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長鏈非編碼RNA在甲狀腺乳頭狀癌發(fā)生機(jī)制及臨床應(yīng)用的研究進(jìn)展

2020-02-16 18:47韋柳興李楊宏盧冠銘
關(guān)鍵詞:細(xì)胞系標(biāo)志物編碼

韋柳興,李楊宏,盧冠銘

(1.右江民族醫(yī)學(xué)院研究生學(xué)院,廣西 百色 533000;2.右江民族醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院腺體外科,廣西 百色 533000)

甲狀腺乳頭狀癌(papillary thyroid cancer,PTC)是頭頸部內(nèi)分泌器官中最常見的惡性腫瘤之一,近年來發(fā)病率逐年增加[1],其5年死亡率不到2%,但是定期追蹤發(fā)現(xiàn)超過25%的PTC患者在很長一段時(shí)間內(nèi)會(huì)復(fù)發(fā)[2]。長鏈非編碼(long noncoding RNA,LncRNA)是從一組不完全注釋的基因轉(zhuǎn)錄而來的非蛋白質(zhì)編碼RNA轉(zhuǎn)錄物,它是一類相對(duì)知之甚少的RNA,幾乎沒有編碼能力[3]。最近幾年,隨著基因芯片和高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,越來越多研究[4]證實(shí)LncRNA在PTC的增殖、侵襲和遷移過程中發(fā)揮重要作用。為深入了解LncRNA與PTC的內(nèi)在關(guān)系,本文就LncRNA在PTC中的作用及發(fā)生機(jī)制、臨床應(yīng)用(診斷、治療作用和預(yù)后價(jià)值判斷)綜述如下。

1 LncRNA在PTC發(fā)生發(fā)展中的作用及作用機(jī)制

目前對(duì)于LncRNA在PTC中的作用的相關(guān)研究尚處于起步階段,但隨著基因芯片和高通量的測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,研究者們[2-3]在PTC及癌旁組織中發(fā)現(xiàn)多種LncRNA,包括抑癌性LncRNA(MEG3、NAMA)、致癌性LncRNA(CCAT1、PVT1)、致癌和抑癌雙重作用的LncRNA(BANCR、H19)等,它們?cè)赑CT的發(fā)生與發(fā)展中發(fā)揮著腫瘤抑制或致癌作用。

1.1MEG3 LncRNA MEG3(long non-coding RNA maternally expressed 3)位于人類染色體 14q32.3區(qū)域的印跡 DLK1-MEG3基因座上,由10個(gè)外顯子組成,長度約為 1,600 nt。MEG3在腦、胃、肝、胰腺和卵巢等多個(gè)器官中正常表達(dá),在一些腫瘤組織中表達(dá)水平喪失或降低,在各類型的癌癥中MEG3啟動(dòng)子的基因組織缺失和異常甲基化,導(dǎo)致腫瘤組織中MEG3下調(diào)[5]。Wang C等[6]通過qrT-PCR檢測(cè)PTC每個(gè)LncRNA的表達(dá)、構(gòu)建MEG3過度表達(dá)載體及用MEG3-MSCV病毒或陰性對(duì)照(NC)感染TPC-1和HTH83細(xì)胞進(jìn)行評(píng)估,最終證實(shí)了MEG3的過度表達(dá)抑制PTC細(xì)胞的遷移和侵襲。此外,通過雙熒光素酶測(cè)定3UTR 內(nèi)的特定靶位點(diǎn)表明Rac1的表達(dá)與PTC組織中的MEG3表達(dá)呈負(fù)相關(guān),表明MEG3通過靶向Rac1基因作為遷移和侵襲的新型抑制劑。研究表明[7]在131I抗性FTC-133和TPC-133細(xì)胞中MEG3的表達(dá)下降,而miR-182表達(dá)明顯增加;此外,MEG3過表達(dá)抑制131I抗性細(xì)胞的活性,促進(jìn)細(xì)胞凋亡并誘導(dǎo)DNA損傷,最后證實(shí)MEG3通過海綿吸附miR-182使PTC對(duì)131I的敏感性增強(qiáng)??梢奙EG3對(duì)PTC具有抑制作用,可作為PTC治療的靶點(diǎn),但其具體分子通路、作用機(jī)制尚未明確,還需進(jìn)一步探索與證實(shí)。

