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5種長鏈非編碼RNA在結(jié)腸癌患者血清學(xué)診斷中的應(yīng)用價值

2020-07-23 04:07劉茵茵羅丹屈晶晶閆曉煜
中國現(xiàn)代藥物應(yīng)用 2020年13期
關(guān)鍵詞:特征參數(shù)結(jié)腸癌標(biāo)志物

劉茵茵 羅丹 屈晶晶 閆曉煜

結(jié)腸癌是目前全世界高發(fā)的惡性腫瘤[1],嚴(yán)重威脅人們的身心健康。眾所周知,早期結(jié)直腸癌患者治愈率比較高,5年生存率可達到90%,但因缺乏有效的早期診斷方法,結(jié)腸癌患者確診時多已為中晚期,其生存率僅為10%~15%[2]。最新研究表明,目前結(jié)腸鏡檢查仍然是對結(jié)腸癌敏感性最高的篩查工具,但有一定風(fēng)險,且目前尚無更好的篩查方法可以替代[3]。病例分期是術(shù)后正確選擇治療方案、制定隨訪計劃和預(yù)測生存率的關(guān)鍵依據(jù)[4],而TNM分期仍然是最強大的預(yù)測指標(biāo)[5]。lncRNAs是近年來發(fā)現(xiàn)的一類非編碼RNA,其會產(chǎn)生長>200bp且多的外顯子轉(zhuǎn)錄本,這些轉(zhuǎn)錄本通常不會被翻譯成蛋白質(zhì)[6]。近年來大量研究表明,腫瘤的復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移及患者的預(yù)后均與lncRNAs的表達失調(diào)密切相關(guān),其表達譜可能作為診斷惡性腫瘤的一類新的生物標(biāo)志物[7-9]。結(jié)腸癌的演變進程復(fù)雜且緩慢,涉及繁雜的基因和蛋白表達變化。因此,篩查并驗證結(jié)腸癌相關(guān)基因及蛋白的表達譜有利于提高早期結(jié)腸癌的診斷率,從而提高患者治愈率并延長生存時間。多項研究表明[10,11],在結(jié)腸癌組織中多條lncRNAs表達上調(diào),且與患者不良預(yù)后緊密關(guān)聯(lián),如CCAT1、HOTAIR。仍有大量結(jié)腸癌相關(guān)的lncRNAs亟待探索。隨著對lncRNAs與結(jié)腸癌的深入研究,其異常表達對結(jié)腸癌發(fā)生發(fā)展、侵襲轉(zhuǎn)移的作用也將越來越明確,很有可能尋找到對結(jié)腸癌高度敏感的lncRNAs作為結(jié)腸癌早期診斷的重要指標(biāo)。故而,本研究將針對5種篩選出的lncRNAs構(gòu)建多個指標(biāo)聯(lián)合篩檢早期結(jié)腸癌的Logistic多因素分析模型,探索其在結(jié)腸癌患者血清學(xué)診斷中的應(yīng)用價值。

1 材料與方法

1.1 主要儀器 STEP one plus QPCR(美國ABI公司),高速冷凍離心機(湖南凱達科學(xué)儀器有限公司),水平電泳槽(北京六一),電泳儀電源(北京六一)。

1.2 主要試劑 Trizol Reagent A350-1(invitrogen),逆轉(zhuǎn)錄RT試劑盒(Fermentas),Power SYBR Green PCR Master Mix(ABI),RNA酶抑制劑(Fermentas),96孔PCR板密封蓋(Axygen),AgaroseⅠ瓊脂糖(Amresco)等試劑。

1.3 方法

1.3.1 43例結(jié)腸癌患者(結(jié)腸癌組)中各型結(jié)腸癌臨床診斷均符合《中國結(jié)直腸癌診療規(guī)范(2017)》[2],男27例,女16例;年齡40~70歲。27例正常對照組(NC組)中男12例,女15例;年齡27~71歲,均為同期體檢正常并排除其他干擾疾病的健康者。

