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口岸鼠體寄生螨類(lèi)分子鑒定

2020-05-26 07:55:50
口岸衛(wèi)生控制 2020年1期
關(guān)鍵詞:鼠類(lèi)形態(tài)學(xué)核酸

重慶國(guó)際旅行衛(wèi)生保健中心(重慶海關(guān)口岸門(mén)診部)(重慶,401147)

螨類(lèi)種類(lèi)眾多,是影響農(nóng)業(yè)、畜牧業(yè)和公共衛(wèi)生的重要節(jié)肢動(dòng)物。其中能引起人類(lèi)疾病的種類(lèi)有革螨,疥螨,恙螨,蠕形螨,粉螨和塵螨等。螨類(lèi)體型微小,生境復(fù)雜,都給螨類(lèi)研究帶來(lái)挑戰(zhàn)。在螨類(lèi)的分類(lèi)鑒定,生態(tài)學(xué),病原生物傳播等領(lǐng)域存在較多空白[1-3]。

鼠體寄生螨類(lèi)是重要病媒生物,格氏血厲螨、廄真厲螨、阿爾及利亞螨和柏氏禽刺螨等均能自然感染森林腦炎、出血熱、Q熱、鼠疫和土拉弗氏菌等自然疫源性疾病,小盾纖恙螨和毒棘厲螨均可攜帶SFTSV,具有傳播SFTS的可能,革螨和恙螨是腎綜合征出血熱傳播媒介,恙螨還是恙蟲(chóng)病立克次體的傳播媒介[4-8]。

螨類(lèi)的種群鑒定以形態(tài)學(xué)鑒定為主。但是形態(tài)學(xué)鑒定標(biāo)本制作過(guò)程復(fù)雜,需要長(zhǎng)時(shí)間經(jīng)驗(yàn)積累。隨著分子生物學(xué)技術(shù)在物種種群鑒定中的成功應(yīng)用,建立螨類(lèi)分子鑒定技術(shù)對(duì)準(zhǔn)確快速確定螨類(lèi)種群意義重大。賀麗敏等建立了基于COⅠ和ITS2的蒲螨分子鑒定方法,鑒定結(jié)果與形體學(xué)鑒定一致;張星星等利用COX1基因?qū)﹄u皮刺螨進(jìn)行鑒定,伍祎等建立了基于COⅠ的儲(chǔ)藏物螨類(lèi)分子鑒定技術(shù),王少麗等建立了截形葉螨的分子鑒定方法。但是目前還沒(méi)有針對(duì)鼠體寄生螨類(lèi)的分子鑒定方法建立的研究[9-12]。

1 材料與方法

1.1 蜱螨類(lèi)標(biāo)本采集

采集重慶江北機(jī)場(chǎng),寸灘港,涪陵港,萬(wàn)州港,湖北宜昌港和滿洲里等口岸鼠體寄生螨類(lèi)。螨類(lèi)采集方法參考《國(guó)檢字(2001)61 號(hào)》,質(zhì)檢衛(wèi)函(2016)16號(hào)文件規(guī)定方法實(shí)施。使用鼠籠法捕捉鼠類(lèi)進(jìn)行鼠體寄生螨類(lèi)搜集。將鼠類(lèi)用乙醚麻醉后搜集鼠體寄生螨類(lèi),對(duì)螨類(lèi)進(jìn)行分類(lèi),用于制作形態(tài)學(xué)標(biāo)本投入70%酒精保存制作玻片標(biāo)本,用于分子鑒定的標(biāo)本置離心管于-80℃保存。

1.2 螨類(lèi)分子鑒定

1.2.1 引物篩選

查閱文獻(xiàn)和NCBI中蜱螨分子鑒定序列,設(shè)計(jì)鼠體寄生螨類(lèi)分子鑒定引物序列。包括用于擴(kuò)增COⅠ,COⅡ,Cytb,ITS2的通用引物如下:

表1

1.2.1 核酸提取

螨類(lèi)初步形態(tài)學(xué)鑒定后,選取形態(tài)一致的3-5只個(gè)體為一組,進(jìn)行核酸提取,同時(shí)對(duì)所選標(biāo)本進(jìn)行拍照。將樣本加入200ul PBS冷凍研磨,使用Qiagen DNA提取試劑盒,按照說(shuō)明書(shū)提取DNA,4℃保存,備用。

