2020年2月13日,墨爾本大學(xué) Ute Roessner教授課題組在Plant Communications上在線發(fā)表題為“Integrative Multi-Omics Analyses of Barley Rootzones Under Salinity Stress Reveal Two Distinctive Salt Tolerance Mechanisms”的研究論文。
一樣的植物物種必然依頼相同的機(jī)制來(lái)扺御根外的高鹽度脅迫嗎?只要是同物種,不同的農(nóng)作物基因型亦可以倚賴同樣的生物基因工程或雜交方式來(lái)提高其耐鹽能力嗎?墨爾本大學(xué)的一隊(duì)硏究小組對(duì)以上的問題進(jìn)行了間接驗(yàn)證。
在本篇硏究中,小組檢測(cè)了在鹽脅迫下幼苗根部生長(zhǎng)擁有相當(dāng)大區(qū)別的兩個(gè)大麥物種:馴化品種(Clipper)和地方品種(Sahara)的多重組學(xué)(轉(zhuǎn)錄組,代謝組,脂質(zhì)組)變化。同時(shí),小組亦設(shè)計(jì)了新型的廣義線性數(shù)學(xué)模型,以確定對(duì)鹽處理丶基因型丶及根區(qū)(包括發(fā)育區(qū)Z1,伸展區(qū)Z2,以及成熟區(qū)Z3)的特有差異基因表達(dá)(DEG)和特有差異代謝物或脂質(zhì)含量(DAM)。基于DEG和DAM的統(tǒng)計(jì)學(xué)過(guò)度表現(xiàn)分析(statistical over-representation analysis)指出,苯丙烷類生物合成(phenylpropanoid biosynthesis)是所有觀察到的根部鹽度反應(yīng)當(dāng)中最具統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性的。而與多重組學(xué)整合分析一致的是,組織學(xué)證據(jù)亦指出僅在Clipper Z2的硬壁細(xì)胞壁上發(fā)現(xiàn)了強(qiáng)烈的鹽誘導(dǎo)木質(zhì)素(lignin)浸漬,而整個(gè)Sahara Z2的木脂蛋白(suberin)沉積亦檢測(cè)出獨(dú)特的含量提升。這項(xiàng)發(fā)現(xiàn)表明了基因型之間有著兩種不同的鹽誘導(dǎo)質(zhì)外體流動(dòng)的調(diào)節(jié)。再者,根據(jù)植物系統(tǒng)層面的表達(dá)相關(guān)網(wǎng)絡(luò)分析(global coexpression correlation analysis)與組織學(xué)化合物定位分析發(fā)現(xiàn),Clipper所有根區(qū)內(nèi)負(fù)責(zé)控制共生質(zhì)流動(dòng)的胼胝質(zhì)(callose)沉積量幾乎與鹽度無(wú)關(guān),而在Sahara根區(qū)當(dāng)中callose的沉積則明顯減少。
綜上所述,小組提出了Clipper(維持生長(zhǎng))和Sahara(鞏固防鹽)的兩種獨(dú)特的耐鹽性機(jī)制,為提高作物的可塑性以應(yīng)對(duì)日益惡化的全球土壤鹽堿化提供了重要的線索。同時(shí),亦為大麥根部多層組學(xué)的硏究提供了穏固的基礎(chǔ)和珍貴的硏究資源。