王康愷 趙娜 馬嘉欣 王迎超 田玲 楊治偉 洪緣緣 田蕾 張銀霞 楊淑琴 李培富
摘要:以高粱稻-1和寧農(nóng)黑粳的雜交F2代和F4代為試驗材料,在實驗室前期已獲得的稻米籽粒中控制γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)含量的3個數(shù)量性狀基因座(quantitative trait locus,QTL)位點基礎上,進一步利用簡單重復序列(simple sequence repeats,SSR)標記對其進行基因型檢測,獲得了不同基因組合類型,在此基礎上利用高效液相色譜法,測定各基因組合類型籽粒中GABA含量,探討GABA含量與其類型間的關系。結果表明,在F2代和F4代的所有組合類型中,代表高含量純合基因組合類型(BBA組合)中GABA含量的檢測結果均值最高,代表低含量純合基因組合類型(AAB組合)中GABA含量的檢測結果均值最低,其檢測結果與基因型表現(xiàn)一致。顯著性分析表明,GABA含量與不同基因組合類型之間存在極顯著相關性。同時還表明,相比F2代,F(xiàn)4代的BBA組合中GABA的平均含量增高,AAB組合中GABA的平均含量降低,且變異程度均有降低,特別是低含量純合基因組合類型材料的符合度從53%上升到75%,其結果表明,低含量純合基因組合類型材料有趨于穩(wěn)定的趨勢。試驗結果可應用于利用分子標記輔助選擇富γ-氨基丁酸雜交后代材料的研究中。
關鍵詞:水稻;γ-氨基丁酸;高效液相色譜;糙米;籽粒;基因型組合;SSR標記
中圖分類號: S511.032文獻標志碼: A
文章編號:1002-1302(2020)08-0078-07
收稿日期:2019-03-18
基金項目:國家自然科學基金(項目編號:31360324、31760374、31401361);寧夏農(nóng)業(yè)育種專項課題(編號:2018NYYZ0302)。
作者簡介:王康愷(1991—),男,陜西華陰人,碩士研究生,主要研究方向為水稻遺傳育種。E-mail:1033678950@qq.com。
通信作者:李培富,博士,教授,主要從事水稻遺傳育種研究。E-mail:peifμLi@163.com。
γ-氨基丁酸(γ-aminobutyric acid,GABA)又稱γ-氨酪酸,是一種天然存在的非蛋白組成性氨基酸[1]。γ-氨基丁酸不僅在植物組織中存在,同時也在哺乳動物和人類的中樞神經(jīng)系統(tǒng)中存在,是中樞神經(jīng)系統(tǒng)中很重要的抑制性神經(jīng)遞質,參與人體內(nèi)多項代謝及生理活動,具有降血壓、健腦、活化肝腎及調節(jié)免疫等功能,被譽為“大腦的天然鎮(zhèn)靜劑”[2]。為了實現(xiàn)“藥食同源”,調節(jié)人體生理功能,尤其是對GABA攝入量有特殊要求的人群而言,研究并開發(fā)富含GABA的水稻新品種顯得非常必要。
目前,國內(nèi)外對于γ-氨基丁酸的研究主要集中在其生理功能[3-5]、測定方法[6-7]以及發(fā)芽糙米工藝優(yōu)化[8]等方面,對富含GABA新品種培育的研究相對較少。目前,張標金通過測定巨胚稻和常規(guī)稻糙米中的GABA含量發(fā)現(xiàn),巨胚稻糙米中GABA的平均含量顯著高于常規(guī)稻,并從中篩選出富含GABA的巨胚稻GE091[6];Maeda等以金南風(Kinmaze)的巨胚突變體作為雜交親本,培育出了巨胚水稻新品種Haiminori,Haiminori籽粒中的GABA含量比日本晴、越光等普通水稻品種籽粒中的γ-氨基丁酸含量高3~4倍[9];日本利用九州大學的變異巨胚系統(tǒng)EM40和中國農(nóng)試高產(chǎn)品種明光諾里雜交,選育出富γ-氨基丁酸水稻新品種海米諾里[10],其胚芽內(nèi)的GABA含量比普通品種高約4倍。
