鄧 楠,樊姝寧,徐 甜,程發(fā)峰,王雪茜,王慶國
(北京中醫(yī)藥大學,北京 100029)
非酒精性脂肪肝(NAFLD)是指以除外酒精和其他明確的損肝因素所致的肝細胞內(nèi)脂肪過度沉積為主要特征的臨床病理綜合征,與肥胖、高血糖、高脂血癥關系密切,是造成慢性肝病、肝功能異常的主要原因之一[1]。目前全球流行病學調(diào)查表明,NAFLD在全球的發(fā)病率為10%~30%,亞洲國家平均為11%~16%,中國的患病率約15%,且逐步呈低齡化趨勢[2-3]。盡管近年來NAFLD的發(fā)病率持續(xù)增加,但臨床上仍缺乏公認的對NAFLD具有明顯療效的藥物治療。目前的主要治療方法是以調(diào)節(jié)血脂作為輔助治療,同時改變生活方式、健康飲食和規(guī)律運動,從而促進脂肪減少以減緩NAFLD病程進展,然而效果并不理想[4]。
中醫(yī)藥治療NAFLD結合辨證與辨病的特點,治療方法多樣,在一定程度上可以有效阻止病情的發(fā)展。紅花為菊科植物紅花的干燥花,性溫,味辛,歸心、肝經(jīng),具有活血通經(jīng),祛瘀止痛的功效。實驗研究表明紅花注射液的使用提高了高脂血癥的治療有效率,縮短了治療時間[5]。同時,紅花提取物可以降低血漿黏度,減少氧自由基,降低脂蛋白對血管內(nèi)皮細胞損傷程度從而提高其抗氧化能力[6]。表明紅花具有降血脂、減輕氧化應激的作用。因此,筆者推論紅花可以治療NAFLD。研究利用網(wǎng)絡藥理學研究方法,篩選出紅花的活性成分,挖掘出其治療NAFLD的多靶點與多通路,為闡明紅花治療NAFLD提供參考。
1.1 紅花所含化學成分的收集與篩選 本研究采用中藥系統(tǒng)藥理數(shù)據(jù)庫和分析平臺TCMSP(http://lsp.nwu.edu.cn/tcmsp.php),以“紅花”為關鍵詞,檢索紅花的化學成分共計189個。生物利用度是藥物吸收、分布、代謝、排泄(ADME)特性中最重要的藥物代謝動力學參數(shù)之一。口服是中藥在胃腸道發(fā)揮作用的最主要途徑,因此本研究主要以紅花中化合物口服生物利用度篩選閾值均≥30%,化合物類藥性篩選閾值均≥0.18,以此得到符合條件的候選化合物。
1.2 紅花靶點預測 基于TCMSP數(shù)據(jù)庫結果,通過蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(http://www.uniprot.org/)獲得與化合物相對應的化學結構式,利用Swiss靶點預測數(shù)據(jù)庫(http://swisstargetprediction.ch/)找到該化合物的預測靶點。
1.3 挖掘已知的NAFLD相關靶點 從目前可用的DisGeNET數(shù)據(jù)庫(http://www.disgenet.org/2019版v6.0)和 OMIM 數(shù)據(jù)庫(https://omim.org/)中,以“非酒精性脂肪肝”為關鍵詞,獲取NAFLD的已知靶點。
1.4 GO與通路富集分析 GO分析包括:生物過程(BP)、細胞組分(CC)和分子功能(MF)。KEGG通路富集分析是描述候選靶點特征的常用方法,本研究以P<0.05作為假定值,利用數(shù)據(jù)庫對GO和KEGG信號通路分析。
1.5 成分-靶點-信號通路網(wǎng)絡構建 將紅花的有效活性成分與其治療NAFLD的潛在作用靶標關系及以P<0.05的KEGG通路中前10位信號通路導入Cytoscape軟件中,構建出成分-靶點-信號通路網(wǎng)絡。
2.1 紅花的活性化合物 通過TCMSP數(shù)據(jù)庫中獲取紅花中OB≥30%,DL≥0.18的化合物共18個。見表1。
表1 紅花的主要活性成分Tab.1 Main active components of Carthamus tinctorius
2.2 紅花與NAFLD交集靶點 根據(jù)篩選出的紅花預測靶點及已知NAFLD靶點,利用omicshare軟件畫出維恩圖,分析出交集靶點38個。見圖1。
