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鵪鶉MyoG基因多態(tài)性與早期生長性能的關(guān)聯(lián)分析

2020-05-15 02:25白俊艷時(shí)坤鵬盧小寧陳夢柯馬永康鞏慧榮董智豪龐有志安肖凱常世增侯偉曉付學(xué)言樊紅燈
河南農(nóng)業(yè)科學(xué) 2020年4期
關(guān)鍵詞:黃羽鵪鶉多態(tài)性

白俊艷,時(shí)坤鵬,盧小寧,楊 帥,陳夢柯,馬永康,鞏慧榮,董智豪,龐有志,雷 瑩,曹 慧,安肖凱,常世增,侯偉曉,付學(xué)言,樊紅燈,曹 恒

(1.河南科技大學(xué) 動(dòng)物科技學(xué)院,河南 洛陽 471023; 2.洛陽市動(dòng)物遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南 洛陽 471023)

肌細(xì)胞生成素(Myogenin,MyoG)是一種生肌調(diào)節(jié)因子(MRFs),與生肌決定因子(MyoD)、生肌調(diào)節(jié)因子4(MRF4)、肌細(xì)胞生成素和生肌因子5(MYF5)共同調(diào)控肌肉的生長[1]。MyoD和MyoG均為肌調(diào)節(jié)蛋白,MyoD決定肌源性的發(fā)生,MyoG可誘導(dǎo)骨骼肌的末端分化[2]。WEINTRAUB等[3]研究發(fā)現(xiàn),單獨(dú)敲除MyoG基因的小鼠會(huì)因骨骼肌發(fā)育出現(xiàn)缺陷而死亡,如果同時(shí)只敲除其他3個(gè)生肌調(diào)節(jié)因子基因,小鼠骨骼肌發(fā)育都未出現(xiàn)缺陷。MyoG作為轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,其表達(dá)啟動(dòng)了一系列骨骼肌特異的胚胎性受體和收縮蛋白的合成。因此 ,MyoG是唯一的無可替代的生肌調(diào)節(jié)因子[4]。近年來,國內(nèi)外對MyoG基因的研究比較廣泛,多集中在生長性能的關(guān)聯(lián)性、肌肉形成機(jī)制、MyoG基因的遺傳表達(dá)和調(diào)控方面[5-9],而MyoG基因與鵪鶉的生長性能的關(guān)聯(lián)分析尚未見報(bào)道。為此,利用PCR-SSCP法對MyoG基因與鵪鶉的早期生長性能進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析,以期為鵪鶉的早期生長性能標(biāo)記輔助選擇提供參考。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)材料

試驗(yàn)用的鵪鶉包括中國黃羽鵪鶉、北京白羽鵪鶉、朝鮮鵪鶉各80只,均來自河南省鵪鶉養(yǎng)殖基地,全部為雌性鵪鶉。翅靜脈采血0.4~1 mL,裝于肝素鈉抗凝管中,充分混勻后置于-20 ℃冰箱中保存。采用家禽全血DNA試劑盒(購自鄭州鼎國生物有限公司)提取DNA,用0.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2 MyoG基因的引物合成

MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)的引物分別為MyoG-5P1、MyoG-5P2,引物設(shè)計(jì)參考王瓊等[10]的方法,由北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司進(jìn)行合成(表1)。

1.3 MyoG基因的PCR擴(kuò)增反應(yīng)

PCR反應(yīng)體系:擴(kuò)增總體積為20 μL,其中滅菌水7.6 μL、Mix 10 μL、上下游引物(10 μmol/L)各0.7 μL、DNA模板1 μL。PCR反應(yīng)循環(huán)參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性40 s,57.2 ℃或61.9 ℃退火45 s,72 ℃延伸35 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃再次延伸5 min。

1.4 MyoG基因的PCR-SSCP檢測

將5 μL變性上樣緩沖液(98%甲酰胺、2%甘油、10 mmol/L的EDTA、0.025%溴酚藍(lán)、0.025%二甲苯青)和5 μL的PCR產(chǎn)物混合均勻,98 ℃水浴變性10 min,立即0 ℃冰水浴10 min。制備10%的丙烯酰胺凝膠(蒸餾水24 mL,50%丙烯酰胺8 mL,5×TBE溶液8 mL,10%過硫酸銨400 μL,四甲基乙二胺40 μL)。220 V電壓條件下電泳15 min,后改為90 V電泳6 h,硝酸銀染色,將結(jié)果在燈光下拍照保存。

1.5 數(shù)據(jù)分析

利用PopGene軟件計(jì)算基因頻率、基因型頻率、雜合度(He)、有效等位基因、多態(tài)信息含量(PIC)。利用SPSS 17.0軟件對MyoG基因多態(tài)性與鵪鶉早期生長性能進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,分析模型:yijkl=μ+Bi+Wj+Mk+eijkl。式中,yijkl為性狀表型值,μ為總體均值,Bi為第i個(gè)品種效應(yīng)(i=1,2,3),Wj為第j周齡效應(yīng)(j=1,2,3,4,5,6,7),Mk為第k種基因型效應(yīng),eijkl為殘差效應(yīng)。

