趙小芳，杜欣娜

(1.江蘇醫(yī)藥職業(yè)學院基礎醫(yī)學部， 江蘇 鹽城 224005；2.佳木斯大學基礎醫(yī)學院，黑龍江佳木斯 154007)

乳腺癌作為女性常見的惡性腫瘤之一，位居女性惡性腫瘤首位，也是導致女性癌癥相關性死亡的主要原因[1-2]。因此，積極尋找經(jīng)濟有效的乳腺癌預防、篩查、治療及護理方式，有效降低其發(fā)病率與病死率，提高患者生活質(zhì)量顯得尤為重要。1號染色體開放閱讀框26(Chromosome 1 Open Reading Frame 26，C1orf26)又名RNA內(nèi)切核糖核酸酶同源物(RNA Endoribonuclease Homolog, SWT1)，前期研究結果發(fā)現(xiàn)C1orf26在乳腺癌組織中高表達。本研究通過高通量數(shù)據(jù)分析DNA甲基化和拷貝數(shù)畸變對乳腺癌組織中C1orf26基因表達的影響。

1 資料與方法

1.1一般資料：本文高通量多組學數(shù)據(jù)來源于癌癥多組學和臨床數(shù)據(jù)庫LinkedOmics[3](http://linkedomics.zhang-lab.org/admin.php)。選取患者均為浸潤性乳腺癌，總數(shù)為1 105例，另外，還包括702例血液樣本和111例正常乳腺組織樣本，患者隨訪時間超過250個月。1 105例患者中，1 093例包含C1orf26 mRNA水平數(shù)據(jù)，963例包含C1orf26基因突變、拷貝數(shù)畸變和mRNA水平數(shù)據(jù)。

1.2數(shù)據(jù)分析方法：登錄LinkedOmics網(wǎng)站，查詢?nèi)橄侔┗颊咧蠧1orf26表達與臨床指標的相關性。另外，筆者還利用該網(wǎng)站分析了C1orf26 mRNA水平與其基因拷貝數(shù)畸變或甲基化水平的相關性。

1.3統(tǒng)計學方法：不同組織類型、腫瘤純度和種族中C1orf26的表達差異采用非參數(shù)T檢驗，P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義；C1orf26基因拷貝數(shù)畸變和甲基化水平對其表達的影響采用Spearman相關分析，P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

2 結果

2.1DNA甲基化和拷貝數(shù)畸變與C1orf26基因在乳腺癌組織中表達的相關性:LinkedOmics結果顯示，C1orf26基因拷貝數(shù)變化與C1orf26表達呈正相關，差異有統(tǒng)計學意義(r=0.509，P<0.01)，見圖1B；而C1orf26基因甲基化水平與C1orf26表達呈負相關，差異有統(tǒng)計學意義(r=-0.333，P<0.01)，見圖1A。

2.2乳腺癌中C1orf26表達與臨床指標的相關性:LinkedOmics結果顯示，C1orf26的表達分別受到乳腺癌組織類型、腫瘤純度和患者種族的影響，差異有統(tǒng)計學意義(P<0.01、P<0.05、P<0.01)，見圖2A～圖2C。

A：DNA甲基化與C1orf26基因表達變化的相關性；B：拷貝數(shù)畸變與C1orf26基因表達變化的相關性。統(tǒng)計學方法均為斯皮爾曼相關性檢驗

A：乳腺癌組織類型對C1orf26表達影響，統(tǒng)計方法為非參數(shù)T檢驗；B：腫瘤純度對C1orf26表達影響，統(tǒng)計方法為非參數(shù)T檢驗；C：患者不同種族對C1orf26表達影響，統(tǒng)計方法為非參數(shù)T檢驗

3 討論

乳腺癌是女性最常見的惡性腫瘤之一，根據(jù)美國癌癥協(xié)會統(tǒng)計分析，2017年美國新發(fā)的乳腺癌病例達到255 180例，因乳腺癌死亡的人數(shù)達到41 070例。而在中國，新發(fā)的乳腺癌病例和死亡病例也分別達到272 400例和70 700例，并且呈持續(xù)增長的模式[4-5]，嚴重威脅女性健康和生活質(zhì)量[6-7]。因此，研究乳腺癌發(fā)病的分子機制以及尋找新的預后標志物對于乳腺癌患者具有重要意義。C1orf26在腫瘤中的作用及其機制尚不明確。本文首次發(fā)現(xiàn)DNA甲基化和拷貝數(shù)畸變與C1orf26基因在乳腺癌組織中表達的相關性。

C1orf26是一種蛋白質(zhì)編碼基因，主要位于細胞核和細胞質(zhì)中，主要功能是促進細胞核周邊異常的前體mRNA降解，防止缺陷型mRNPs進入細胞質(zhì)[8]。有研究表明，C1orf26是具有轉(zhuǎn)錄功能的蛋白質(zhì)[9]，并在前期研究中發(fā)現(xiàn)其在乳腺癌中高表達，可能促進腫瘤的相關基因的表達。

C1orf26基因拷貝數(shù)增加促進了該基因的表達，這符合基因表達調(diào)控機制的認知[10-11]。C1orf26基因甲基化水平負向調(diào)控其表達，表明該基因呈低甲基化水平，符合低甲基化狀態(tài)的原癌基因表達增強促進腫瘤發(fā)生的機制[12-13]。然而，有關C1orf26基因在腫瘤中的表達情況目前尚未見報道。這提示C1orf26作為具有轉(zhuǎn)錄功能的蛋白[9]，其高表達極有可能促進了乳腺癌的發(fā)生和發(fā)展。因此，檢測乳腺癌中C1orf26基因表達具有重要的臨床意義，可作為乳腺癌預后的潛在標志物，此結果有進一步研究的價值。此外，C1orf26在不同組織學類型的乳腺癌中表達不同，說明可能參與不同亞型乳腺癌的發(fā)生和進展。腫瘤純度與C1orf26表達有關，說明不同細胞中C1orf26的表達豐度不同，具有細胞表達特異性。而患者種族與C1orf26表達相關，說明C1orf26的表達可能具有種族差異性。

利用TCGA數(shù)據(jù)庫和LinkedOmics數(shù)據(jù)庫進行數(shù)據(jù)挖掘以及預后的分析，可以快速分析一個或多個基因在腫瘤中的特異性表達，為以后的實驗研究提供理論基礎，可以對數(shù)據(jù)進行很好的整合，縮短科研周期，這給廣大科研工作者提供了新的思路[14]。筆者通過生物信息學預測的方式初步篩選出腫瘤與正常組織有差異性表達的基因C1orf26，鑒于患者樣本數(shù)據(jù)較大，隨訪時間較長，組學數(shù)據(jù)完備，C1orf26高表達不利于乳腺癌患者預后這一結果的可信度較高。但是，基因C1orf26是否能作為新的乳腺癌腫瘤標記物還需進一步的研究。