王鵬程 吳楚 孫智 彭新 韓永世 孫長城 賈切
摘要:為明確引起宜昌市核桃黑斑病的病原菌,根據(jù)柯赫氏法則測定其致病性,通過形態(tài)學(xué)觀察和rDNA-ITS序列分析鑒定病原菌。結(jié)果表明,引起宜昌市核桃黑斑病的病原菌為鏈格孢屬鏈格孢
(Alternaria alternata)。
關(guān)鍵詞:核桃黑斑病;分離鑒定;形態(tài)學(xué)觀察;鏈格孢(Alternaria alternata);宜昌市
中圖分類號:S436.64 ? ? ? ? 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A
文章編號:0439-8114(2019)18-0055-03
DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2019.18.013 ? ? ? ? ? 開放科學(xué)(資源服務(wù))標(biāo)識碼(OSID):
Isolation and identification of a pathogen of walnut black spot in Yichang city
WANG Peng-cheng1,WU Chu2,SUN Zhi1,PENG Xin3,HAN Yong-shi4,SUN Chang-cheng5,JIA Qie2
(1.Hubei Three Gorges Polytechnic, Yichang 443000,Hubei,China;2.College of Horticulture and Gardening,Yangtze University,Jingzhou 434000,Hubei,China;3.Guojiaba Town Forestry Station of Zigui County,Zigui 443621,Hubei,China;4.Zigui County Forestry Bureau,Zigui 443600,Hubei,China;5.Xiakou Town Agricultural Technology Service Center of Xingshan County,Xingshan 443701,Hubei,China)
Abstract: To identify the pathogen causing walnut black spot in Yichang city, the pathogenicity was determined according to Koch's rule. And the pathogenic bacteria was identified by morphological characteristics and rDNA-ITS sequence analysis. The results showed that Alternaria altenata was the pathogen causing walnut black spot in Yichang city.
Key words: walnut black spot; isolation and identification; morphological observation; Alternaria alternata; Yichang city
核桃黑斑病是一種世界性病害[1],對該病害的研究報道較多[2-6],普遍認(rèn)為黑斑病具有潛伏期長、發(fā)病時間短、暴發(fā)性強(qiáng)等特點(diǎn);主要為害葉片、嫩枝、幼果及花序。當(dāng)為害葉片時,先在葉片上出現(xiàn)圓形或者不規(guī)則小褐斑,隨著病情發(fā)展,病斑相連成片,最后葉片脫落;為害嫩枝時,在嫩枝上形成黑褐色長條形斑,稍凹陷,最終病斑擴(kuò)展包圍枝條而使上段枯死;花序感病后產(chǎn)生黑褐色水漬狀病斑,造成落花;果實(shí)受害后果面上形成黑褐色小點(diǎn),隨著病情發(fā)展,病斑不斷擴(kuò)大并逐漸下陷、變黑,果實(shí)腐爛脫落;未脫落的受害果實(shí)干癟皺縮,核殼、核仁變黑,失去食用價值。
目前宜昌市有近4.6×105 hm2核桃樹[7],當(dāng)?shù)亓謽I(yè)部門把核桃生產(chǎn)作為頭等大事來抓。2018年春在秭歸縣進(jìn)行果樹病害調(diào)查時發(fā)現(xiàn)核桃樹上有疑似核桃黑斑病病害,初步統(tǒng)計病株率高達(dá)30%以上,且呈暴發(fā)之勢。據(jù)當(dāng)?shù)毓r(nóng)反映,這種病害每年都會發(fā)生,且很嚴(yán)重,常規(guī)施藥防治效果不理想,嚴(yán)重影響了當(dāng)?shù)睾颂疑a(chǎn)和果農(nóng)的積極性。為有效控制和防治該病害蔓延,對病原進(jìn)行了分離、致病性測定和rDNA-ITS鑒定,初步確定了該病原菌分類定位,期望為探索該病害的防治措施提供理論依據(jù)。
1 ?材料與方法
1.1 ?材料
