李常紅,趙寒冬,程云云,郝林琳,滕肇慧 (.白城師范學(xué)院 生命科學(xué)學(xué)院,吉林 白城7000;.長春農(nóng)業(yè)博覽園 吉林 長春07;.吉林大學(xué) 動(dòng)物科學(xué)學(xué)院 長春0000;4.大連摩格生物科技有限公司 遼寧 大連

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動(dòng)物的生長是一個(gè)復(fù)雜的生物代謝過程,受多種因素的影響,包括環(huán)境變化、營養(yǎng)供給、遺傳基因、激素調(diào)節(jié)等。各種因素對生長的調(diào)節(jié)最終是通過下丘腦-垂體-胰島素樣生長因子1(insulin-like growth factor 1,IGF1)生長軸來調(diào)控實(shí)現(xiàn)的[1-3]。據(jù)報(bào)道GH 是1種由垂體合成分泌的單一肽類激素,其呈脈沖式釋放后主要與肝細(xì)胞表面的GHR 結(jié)合,經(jīng)過JAK2/STAT5途徑激活下游信號傳導(dǎo)和靶基因轉(zhuǎn)錄[4],產(chǎn)生IGF1。IGF1與IGF1R 結(jié)合后通過多種信號通路而發(fā)揮促進(jìn)生長和調(diào)節(jié)代謝的作用。

microRNAs(miRNAs)作為一類在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)節(jié)靶基因表達(dá)的非編碼小RNA 分子,在動(dòng)物體內(nèi)主要是通過靶向m RNA 的3′UTR 發(fā)揮作用。它們通過這種方式參與調(diào)控大量生物功能和進(jìn)程,如發(fā)育、分化、代謝、生長、增殖和細(xì)胞凋亡,近年來它們成為分子和細(xì)胞生物學(xué)領(lǐng)域研究的熱點(diǎn)。miRNAs的研究在各領(lǐng)域都取得了重要的進(jìn)展,人們對miRNAs的研究也更加深入。哺乳動(dòng)物miRNAs的研究已經(jīng)涉及多個(gè)組織/器官,關(guān)于垂體miRNAs的研究也取得了一些重要進(jìn)展。

研究表明,大量非編碼RNAs參與調(diào)控IGFs的表達(dá)進(jìn)而影響機(jī)體生理和病理效應(yīng)。LIU 等[5]研究發(fā)現(xiàn),出生后70 d豬肝臟中IGF1的表達(dá)水平是胚胎70 d時(shí)的26.6倍,并從miRNA 調(diào)控方面探討了豬不同發(fā)育階段肝源性IGF1差異表達(dá)的原因,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-18b 和miR-130b-3p 可能是導(dǎo)致IGF1在不同發(fā)育階段肝臟中表達(dá)差異的部分原因。KAMRAN 等[6]證實(shí)在青少年時(shí)期,miR-29的高表達(dá)降低了多種促進(jìn)生長基因(包括肝臟IGF1)的表達(dá),從而導(dǎo)致生長發(fā)育緩慢。IGF1 是肝細(xì)胞癌中的1個(gè)關(guān)鍵基因,也是肝癌組織與正常組織相比上調(diào)最多的基因之一,miR-379通過靶向其受體基因IGF1R并抑制其表達(dá),促進(jìn)肝癌細(xì)胞的凋亡[7]。研究發(fā)現(xiàn)miR-511通過靶向豬IGF1基因,降低IGF1表達(dá)水平及相關(guān)通路因子(MAPK/ERK 及PI3K/Akt)的表達(dá),并抑制PK-15細(xì)胞的增殖、促進(jìn)其凋亡[8]。大量研究表明垂體中miRNAs與動(dòng)物生長調(diào)控密切相關(guān),ZHANG 等[9]通過microarray檢測了大鼠垂體中的miRNAs,其中miR-709在大鼠垂體中高表達(dá)且可能參與生長調(diào)控過程。因此,本研究旨在明確垂體miR-709 與關(guān)鍵生長調(diào)控因子IGF1的靶向關(guān)系及對IGF1基因表達(dá)的影響。