1.3.2 篩選目標(biāo)lncRNAs采用文獻篩選的方法篩選結(jié)腸癌患者中表達差異的lncRNAs(5條)作為研究對象。

1.3.3 qRT-PCR驗證表達差異的lncRNAs采用TRIzol LS法提取血清樣本中的總RNAs。采用qRTPCR相對定量法檢測候選的5種lncRNAs的表達情況。

1.3.4 將結(jié)腸癌組與NC組組成一個有序分類變量,分析lncRNAs表達譜診斷結(jié)腸癌的正確率。

1.4 統(tǒng)計學(xué)方法 采用SPSS21.0統(tǒng)計學(xué)軟件對實驗數(shù)據(jù)進行ROC和Logistic回歸分析。t檢驗作兩組間的比較;ROC曲線法計算每個lncRNAs診斷結(jié)腸癌的Se、Sp、Youden指數(shù)、AUC、cut off等特征參數(shù)。

2 結(jié)果

2.1 兩組血清中l(wèi)ncRNAs的表達情況比較 兩組血清中l(wèi)ncRNAs的ROC曲線,見圖1。結(jié)腸癌組CCATI、HOTAIR、LincRNAP2、SOX2OT、ANRIL的表達值分別為(25.62±17.07)、(4.71±2.86)、(1.29±0.63)、(2.98±1.41)、(3.81±2.62) ;NC組 CCATI、HOTAIR、LincRNAP2、SOX2OT、ANRIL的表達值分別為(1.39±0.71)、(1.04±0.45)、0.81±0.41)、(1.26±0.63)、(1.36±0.80);結(jié)腸癌組CCATI、HOTAIR、LincRNAP2、SOX2OT、ANRIL的表達值高于NC組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。見表1。

圖1 結(jié)腸癌組血清中l(wèi)ncRNAs的ROC曲線

2.2 5種lncRNAs中ROC分析結(jié)果及特征參數(shù) CCAT1的AUCROC最高,達到0.924;其次分別為HOTAIR(0.904)、SOX2OT(0.895)、ANRIL(0.868),而LincRNAP2的AUCROC最低,僅0.602,故而此次試驗排除該條lncRNAs,不將其作為聯(lián)合預(yù)測分期的選擇;靈敏度最高的是CCAT1,最低的是SOX2OT;特異度最高的是CCAT1,最低的是LincRNAP2。見表2。

表1 兩組血清中l(wèi)ncRNAs的表達情況比較()

表1 兩組血清中l(wèi)ncRNAs的表達情況比較()

注:與NC組比較,aP<0.05

表2 5種lncRNAs中ROC分析結(jié)果及特征參數(shù)

2.3 系列試驗組合檢測特征參數(shù) 鑒于結(jié)腸癌患者血清CCAT1表達值的Se、Sp均較高,為大量研究和試驗所證實,故此以CCAT1為基本檢測項目,結(jié)合文獻及試驗篩選出的3種lncRNAs,進行CCAT 1加 1~ 3種的lncRNAs系列試驗,篩選 Youden指數(shù)和準(zhǔn)確度高組合項。見表3。

表3 系列試驗組合檢測特征參數(shù)