1.2NAMA LncRNA NAMA(long non-coding RNA associated with MAP kinase pathway and growth arrest)是一種與MAP激酶途徑和生長停滯有關(guān)的LncRNA,是2007年首次發(fā)現(xiàn)的PTC中第一個(gè)LncRNA。NAMA在人體組織中幾乎不表達(dá),因缺乏顯著的ORF,并且大多數(shù)外顯子在人和小鼠之間顯示出非常低的序列同一性,故其被認(rèn)為不是編碼蛋白質(zhì)的基因,而是非編碼RNA[8]。Yoon H等[9]發(fā)現(xiàn)在帶有BRAF(V600E)突變的PTC組織中NAMA低表達(dá)后,進(jìn)一步測(cè)試NAMA是否受MAPK途徑的調(diào)控,結(jié)果證明NAMA不僅被BRAF或MEK抑制劑誘導(dǎo),也可由NPA87細(xì)胞中的血清耗竭誘導(dǎo),而不是由突變型BRAF的K1細(xì)胞來誘導(dǎo)。因此認(rèn)為,通過MAPK途徑調(diào)節(jié)NAMA的表達(dá)并非只針對(duì)甲狀腺細(xì)胞。Zheng H等[10]通過RT-PCR分析了40對(duì)PTC組織及相鄰的正常組織中NAMA的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)與正常組織相比,PTC中的NAMA表達(dá)顯著下調(diào)。由于甲狀腺細(xì)胞的增殖和功能是通過TSH與其受體的相互作用介導(dǎo)的,因此使用PTC的IHH-4細(xì)胞系來研究沉默的NAMA對(duì)TSH表達(dá)的影響,結(jié)果NAMA并未對(duì)IHH-4細(xì)胞系中TSH的表達(dá)產(chǎn)生顯著的影響。綜合以上研究:對(duì)于PTC,可通過MAPK途徑調(diào)控降低NAMA水平濃度,從而達(dá)到抑制PTC的進(jìn)一步發(fā)展的目標(biāo),但具體方案及機(jī)制仍需廣大科研工作者進(jìn)一步研究與探索。

1.3CCAT1 LncRNA CCAT1(long non-coding RNA colon cancer-associated transcript 1)又稱為CARLo-5或CCAT1-S,其基因定位于染色體 8q24.21上,長度為2826 nt[11]。劉麗云等[12]通過檢測(cè)人正常甲狀腺細(xì)胞Nthy-ori3-1及PTC TPC-1中CCAT1的表達(dá)水平,發(fā)現(xiàn)人PTC TPC-1中 CCAT1的表達(dá)水平明顯高于人正常甲狀腺細(xì)胞Nthy-ori3-1,并且在PTC中下調(diào)表達(dá)CCAT1可抑制癌細(xì)胞的侵襲、遷移能力,能通過影響B(tài)RAF、MUC15、RKIP蛋白的表達(dá)發(fā)揮上述功能。Boloix A等[13]研究顯示CCAT1在FTC-133細(xì)胞上表現(xiàn)的促進(jìn)細(xì)胞活力、增殖、遷移和侵襲功能是通過抑制miR-143激活PI3K/AKT和MAPK信號(hào)通路。此外,CCAT1通過下調(diào)miR-143可促進(jìn)FTC-133細(xì)胞中血管內(nèi)皮生長因子的表達(dá),其可作為miR-143的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA??梢姡覀兛赏ㄟ^調(diào)節(jié)BRAF、MUC15、RKIP等相關(guān)蛋白,抑制PI3K/AKT和MAPK信號(hào)通路,降低CCAT1的表達(dá)水平,從而抑制PTC的發(fā)展。

1.4PVT1 LncRNA PVT1(long non-coding RNA plasmacytoma variant translocation 1)是由漿細(xì)胞瘤變種1基因編碼的一個(gè)LncRNA,它由1716個(gè)堿基組成,具有9~12個(gè)外顯子,位于8q24.21染色體上,該染色體區(qū)域因缺乏蛋白質(zhì)編碼基因被稱為基因沙漠,是包括易位、擴(kuò)增、病毒整合的多重風(fēng)險(xiǎn)位點(diǎn),與癌癥的易感性及進(jìn)展密切相關(guān)[14]。Zhang R等[15]的研究發(fā)現(xiàn)PVT1在從NT到PTC過程中均高度表達(dá),其在PTC的發(fā)生發(fā)展中具有重要的調(diào)節(jié)作用。Feng K等[16]研究發(fā)現(xiàn)在PTC組織中PVT1高度表達(dá),其表達(dá)與PTC的TNM分期、預(yù)后密切相關(guān)。該團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步研究其機(jī)制發(fā)現(xiàn),LncRNA PVT1可通過與miR-30a競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合來增強(qiáng)IGF1R的表達(dá),從而增強(qiáng)PTC細(xì)胞的侵襲力和活力。以上研究說明LncRNA PVT1與PTC密切相關(guān),我們可通過慢病毒轉(zhuǎn)染、抑制LncRNA PVT1與miR-30a競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合來降低PVT1的表達(dá)水平,抑制PTC細(xì)胞增殖、減弱其侵襲力和活力,從而延緩PTC的進(jìn)展。