1 材料與方法

1.1 細(xì)胞系所用HEK-293T 細(xì)胞系由吉林大學(xué)李占軍教授饋贈(zèng),大鼠肝癌細(xì)胞H4-Ⅱ-E 為本實(shí)驗(yàn)室保存細(xì)胞系。

1.2 菌株及載體所用E.coli感受態(tài)細(xì)胞為DH5α,所用載體為psi-CHECKTM-2雙熒光素酶報(bào)告基因表達(dá)載體,由吉林大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院歐陽紅生課題組饋贈(zèng)。

1.3 主要試驗(yàn)儀器、試劑及耗材所用主要儀器列表如表1所示。

表1 主要試驗(yàn)儀器

限制性內(nèi)切酶NotI(Ta KaRa)、XhoⅠ(Ta Ka-Ra),T4DNA 連接酶(TaKaRa),酵母提取物(OXOID),胰蛋白胨(OXOID),瓊脂粉(OXOID),NaCl(北京化工),氨芐青霉素,Fu GENE?HD 轉(zhuǎn)染試劑(PROMEGA),F12K 細(xì)胞培養(yǎng)基(GIBCO),Opti-MEM 培養(yǎng) 基(GIBCO),胎 牛 血 清(MCE),0.25%胰酶(GIBCO),PBS(博士德),谷氨酰胺(GIBCO),青鏈霉素雙抗(GIBCO),丙烯酰胺(北京化工),N,N-亞甲基雙丙烯酰胺(北京化工),過硫酸銨(北京化工),鹽酸(北京化工),TEMED(BIOSHARP),甲醇(北京化工),蛋白酶抑制劑Cocktail(MCE),磷酸酶抑制劑Cocktail(MCE),無水乙醇(北京化工),雙熒光素酶檢測試劑盒(PROMEGA),無內(nèi)毒素質(zhì)粒小提試劑盒(Promega),凝膠回收試劑盒(天根),TRIzol(Ta KaRa),反轉(zhuǎn)錄試劑盒(Ta KaRa),熒光定量試劑盒(Ta KaRa)。試驗(yàn)所用離心管,移液吸頭,細(xì)胞培養(yǎng)皿及細(xì)胞培養(yǎng)板等耗材均為BIOSHARP品牌。

1.4 細(xì)胞培養(yǎng)基配制H4-Ⅱ-E 細(xì)胞及HEK-293T 細(xì)胞培養(yǎng)基配制體系(表2)。

表2 H4-Ⅱ-E細(xì)胞及HEK-293T 細(xì)胞培養(yǎng)基配方

1.5 miRNAs合成所研究的miR-709 mimic序列(表3)由蘇州吉瑪生物公司合成,其中包括所用到的mimic的陰性對照(NC)。

表3 miR-709及NC的核苷酸序列

1.6 靶基因預(yù)測及載體構(gòu)建采用在線軟件TargetScan(http://www.targetscan.org)對miR-709的潛在靶基因進(jìn)行預(yù)測,采用mfold(http://unafold.rna.albany.edu)對miR-709 與IGF1 基 因3′UTR 互補(bǔ)配對形成的RNA 二級結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測。

為了檢測目標(biāo)miRNA 與潛在靶基因的靶關(guān)系,本試驗(yàn)構(gòu)建了大鼠IGF1基因野生型(WT)、突變型(MUT)及刪除型(DEL)3′UTR 雙熒光素酶報(bào)告基因表達(dá)載體。首先合成了IGF1 基因的3′UTR 序列及對應(yīng)的miR-709結(jié)合靶點(diǎn)突變及刪除的3′UTR 序列,然后將其插入到psiCHECKTM-2的XhoⅠ和NotⅠ限制性內(nèi)切酶酶切位點(diǎn)中間形成IGF1-3′UTR-WT、IGF1-3′UTR-MUT 和IGF1-3′UTR-DEL重組載體。

載體構(gòu)建過程簡述如下:psiCHECKTM-2 載體經(jīng)XhoⅠ和NotⅠ限制性內(nèi)切酶雙酶切,酶切體系如表4所示,采用凝膠回收試劑盒進(jìn)行回收,并分別用T4連接酶與合成的IGF1 基因3′UTR 片段在16℃條件下過夜連接,連接體系如表5所示,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,挑取單菌落,采用菌液PCR 法和測序法對連接產(chǎn)物進(jìn)行鑒定。

