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革蘭陰性菌多粘菌素耐藥機(jī)制研究進(jìn)展

2020-02-17 15:26杜佳侯淵博
關(guān)鍵詞:克雷伯質(zhì)粒異質(zhì)性

杜佳,侯淵博

(1 中國科學(xué)院腫瘤與基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所,中國科學(xué)院大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院檢驗(yàn)科,浙江省腫瘤醫(yī)院檢驗(yàn)科,浙江 杭州;2 浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬邵逸夫醫(yī)院檢驗(yàn)科,浙江 杭州)

1 背景介紹

近 年 來,多 重 耐 藥(multidrug-resistant, MDR)和 全 耐 藥(pan-drug-resistant, PDR)肺炎克雷伯菌、鮑曼不動桿菌和銅綠假單胞菌愈發(fā)增多,這些細(xì)菌往往攜帶碳青霉烯酶,此酶可以使絕大多數(shù)β 內(nèi)酰胺類抗菌藥物失活,并且這些細(xì)菌還攜帶可以水平轉(zhuǎn)移的耐藥質(zhì)粒,進(jìn)一步加劇了耐藥傳播[1]。針對這些耐藥細(xì)菌,目前臨床尚缺乏有效的治療措施,迫使臨床醫(yī)生選擇已摒棄使用的多粘菌素和磷霉素進(jìn)行治療,但是治療效果都不理想[2]。

體外實(shí)驗(yàn)表明MDR 細(xì)菌通常對多粘菌素表現(xiàn)敏感,但是隨著臨床用量的增加,細(xì)菌對多粘菌素的耐藥率呈逐年遞增的趨勢。目前用藥指南明確指出磷霉素只適用于治療尿路感染,這樣做的目的是可以降低耐藥率的發(fā)生[3]。由于MDR 細(xì)菌對多粘菌素非常敏感,耐藥率極低,因此多粘菌素被認(rèn)作為最后一道“防線藥物”[4]。本綜述主要針對目前多粘菌素耐藥機(jī)制及耐藥變遷做闡述。

2 多粘菌素介紹

多粘菌素是一種具有殺菌活性的陽離子肽類物質(zhì),最早于1947 年從土壤細(xì)菌Paenibacilluspolymyxa 中分離得到。目前用于臨床治療的主要是多粘菌素B 和多粘菌素E,二者在結(jié)構(gòu)上只有一個氨基酸不同,但效果卻明顯不同[5,6]。相比多粘菌素B 更為直接激進(jìn)的作用效果,多粘菌素E 反而會更溫柔遲緩一點(diǎn),毒力也較弱,因此也更多的用于臨床治療[7,8]。

多粘菌素的作用位點(diǎn)是革蘭陰性菌的外膜,與脂多糖(LPS)脂質(zhì)A 的磷酸基團(tuán)親和。具體機(jī)制為,脂質(zhì)A 帶負(fù)電荷,兩端被二價(jià)陽離子Ca2+ 和Mg2+ 包圍,多年菌素帶正電荷可以替換Ca2+ 和Mg2+ 破壞細(xì)菌外膜的穩(wěn)定性,滲透性改變、細(xì)菌內(nèi)容物流失、細(xì)菌死亡[9]。

多粘菌素除了具有良好的殺菌作用外,還具有比較嚴(yán)重的副作用,如神經(jīng)毒性和腎毒性。正是因?yàn)檫@些副作用,多粘菌素于1970 年被β 內(nèi)酰胺類、喹諾酮類和氨基糖苷類抗菌藥物替代。最近幾年由于細(xì)菌對這些藥物耐藥率愈發(fā)增高,多粘菌素又重新用于臨床。值得注意的是,多粘菌素除了臨床上使用外,一些國家在養(yǎng)殖業(yè)上存在過度使用多粘菌素的現(xiàn)象[10,11],這也是導(dǎo)致多粘菌素耐藥率增高的原因之一。

3 耐藥機(jī)制

3.1 天然耐藥

由于多粘菌素的作用位點(diǎn)是LPS,所以它的抗菌譜比較窄,其中包括大部分的革蘭陰性菌。革蘭陽性菌和一些厭氧菌外膜中沒有LPS,所以多粘菌素對這些細(xì)菌無作用。還有一些細(xì)菌如普羅威登絲菌屬、愛德華菌屬、布魯士菌屬、軍團(tuán)菌屬及摩根摩根菌等均對多粘菌素天然耐藥,原因可能是由于這些細(xì)菌基因表達(dá)的陽離子產(chǎn)物添加到LPS,導(dǎo)致細(xì)菌外膜與多粘菌素親和力下降引起[12]。