本試驗通過檢測雜交F2代182份材料和雜交F4代109份材料的基因型,將所有材料按基因型組合進行分類,利用高效液相色譜法,測定各基因型組合籽粒中γ-氨基丁酸含量,分析不同類型材料γ-氨基丁酸含量與基因型的相關性,旨在為利用分子標記輔助選擇培育富γ-氨基丁酸新品種提供參考。
1?試驗材料與方法
1.1?試驗材料
1.1.1?供試水稻材料
試驗材料由寧夏大學農(nóng)學院作物遺傳育種實驗室提供,包括高粱稻-1和寧農(nóng)黑粳雜交F2,共182份單株材料。試驗材料于2017年10月在海南省三亞育種基地種植,采用播后上水的方式,常規(guī)田間管理方法,成熟時單株收獲。再于2018年5月在寧夏大學水稻育種基地種植,采用旱育秧方式育苗,單株移栽,田間采用常規(guī)栽培管理方法,成熟后收獲單株材料109份。
1.1.2?試驗用相關引物
本試驗所用引物來自筆者所在實驗室前期構建的簡單重復序列(simple sequence repeats,SSR)引物連鎖遺傳圖譜,以GABA含量為10.47 mg/100 g的高粱稻-1作為父本,以GABA含量為5.57 mg/100 g的寧農(nóng)黑粳作為母本,以雜交F2群體為基礎,篩選出貢獻率最高的3個數(shù)量性狀基因座(quantitative trait locus,QTL)位點,再對其進行優(yōu)化。結果如表1所示,其中qGABA-8-1和qGABA-8-2來自母本寧農(nóng)黑粳,qGABA-9來自父本高粱稻-1。引物由生工生物工程(上海)股份有限公司北京分公司合成。
1.2?試驗方法
1.2.1?籽粒γ-氨基丁酸含量的測定
本試驗采用水提法(參照程威威等的提取方法[7,11]并進行優(yōu)化),提取水稻糙米中的GABA。將收獲的182份雜交F2代和109份雜交F4代籽粒于60 ℃烘箱中烘干備用,使用礱谷機脫殼,磨粉機研磨,過80目篩,準確稱取糙米粉(1.000 0±0000 2) g,每份材料重復3次,倒入50 mL離心管中,加入15 mL超純水,混勻,60 ℃、120 r/min水浴振蕩浸提90 min,12 000 r/min 離心20 min,將上清液移入圓底燒瓶中,重復上述操作,將2次上清液混合,用旋轉蒸發(fā)儀在96 ℃下旋轉蒸發(fā),最后濃縮到5 mL,過 0.2 μm 有機濾膜,得到糙米中γ-氨基丁酸提取液,然后將提取液進行高效液相色譜(high performance liquid chromatography,HPLC)柱前衍生,使用安捷倫1220高效液相色譜儀進行測定,并繪制標準曲線,計算籽粒γ-氨基丁酸含量。
根據(jù)表2中的數(shù)據(jù),以γ-氨基丁酸標準品的濃度為橫坐標,峰面積為縱坐標,繪制出γ-氨基丁酸濃度與峰面積的標準曲線(圖1),擬合標準曲線方程為:y=1 133 314x-1 023.11,相關系數(shù)r2=0997 4。
1.2.2?葉片DNA的提取及檢測
本試驗采用十二烷基硫酸鈉(sodium dodecyl sulfate,SDS)法提取葉片中的DNA,以DNA為模板進行PCR擴增,配制20 μL反應體系,其中10×Buffer(含Mg2+)2.0 μL,2.5 μmol/mL dNTP 0.4 μL,引物(2 mmol/L)15 μL,Taq酶0.4 μL,模板DNA 2.0 μL,最后用ddH2O補足20 μL。PCR反應程序:95 ℃ 5 min;95 ℃ 50 s,58 ℃ 50 s,72 ℃ 1 min,35個重復;最后72 ℃延伸10 min。擴增產(chǎn)物用8%的聚丙烯酰胺凝膠(PAGE)電泳檢測,銀染顯色,包膠,并于膠片觀察燈下觀察,讀膠。
1.3?試驗數(shù)據(jù)處理
電泳后,讀取雜交后代群體的條帶,將與寧農(nóng)黑粳帶型一致的條帶記為B,與高粱稻-1帶型一致的條帶記為A,雙親雜合型條帶記為H,缺失記為“-”。在Microsoft Excel表中整理統(tǒng)計4種帶型數(shù)據(jù),用Microsoft Excel完成試驗數(shù)據(jù)的處理及繪圖,并用SPSS19.0分析軟件進行方差分析。
2?結果與分析
