biāo)記PCR產(chǎn)物可以用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)分析,操作簡單快速且成本較低。
利用Ins2-1標(biāo)記,從湘晚秈11號(hào)×75-1-127的BC1F1代起,開展分子標(biāo)記輔助選擇育種實(shí)踐,于2016年獲得BC6F1群體,2018年篩選出11個(gè)BC6F3株系,2019年經(jīng)標(biāo)記基因型分析和田間病圃稻瘟病抗性鑒定,遴選出9個(gè)高抗稻瘟病的改良株系湘晚秈11號(hào)-Pi9(圖2),為進(jìn)一步培育優(yōu)異抗病優(yōu)質(zhì)水稻新品種奠定了基礎(chǔ)。
圖2 抗病改良株系湘晚秈11 號(hào)-Pi9的鑒定
水稻稻瘟病抗性屬于典型的質(zhì)量—數(shù)量性狀,抗性表型既受遺傳(基因)控制,又受病原菌、溫度、濕度、光照等環(huán)境因素影響,因此傳統(tǒng)育種的表型選擇往往不準(zhǔn)確、效率低。分子標(biāo)記輔助選擇育種是對(duì)標(biāo)記基因型的鑒定和選擇,不受環(huán)境因素影響,相對(duì)于傳統(tǒng)育種更準(zhǔn)確高效,現(xiàn)已被廣泛應(yīng)用于作物遺傳改良,尤其是稻瘟病抗性育種。本研究鑒定出的顯性標(biāo)記Ins2-1,可以在供體親本75-1-127與受體親本湘晚秈11號(hào)間產(chǎn)生明顯而穩(wěn)定的多態(tài)性,選擇效率高,其擴(kuò)增產(chǎn)物可用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),成本低、效率高,具有較好的應(yīng)用前景。廣譜持久抗稻瘟病基因Pi9被成功克隆后,已被廣泛應(yīng)用于水稻育種實(shí)踐。如廖花等[12]利用Pi9基因序列開發(fā)出共顯性標(biāo)記SPL-1,通過分子標(biāo)記輔助選擇,將Pi9基因?qū)攵i稻恢復(fù)系R747 中,培育出了與受體親本遺傳背景高度相似的高抗稻瘟病新品系R747-Pi9,雜交種的稻瘟病抗性也同時(shí)改良;李永聰?shù)萚13]通過顯性標(biāo)記Ins1-1的輔助選擇,成功改良了秈稻恢復(fù)系R389及其雜交種的稻瘟病抗性;鄒俊鋒等[14]利用共顯性標(biāo)記Ins2-3改良了秈稻恢復(fù)系E32及其雜交種的稻瘟病抗性;殷得所等[15]通過Pi9基因緊密連鎖的共顯性STS標(biāo)記的輔助選擇育種,成功改良了揚(yáng)稻6號(hào)、R6547及其雜交種的稻瘟病抗性。
本研究獲得的9個(gè)含Pi9基因的湘晚秈11號(hào)改良抗病系,將用于進(jìn)一步的農(nóng)藝、產(chǎn)量、米質(zhì)等性狀分析,以及不同生態(tài)區(qū)稻瘟病抗性鑒定,可望最終培育出高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)抗瘟水稻新品種。