1.1.1 ?樣品采集 ?2018年5月分別從宜昌市秭歸縣郭家壩鎮(zhèn)白云山村及煙燈堡村核桃種植基地采集具有典型黑斑病癥狀的當(dāng)年生幼嫩枝條,分別放于自封生物標(biāo)本袋中帶回實(shí)驗(yàn)室,直接分離病原菌或置于冰箱冷藏保存。采集健康核桃葉片及幼嫩枝條用于回接試驗(yàn),進(jìn)行致病性檢測。
1.1.2 ?試驗(yàn)試劑、儀器與設(shè)備 ?Taq DNA聚合酶、緩沖液體系均由TaKaRa公司提供,定制引物、基因組DNA提取試劑盒、凝膠回收試劑盒均由上海Sangon公司提供。
普通光學(xué)顯微鏡,E100,日本Nikon公司;PCR儀,9700型,美國ABI公司;DNA測序儀,3730XL型,美國ABI公司。
1.2 ?方法
1.2.1 ?菌株分離純化 ?參照方中達(dá)[8]的方法,將幼嫩枝條沖洗干凈,自然風(fēng)干,用消毒剪刀切取病健交界處約4.0 mm×4.0 mm的組織,放于75%乙醇中消毒10~15 s,再經(jīng)2% NaClO表面消毒4 min,然后用無菌水漂洗3次,最后轉(zhuǎn)至PDA平板上,置于25 ℃恒溫連續(xù)光照條件下培養(yǎng)3~4 d,待菌落長出后,挑取菌落邊緣形態(tài)比較單一的小塊菌絲轉(zhuǎn)接到新的PDA平板上培養(yǎng),重復(fù)純化2~3次后挑取形態(tài)比較單一的小塊菌絲移至PDA斜面試管中,于25 ℃恒溫連續(xù)光照培養(yǎng)4 d后置于4 ℃冰箱內(nèi)貯存?zhèn)溆谩?/p>
分離菌株的單孢純化采用分生孢子稀釋法。供試菌株在PDA培養(yǎng)基中25 ℃連續(xù)黑暗培養(yǎng)7 d,加無菌水2 mL,用滅菌棉簽輕洗培養(yǎng)菌落,配制分生孢子懸浮液,然后用無菌水進(jìn)行梯度稀釋,直至普通光學(xué)顯微鏡10×40放大倍率視野中鏡檢到1~2個分生孢子為止;最后將孢子懸浮液均勻涂抹在PDA培養(yǎng)基平板上。2 d后,再挑取單個分生孢子萌發(fā)產(chǎn)生的單菌落,移至PDA斜面培養(yǎng)保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 ?致病性試驗(yàn) ?按照柯赫氏法則,選取新鮮且健康的核桃葉片和幼莖莖段,用75%乙醇表面消毒后再用無菌水沖洗2~3次,放入鋪有濕潤滅菌吸水紙的搪瓷盤中,擺放整齊。用直徑5.0 mm的打孔器在PDA平板上活化培養(yǎng)5 d的菌落邊緣打孔,然后將菌絲塊接種到葉片上,用保鮮膜封盤,置于25 ℃恒溫、12 h光暗交替條件下保濕培養(yǎng),設(shè)置3次重復(fù),PDA作為空白對照。接種2 d后移去菌絲塊,連續(xù)10 d觀察發(fā)病情況并進(jìn)行記錄。若癥狀相同,則對發(fā)病組織進(jìn)行再分離,分離得到與原始接種菌株培養(yǎng)特征一致的菌株則可確定為該病的病原菌。
1.3 ?病原菌形態(tài)鑒定
1.3.1 ?菌落培養(yǎng)性狀觀察 ?將直徑5.0 mm的菌絲塊接種到PDA平板上,在25 ℃恒溫連續(xù)光照條件下培養(yǎng),觀察記錄病原菌的菌落特征以及有無分生孢子產(chǎn)生。
1.3.2 ?產(chǎn)孢表型觀察 ?參照張?zhí)煊頪9]的方法,取濾紙剪成比載玻片小的長方形,將中心挖1 cm左右的小方孔,滅菌后用無菌水潤濕放于無菌載玻片上。然后從活化5 d的菌落邊緣挑取小塊菌絲均勻涂于濾紙中央方孔邊緣,再將載玻片置于鋪有濕潤濾紙的滅菌培養(yǎng)皿中,25 ℃恒溫連續(xù)光照條件下培養(yǎng)2 d后取出載玻片,在光學(xué)顯微鏡下觀察分生孢子及分生孢子梗形態(tài)。
1.4 ?菌株rDNA-ITS分子鑒定
1.4.1 ?DNA提取和引物擴(kuò)增 ?取無菌的玻璃紙平鋪在凝固的PDA培養(yǎng)基表面。從活化5 d的菌落邊緣打取直徑6.0 mm菌絲塊,置于玻璃紙上。25 ℃恒溫光照條件下培養(yǎng),5 d后收集菌落邊緣新鮮菌絲。
采用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法提取DNA。取6 μL DNA瓊脂糖凝膠液電泳檢測,用英國Syngene G:BOX EF 2凝膠成像系統(tǒng)進(jìn)行拍照。
采用真菌生物核糖體DNA通用引物ITS1和ITS4對rDNA-ITS區(qū)域進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
ITS1:5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′
ITS4:5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3′
