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香爐山雞隱性白羽鑒定分析

2020-03-08 03:35李興才潘成勇楊華婷
中國畜牧雜志 2020年2期
關鍵詞:山雞白羽香爐

李興才,潘成勇,李 輝*,楊華婷,陳 林

(1.貴州大學動物科學學院,高原山地動物遺傳育種與繁殖教育部重點實驗室,貴州貴陽 550025;2.貴州大學貴州省動物遺傳育種與繁殖重點實驗室,貴州貴陽 550025;3.凱里鳳凰苑畜牧養(yǎng)殖有限公司,貴州凱里 556000)

雞的羽毛顏色受多個等位基因控制,目前已經發(fā)現(xiàn)存在5 對等位基因,分別為抑制色素形成基因I、色素原基因C、氧化酶基因O、抑制色素表現(xiàn)基因P以及非白化基因A,其中只有I基因和C基因已分別被定位于PMEL17與TYR基因上,其他基因未見報道[1]。I基因存在時,無論其他基因是否顯隱性都表現(xiàn)為白羽型,因此通常被稱為顯性白羽;隱性白羽情況比較復雜,但目前為止對于C基因控制的白羽研究比較多,因此由C基因控制的白羽通常稱為隱性白羽。Kerje 等[2]研究發(fā)現(xiàn),PMEL17基因第十外顯子區(qū)域插入了一段9 bp 的核苷酸序列導致黑色素基因非正常轉錄翻譯,引起顯性白羽產生。Chang 等[3]研究得出TYR(絡氨酸酶基因)第四內含子區(qū)域插入了一段長7.7 kp 的內源性白血病病毒ALV 序列,導致TYR基因轉錄物中缺少第五外顯子編碼的跨膜結構域而無法正常轉錄,從而使絡氨酸酶失去正常功能活性,致使黑色素無法合成,導致隱性白羽形成。中國消費者對雞羽毛顏色具有一定偏好,認為白色是一種不吉利的顏色,因此本研究對雞群白羽與有色羽鑒定具有一定的研究價值。

香爐山雞系貴州省凱里地區(qū)苗族人民從中原遷徙到西南后,在香爐山區(qū)域長期封閉的自然條件下形成的原始類群,主要分布于貴州省黔東南凱里、麻江、黃平、丹寨等縣。香爐山雞體型矮小、結實緊湊、結構勻稱,具有耐粗飼、抗逆性強、無應激、抗病能力強、營養(yǎng)豐富、肉質鮮美等特點[4-5]。在香爐山雞群體中,有千分之二左右的白羽雞出現(xiàn),經研究分析為隱性白羽等位基因造成,其中雜合子個體表型與顯性純合子表現(xiàn)一致,但部分雜合子雞群翅膀和尾部羽毛出現(xiàn)白斑現(xiàn)象,因此凱里鳳凰苑畜牧養(yǎng)殖有限公司計劃在香爐山雞選育中剔除雜合子個體,建立麻羽和白羽2 個品系。采用傳統(tǒng)選育一般要連續(xù)幾個世代才能淘汰雜合子雞群,耗時耗力,本研究利用分子輔助標記技術對香爐山雞隱性白羽進行鑒定,成本低廉、準確度高,只需一代就能淘汰全部雜合子,能夠有效縮短育種周期,加快育種進展。本研究將為香爐山雞種質資源保護、開發(fā)與利用奠定一定的基礎。

1 材料與方法

1.1 實驗動物 本實驗選用的香爐山雞來自貴州省黔東南州凱里市鳳凰苑畜禽養(yǎng)殖有限公司種雞擴繁場,其中有色羽60 只、白羽60 只,公母各半。使用EDTA 抗凝管翅靜脈采血,采血過程中快速顛倒混勻,置于低溫泡沫盒內帶回實驗室,-20℃保存用于總DNA 提取。

1.2 基因組DNA 提取 利用血液基因組DNA 提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)對香爐山雞基因組DNA 進行提取,紫外分光光度計檢測其濃度,OD 值在1.8~2.0 為合格。利用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測其完整性,合格DNA 樣品分裝于-20℃冰柜保存?zhèn)溆谩?/p>

1.3 引物設計及PCR 擴增 根據GenBank 發(fā)布的TYR基因第四內含子序列含ALV 插入序列結合TYR第四內含子未含插入序列作為參考,利用引物設計軟件Primer 5.0 和Oligo 6.0 進行多重PCR 引物設計。NCBI上參考序列GenBank 登錄號分別為DQ118701.1 和DQ118702.1。引物設計特點是共用同一條上游引物,總共2 對3 條引物,分別命名為F、R1、R2。引物F:5'-GGGAAACTTTAAGGACTGGTGGA-3',R1:5'-CTG GGTAGATGGACAGACCGTTG-3',R2:5'-CAAGAGG CACAAGGAGTGGGACA-3',序列送往上海英濰捷基生物有限公司進行引物合成。

PCR 擴增運用15 μL 反應體系:1 個上游和2 個下游引物(10 pmol/μL)各1 μL,(80 ng/μL)模板DNA 1 μL,2×Es Taq Master Mix 7 μL,ddH2O 4 μL。反 應 條件為:95 ℃預變性5 min;95℃變性45 s、59.2℃退火45 s、72℃延伸40 s,35 個循環(huán);72℃終延伸8 min,4℃保存。