1.2.2 PCR擴(kuò)增程序及產(chǎn)物分析

PCR擴(kuò)增與測(cè)序PCR反應(yīng)擴(kuò)增體系:10×緩沖液 2.5μl,dNTP 1μl, 引物各 1μl,EX Taq 聚合酶0.2μl, 模板 DNA 1μl,ddH2O 18.3μl。 PCR 反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性 5min,94℃變性 45s,53℃退火 30s,72℃延伸1min,35個(gè)循環(huán),最后再72℃延伸10min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),將擴(kuò)增產(chǎn)物送華大生物技術(shù)有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序。

2 結(jié)果

2.1 2016-2018年分別在滿洲里和重慶口岸鼠類(lèi)監(jiān)測(cè)捕獲活鼠搜檢鼠體寄生螨類(lèi),共檢獲各類(lèi)螨類(lèi)185只,各口岸鼠類(lèi)攜帶蜱類(lèi)情況如表2。鼠類(lèi)平均帶螨率為30.77%,鼠類(lèi)帶螨率最高的為滿洲里,為35.42%,最低為湖北宜昌口岸,為12.5%。但檢獲的螨大部分為若螨,部分螨形態(tài)學(xué)結(jié)構(gòu)如圖2所示。

表2 各口岸鼠類(lèi)攜帶螨類(lèi)情況

2.2 螨類(lèi)分子鑒定

共提取8組螨類(lèi)核酸,分別擴(kuò)增ITS2,Cytb,COⅠ等基因部分片段。僅有COⅠ基因能獲得特異性片段,其中3組測(cè)序成功獲得特異性序列。將測(cè)序獲得的序列與GenBank中其他螨類(lèi)的COⅠ基因序列進(jìn)行Blast比對(duì),形態(tài)學(xué)鑒定為毒厲蟎的螨類(lèi)與螨類(lèi)Laelaps muricola (鼠尾厲螨)COⅠ基因KU166775同源性較高,同源性為89.3%;形態(tài)學(xué)鑒定為柏氏禽刺螨的螨類(lèi)COⅠ基因與已知的柏氏禽刺螨Ornithonyssus bacoti COⅠ基因FM179677同源性100%。形態(tài)學(xué)未鑒定到種螨類(lèi)COⅠ基因分別與已知的螨類(lèi)COⅠ基因同源性均較低,與相似度最高的Pachylaelapidae sp的COⅠ基因同源性為77%。

圖1 螨類(lèi)COⅠ基因片段擴(kuò)增結(jié)果

圖2 螨類(lèi)形態(tài)及序列分析

3 討論

3.1 本研究對(duì)鼠體寄生螨進(jìn)行了分子鑒定研究,并成功獲得3種螨類(lèi)COⅠ基因序列,但目前數(shù)據(jù)庫(kù)中螨類(lèi)COⅠ基因序列數(shù)量較少,比對(duì)分析較困難。需要進(jìn)一步積累螨類(lèi)分子鑒定序列數(shù)據(jù)。

3.2 螨類(lèi)數(shù)量還需要進(jìn)一步擴(kuò)大。因時(shí)間關(guān)系采集螨主要集中在滿洲里和重慶口岸,種類(lèi)較少且單一,需進(jìn)一步擴(kuò)大采集口岸,使數(shù)據(jù)更具有代表性。

3.3 本研究采集螨類(lèi)時(shí)間跨度長(zhǎng),標(biāo)本運(yùn)輸保存可能影響了核酸質(zhì)量,8組螨核酸僅有4個(gè)樣本擴(kuò)增獲得了COⅠ基因特異性條帶(圖1),且其中只有1個(gè)樣品電泳條帶較亮。核酸質(zhì)量可能也影響了其他基因擴(kuò)增效率。進(jìn)一步優(yōu)化螨類(lèi)標(biāo)本篩檢和核酸提取,可以提高螨類(lèi)分子鑒定的成功率和特異性。

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