1.7 無內(nèi)毒素質(zhì)粒提取及細(xì)胞轉(zhuǎn)染將轉(zhuǎn)化了IGF1基因3′UTR 重組載體的大腸桿菌于37℃擴(kuò)大培養(yǎng)后,采用無內(nèi)毒素質(zhì)粒提取試劑盒提取質(zhì)粒,測定質(zhì)粒濃度后保存于－80℃?zhèn)溆谩?/p>

本試驗(yàn)中的細(xì)胞轉(zhuǎn)染包括miRNA 的轉(zhuǎn)染和miRNA 與雙熒光素酶表達(dá)載體的共轉(zhuǎn)染。為了驗(yàn)證目標(biāo)miR-709 與IGF1 基因的靶關(guān)系,將miRNAs與構(gòu)建好的雙熒光素酶表達(dá)載體共同轉(zhuǎn)染至HEK-293T 細(xì)胞中,48 h后通過檢測螢火蟲熒光素酶及海腎熒光素酶的活性來確定miR-709與IGF1基因的靶關(guān)系;為了檢測miR-709對IGF1表達(dá)的影響,將miR-709 轉(zhuǎn)染至大鼠肝癌細(xì)胞H4-Ⅱ-E中,48 h后收集細(xì)胞進(jìn)行總RNA 及總蛋白質(zhì)的提取。

表4 載體雙酶切體系

表5 目的片段與載體連接體系

1.8 雙熒光素酶活性檢測提前1 d 將4×104cells/well的HEK-293T 細(xì)胞接種于96孔細(xì)胞培養(yǎng)板,細(xì)胞轉(zhuǎn)染之前使用100μL 新鮮的DMEM培養(yǎng)基漂洗細(xì)胞1次,并加入80μL DMEM 培養(yǎng)基預(yù)處理細(xì)胞2 h。psiCHECKTM-2重組質(zhì)粒與miRNAs分別共轉(zhuǎn)染HEK-293T 細(xì)胞,48 h 后按照雙熒光素酶活性檢測試劑盒說明書分別于多功能酶標(biāo)儀檢測螢火蟲熒光素酶活性及海腎熒光素酶的活性。

1.9 總RNA提取、RNA反轉(zhuǎn)錄及q RT-PCR本試驗(yàn)采用TRIzol進(jìn)行RNA 的提取,即將收集的轉(zhuǎn)染后細(xì)胞加入至500～1 000μL TRIzol中,室溫裂解10 min后,加入0.2倍TRIzol體積的氯仿進(jìn)行萃取顛倒混勻,室溫靜置10 min后于4℃離心機(jī)中離心10 min,取上清加入0.5倍TRIzol體積的異丙醇進(jìn)行RNA 的沉淀,室溫靜置5 min后于4℃離心機(jī)中離心10 min,棄掉上清后然后用75%的酒精洗滌沉淀,晾干,加入40μL無RNA 酶dd H2O 進(jìn)行溶解,測定濃度后對其進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。

對于miR-709,采用特異性頸環(huán)結(jié)構(gòu)引物RT primer(表6)對所得總RNA 進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄;對于m RNA,則采用Oligod T 反轉(zhuǎn)錄引物進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。qRT-PCR 結(jié)果采用2－ΔCt法進(jìn)行分析,β-actin和U6分別作為IGF1和miR-709的內(nèi)參基因。

表6 反轉(zhuǎn)錄及qRT-PCR 引物

以反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA 為模板,以miR-709、U6、IGF1及β-actin(表6)為引物,以SYBR?Green為染料,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR。根據(jù)Power SYBR?Green PCR 說明書加反應(yīng)體系:cDNA:2.0μL,2× Master Mix 10.0μL,上、下游引物各0.5μL,dd H2O:7.0μL。反應(yīng)程序:95℃3 min;95℃15 s,57℃15 s,72℃20 s,40 個(gè)循環(huán),在72℃采集熒光信號;溶解曲線程序:55℃,30 s,81個(gè)循環(huán)。

1.10 總蛋白質(zhì)提取及濃度測定細(xì)胞轉(zhuǎn)染48 h后采用Western blot及IP裂解液進(jìn)行裂解,將細(xì)胞碎片離心后取上清;采用BCA 試劑盒對所提取的總蛋白質(zhì)濃度進(jìn)行測定。