2.1?雜交后代群體基因型分析
將所用引物合成,按要求稀釋,然后進行PCR擴增反應,聚丙烯酰胺凝膠電泳檢測,部分結果如圖2所示,統(tǒng)計全部結果得出,其中有效條帶占全部條帶的 94.65%,數(shù)據(jù)可靠性較高,可用于下一步檢測分析。
2.2?雜交后代單株籽粒基因型組合及其對應γ-氨基丁酸含量
對雜交F2代和F4代材料的單株籽?;蛐瓦M行分類,并對其相應GABA含量進行統(tǒng)計,結果如表3、表4所示。由表3可以看出,F(xiàn)2群體中,GABA含量最高為 15.02 mg/100 g,其基因組合類型為BBH,最低為377 mg/100 g,其基因組合類型為AAB,其中純合基因型組合材料中GABA含量最高為12.15 mg/100 g,對應基因組合類型為BBA;由表4可以看出,F(xiàn)4群體中,GABA含量最高為 12.89 mg/100 g,其基因組合類型為BBB,最低為299 mg/100 g,其基因組合類型為AAB。綜上,在F2、F4代群體中,GABA含量最低的材料基因型組合均為AAB,但最高含量來自不同基因型組合。
2.3?雜交后代籽粒中γ-氨基丁酸含量與其基因組合類型的差異顯著性分析
由圖3可以看出,HHA、BBA基因組合類型的GABA含量高于BBB、HBH、HHH、HAH、HHB、AAA、AAH、HAB、AAB基因組合類型,AAH、HAB、AAB類型含量低于BBH、HHA、BBA類型,且均呈極顯著差異。其中HHA、BBA基因組合類型材料的GABA平均含量較高,分別為10.08、9.87 mg/100 g,AAB基因組合類型材料平均含量最低,為 5.98 mg/100 g,前者分別是后者的1.69、1.65倍。從遺傳學角度來看,雜合材料存在分離且穩(wěn)定性不高,所以選擇純合BBA類型進行后代遺傳。由圖4可以看出,BBA類型GABA含量高于HHB、BBH、AHB、HHH、HBB、HAB、AAB類型,AAB類型含量低于BBA、BBB、BAB、BHH類型,也均呈極顯著差異。其中BBA類型材料的GABA平均含量最高,達 10.12 mg/100 g;AAB類型材料平均含量最低,為3.30 mg/100 g;BBA類型材料是AAB的3.07倍。綜上,F(xiàn)2、F4代群體中,GABA平均含量最低的均為AAB類型材料,且含量有下降趨勢,BBA類型材料從F2到F4代變?yōu)樽罡?,且平均含量有所提高?/p>
2.4?不同基因組合類型間GABA含量的比較
由表5可以看出,F(xiàn)2代中,純合AAB基因組合類型材料γ-氨基丁酸含量的平均值為(5.98±1.15) mg/100 g,變異范圍為3.77~7.98 mg/100 g,變異系數(shù)為1930%;純合BBA基因組合類型材料γ-氨基丁酸含量的平均值為(9.87±1.24) mg/100 g,變異范圍為 8.18~12.15 mg/100 g,變異系數(shù)為1256%。由表6可以看出,F(xiàn)4代中,純合AAB基因組合類型材料γ-氨基丁酸含量的平均值為(3.30±0.47) mg/100 g,變異范圍為2.99~4.10 mg/100 g,變異系數(shù)為14.11%;純合BBA基因型材料γ-氨基丁酸含量的平均值為(10.12±121) mg/100 g,變異范圍為8.10~12.08 mg/100 g,變異系數(shù)為11.96%。綜上, 從F2代到F4代,純合AAB、BBA基因組合類型材料變異系數(shù)均有降低,其中AAB降低幅度較大,且均值都有向其最低或最高方向變化的趨勢。由表5、表6還可以看出,雜合基因型材料變異系數(shù)不穩(wěn)定。
2.5?純合高含量與低含量基因組合類型材料符合度的比較
為進一步探究純合高含量基因組合類型BBA和純合低含量基因組合類型AAB材料的穩(wěn)定性,對這2種組合類型的符合度進行了統(tǒng)計。結果(表7)表明,F(xiàn)2、F4代中BBA類型材料的符合度均為50%,AAB類型材料的符合度分別為53%、75%,相比純合高含量基因組合類型材料,純合低含量基因組合類型材料的符合度隨著世代增加有所增加,說明純合低含量基因組合類型材料穩(wěn)定性更高。