2.3 蛋白交互關系網(wǎng)絡構建 利用STRING軟件構建了紅花治療NAFLD交互靶點間的蛋白關系網(wǎng)絡。網(wǎng)絡包含38個蛋白質(zhì)節(jié)點,140條相互作用關系(連線)。見圖2。
圖1 紅花和NAFLD交互的38個常見靶點Fig.1 The 38 common targets for interaction between Carthamus tinctorius and nonalcoholic fatty liver disease
圖2 基于STRING的藥物-疾病靶標相互作用圖Fig.2 Drug-disease target interaction map based on STRING treatment of nonalcoholic fatty liver disease
2.4 GO富集結果分析 利用DAVID數(shù)據(jù)庫,將交互靶點的GO生物過程富集分析結果按照P由低到高排序,選擇排名前10的數(shù)據(jù)結果,得到生物過程結果如圖3A所示:分別為RNA聚合酶Ⅱ啟動子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、RNA聚合酶Ⅱ啟動子的轉(zhuǎn)錄起始、類固醇激素介導的信號通路、蛋白質(zhì)磷酸化的正調(diào)控、一氧化氮生物合成過程的正向調(diào)控、RNA聚合酶Ⅱ啟動子轉(zhuǎn)錄的負調(diào)控、調(diào)控細胞增殖、蛋白質(zhì)磷酸化、膽固醇儲存負調(diào)控、細胞內(nèi)受體信號通路。細胞成分的分析結果如圖3B所示,靶點主要涉及核、細胞質(zhì)、質(zhì)膜、受體和胞漿等。分子功能如圖3C所示,靶點主要涉及類固醇激素受體活性、藥物結合、酶結合、鋅離子結合、蛋白質(zhì)結合、鐵離子結合、受體結合等。
圖3 對交互的基因進行GO分析Fig.3 GO analysis of interacting genes
2.5 紅花成分-靶點-信號通路網(wǎng)絡 該網(wǎng)絡共包括節(jié)點61個,邊134條。不同節(jié)點有不同的意義,其中菱形節(jié)點代表活性成分,正方形節(jié)點代表作用交集靶標,圓形代表信號通路,而邊則代表成分、靶標及信號通路的關系。不同靶標可對應相同的活性成分及信號通路,同一靶標也可與不同的活性成分及信號通路相對應,可見紅花治療NAFLD具有多成分、多靶點、多信號通路的特點。見圖4。
2.6 KEGG通路富集分析 將基因名稱導入DAVID數(shù)據(jù)庫,構建KEGG通路富集分析,以P<0.05判斷具有顯著性進行篩選,共獲得33條富集通路,其中前10條KEGG通路分別為胰島素抵抗、PPAR信號通路、脂肪細胞因子信號通路、泌乳素信號通路、丙型肝炎、NAFLD、甲型流感、弓形蟲病、血清素的神經(jīng)突觸、AMPK信號通路。見圖5。表明紅花的有效成分可能通過作用以上通路來治療NAFLD。根據(jù)以上分析,基于P值,選擇胰島素抵抗通路進一步了解紅花治療NAFLD的可能性。概念圖包含了胰島素抵抗通路中紅花的靶點和NAFLD靶點,基于這些數(shù)據(jù),假設紅花通過調(diào)節(jié)胰島素抵抗通路治療NAFLD。概念圖見圖6。
圖4 紅花成分-靶點-信號通路網(wǎng)絡Fig.4 Carthamus tinctorius constituents-target-signal pathway network
圖5 活性靶點KEGG代謝通路氣泡圖Fig.5 Bubble diagram of active target KEGG metabolic pathway
中醫(yī)藥治療NAFLD的優(yōu)勢已逐漸顯現(xiàn),單味藥或諸藥合用都能調(diào)節(jié)肝臟脂質(zhì)代謝,促進吸收和排泄,且可避免長期服用西藥帶來的不良反應。紅花具有明顯的降脂、抗氧化的作用,且能有效治療高脂血癥。