3.2 基因表達(dá)水平改變引起耐藥

多數(shù)腸桿菌科細(xì)菌、銅綠假單胞菌、鮑曼不動桿菌及嗜麥芽窄食單胞菌對多粘菌素敏感[13]。這些細(xì)菌出現(xiàn)對多粘菌素耐藥跟上述天然耐藥細(xì)菌一樣是LPS 結(jié)構(gòu)發(fā)生改變導(dǎo)致。

目前在腸桿菌科細(xì)菌中,研究最多的主要為兩種分子結(jié)構(gòu)——pEtN 和L-Are4N[10,14]。耐藥的產(chǎn)生是由于這兩種分子結(jié)構(gòu)添加到LPS 上引起細(xì)菌外膜與多粘菌素親和力下降[15]。這兩種分子是由LPS 修飾酶基因pmrC、pmrE 和pmrHFIJKLM 表達(dá)控制,這些基因的表達(dá)則受控于PmrAB 和PhoPQ 雙組分系統(tǒng)[16-18]。除此之外,mgrB 和crrAB 也參與調(diào)控,MgrB 抑制PhoPQ 的表達(dá),CrrAB 參與調(diào)控PmrAB 表達(dá)[19-22]。具體耐藥機(jī)制是由于參與調(diào)控這些信號通路中的某些基因發(fā)生突變引起,已知的有pmrA、pmrB、phoP 和phoQ 基因發(fā)生突變、mgrB 基因出現(xiàn)插入或缺失突變及crrB 基因發(fā)生突變。

在肺炎克雷伯菌中,其莢膜多糖可以阻止多粘菌素與外膜相結(jié)合[23,24]。另外一些外排泵(AcrAB 和KpnEF)的存在可以加速多粘菌素的外排,這些都可引起多粘菌素敏感性下降[25,26]。除了PmrA/PmrB 和PhoP/PhoQ TCS 外,銅綠假單胞菌中還存在ColR/ColS 和CprR/CprS TCSs 參與調(diào)控多粘菌素耐藥。在phoQ 突變菌株中如果ColR/ColS 和CprR/CprS TCSs 也發(fā)生基因突變,該菌株會出現(xiàn)高耐藥表型[27]。由此看來,ColR/ColS 和CprR/CprS TCSs與PhoP/PhoQ TCS 可能存在交叉作用,colR/colS 和cprR/cprS 基因增強(qiáng)了PhoQ 的活性和LPS 結(jié)構(gòu)發(fā)生添加L-Ara4N 改變的能力,進(jìn)而導(dǎo)致高水平耐藥。這種效應(yīng)可因colR/colS 和cprR/cprS 基因發(fā)生突變而受抑制。研究還表明ColR/ColS 和CprR/CprS TCSs 還可以調(diào)控其他未知基因表達(dá)水平介導(dǎo)L-Ara4N 修飾作用[27]。

3.3 異質(zhì)性耐藥

臨床工作者在檢測大腸桿菌、鮑曼不動桿菌和肺炎克雷伯菌多粘菌素藥敏的時候往往會遇到異質(zhì)性耐藥現(xiàn)象。這種現(xiàn)象在用BMD 方法檢測時出現(xiàn)“跳空”或用紙片擴(kuò)散法檢測是抑菌圈內(nèi)出現(xiàn)菌落生長可以說明。當(dāng)把這些菌落挑選出來繼續(xù)檢測藥敏發(fā)現(xiàn)異質(zhì)性耐藥仍然存在。

圖1 CrrAB 介導(dǎo)多粘菌素耐藥及與PmrAB 和PhoPQ 之間關(guān)系[22]

在肺炎克雷伯菌研究中,Aurélie Jayol 等人發(fā)現(xiàn),在對多粘菌素耐藥菌株用Etest 方法檢測多粘菌素的MIC 時,在抑菌圈當(dāng)中出現(xiàn)散在的小菌落,作者將這些小菌落進(jìn)行分純培養(yǎng)后,經(jīng)PCR檢測發(fā)現(xiàn)此菌株存在PhoP(D191Y) 氨基酸替換,敲除回補(bǔ)試驗(yàn)表明此突變介導(dǎo)菌株對多粘菌素耐藥[28]。Ana Silva 等人在研究肺炎克雷伯菌生物膜特性中,通過菌譜分析(Population analysis profile, PAP)方法發(fā)現(xiàn)在生物膜狀態(tài)下檢測到一種菌體較小的菌株,經(jīng)分析后發(fā)現(xiàn)此菌株對多粘菌素的耐藥表型比較固定,可能是細(xì)菌處在生物膜狀態(tài)下,經(jīng)群體感應(yīng)系統(tǒng)的調(diào)節(jié)出現(xiàn)了異質(zhì)性耐藥現(xiàn)象[29]。Myung-Jin CHOI 等人研究發(fā)現(xiàn),與敏感株相比多粘菌素耐藥菌株HV 表型及CPS 表達(dá)量都發(fā)生下降,耐藥株的抗血清及生物膜形成能力也都發(fā)生降低。體外競爭試驗(yàn)也發(fā)現(xiàn)耐藥株的競爭優(yōu)勢下降[30]。

