白俊艷,時(shí)坤鵬,盧小寧,楊 帥,陳夢柯,馬永康,鞏慧榮,董智豪,龐有志,雷 瑩,曹 慧,安肖凱,常世增,侯偉曉,付學(xué)言,樊紅燈,曹 恒
(1.河南科技大學(xué) 動(dòng)物科技學(xué)院,河南 洛陽 471023; 2.洛陽市動(dòng)物遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南 洛陽 471023)
肌細(xì)胞生成素(Myogenin,MyoG)是一種生肌調(diào)節(jié)因子(MRFs),與生肌決定因子(MyoD)、生肌調(diào)節(jié)因子4(MRF4)、肌細(xì)胞生成素和生肌因子5(MYF5)共同調(diào)控肌肉的生長[1]。MyoD和MyoG均為肌調(diào)節(jié)蛋白,MyoD決定肌源性的發(fā)生,MyoG可誘導(dǎo)骨骼肌的末端分化[2]。WEINTRAUB等[3]研究發(fā)現(xiàn),單獨(dú)敲除MyoG基因的小鼠會(huì)因骨骼肌發(fā)育出現(xiàn)缺陷而死亡,如果同時(shí)只敲除其他3個(gè)生肌調(diào)節(jié)因子基因,小鼠骨骼肌發(fā)育都未出現(xiàn)缺陷。MyoG作為轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,其表達(dá)啟動(dòng)了一系列骨骼肌特異的胚胎性受體和收縮蛋白的合成。因此 ,MyoG是唯一的無可替代的生肌調(diào)節(jié)因子[4]。近年來,國內(nèi)外對MyoG基因的研究比較廣泛,多集中在生長性能的關(guān)聯(lián)性、肌肉形成機(jī)制、MyoG基因的遺傳表達(dá)和調(diào)控方面[5-9],而MyoG基因與鵪鶉的生長性能的關(guān)聯(lián)分析尚未見報(bào)道。為此,利用PCR-SSCP法對MyoG基因與鵪鶉的早期生長性能進(jìn)行了關(guān)聯(lián)分析,以期為鵪鶉的早期生長性能標(biāo)記輔助選擇提供參考。
試驗(yàn)用的鵪鶉包括中國黃羽鵪鶉、北京白羽鵪鶉、朝鮮鵪鶉各80只,均來自河南省鵪鶉養(yǎng)殖基地,全部為雌性鵪鶉。翅靜脈采血0.4~1 mL,裝于肝素鈉抗凝管中,充分混勻后置于-20 ℃冰箱中保存。采用家禽全血DNA試劑盒(購自鄭州鼎國生物有限公司)提取DNA,用0.5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測,置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)的引物分別為MyoG-5P1、MyoG-5P2,引物設(shè)計(jì)參考王瓊等[10]的方法,由北京鼎國昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司進(jìn)行合成(表1)。
PCR反應(yīng)體系:擴(kuò)增總體積為20 μL,其中滅菌水7.6 μL、Mix 10 μL、上下游引物(10 μmol/L)各0.7 μL、DNA模板1 μL。PCR反應(yīng)循環(huán)參數(shù):95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性40 s,57.2 ℃或61.9 ℃退火45 s,72 ℃延伸35 s,35個(gè)循環(huán);72 ℃再次延伸5 min。
將5 μL變性上樣緩沖液(98%甲酰胺、2%甘油、10 mmol/L的EDTA、0.025%溴酚藍(lán)、0.025%二甲苯青)和5 μL的PCR產(chǎn)物混合均勻,98 ℃水浴變性10 min,立即0 ℃冰水浴10 min。制備10%的丙烯酰胺凝膠(蒸餾水24 mL,50%丙烯酰胺8 mL,5×TBE溶液8 mL,10%過硫酸銨400 μL,四甲基乙二胺40 μL)。220 V電壓條件下電泳15 min,后改為90 V電泳6 h,硝酸銀染色,將結(jié)果在燈光下拍照保存。
利用PopGene軟件計(jì)算基因頻率、基因型頻率、雜合度(He)、有效等位基因、多態(tài)信息含量(PIC)。利用SPSS 17.0軟件對MyoG基因多態(tài)性與鵪鶉早期生長性能進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析,分析模型:yijkl=μ+Bi+Wj+Mk+eijkl。式中,yijkl為性狀表型值,μ為總體均值,Bi為第i個(gè)品種效應(yīng)(i=1,2,3),Wj為第j周齡效應(yīng)(j=1,2,3,4,5,6,7),Mk為第k種基因型效應(yīng),eijkl為殘差效應(yīng)。
從圖1可以看出,鵪鶉MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)擴(kuò)增獲得的目的片段大小為203 bp,B位點(diǎn)擴(kuò)增獲得的目的片段大小為236 bp,這與預(yù)期相一致,具有較好的特異性,可以進(jìn)行后續(xù)的試驗(yàn)。
在3個(gè)鵪鶉群體中MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A點(diǎn)共發(fā)現(xiàn)6種基因型,分別為AA、BB、CC、AB、AC、BC基因型,其中在朝鮮鵪鶉群體中沒有發(fā)現(xiàn)AB、BC基因型(圖2)。
A為MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn);B為MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn);M為Marker 2000;1、2、6、7為中國黃羽鵪鶉;3、4、8、9為北京白羽鵪鶉;5、10為朝鮮鵪鶉