2 結(jié)果與分析

2.1 鵪鶉MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)的PCR產(chǎn)物檢測

從圖1可以看出,鵪鶉MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)擴(kuò)增獲得的目的片段大小為203 bp,B位點(diǎn)擴(kuò)增獲得的目的片段大小為236 bp,這與預(yù)期相一致,具有較好的特異性,可以進(jìn)行后續(xù)的試驗(yàn)。

2.2 MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)在鵪鶉群體中的多態(tài)性檢測

在3個(gè)鵪鶉群體中MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A點(diǎn)共發(fā)現(xiàn)6種基因型,分別為AA、BB、CC、AB、AC、BC基因型,其中在朝鮮鵪鶉群體中沒有發(fā)現(xiàn)AB、BC基因型(圖2)。

A為MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn);B為MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn);M為Marker 2000;1、2、6、7為中國黃羽鵪鶉;3、4、8、9為北京白羽鵪鶉;5、10為朝鮮鵪鶉

A為中國黃羽鵪鶉;B為北京白羽鵪鶉;C為朝鮮鵪鶉;4、12、14、17、19、23、24為AA基因型;5為AB基因型;1、3、13、20為AC基因型;7、9為BB基因型;10為BC基因型;2、6、8、11、15、16、18、21、22為CC基因型

對3個(gè)品種鵪鶉的MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)基因型檢測,結(jié)果見圖3。在3個(gè)品種鵪鶉群體中共發(fā)現(xiàn)AA、BB、CC、DD、EE、AB、AC、AD、AE等9種基因型,A、B、C、D、E等5個(gè)等位基因,其中朝鮮鵪鶉群體中缺少等位基因C。

A為中國黃羽鵪鶉;B為北京白羽鵪鶉;C為朝鮮鵪鶉;3、4、7、10、11、15、17、18、19、20、21、23為AA基因型;2為BB基因型;1、6為DD基因型;5為EE基因型;8、12、13、16為AB基因型;9、14、22為AE基因型

2.3 MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)在鵪鶉群體中的遺傳多態(tài)性

從表2和表3可以看出,對于A位點(diǎn)來說,中國黃羽鵪鶉、北京白羽鵪鶉和朝鮮鵪鶉的CC基因型頻率均為最高,CC基因型頻率分別為0.323、0.366、0.444;中國黃羽鵪鶉、北京白羽鵪鶉和朝鮮鵪鶉的遺傳多樣性較為豐富(He>0.5),3個(gè)品種鵪鶉群體都為中度多態(tài)(0.250.5),3個(gè)品種鵪鶉群體均為高度多態(tài)(PIC>0.5)。

表2 鵪鶉MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)和B位點(diǎn)的基因型頻率Tab.2 Genotype frequencies of A and B loci in 5′regulatory region of quail MyoG gene

表3 鵪鶉MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)和B位點(diǎn)的等位基因頻率和多態(tài)信息含量Tab.3 Allele frequencies and polymorphic information content of A and B loci in 5′regulatory region of quail MyoG gene

2.4 MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)的多態(tài)性與鵪鶉生長性能的關(guān)聯(lián)分析

MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)的多態(tài)性與蛋用鵪鶉早期生長發(fā)育的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果見表4,由于BB基因型和BC基因型個(gè)體比較少,因此,關(guān)聯(lián)分析時(shí)未考慮這2個(gè)基因型,蛋用鵪鶉早期生長發(fā)育性能只對AA、AB、AC、CC這4種基因型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。由表4可知,在體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長等性狀上,AB基因型顯著高于AA、AC、CC基因型(P<0.05),AA、AC、CC基因型個(gè)體間不存在顯著性差異(P>0.05)。脛圍在AA、AB、AC、CC基因型間無顯著性差異(P>0.05)。

表4 MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)與鵪鶉早期生長性能的關(guān)聯(lián)分析Tab.4 Association of 5′regulatory region A site of MyoG gene of quail with early growth and development

注:同行數(shù)據(jù)后不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05)。

Note: The different lowercase letters in the same row mean significant difference (P<0.05).

MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)的多態(tài)性與蛋用鵪鶉早期生長發(fā)育的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果見表5。由于AC、CE、BD基因型個(gè)體比較少,關(guān)聯(lián)分析時(shí)未考慮這3個(gè)基因型。從表5可以看出,CC基因型體質(zhì)量顯著高于AD、AE、BB、DD基因型(P<0.05),DD基因型的體質(zhì)量最低。CC基因型脛長顯著高于AA、AD、AE、BB、DD基因型(P<0.05)。CC基因型胸寬顯著高于其他基因型(P<0.05)。CC基因型胸深顯著高于其他基因型(P<0.05)。CC基因型胸骨長顯著高于AA、AB、AD、AE、BB、DD、EE基因型(P<0.05),AA、AB、EE基因型胸骨長顯著高于AD、AE、DD基因型(P<0.05)。CC、EE基因型體長顯著高于AD、AE基因型和DD基因型(P<0.05)。

表5 MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)與鵪鶉早期生長性能的關(guān)聯(lián)分析Tab.5 Association of 5′ regulatory region B site of MyoG gene of quail with early growth and development

注:同列數(shù)據(jù)后不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05)。

Note:The different lowercase letters in the same column mean significant difference(P<0.05).

3 結(jié)論與討論

3.1 MyoG基因的多態(tài)性

在禽類研究中,趙忠海等[11]在三穗鴨MyoG基因的外顯子1、2、3中分別發(fā)現(xiàn)了1個(gè)、2個(gè)和3個(gè)突變位點(diǎn)。王瓊[12]在肉雞的MyoG5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了1個(gè)突變位點(diǎn),共3種基因型,B位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了3個(gè)SNPs位點(diǎn),共6種基因型。魏岳等[13]在邊雞的MyoG基因第3外顯子中發(fā)現(xiàn)了2處突變位點(diǎn),共6種基因型。唐瑩等[14]在京海黃雞的MyoG基因外顯子1上共發(fā)現(xiàn)了3種基因型。可見,MyoG基因在禽類中存在豐富的多態(tài)性。本研究中,使用MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)在3個(gè)品種的鵪鶉群體中進(jìn)行多態(tài)性檢測,A位點(diǎn)中出現(xiàn)了6種基因型;在B位點(diǎn)中檢測到了9種基因型??梢?,MyoG基因在鵪鶉群體中存在豐富的多態(tài)性。

3.2 MyoG基因的多態(tài)性與生長性能的關(guān)聯(lián)分析

關(guān)于MyoG基因與生長性能關(guān)系的研究大多集中在豬上,在禽類中也有少量的研究。在MyoG多態(tài)性與禽類生長性能關(guān)聯(lián)性的研究中,趙忠海等[11]研究發(fā)現(xiàn),MyoG基因的2種突變分別對鴨的胸肌率、體質(zhì)量和全凈膛質(zhì)量有顯著影響,其所對應(yīng)的純合子基因型 CC、GG型為優(yōu)勢基因。王瓊[12]發(fā)現(xiàn),MyoG基因?qū)﹄u的肌纖維生長發(fā)育有顯著影響。魏岳等[13]在MyoG基因上發(fā)現(xiàn)2處同義突變位點(diǎn),MyoG基因在胸肌中的表達(dá)量極顯著高于腿肌。唐瑩等[14]在京海黃雞的MyoG基因外顯子1上共發(fā)現(xiàn)了3種基因型,分別為 AA、AB、BB,BB基因型的2、4、6周齡體質(zhì)量顯著高于 AB基因型(P<0.05), BB基因型的8周齡體質(zhì)量顯著高于 AA基因型(P<0.05)。王瓊[12]在肉雞的MyoG5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)和B位點(diǎn)都發(fā)現(xiàn)了基因的多態(tài)性與肉雞的屠宰性存在顯著的相關(guān)性(P<0.05),其中B位點(diǎn)的多態(tài)性與雞的肌纖維發(fā)育存在顯著的正相關(guān)。魏岳等[13]研究發(fā)現(xiàn),MyoG基因的多態(tài)性對邊雞生長發(fā)育性能和屠宰性能表現(xiàn)出顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01)。唐瑩等[14]研究發(fā)現(xiàn),MyoG基因外顯子1的多態(tài)性與京海黃雞早期生長發(fā)育性能存在顯著的相關(guān)性(P<0.05)。

在MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)的多態(tài)性與鵪鶉生長性能關(guān)聯(lián)的研究中,AB基因型的蛋用鵪鶉在體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長等早期生長發(fā)育性狀上都顯著性高于AA、AC和CC基因型(P<0.05)。在MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)的多態(tài)性與鵪鶉生長性能關(guān)聯(lián)的研究中,蛋用鵪鶉在體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長、等多個(gè)早期生長發(fā)育性狀上都出現(xiàn)了顯著性差異(P<0.05)。MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)的多態(tài)性與鵪鶉早期生長發(fā)育性能存在關(guān)聯(lián)性,這與王瓊[12]、魏岳等[13]、唐瑩等[14]的研究結(jié)果相似。早期生長性能與MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)的多態(tài)性存在關(guān)聯(lián),但由于基因型較多,還不能確定優(yōu)勢基因型,需要后續(xù)進(jìn)一步研究。綜上,MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)關(guān)聯(lián)分析顯示,不同基因型與早期蛋用鵪鶉的體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長存在關(guān)聯(lián)性,且差異顯著(P<0.05),說明MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)對鵪鶉的早期生長性能有一定影響。

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