1.5BANCR LncRNA BANCR(BRAF-activated long non-coding RNA)是由BRAF基因發(fā)生BRAFV600E位點(diǎn)基因突變后激活產(chǎn)生的非蛋白質(zhì)編碼RNA,其基因位于9號(hào)染色體上且有4個(gè)外顯子,全長為693 bp[17]。最初于2012年由Flockhart RJ等[18]在具有BRAFV600E突變的黑色素瘤組織中發(fā)現(xiàn),BANCR在黑色素瘤組織中高表達(dá),并且與黑色素瘤的增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移能力密切相關(guān)。研究表明[19],BANCR可通過調(diào)節(jié)各種機(jī)制(包括改變細(xì)胞的增殖和遷移)來促進(jìn)或抑制腫瘤的發(fā)生,其表達(dá)和功能具有組織特異性,既可以作為癌基因,又可以作為腫瘤抑制劑。Wang Y等[20]研究發(fā)現(xiàn),BANCR在PTC組織和BCPAD細(xì)胞系中過表達(dá),并且BANCR的過表達(dá)上調(diào)了c-Raf、MEK1/2和ERK1/2的表達(dá),通過U0126的處理可抑制其作用。Zhou Q等[21]通過RT-PCR分析40對(duì)PTC組織及相鄰的正常組織相比BANCR表達(dá)明顯上調(diào),PTC衍生細(xì)胞系(IHH-4)中的沉默BANCR 通過EZH2 染色質(zhì)募集減少導(dǎo)致TSHR表達(dá)的顯著抑制。結(jié)果表明,BANCR可通過調(diào)節(jié)細(xì)胞周期蛋白和TSHR來促進(jìn)PTC的發(fā)生。然而,Liao T等[22]通過RT-PCR評(píng)估92例患者PTC組織和其他正常甲狀腺組織中BANCR的表達(dá)水平,同時(shí)使用慢病毒載體建立PTC細(xì)胞系來研究BANCR過表達(dá)對(duì)癌細(xì)胞增殖、凋亡、遷移、侵襲的影響,結(jié)果表明,PTC組織中BANCR的表達(dá)水平明顯低于正常組織,BANCR的過表達(dá)減少了PTC細(xì)胞的增殖并促進(jìn)了細(xì)胞的凋亡,抑制了轉(zhuǎn)移。Zhang J等[23]的研究發(fā)現(xiàn)BANCR在PTC中的異常表達(dá)與腫瘤的大小、淋巴結(jié)的轉(zhuǎn)移呈負(fù)相關(guān),BANCR的過表達(dá)抑制了癌細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,并且BANCR通過激活ERK-MAPK和PI3K-AKt通路調(diào)節(jié)PTC細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移。綜上研究,BANCR通過調(diào)節(jié)細(xì)胞周期的樞紐節(jié)點(diǎn)和相關(guān)信號(hào)通路,影響PTC細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,說明了BANCR同細(xì)胞周期調(diào)控機(jī)制、信號(hào)通路機(jī)制密切相關(guān),將為PTC的診治提供重要參考。