Li 等人在鮑曼不動桿菌中發(fā)現(xiàn),臨床分離的菌株中有90%的菌株對多粘菌素異質(zhì)性耐藥。這些亞群菌株與增加多粘菌素耐藥和再生長有著密切關(guān)系[31]。但是,鮑曼不動桿菌對多粘菌素異質(zhì)性耐藥的機(jī)制目前還不清楚。Alejandro Beceiro 等人研究發(fā)現(xiàn),lpx 突變的菌株體外生長能力明顯下降,體外競爭和毒力也比敏感菌株有明顯下降[32]。

在陰溝腸桿菌科(Enterobacter cloacae complex, ECC)研究中發(fā)現(xiàn),E.cloacae 菌株對多粘菌素耐藥具有一定的種群特異性,深入研究機(jī)制后發(fā)現(xiàn),ECC 中多粘菌素異質(zhì)性耐藥是由于PhoPQ雙組分調(diào)控系統(tǒng)控制arn 操縱子基因表達(dá)引起的。與E.coli,S.enterica 和K.pneumoniae 不 同 的 是,ECC 菌 株 中PmrAB 和PhoPQ 之間不存在交叉關(guān)系[33]。

3.4 質(zhì)粒介導(dǎo)耐藥

Liu 等人[34]首次發(fā)現(xiàn)了質(zhì)粒介導(dǎo)多粘菌素耐藥基因——mcr-1。該基因陽性標(biāo)本主要來源于動物,人源性標(biāo)本陽性率要遠(yuǎn)低于動物源性標(biāo)本,可能是跟多粘菌素藥物在畜牧業(yè)的使用量較大有關(guān)系。研究還發(fā)現(xiàn),mcr-1 基因具有較強(qiáng)的傳播性,可以轉(zhuǎn)移到肺炎克雷伯菌和銅綠假單胞菌中,且mcr-1 可以與不同的耐藥基因整合于同一個轉(zhuǎn)移性質(zhì)粒上,因此這種質(zhì)粒具有較強(qiáng)的危險(xiǎn)性。

自mcr-1 基因首次發(fā)現(xiàn)后,世界范圍內(nèi)(包括歐洲、南亞、非洲和美洲地區(qū)等)出現(xiàn)了大量關(guān)于mcr-1 的報(bào)道[35-41],說明mcr-1成為全球性問題是不可避免的。目前mcr-1 基因主要存在于大腸桿菌中,在沙門菌和肺炎克雷伯菌中也有檢出,但報(bào)道較少。鮑曼不動桿菌和銅綠假單胞菌中至今未有報(bào)道。Yu 等人首次報(bào)道了一例整合在耐碳青霉烯大腸桿菌染色體上的mcr-1 基因,這可能與mcr-1 基因在傳播過程中發(fā)生了衍變有關(guān)。雖然mcr-1 基因在2015 年首次報(bào)道,但是有研究報(bào)道顯示2012 的大腸桿菌中也有檢出mcr-1 基因,根據(jù)目前結(jié)果推測mcr-1 基因的出現(xiàn)有可能會更早。mcr-1 基因在人、食物、水、農(nóng)場養(yǎng)殖動物甚至遷徙的鳥類源性標(biāo)本中均有檢出[34,40,42],在多重耐藥菌如產(chǎn)ESBL 和碳青霉烯酶的大腸桿菌中也有報(bào)道[43,44]。且這些陽性質(zhì)粒分型種類較多,提示mcr-1 基因的兼容性非常好。2016 年7 月,比利時地區(qū)來源于豬和牛的大腸桿菌中檢出一種新的質(zhì)粒介導(dǎo)多粘菌素耐藥基因mcr-2[45]。該基因在牛來源大腸桿菌中的檢出率要遠(yuǎn)高于mcr-1 的檢出率。MCR-1 和MCR-2 具有80.65%的蛋白相似度,同屬于磷酸乙胺醇家族,可介導(dǎo)lipidA 添加磷酸乙胺醇基團(tuán)引起細(xì)菌LPS 與多粘菌素親和力下降[34]。在Liu 等人[34]的研究中,攜有mcr-1 的質(zhì)粒命名為pHNSHP45,是一個大小為64Kb 左右的IncI-like 質(zhì)粒,預(yù)測有83 個開放閱讀框架(ORFs),G+C 含量為42.7%。該質(zhì)粒最早在2013 年7 月份的一株來源于養(yǎng)豬場分離的大腸桿菌分離得到。藥敏結(jié)果顯示該大腸桿菌對大多數(shù)的抗菌藥物都耐藥,但是對碳青霉烯類藥物保持敏感[34]。攜帶mcr-2的質(zhì)粒命名為pKP37-BE,是一個大小為35Kb 左右的IncX4 型質(zhì)粒,G+C 含量為41.3%,不攜帶其他耐藥基因。目前為止,已有8種mcr 基因突變體被報(bào)道(mcr-1, mcr-2, mcr-3, mcr-4, mcr-5, mcr-6, mcr-7, mcr-8)[36-42],且攜帶mcr 基因的質(zhì)粒載體種類多變,此現(xiàn)象也加劇了mcr 基因的傳播,由此帶來的傳播危害值得密切關(guān)注。