3?結論與討論
3.1?水稻籽粒中γ-氨基丁酸含量測定方法比較
γ-氨基丁酸作為一種新型的功能性因子,其測定方法目前在我國還沒有明確統(tǒng)一標準[12-13]。比色法和高效液相色譜法(HPLC)是這些年比較常用的2種測定γ-氨基丁酸含量的方法,但是均有優(yōu)缺點。比色法利用游離氨基酸與苯酚和次氯酸鈉反應,生成有色物質,進行比色測定。這一方法操作簡便,設備簡單,適合大規(guī)模測定。但是水稻糙米中的GABA含量普遍較低,所以在對其進行檢測時,其他物質產(chǎn)生的顏色會對分光光度計顯色反應造成影響,使其準確度降低。HPLC檢測的原理是γ-氨基丁酸與一些特殊的化學試劑發(fā)生柱前衍生反應后,生成一種能被紫外-可見光檢測到的穩(wěn)定熒光物。這一方法分離度較高、重復性較好、精密度較高、結果比較準確,但試劑昂貴,程序也較為繁瑣。程威威等對比分析了鄰苯二甲醛(OPA)、丹磺(Dansyl-Cl)、6-氨基喹啉基-N-羥基琥珀酰亞氨基甲酸酯(AQC)等作為柱前衍生試劑,檢測發(fā)芽糙米中的γ-氨基丁酸含量結果,發(fā)現(xiàn)OPA雖然衍生時間比較短,但其衍生產(chǎn)物較不穩(wěn)定,易分解[7,14];Dansyl-Cl衍生過程比較復雜,不僅需要避光保存,而且其衍生產(chǎn)物也相對較不穩(wěn)定[15];而AQC作為一種較為新型的柱前衍生試劑,衍生反應時不僅反應迅速,靈敏度較高,而且衍生產(chǎn)物也較為穩(wěn)定[16]。唐濤等在研究中均證實了AQC的優(yōu)越性[17-19]。因此,本試驗采用高效液相色譜法,并用AQC作柱前衍生,檢測籽粒中γ-氨基丁酸含量。
3.2?水稻籽粒γ-氨基丁酸含量與基因型的相關關系
王迎超研究發(fā)現(xiàn),高粱稻-1與寧農(nóng)黑粳雜交組合F1代籽粒γ-氨基丁酸含量介于雙親之間,F(xiàn)2代籽粒γ-氨基丁酸含量呈偏正態(tài)分布,并出現(xiàn)超親現(xiàn)象[2]。本試驗在此基礎上,依據(jù)3個QTL位點,對雜交F2代和F4代進行基因型組合分類,具體分析結果表明,不同基因組合類型與γ-氨基丁酸含量之間呈極顯著相關,代表高含量純合基因型(BBA組合)中GABA的檢測結果均值最高,代表低含量純合基因型(AAB組合)中GABA的檢測結果均值最低,其檢測結果與基因型表現(xiàn)一致。顯著性分析結果表明,GABA含量與其基因組合類型之間存在極顯著相關性。F2代BBA類型材料的GABA平均含量 (9.87 mg/100 g) 是AAB類型材料平均含量(5.97 mg/100 g)的1.65倍,F(xiàn)4代BBA類型材料平均含量(10.12 mg/100 g)是AAB類型材料GABA平均含量(3.30 mg/100 g)的3.07倍。結果表明,相比于F2代,F(xiàn)4代的BBA組合中GABA的平均含量增高,且F4代的AAB組合中GABA的平均含量降低,變異程度也均有所降低,特別是低含量純合基因型材料符合度從53%上升到75%,其結果表明,低含量材料γ-氨基丁酸含量趨于穩(wěn)定程度較高。
3.3?富γ-氨基丁酸水稻品種的選育
本試驗在王迎超的研究基礎[2]上進行延伸,利用分子標記輔助技術篩選富γ-氨基丁酸的水稻新材料,不僅可以縮短育種年限,也能快速選擇出富γ-氨基丁酸的水稻新品種。有關水稻籽粒中控制γ-氨基丁酸含量的遺傳學研究起步較晚,目前,籽粒中控制γ-氨基丁酸含量的QTL位點并沒有得到精細定位。本試驗結果證明,控制GABA基因定位的準確性,可為分子標記輔助選擇富含γ-氨基丁酸的水稻新品種以及控制γ-氨基丁酸含量的候選基因篩選奠定基礎。
參考文獻:
[1]王迎超,王全興,王?浩,等. 富γ-氨基丁酸水稻種質篩選及與籽粒性狀的相關性分析[J]. 植物遺傳資源學報,2016,17(6):1116-1122.