1.6H19 LncRNA H19(long non-coding RNA imprinted maternally expressed transcript)位于人類染色體11p15.5上,長度約為2.3kb核苷酸,在胚胎前組織、胚胎本身和大多數(shù)胎兒組織中均高表達(dá),但產(chǎn)后H19的表達(dá)出現(xiàn)大水平下降[24]。LncRNA H19在多種人類癌癥中均出現(xiàn)表達(dá)異常,致癌機(jī)制錯(cuò)綜復(fù)雜,并且H19的過表達(dá)在不同腫瘤中作用不同,例如:在食管癌、胃癌、乳腺癌中,H19過表達(dá)促進(jìn)癌癥的發(fā)生和發(fā)展,然而,H19過表達(dá)在骨肉瘤和腎細(xì)胞癌中,具有抑制腫瘤的作用。lncRNA H19具有完全相反的功能,很大程度上取決于癌癥的類型、細(xì)胞環(huán)境和分子伴侶[25]。同樣,LncRNA H19在PTC中的作用也存在爭(zhēng)議。Jiao X等[26]研究發(fā)現(xiàn)H19在PTC中低表達(dá),并與患者年齡、腫瘤大小、病理類型、轉(zhuǎn)移密切相關(guān)。Liang WQ等[27]研究發(fā)現(xiàn),PTC組織中的H19表達(dá)水平明顯高于癌旁或正常組織,可促進(jìn)甲狀腺乳頭狀癌上皮-間質(zhì)的轉(zhuǎn)化過程,并促進(jìn)PTC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和侵襲。然而,有其他研究者得出了相反的結(jié)論。Lan X等[28]研究發(fā)現(xiàn)H19在PTC組織和細(xì)胞系中下調(diào),并且與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān),H19的過表達(dá)可抑制PTC細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,同時(shí)抑制蛋白腫瘤壞死因子受體2的表達(dá)。H19在PTC中的表達(dá)及作用差異可能與腫瘤直徑、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、腫瘤分期和樣本例數(shù)有關(guān),具體有待進(jìn)一步研究。以上研究提示LncRNA H19可能與PTC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和增殖相關(guān),但目前研究結(jié)論尚不一致,若能進(jìn)一步研究明確LncRNA H19與PTC細(xì)胞的轉(zhuǎn)移和增殖的關(guān)系,將對(duì)PTC的早期診斷產(chǎn)生重要意義。

2 LncRNA 在PTC中的臨床應(yīng)用

2.1LncRNA作為PCT的診斷生物學(xué)標(biāo)志物 在甲狀腺疾病中最重要的是將甲狀腺良性疾病和惡性腫瘤區(qū)分開來,但僅僅憑臨床表現(xiàn)難以區(qū)分,還需要依靠輔助檢查,例如放射性核素掃描、高分辨率超聲檢查、細(xì)針穿刺細(xì)胞學(xué)檢查(FNAB)等。目前FNAB是甲狀腺結(jié)節(jié)術(shù)前診斷最重要的方法,因?yàn)樗哂休^高的診斷可靠性和較低的并發(fā)癥風(fēng)險(xiǎn)。盡管大多數(shù)甲狀腺病變可以通過FNAB識(shí)別,但由于受腫物大小、病理類型和穿刺技術(shù)等各方面的影響,仍有部分甲狀腺結(jié)節(jié)不能得到準(zhǔn)確的診斷[29]。LncRNA的表達(dá)模式具有組織特異性,這使它們成為高度特異性診斷標(biāo)記物的編碼RNA。Zhang K等[30]通過對(duì)76例PTC患者的研究發(fā)現(xiàn),DANCR在PTC組織中表達(dá)下降,其表達(dá)與臨床分期和浸潤程度呈負(fù)相關(guān),并且DANCR可以將PTC與正常組織區(qū)分開來,其診斷PTC的靈敏度為 85.29%,特異性為 66.18%。這項(xiàng)研究為DANCR作為新型診斷標(biāo)記檢測(cè)PTC提供了證據(jù)。另外一研究[31]發(fā)現(xiàn),血漿中的LncRNA GAS8-AS1是診斷PTC的潛在重要生物標(biāo)志物,PTC患者血漿中GAS8-AS1表達(dá)下調(diào),其低水平表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān),在LNM預(yù)測(cè)中,GAS8-AS1的接收器工作特性曲線下的面積為0.746。Liu J等[32]研究報(bào)道,與配對(duì)的非癌組織相比,MALAT1在PTC中表達(dá)上調(diào),并且和腫瘤大小、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、疾病的相關(guān)階段密切相關(guān)。MALAT1在淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、甲狀腺外擴(kuò)展、疾病分期預(yù)測(cè)的曲線下面積分別為0.6320、0.7192、0.7089和0.7000。淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移是PTC最主要的挑戰(zhàn),復(fù)發(fā)性癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移需要反復(fù)手術(shù),這就增加手術(shù)并發(fā)癥的風(fēng)險(xiǎn),影響患者的預(yù)后。超聲檢查對(duì)淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的識(shí)別靈敏度非常低,這就需要LncRNA在PTC的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移診斷中發(fā)揮重要的作用。以上研究表明,通過對(duì)LncRNA及其相關(guān)靶向調(diào)控通路的研究,有望為PTC的發(fā)生發(fā)展提供新的早期診斷標(biāo)志物及治療方案。