1.11 Western blot檢測在15%濃度SDS-PAGE分離膠上對總蛋白進(jìn)行分離,經(jīng)過轉(zhuǎn)膜、封閉,然后于4℃進(jìn)行IGF1和β-actin一抗過夜孵育及室溫進(jìn)行辣根過氧化物酶標(biāo)記的羊抗兔二抗孵育2 h后在多功能分子成像系統(tǒng)中進(jìn)行成像。

1.12 數(shù)據(jù)分析采用SPSS17.0進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,對于組間miR-709及IGF1表達(dá)水平差異采用單因素方差(ANOVA)分析,?表示P＜0.05為差異顯著,??表示P＜0.01為差異極顯著。

2 結(jié)果

2.1 miRNA mimic轉(zhuǎn)染效率及miR-709表達(dá)量檢測為了檢測miRNA 在細(xì)胞中的轉(zhuǎn)染效率,我們將FAM 標(biāo)記的NC mimic轉(zhuǎn)染至HEK-293T 細(xì)胞中,12 h 后在熒光顯微鏡下對其轉(zhuǎn)染效率進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示,miRNA 在細(xì)胞中的轉(zhuǎn)染效率較高(圖1A,B),能夠滿足試驗(yàn)要求。然后為了進(jìn)一步確定miR-709在大鼠肝臟細(xì)胞H4-Ⅱ-E 中的轉(zhuǎn)染效率,本試驗(yàn)在轉(zhuǎn)染miR-709 mimic及NC mimic 48 h后采用qRT-PCR 法對miR-709的表達(dá)量進(jìn)行檢測,結(jié)果顯示miR-709 mimic組細(xì)胞中miR-709的表達(dá)量極顯著高于對照組(圖1C)(P＜0.01)。

圖1 miRNA 轉(zhuǎn)染效率及miR-709表達(dá)量檢測 A.miRNA在HEK-293T 細(xì)胞中的轉(zhuǎn)染效率檢測;B.陰性對照組;C.在H4-Ⅱ-E細(xì)胞中轉(zhuǎn)染miR-709 mimic后miR-709的表達(dá)量檢測

2.2 miR-709與IGF 1基因的靶關(guān)系鑒定基于生物信息學(xué)分析,miR-709的種子序列與IGF1 基因3′UTR 互補(bǔ)(圖2A),且結(jié)合形成較穩(wěn)定的二級結(jié)構(gòu)(圖2B)。IGF1基因3′UTR 的雙熒光素酶重組表達(dá)載體(IGF1-3′UTR-WT、IGF1-3′UTR-MUT和IGF1-3′UTR-DEL)與miR-709 或NC 轉(zhuǎn) 染 至HEK-293T 細(xì)胞后48 h,采用雙熒光素酶活性檢測試劑盒分別對螢火蟲熒光素酶及海腎熒光素酶的活性進(jìn)行檢測,相對熒光素酶活性結(jié)果表明miR-709直接靶向IGF1基因(圖2C)。

圖2 miR-709 靶向IGF 1 基因A.miR-709 種子序列與IGF 1基 因3′UTR 互補(bǔ)配對情況;B.miR-709 與IGF 1基因3′UTR 形成的RNA 二級結(jié)構(gòu);C.miR-709靶向IGF 1基因的雙熒光素酶活性檢測結(jié)果;1,2.IGF1-3′UTR-WT;3,4.IGF1-3′UTR-MUT;5,6.IGF1-3′UTR-DEL

2.3 miR-709 對IGF 1 基因表達(dá)量的影響明確miR-709靶向IGF1基因后,本研究進(jìn)一步將miR-709轉(zhuǎn)染至大鼠肝臟細(xì)胞H4-Ⅱ-E 中,48 h后檢測IGF1表達(dá)量。qRT-PCR 及Western blot檢測結(jié)果表明miR-709 顯著抑制了IGF1 RNA(圖3A)(P＜0.05)及蛋白質(zhì)的表達(dá)水平(圖3B,C)(P＜0.05)。