3.5 交叉耐藥

根據(jù)目前研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),一些多粘菌素年耐藥的革蘭陰性菌并沒有出現(xiàn)雙組分調(diào)控系統(tǒng)中相應(yīng)基因突變,也不存在異質(zhì)性耐藥、質(zhì)粒介導(dǎo)耐藥。對于這些菌株耐藥機(jī)制是如何產(chǎn)生的,交叉耐藥可能是最好的解釋。有研究表明,醫(yī)用消毒劑(如洗必泰)在臨床消毒過程中廣泛使用,可能引起了細(xì)菌多多件菌素的交叉耐藥[46]。洗必泰以種陽離子形式存在,它可以替換細(xì)菌外膜磷脂雙層中的二價(jià)陽離子(Ca2+ 和Mg2+)導(dǎo)致細(xì)菌外膜結(jié)構(gòu)瓦解,細(xì)菌內(nèi)容物外泄死亡。

綜上可以看出洗必泰的殺菌機(jī)制與多粘菌素相似,都是與細(xì)菌的外膜結(jié)合。Matthew E et al 等人[46]研究發(fā)現(xiàn),通過體外誘導(dǎo)試驗(yàn)使肺炎克雷伯菌對洗必泰耐藥,這些耐藥菌同時產(chǎn)生了對多粘菌素耐藥。肺炎克雷伯菌對洗必泰的耐藥機(jī)制與phoPQ 和smvR 基因突變有關(guān),smvR 基因是Tet 抑制基因,與外排泵基因smvA 相鄰。smvR 基因發(fā)生突變后,smvA 基因的表達(dá)量升高。而體外誘導(dǎo)肺炎克雷伯菌對多粘菌素耐藥后,并不會產(chǎn)生對洗必泰耐藥。根據(jù)Matthew E et al 等人研究結(jié)果可以發(fā)現(xiàn),肺炎克雷伯菌對多粘菌素耐藥可能與消毒劑的使用有交叉關(guān)系,這為臨床預(yù)防感染提供一定幫助。

4 結(jié)論與展望

近年來由于新藥的缺乏,臨床較多使用多粘菌素治療MDR 革蘭陰性菌引起的感染以及畜牧業(yè)中多粘菌素的濫用導(dǎo)致了多粘菌素耐藥率的升高。值得警惕的是,質(zhì)粒介導(dǎo)到多粘菌素耐藥的出現(xiàn)加劇了耐藥的傳播。因此,多粘菌素耐藥機(jī)制的研究在學(xué)術(shù)上受到了較多關(guān)注。

正是由于新藥的缺乏,在治療MDR 革蘭陰性菌感染方面,多粘菌素可能還會處于主力地位。目前,一種新型復(fù)合制劑藥頭孢他啶/阿維巴坦用于臨床治療。這種復(fù)合制劑是一種β 內(nèi)酰胺抗生素和有一種β 內(nèi)酰胺酶抑制劑的組合,這種β 內(nèi)酰胺酶抑制劑只能抑制A 類碳青霉烯酶,對B 類金屬β 內(nèi)酰胺酶無效,因此這種復(fù)合制劑并不能廣泛使用。Mcr 抑制劑目前仍處于研究階段,真正運(yùn)用于臨床還尚需較長時間。因此,有效的感染控制措施(如抗生素管制和耐藥監(jiān)測)是目前應(yīng)對最近出現(xiàn)的多粘菌素耐藥問題的首要方案。

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