2.2LncRNA作為PCT的治療靶標(biāo) PCT是最常見的甲狀腺惡性腫瘤,與其他亞型相比,其患者預(yù)后相對(duì)較好,然而對(duì)于遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移或復(fù)發(fā)性PTC患者,目前常用的治療方案臨床效果仍不理想。因此,弄清LncRNA與PTC發(fā)病的相關(guān)機(jī)制可有助于改善PTC患者的治療現(xiàn)狀。研究[33]發(fā)現(xiàn),ASMTL-AS1通過調(diào)節(jié)miR-93-3p/miR-660/FOXO1途徑在 PTC中起著新型的抑癌作用。靶向ASMTL-AS1及其下游途徑成為甲狀腺癌患者的潛在治療靶標(biāo)。另有研究[34]發(fā)現(xiàn)LINC00460 通過調(diào)節(jié) LINC00460/miR-485-5p/Raf1軸誘導(dǎo)PTC細(xì)胞的增殖、遷移、侵襲和EMT,表明LINC00460是PTC的潛在生物標(biāo)志物和治療靶標(biāo)。綜上所述,以上總結(jié)和討論的LncRNA(MEG3、NAMA、CCAT1、PVT1、BANCR、H19、ASMTL-AS1、LINC00460)及其他具有致癌或抑癌性的LncRNA均有可能稱為PTC的潛在的新型治療靶標(biāo)。

2.3LncRNA作為PCT的預(yù)后生物標(biāo)志物 許多研究[34-35]已經(jīng)證實(shí)LncRNA的表達(dá)異常與PTC的發(fā)生、發(fā)展、轉(zhuǎn)移過程和預(yù)后密切相關(guān),LncRNA為PTC的預(yù)后生物標(biāo)志物。Gu Y等[35]分析TCGA基因數(shù)據(jù)庫發(fā)現(xiàn)EMX2OS在PTC中顯著下調(diào),并且可獨(dú)立預(yù)測(cè)經(jīng)典PCT的無復(fù)發(fā)生存期,是PTC中有價(jià)值的預(yù)后生物標(biāo)志物。若在未來能通過檢測(cè)特異性LncRNA精確判斷或預(yù)測(cè)PTC患者的預(yù)后情況,必將會(huì)對(duì)臨床診治方案產(chǎn)生重要指導(dǎo)意義。

3 結(jié)語

PTC和其他惡性腫瘤一樣,其發(fā)生、發(fā)展也是一個(gè)多基因綜合改變的復(fù)雜過程,盡管目前對(duì) LncRNA 與PTC的作用機(jī)制和調(diào)控方式仍不完全明確,但上述多數(shù)研究均發(fā)現(xiàn)LncRNA濃度降低和人群PTC發(fā)病相關(guān),且具有預(yù)測(cè)PTC是否復(fù)發(fā)的價(jià)值,是PTC治療的靶標(biāo),因此,LncRNA可作為評(píng)估PTC病情變化情況的標(biāo)志物之一,在臨床上應(yīng)逐漸重視LncRNA對(duì)PTC防治的價(jià)值。但后續(xù)在PTC病因、早期診斷、分子靶向治療和預(yù)測(cè)預(yù)后LncRNA靶點(diǎn)或靶點(diǎn)組合等方面仍需要更多的動(dòng)物和臨床實(shí)驗(yàn)加以驗(yàn)證。若能闡明LncRNA水平和PTC的因果關(guān)系,通過檢測(cè)特異性LncRNA判斷PTC的病情及預(yù)后情況,并制定公認(rèn)的與PTC直接相關(guān)的濃度參考值,探究一種安全有效的防治策略,降低PTC的發(fā)生率,延緩其發(fā)展速度,改善患者的臨床預(yù)后,達(dá)到提高患者生活質(zhì)量的目的,最終減輕患者自身與社會(huì)經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān),必將會(huì)對(duì)臨床治療起重要指導(dǎo)意義。

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