劉沃滿,唐玉芬△,黎洛冰,聶俊瑋,譚滿勝
(茂名市婦幼保健院:1.遺傳優(yōu)生優(yōu)育中心;2.產(chǎn)前診斷中心,廣東茂名 525000)
染色體非整倍體異常是一種常見(jiàn)的染色體數(shù)目異常,其中以三體型和單體型最為常見(jiàn)。最常見(jiàn)的染色體數(shù)目異常包括21三體綜合征、18三體綜合征、13三體綜合征、三倍體和性染色體數(shù)目異常,如Klinefelter綜合征(47,XXY)、Jacobs綜合征(47,XXX)、XYY綜合征(47,XYY)和Turner綜合征(45,X),約占產(chǎn)前診斷中有臨床意義染色體異常的80%[1]。這些疾病在胎兒期常表現(xiàn)為宮內(nèi)死胎、流產(chǎn)等。出生后臨床可表現(xiàn)為不同程度的智力低下、生長(zhǎng)發(fā)育遲緩、性發(fā)育不良和其他組織器官畸形等,患者多數(shù)生活上不能自理,這給家庭和社會(huì)帶來(lái)沉重的經(jīng)濟(jì)和精神負(fù)擔(dān)。染色體異常目前還沒(méi)有有效的治療方法,僅能通過(guò)產(chǎn)前篩查和產(chǎn)前診斷干預(yù)患兒的出生,提高新生兒的質(zhì)量。染色體核型分析是目前診斷染色體數(shù)目和結(jié)構(gòu)異常的金標(biāo)準(zhǔn),但因?yàn)槭菍?duì)活細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng),對(duì)環(huán)境條件和人員的要求比較高,而且以手工操作為主,耗時(shí)長(zhǎng),造成孕婦及其家屬等待核型分析結(jié)果的焦慮。熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(QF-PCR)技術(shù)是近年發(fā)展的一種快速診斷染色體非整倍體的分子生物學(xué)方法,目前已廣泛應(yīng)用于國(guó)內(nèi)外多家產(chǎn)前診機(jī)構(gòu)[2-7]。本研究是應(yīng)用QF-PCR技術(shù)和核型分析兩種方法對(duì)3 398例胎兒樣本進(jìn)行檢測(cè),并對(duì)結(jié)果進(jìn)行比較分析,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
1.1一般資料 87例絨毛、219例臍帶血和3 092例羊水標(biāo)本來(lái)自于2016年3月至2018年12月本院產(chǎn)前診斷中心就診的3 398例高危孕婦,風(fēng)險(xiǎn)指標(biāo)主要包括孕婦高齡、唐篩高風(fēng)險(xiǎn)、無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前基因檢測(cè)高風(fēng)險(xiǎn)、胎兒超聲異常、夫婦雙方患有珠蛋白生成障礙性貧血(簡(jiǎn)稱地貧)、不良生育史和染色體異常家族史,孕周為7~25周。
1.2標(biāo)本采集 孕婦在本院產(chǎn)前診斷中心咨詢并簽署知情同意書(shū),根據(jù)孕周的不同,在B超引導(dǎo)下進(jìn)行絨毛或羊水或臍血穿刺取樣后,同時(shí)進(jìn)行染色體核型分析及QF-PCR檢測(cè)。
1.3染色體核型分析 按照常規(guī)細(xì)胞培養(yǎng)、收獲、制片G顯帶,參照人類細(xì)胞遺傳學(xué)命名的國(guó)際體制(2013年)標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行核型分析。
1.4QF-PCR檢測(cè)方法
1.4.1STR位點(diǎn) 采用北京閱微基因技術(shù)有限公司的非整倍體檢測(cè)試劑盒對(duì)常見(jiàn)21、18、13及性染色體非整倍體進(jìn)行檢測(cè)。共檢測(cè)27個(gè)位點(diǎn),包括21號(hào)染色體的8個(gè)STR位點(diǎn),分別為D21S2052、D21S1411、D21S1446、LFG21、D21S1435、D21S11、D21S1246、Penta D;18號(hào)染色體的6個(gè)STR位點(diǎn),分別為D18S51、D18S535、D18S1002、D18S877、D18S851、D18S391;13號(hào)染色體的6個(gè)STR位點(diǎn),分別為D13S256、D13S797、D13S317、D13S305、D13S800、D13S325;性染色體的7個(gè)STR位點(diǎn),分別為DXS6809、DXS9895、AMEL、TAF9L(3號(hào)染色體和X染色體)、ZFXY、SRY、XHPRT。
1.4.2標(biāo)本DNA的提取 按Chelex-100法[8]提取臍血、羊水、絨毛等標(biāo)本的DNA。
1.4.3PCR擴(kuò)增 在Bio-Rad T100型PCR擴(kuò)增儀上擴(kuò)增,反應(yīng)條件:95 ℃ 5 min預(yù)變性,然后 94 ℃ 30 s、60 ℃ 1 min、70 ℃ 1 min,循環(huán) 27 次,再60 ℃延伸 60 min,最后擴(kuò)增產(chǎn)物于 4 ℃避光保存?zhèn)溆谩?/p>