研究采用網(wǎng)絡藥理學方法,通過TCMSP數(shù)據(jù)庫共發(fā)現(xiàn)紅花化學成分189個,進一步篩選獲得主要活性成分18個,為紅花的研究提供了更多可能性。
圖6 紅花在胰島素抵抗通路中的KEGG富集分析Fig.6 KEGG enrichment analysis of Carthamus tinctorius in insulin resistance pathway
通過構建靶點維恩圖,共獲得紅花治療酒精性脂肪肝相關靶點38個。分析交集靶點KEGG通路富集得到P<0.05通路共33條,其中胰島素抵抗通路P值最小,富集靶點最多,分別為Akt,PPARA,TNF-α,GSK3B,PTP1B,INSR,CPT1A,LXR-α,提示紅花最有可能通過調(diào)節(jié)胰島素抵抗通路治療NAFLD。其中,Akt磷酸化減少,可以降低下游葡萄糖轉(zhuǎn)運蛋白4(GLUT4)表達,抑制葡萄糖的跨膜轉(zhuǎn)運,增加胰島素抵抗[7]。PPARA能有效誘導脂肪酸攝取、細胞內(nèi)脂肪酸活化與結合、脂肪酸延伸和去飽和、三酰甘油(TG)和脂滴的形成與分解等多種脂質(zhì)代謝途徑的基因表達[8]。TNF-α是胰島素抵抗調(diào)節(jié)過程中的重要因子,加快脂肪細胞分解,釋放大量游離脂肪酸(FFA)的同時抑制脂質(zhì)轉(zhuǎn)運,導致肝臟脂質(zhì)積累,從而誘發(fā)NAFLD。TNF-α促進釋放的FFA可以介導胰島素抵抗,反之胰島素抵抗與NAFLD的發(fā)生發(fā)展會導致FFA的升高,而FFA又可促使TNF-α升高,從而加重胰島素抵抗和NAFLD[9]。GSK3B是P13K/AKT通路的一個主要基質(zhì),胰島素刺激的AKT磷酸化GSK3B絲氨酸,從而使GSK3B失活,而GSK3B活性降低導致糖原合成酶磷酸化水平降低,從而導致糖原合成酶活性升高,糖原合成增加[10]。PTP1B在胰島素抵抗(IR)發(fā)生時表達顯著升高,通過作用于胰島素受體及其底物,減弱或終止胰島素信號傳導,產(chǎn)生IR[11]。CPT1A對脂肪細胞中的游離脂肪酸誘導的IR起保護作用,且可以抑制JNK因子從而阻斷游離脂肪酸引起的IR效應及炎癥反應。同時CPT1A表達增加可顯著降低TG的含量[12-13]。LXR-α可以激活脂肪細胞生成大量超過體內(nèi)代謝能力的脂肪酸,導致脂肪堆積于肝臟引起肝細胞脂肪變性[14]。
西醫(yī)學研究認為IR、氧化應激及脂質(zhì)過氧化可能是NAFLD發(fā)病過程中的重要環(huán)節(jié)?!岸未驌簟睂W說認為IR是引起肝細胞脂質(zhì)積累并誘導機體對內(nèi)源性損害因子敏感性增加從而導致NAFLD的第一次打擊[15]。因此IR是NAFLD的主要致病機制,是脂肪變性向脂肪性肝炎、肝硬化發(fā)展的觸發(fā)因素并貫穿該病全過程[16]。它減弱胰島素對脂肪代謝的調(diào)節(jié),脂肪組織分解加強,促進游離脂肪酸在肝細胞內(nèi)的沉積,導致肝細胞線粒體氧化超載,加重脂肪變性[17]。此外,增多的游離脂肪酸通過抑制胰島素信號傳導,減少胰島素清除,從而加重IR[18]?;诩t花對IR通路的調(diào)節(jié)作用及IR通路在NAFLD發(fā)病機制中的重要作用,提示了紅花治療NAFLD的可能性。
研究通過網(wǎng)絡藥理學研究策略對紅花進行化學成分數(shù)據(jù)庫構建、靶點預測,為紅花的進一步研究提供了更多可能性。構建了紅花成分-靶點-信號通路圖,展示了紅花治療NAFLD具有多成分、多靶點、多信號通路的特點。分析了GO生物過程和KEGG通路富集,提示紅花治療NAFLD的作用可能與胰島素抵抗相關。對全面、深入探索紅花治療NAFLD的可能性具有重要的參考意義。研究僅是借用網(wǎng)絡藥理學的方法對紅花治療NAFLD進行了數(shù)據(jù)庫的分析研究,其研究結果仍需要進一步的實驗驗證。