1.4 統(tǒng)計分析 將香爐山雞隱性白羽基因PCR 擴增產物用1.0% 的瓊脂糖凝膠、130 V 電泳30min 進行檢測,用凝膠成像系統(tǒng)對檢測結果進行拍照讀取。根據鑒定結果挑選2 種純合子PCR 產物送往北京諾賽基因組研究中心有限公司進行測序驗證,應用Popgene2.1 軟件對香爐山雞鑒定結果進行平均等位基因數(Na)、有效等位基因數(Ne)、Shanon 指數、多態(tài)信息含量(PIC)、等位基因頻率、基因型頻率等計算。

2 結果

2.1 隱性白羽C 基因鑒定分析 本研究提取的DNA 經瓊脂糖凝膠電泳檢測條帶清晰明亮,無嚴重拖帶,說明提取效果較好,可以用于后續(xù)實驗。實驗利用2 對3 條F、R1、R2 引物對120 只香爐山雞隱性白羽基因型進行雙重PCR 鑒定分析。結果顯示PCR 擴增產物在1.0% 的瓊脂糖凝膠電泳檢測中產生3 種類型的條帶,其中只能夠得出169 bp 條帶的待測雞等位基因型為cc 的隱性白羽純合型,只得出526 bp 條帶的待測雞等位基因型為CC 的有色羽純合型;如果同時得出169 bp 和526 bp 2條帶的待測雞等位基因型為Cc 的有色雜合型,凝膠電泳檢測結果如圖1~5 所示。統(tǒng)計得出CC 型為56 個,占總群體46.67%;Cc 型為4 個,占3.33%;cc 為60 個,占50%。能夠成功鑒定出隱性白羽cc 型與尾部白斑雜合子Cc 型,為香爐山雞剔除雜合子建立2 個純合子雞群提供理論依據。鑒定出60 只白羽雞群全部為隱性純合,60 只有色羽樣品未出現(xiàn)隱性白羽純合基因型,與表現(xiàn)型結果一致,說明鑒定結果準確可靠。

利用Popgene 2.1 軟件對隱性白羽C 基因多態(tài)性分析得出Na 為2、Ne 為1.997 8,如表1 所示。Shannon指數為0.692 6、PIC 為0.374 7,0.25<PIC<0.50,該位點為中度多態(tài),Shannon 指數與PIC 具有一致性,說明香爐山雞隱性白羽基因多態(tài)性比較豐富,具有一定的選育空間。

3 討 論

雞的羽毛顏色性狀是消費者比較關心的質量性狀。羽毛顏色種類繁多,主要分為有色羽和白羽兩類。羽色形成過程比較復雜,受多種色素原基因控制[6],正是這樣形成了各具特色的地方品種資源。在香爐山雞選育中發(fā)現(xiàn)隱性白羽的存在,雞群白羽基因雜合子中部分出現(xiàn)翅膀和尾部白斑現(xiàn)象,為更好地保護、開發(fā)、利用這一類群,本研究采用分子輔助標記選育方法,利用多重PCR 結合瓊脂糖凝膠電泳技術,快速鑒定分離淘汰雜合子。相對于傳統(tǒng)的選育方式,該方法成本低廉、準確度高、省時省力,同時具備有效縮短育種周期、加快育種進展等優(yōu)點,有利于香爐山雞2 個核心群快速建立,防止優(yōu)良的地方種質資源流失。

隱性白羽主要是色素原基因C起主導作用,它被定位于TYR基因上。TYR是一種含銅的金屬酶,是黑色素形成的關鍵酶[7],而黑色素是否表達與隱性白羽的形成密切相關。研究證明TYR基因第四內含子區(qū)域插入內源性白血病病毒ALV 序列,導致隱性白羽形成[8]。因此,本研究利用TYR基因的這一特性,合理地設計出鑒定隱形白羽的雙重PCR 引物,成功鑒定分離香爐山雞隱性白羽,同時成功淘汰該類群隱性白羽雜合子,建立麻羽與隱性白羽2 個純合群體。

表1 香爐山雞隱性白羽基因位點多態(tài)性

隱性白羽純合雞具有體格健壯、性情溫順、繁殖性能好等特點[9],用于其他品種的改良可以對繁殖性能、生長性能等方面進行改進,由于白羽對其他羽色為隱性的緣故,因此不會大面積改變改良品種羽毛顏色,只是翅膀與尾部出現(xiàn)部分白斑,因而能夠最大程度保持原品種性狀特征[10-13],因此可以嘗試將隱性白羽雞群作為其他品種的改良材料。

4 結 論

本研究通過對120 只香爐山雞隱性白羽進行鑒定分析,經雙重PCR 擴增結合瓊脂糖凝膠電泳檢測技術成功鑒定隱性白羽基因型,將香爐山雞雜合子雞淘汰,建立2 個純合雞群;對隱性白羽基因位點進行遺傳多樣性分析發(fā)現(xiàn),PIC 為0.374 7,屬于中度多態(tài),說明該品種具有一定的選育空間。

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