圖3 miR-709對IGF 1基因表達(dá)的影響 A.qRT-PCR 檢測miR-709 對IGF 1 基因m RNA 表達(dá)的影響;B.Western blot檢測miR-709對IGF 1基因蛋白質(zhì)表達(dá)的影響;C.Western blot檢測結(jié)果量化

3 討論

在動(dòng)物生長調(diào)控過程中,垂體發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,其作用的垂體-IGF1-靶器官生長軸中IGF1是關(guān)鍵的中心環(huán)節(jié)。在血液循環(huán)和局部組織中,絕大部分IGF1 由肝臟提供,研究人員證實(shí)過表達(dá)IGF1的小鼠與野生型小鼠相比各器官重量顯著增加,并表明IGF1參與到機(jī)體出生至青春期階段的生長,且引起各器官體積成比例地增大[10]。反之,缺乏IGF1則會(huì)導(dǎo)致病人身材相對矮小[11],而這種現(xiàn)象可通過長期用IGF1治療明顯恢復(fù)[12]。此外,缺乏IGF1的胎鼠有短肢侏儒癥,礦化延遲,慢性粒細(xì)胞凋亡增加的現(xiàn)象[13],表明IGF1的促生長作用貫穿出生前及出生后,也足以見得IGF1在動(dòng)物生長中的重要性[14]。

miRNA 是1類長度為19～24 nt的非編碼單鏈RNA,通過堿基互補(bǔ)配對的方式與靶基因的3′UTR部分或完全互補(bǔ),剪切靶基因的轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物或者抑制轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的翻譯,從而起到轉(zhuǎn)錄后調(diào)控靶基因表達(dá)的作用。研究表明miRNA 與動(dòng)物生長密切相關(guān),表現(xiàn)為在肌肉發(fā)育的各個(gè)環(huán)節(jié)具有重要的調(diào)節(jié)作用,以及涉及骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞的遷移、增殖、分化和凋亡,成肌細(xì)胞的分化和肌管融合,肌纖維類型轉(zhuǎn)換等多個(gè)生物學(xué)過程[15]。目前已經(jīng)在牛、豬、羊等家畜中鑒定到多個(gè)參與骨骼肌發(fā)育的 miRNAs[16-17]。近年來,組織/器官間的信息交流也逐漸成為研究熱點(diǎn),例如非編碼RNA 可能通過外泌體等介質(zhì)進(jìn)行組織間的調(diào)控[18-19]。隨著處于生長軸中心的垂體組織中miRNAs逐漸被挖掘,垂體miRNA 的功能也相繼被報(bào)道[20-24]。miRNA 在細(xì)胞之間以及組織之間的表達(dá)具有特異性。有研究證實(shí)miRNA 在某一組織中的特異性高表達(dá)往往與該組織的一些典型功能相關(guān)。其中大鼠垂體中miR-7是表達(dá)量最高的miRNA,其可能參與到FSH 的表達(dá)調(diào)控,與動(dòng)物繁殖性能相關(guān)[25-27]。而目前對于大鼠垂體中第二高表達(dá)的miR-709的功能研究較少,基于ZHANG 等[9]的研究結(jié)果可以推斷miR-709可能參與動(dòng)物的生長調(diào)控。因此,本研究基于生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn)miR-709 可能靶向關(guān)鍵生長因子IGF1基因。

本研究通過雙熒光素酶報(bào)告系統(tǒng)及IGF1表達(dá)量檢測證實(shí)了miR-709 與IGF1 基因的靶關(guān)系及miR-709對IGF1表達(dá)量的抑制作用。試驗(yàn)結(jié)果表明H4-Ⅱ-E細(xì)胞中表達(dá)較低含量的IGF1,猜測原因可能是此細(xì)胞為大鼠肝癌細(xì)胞,屬于肝臟受損細(xì)胞,因細(xì)胞功能缺失而導(dǎo)致的IGF1表達(dá)量較低。miR-709是在大鼠垂體組織中高表達(dá)的miRNA,IGF1在垂體GH 的合成中扮演的是負(fù)反饋調(diào)控因子。因此,推測miR-709 在調(diào)控垂體GH-IGF1 軸發(fā)揮的可能是平衡的作用,即維持垂體GH 表達(dá)的穩(wěn)定性。