[2]王迎超. 水稻γ-氨基丁酸含量的遺傳分析及QTL定位[D]. 銀川:寧夏大學,2016.
[3]張祥喜,袁林峰,劉?凱,等. 富含γ-氨基丁酸(GABA)的巨胚功能稻研究進展[J]. 江西農(nóng)業(yè)學報,2007,19(1):36-39.
[4]張琳琳,舒小麗,盧懷江,等. 富含γ-氨基丁酸降壓功能稻米研究進展[J]. 核農(nóng)學報,2006,20(3):218-220.
[5]王?輝,項麗麗. γ-氨基丁酸(GABA)的功能性及在食品中的應用[J]. 食品工業(yè),2013,6(34):186-189.
[6]張標金. 用基于鄰苯二甲醛柱前衍生的高效液相色譜法測定稻米的γ-氨基丁酸含量[J]. 江西農(nóng)業(yè)學報,2013,25(11):105-107.
[7]程威威. HPLC法測定發(fā)芽糙米中γ-氨基丁酸中不同衍生方式的比較研究[J]. 中國農(nóng)學通報,2014,30(9):279-284.
[8]李常鈺,王超超,楊慧萍. 發(fā)芽糙米中γ-氨基丁酸的富集與測定[J]. 糧食與飼料工業(yè),2011(2):4-7.
[9]Maeda H,Nemoto H,Iida S,et al. A new rice variety with giant embryos,“Haminori”[J]. Breeding Sci,2001,51:211-213.
[10]姜?賓. 日本育出巨大胚水稻新品種[J]. 天津農(nóng)林科技,2001(4):45.
[11]房克敏,李再貴,袁漢成,等. HPLC法測定發(fā)芽糙米中γ-氨基丁酸含量[J]. 食品科學,2006,27(4):208-211.
[12]田小磊,吳效嵐. γ-氨基丁酸在高等植物逆境反應中的作用[J]. 生命科學,2002,14(4):215-219.
[13]徐瑞萍. γ-氨基丁酸在發(fā)芽糙米中檢測方法與綜述[J]. 山東化工,2012,41(11):35-37.
[14]陳?稚. 食品營養(yǎng)強化劑及保健食品中的違禁藥物分析方法研究[D]. 長沙:湖南師范大學,2006.
[15]Huang X,Chen J W,He L P,et al. Detection of monoamine neurotransmitters and its metabolites by high performance liquid chromatograph after pre-colum derivatization of dansyl chloride column[J]. Europe Pub Med Central,2012,46(12):51-53.
[16]覃婷婷,白海嬌,黃哲蘇,等. AQC柱前衍生法在氨基酸分析測定中的應用[J]. 天津藥學,2010,22(5):51-53.
[17]唐?濤. 氨基酸柱前衍生化HPLC方法發(fā)展及應用[D]. 南京:南京理工大學,2006.
[18]呂瑩果,張?暉,孟?祥. 氨基酸分析測定及衍生化方法[J]. 糧食與油脂,2009(7):35-38.
[19]王秀中,王清清,宋海峰. 衍生化技術在氨基酸分析中的應用進展[J]. 藥物分析雜志,2010,30(6):1162-1166.