1.4.2 ?PCR反應(yīng)體系與ITS序列分析 ?PCR反應(yīng)體系總體積為50 μL,反應(yīng)液組分為:10×PCR Buffer(含MgCl2)5 μL,10 mmol/L dNTP 2 μL,5 U/μL Taq酶0.3 μL,模板DNA 10 ng,引物ITS1和ITS4(25 μmol/L)各1 μL,加ddH2O使總體積達(dá)到50 μL,在PTC-100 PCR擴(kuò)增儀上擴(kuò)增。擴(kuò)增條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性30 s,54 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共30個循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。反應(yīng)結(jié)束后取6 μL產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳檢測。PCR產(chǎn)物委托深圳華大基因科技有限公司進(jìn)行DNA純化和測序。測序結(jié)構(gòu)登錄NCBI進(jìn)行Blast比對。
2 ?結(jié)果與分析
2.1 ?病原菌菌落形態(tài)
將所采病樣經(jīng)過3次單菌落分離和純化,獲得1株真菌,編號為JF1。初期菌落生長較慢,菌絲絨毛狀,白色,菌落近圓形,較整齊,隨著菌落不斷擴(kuò)大,菌落顏色逐漸呈淺灰色或深灰色;氣生菌絲致密厚實(shí),無異味。翻轉(zhuǎn)培養(yǎng)基觀察,背面灰黑色至黑色,呈同心輪紋狀(圖1)。
2.2 ?菌種形態(tài)觀察
取出載玻片在光學(xué)顯微鏡下觀察,JF1菌絲單生或有分枝,有隔,有鎖狀聯(lián)合。分生孢子梗鏈短、分枝較多,直立或彎曲;分生孢子黃褐色,倒棒狀、倒梨形或橢圓形,臍部明顯,具有若干橫、縱隔膜,分隔處平滑或縊縮,頂部有鳥嘴狀突起的喙,初步判斷為鏈格孢屬真菌(圖2)。
2.3 ?菌株致病性確定
取菌絲塊分別接種到活體核桃葉片和幼莖上,3 d后該菌在核桃莖干(圖3a)和葉片(圖3b)上開始出現(xiàn)病斑,繼續(xù)培養(yǎng),病斑不斷擴(kuò)大(圖3b、圖3c),持續(xù)觀察10 d并記錄癥狀變化情況,發(fā)現(xiàn)此癥狀與之前采樣的核桃病癥一致(圖3)。
2.4 ?菌絲DNA提取及凝膠電泳檢測
按試劑盒操作說明及相關(guān)方法從菌體中提取出基因組DNA,提取的DNA經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳檢測,DNA條帶清晰、較明亮,可以作為PCR反應(yīng)的模板;以DNA為模板,ITS1、ITS4為引物,對rDNA-ITS區(qū)段PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增片段大小約為562 bp。
2.5 ?rDNA-ITS序列分析
ITS序列長度為562 bp,提交GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行Blast比對,登錄號為MF785102.1、JF439442.1、MH619630.1。其中,MF785102.1(Alternaria alternata)相似度達(dá)100%。進(jìn)一步結(jié)合MEGA 7.0分子軟件,以5種鏈格孢屬種即鏈格孢(Alternaria alternata)、蘆薈黑斑病菌(Alternaria aborescens)、空心蓮子草黑斑病菌(Alternaria alternantherae)、人參黑斑病菌(Alternaria panax)和向日葵黑斑病菌(Alternaria helianthi)在GenBank已知的ITS序列為參照,采用鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖4)。結(jié)果表明,JF1菌株與4株Alternaria alternata(HQ257255、GU566303、GQ249171和AB470838)聚為一支,相似度為86%,鏈格孢屬其他菌株所在分支按相似度不同與其并列。結(jié)合形態(tài)學(xué)特征,將其鑒定為Alternaria alternata。
3 ?討論
鏈格孢屬真菌是世界性分布的真菌,包括腐生、內(nèi)生和致病性等種類[10]。據(jù)報道,95%以上的鏈格孢種類兼性寄生于植物上,代謝產(chǎn)物即毒素可導(dǎo)致受害植物產(chǎn)生各種癥狀,如黑斑病、褐斑病、莖枯病、赤星病等,嚴(yán)重影響作物的產(chǎn)量和品質(zhì),給農(nóng)業(yè)生產(chǎn)帶來巨大損失[11]。自從2002年Belisario等[12]在核桃樹的病斑上分離到鏈格孢屬真菌后,鏈格孢對核桃的危害開始引起人們關(guān)注;Hong等[13]認(rèn)為有3種鏈格孢可侵染核桃,分別是鏈格孢、細(xì)極鏈格孢和樹狀鏈格孢;在致病過程方面,Moragrega等[14]認(rèn)為鏈格孢屬真菌既能夠單獨(dú)致病,又可與其他病原生物共同致病;曲文文等[15,16]在山東省也從核桃病斑中分離出了鏈格孢屬真菌,認(rèn)為鏈格孢是造成核桃黑斑病和頂端褐色壞死的主要病原菌。本試驗(yàn)在宜昌市也分離到鏈格孢屬真菌,認(rèn)為鏈格孢屬真菌是造成宜昌市地區(qū)核桃黑斑病的主要病原菌之一。
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