A為中國黃羽鵪鶉;B為北京白羽鵪鶉;C為朝鮮鵪鶉;4、12、14、17、19、23、24為AA基因型;5為AB基因型;1、3、13、20為AC基因型;7、9為BB基因型;10為BC基因型;2、6、8、11、15、16、18、21、22為CC基因型
對3個(gè)品種鵪鶉的MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)基因型檢測,結(jié)果見圖3。在3個(gè)品種鵪鶉群體中共發(fā)現(xiàn)AA、BB、CC、DD、EE、AB、AC、AD、AE等9種基因型,A、B、C、D、E等5個(gè)等位基因,其中朝鮮鵪鶉群體中缺少等位基因C。
A為中國黃羽鵪鶉;B為北京白羽鵪鶉;C為朝鮮鵪鶉;3、4、7、10、11、15、17、18、19、20、21、23為AA基因型;2為BB基因型;1、6為DD基因型;5為EE基因型;8、12、13、16為AB基因型;9、14、22為AE基因型
從表2和表3可以看出,對于A位點(diǎn)來說,中國黃羽鵪鶉、北京白羽鵪鶉和朝鮮鵪鶉的CC基因型頻率均為最高,CC基因型頻率分別為0.323、0.366、0.444;中國黃羽鵪鶉、北京白羽鵪鶉和朝鮮鵪鶉的遺傳多樣性較為豐富(He>0.5),3個(gè)品種鵪鶉群體都為中度多態(tài)(0.25
表2 鵪鶉MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)和B位點(diǎn)的基因型頻率Tab.2 Genotype frequencies of A and B loci in 5′regulatory region of quail MyoG gene
表3 鵪鶉MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)和B位點(diǎn)的等位基因頻率和多態(tài)信息含量Tab.3 Allele frequencies and polymorphic information content of A and B loci in 5′regulatory region of quail MyoG gene
MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)的多態(tài)性與蛋用鵪鶉早期生長發(fā)育的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果見表4,由于BB基因型和BC基因型個(gè)體比較少,因此,關(guān)聯(lián)分析時(shí)未考慮這2個(gè)基因型,蛋用鵪鶉早期生長發(fā)育性能只對AA、AB、AC、CC這4種基因型進(jìn)行關(guān)聯(lián)分析。由表4可知,在體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長等性狀上,AB基因型顯著高于AA、AC、CC基因型(P<0.05),AA、AC、CC基因型個(gè)體間不存在顯著性差異(P>0.05)。脛圍在AA、AB、AC、CC基因型間無顯著性差異(P>0.05)。
表4 MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)與鵪鶉早期生長性能的關(guān)聯(lián)分析Tab.4 Association of 5′regulatory region A site of MyoG gene of quail with early growth and development
注:同行數(shù)據(jù)后不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05)。
Note: The different lowercase letters in the same row mean significant difference (P<0.05).
MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)的多態(tài)性與蛋用鵪鶉早期生長發(fā)育的關(guān)聯(lián)分析結(jié)果見表5。由于AC、CE、BD基因型個(gè)體比較少,關(guān)聯(lián)分析時(shí)未考慮這3個(gè)基因型。從表5可以看出,CC基因型體質(zhì)量顯著高于AD、AE、BB、DD基因型(P<0.05),DD基因型的體質(zhì)量最低。CC基因型脛長顯著高于AA、AD、AE、BB、DD基因型(P<0.05)。CC基因型胸寬顯著高于其他基因型(P<0.05)。CC基因型胸深顯著高于其他基因型(P<0.05)。CC基因型胸骨長顯著高于AA、AB、AD、AE、BB、DD、EE基因型(P<0.05),AA、AB、EE基因型胸骨長顯著高于AD、AE、DD基因型(P<0.05)。CC、EE基因型體長顯著高于AD、AE基因型和DD基因型(P<0.05)。
表5 MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)與鵪鶉早期生長性能的關(guān)聯(lián)分析Tab.5 Association of 5′ regulatory region B site of MyoG gene of quail with early growth and development
注:同列數(shù)據(jù)后不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05)。
Note:The different lowercase letters in the same column mean significant difference(P<0.05).