3 討論

據(jù)報道,腫瘤的復(fù)發(fā)、轉(zhuǎn)移以及患者的預(yù)后均與lncRNAs的表達失調(diào)緊密關(guān)聯(lián),其表達譜可能成為診斷惡性腫瘤的一類新的生物標(biāo)志物。作為標(biāo)志物,Se與Sp越高,準(zhǔn)確性越高,用于早期診斷、療效評估、預(yù)后判定等的價值越高[12]。目前結(jié)腸鏡檢查是對結(jié)腸癌敏感性最高的篩查工具,但過程有一定風(fēng)險;而lncRNAs僅需抽取患者血清即可進行檢測,無風(fēng)險,但若應(yīng)用于臨床,還需有較高的Se或 Sp[13]。一種lncRNAs檢測能力有限,若聯(lián)合幾種lncRNAs標(biāo)志物可以提高診斷效率。本研究所檢測的5種腫瘤標(biāo)志物,其中CCAT1在結(jié)腸癌中的作用研究已相對成熟,但其尚未應(yīng)用于臨床,Se與Sp還需進一步提高。本文聯(lián)合Logistic多因素分析方法和ROC曲線,用AUCROC、Se、Sp等指標(biāo)探索lncRNAs的診斷價值。

3.1 單項指標(biāo)鑒別診斷結(jié)腸癌的臨床價值 本研究對ROC區(qū)線下面積和Se、Sp、Youden等指標(biāo)進行了綜合評價,最大限度提高評價診斷試驗準(zhǔn)確性。本研究結(jié)果顯示,用于診斷結(jié)腸癌的lncRNAs中,AUCROC≥0.7的指標(biāo)有CCAT1、HOTAIR、SOX2OT、ANRIL,表明其有一定的準(zhǔn)確性,可作為預(yù)測結(jié)腸癌的單項指標(biāo)。其中又以CCAT1的AUCROC最大,診斷價值最高,其Sp、Youden指數(shù)、Se也最大;而LincRNAP2的AUCROC最低,故而舍棄。

3.2 多指標(biāo)聯(lián)合診斷對診斷結(jié)腸癌的臨床價值 理想的鑒別指標(biāo)要求既靈敏又特異,高Se利于篩選,減少漏診; 高Sp則有助于診斷,避免誤診。在臨床實踐中,經(jīng)常會應(yīng)用多指標(biāo)的聯(lián)合進行診斷。本文聯(lián)合診斷常采用系列試驗,可提高Sp。本研究結(jié)果顯示,多指標(biāo)聯(lián)合診斷的效率明顯優(yōu)于單項指標(biāo),且隨著聯(lián)合指標(biāo)的增加,系列試驗的Sp隨之升高,表明聯(lián)合診斷的指標(biāo)越多其診斷效率越高。但并非指標(biāo)越多越好,鑒于CCAT1研究相對成熟其作用已被證實[14],本研究以CCAT1為基本檢測項目,聯(lián)合其他標(biāo)志物進行CCAT1加其他1~3項隨機組合的聯(lián)合試驗,做等級多分類Logistic回歸分析,然后用其概率做ROC曲線,結(jié)果顯示,系列試驗中CCAT1+HOTAIR+SOX2OT的平行線檢驗大于0.05,該假設(shè)被認(rèn)可,而且其組合Sp為98.4%,Youden指數(shù)0.856,Se為87.2%,AUCROC為0.982。

本研究嘗試應(yīng)用Logistic回歸綜合多指標(biāo)信息,根據(jù) ROC曲線確定診斷界值,同時增加診斷的Se和Sp。本次研究中單個CCAT1用于診斷結(jié)腸癌,其AUCROC達到0.924,Se達到0.903,Sp達到0.894,說明其對結(jié)腸癌的鑒別效能較高。

綜上所述,CCAT1將可能作為結(jié)腸癌的診斷、病情監(jiān)測及患者預(yù)后評估的分子標(biāo)記物,但其對結(jié)腸癌TNM分期的鑒別效能有待進一步研究。經(jīng)文獻篩選出的LincRNAP2,在本次研究中卻不具有檢驗效能,可能與樣本量過少有關(guān),其具體效能有待商榷。多指標(biāo)聯(lián)合診斷的效率優(yōu)于單項指標(biāo),且聯(lián)合指標(biāo)增加,系列試驗的特異度隨之升高。該方法亦可應(yīng)用于其他疾病診斷實驗的資料分析中,有著廣泛的應(yīng)用前景。

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