在禽類研究中,趙忠海等[11]在三穗鴨MyoG基因的外顯子1、2、3中分別發(fā)現(xiàn)了1個(gè)、2個(gè)和3個(gè)突變位點(diǎn)。王瓊[12]在肉雞的MyoG5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了1個(gè)突變位點(diǎn),共3種基因型,B位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了3個(gè)SNPs位點(diǎn),共6種基因型。魏岳等[13]在邊雞的MyoG基因第3外顯子中發(fā)現(xiàn)了2處突變位點(diǎn),共6種基因型。唐瑩等[14]在京海黃雞的MyoG基因外顯子1上共發(fā)現(xiàn)了3種基因型。可見,MyoG基因在禽類中存在豐富的多態(tài)性。本研究中,使用MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)在3個(gè)品種的鵪鶉群體中進(jìn)行多態(tài)性檢測,A位點(diǎn)中出現(xiàn)了6種基因型;在B位點(diǎn)中檢測到了9種基因型??梢?,MyoG基因在鵪鶉群體中存在豐富的多態(tài)性。
關(guān)于MyoG基因與生長性能關(guān)系的研究大多集中在豬上,在禽類中也有少量的研究。在MyoG多態(tài)性與禽類生長性能關(guān)聯(lián)性的研究中,趙忠海等[11]研究發(fā)現(xiàn),MyoG基因的2種突變分別對鴨的胸肌率、體質(zhì)量和全凈膛質(zhì)量有顯著影響,其所對應(yīng)的純合子基因型 CC、GG型為優(yōu)勢基因。王瓊[12]發(fā)現(xiàn),MyoG基因?qū)﹄u的肌纖維生長發(fā)育有顯著影響。魏岳等[13]在MyoG基因上發(fā)現(xiàn)2處同義突變位點(diǎn),MyoG基因在胸肌中的表達(dá)量極顯著高于腿肌。唐瑩等[14]在京海黃雞的MyoG基因外顯子1上共發(fā)現(xiàn)了3種基因型,分別為 AA、AB、BB,BB基因型的2、4、6周齡體質(zhì)量顯著高于 AB基因型(P<0.05), BB基因型的8周齡體質(zhì)量顯著高于 AA基因型(P<0.05)。王瓊[12]在肉雞的MyoG5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)和B位點(diǎn)都發(fā)現(xiàn)了基因的多態(tài)性與肉雞的屠宰性存在顯著的相關(guān)性(P<0.05),其中B位點(diǎn)的多態(tài)性與雞的肌纖維發(fā)育存在顯著的正相關(guān)。魏岳等[13]研究發(fā)現(xiàn),MyoG基因的多態(tài)性對邊雞生長發(fā)育性能和屠宰性能表現(xiàn)出顯著或極顯著的影響(P<0.05或P<0.01)。唐瑩等[14]研究發(fā)現(xiàn),MyoG基因外顯子1的多態(tài)性與京海黃雞早期生長發(fā)育性能存在顯著的相關(guān)性(P<0.05)。
在MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A位點(diǎn)的多態(tài)性與鵪鶉生長性能關(guān)聯(lián)的研究中,AB基因型的蛋用鵪鶉在體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長等早期生長發(fā)育性狀上都顯著性高于AA、AC和CC基因型(P<0.05)。在MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)的多態(tài)性與鵪鶉生長性能關(guān)聯(lián)的研究中,蛋用鵪鶉在體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長、等多個(gè)早期生長發(fā)育性狀上都出現(xiàn)了顯著性差異(P<0.05)。MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)的多態(tài)性與鵪鶉早期生長發(fā)育性能存在關(guān)聯(lián)性,這與王瓊[12]、魏岳等[13]、唐瑩等[14]的研究結(jié)果相似。早期生長性能與MyoG基因5′調(diào)控區(qū)B位點(diǎn)的多態(tài)性存在關(guān)聯(lián),但由于基因型較多,還不能確定優(yōu)勢基因型,需要后續(xù)進(jìn)一步研究。綜上,MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)關(guān)聯(lián)分析顯示,不同基因型與早期蛋用鵪鶉的體質(zhì)量、脛長、胸寬、胸深、胸骨長、體長存在關(guān)聯(lián)性,且差異顯著(P<0.05),說明MyoG基因5′調(diào)控區(qū)A、B位點(diǎn)對鵪鶉的早期生長性能有一定影響。