1.4.4毛細(xì)管電泳 取甲酰胺8.5 μL,分子質(zhì)量標(biāo)記物0.5 μL,PCR擴(kuò)增產(chǎn)物 1.0 μL,于95 ℃變性 3 min,放置冰上迅速冰冷 3 min,用 ABI 3500 Dx 型遺傳分析儀進(jìn)行毛細(xì)管電泳。
1.4.5結(jié)果分析及判斷標(biāo)準(zhǔn) 采用GeneMapper?ID-X軟件對(duì)電泳原始數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。參照英國(guó)臨床分子遺傳協(xié)會(huì)(CMGS)2012年新頒布的指南進(jìn)行分析。(1)雙峰比值為0.8~1.4視為正常;當(dāng)峰標(biāo)記長(zhǎng)度大于或等于24 bp時(shí),峰高度或面積比值達(dá)1.5時(shí)也可視為正常。(2)三峰比值為1∶1∶1及雙峰比值為2∶1(1.8~2.4)或1∶2(0.45~0.65)視為異常;(3)當(dāng)雙峰比值在1.4~1.8或0.65~0.80時(shí),需要對(duì)該樣本進(jìn)行重測(cè)。(4)單峰一般為純合,不能提供診斷信息。45,X診斷的標(biāo)準(zhǔn)必須具備以下兩個(gè)條件:(1)所有X染色體STR位點(diǎn)呈單峰;(2)TAF9L基因座上的兩個(gè)峰高比為2∶1(1.8~2.4)。
2.1兩種方法的檢測(cè)結(jié)果比較 應(yīng)用QF-PCR方法成功檢測(cè)3 398例樣本,共檢出非嵌合型染色體數(shù)目異常152例,見(jiàn)表1。其中21三體綜合征92例,18三體綜合征30例,13三體綜合征6例,X單體 6例,XXX 1例,XXY 11例,XYY 5例,XXX合并18三體綜合征1例,上述檢測(cè)結(jié)果與核型分析結(jié)果一致。嵌合型染色體數(shù)目異常7例,QF-PCR檢出3例,分別是1例18三體綜合征嵌合體,1例21三體綜合征嵌合體,1例XXX與XX嵌合體,還有4例嵌合體QF-PCR未能檢出。另外,有2例QF-PCR結(jié)果與核型分析結(jié)果不符。1例QF-PCR結(jié)果為XYY,染色體核型結(jié)果為46,X,?der(Y),另1例QF-PCR結(jié)果為XY,染色體核型結(jié)果為45,X。
表1 QF-PCR檢測(cè)的5種染色體非整倍體結(jié)果與核型分析結(jié)果
2.2其他染色體核型分析異常結(jié)果 共檢出其他染色體核型分析異常100例,包括染色體易位65例、倒位14例、缺失7例的結(jié)構(gòu)異常和其他染色體數(shù)目異常14例,因不在QF-PCR檢測(cè)范圍內(nèi),未能檢測(cè)到。
2.3檢出1例雙三體 在3 398例胎兒樣本中,發(fā)現(xiàn)1例XXX合并18三體綜合征的雙三體,核型結(jié)果為48,XXX,+18見(jiàn)圖1、2。
圖1 XXX,+18 QF-PCR檢測(cè)結(jié)果圖
圖2 48,XXX,+18的核型分析結(jié)果
2.4產(chǎn)前地貧基因診斷同時(shí)進(jìn)行QF-PCR檢測(cè)的結(jié)果 患有地貧的夫婦雙方進(jìn)行產(chǎn)前地貧基因診斷的1 041個(gè)家庭,同時(shí)進(jìn)行了QF-PCR檢測(cè),地貧基因產(chǎn)前診斷結(jié)果為輕型或正常,而QF-PCR則檢出2例21三體綜合征,1例XXY染色體非整倍體異常胎兒。
QF-PCR檢測(cè)是利用STR遺傳標(biāo)記在人群中的多態(tài)性,采用多重PCR擴(kuò)增及毛細(xì)管電泳技術(shù),通過(guò)分析各STR點(diǎn)熒光峰的個(gè)量或面積的比值從而達(dá)到判斷染色體數(shù)目[9]。QF-PCR技術(shù)與G顯帶的核型分析方法相比,具有以下優(yōu)點(diǎn):(1)快速。核型分析方法因需要對(duì)胎兒活細(xì)胞進(jìn)行培養(yǎng),至少要2~3周才能出結(jié)果,而QF-PCR可在24~48 h內(nèi)得出結(jié)果,大大縮短了報(bào)告時(shí)間,減輕了孕婦在等待報(bào)告過(guò)程中產(chǎn)生的心理負(fù)擔(dān)和焦慮;(2)所需的樣本量少,可以同時(shí)進(jìn)行單基因病的診斷;(3)操作簡(jiǎn)便、自動(dòng)化程度高、通量大;(4) 可以根據(jù)STR等位基因的個(gè)性化信息判別多余染色體的來(lái)源,鑒別母體組織污染。但是QF-PCR技術(shù)仍存在以下不足:(1)目前QF-PCR只能檢測(cè)13、18、21、X及Y這5條染色體的數(shù)目異常,對(duì)其他染色體數(shù)目異常無(wú)法檢出;(2)對(duì)比例低的嵌合體異常無(wú)法檢出;(3)不能診斷染色體結(jié)構(gòu)異常。
本報(bào)道中的3 398例產(chǎn)前標(biāo)本采用QF-PCR技術(shù)檢測(cè),均在24~48 h內(nèi)成功得出結(jié)果。共檢出非嵌合型13、18、21、X及Y 5種染色體數(shù)目異常152例,與核型分析結(jié)果一致,說(shuō)明QF-PCR技術(shù)檢測(cè)常見(jiàn)5種染色體非整倍體有較高的特異度和靈敏度,與文獻(xiàn)報(bào)道相符[10]。用QF-PCR方法是檢測(cè)不到的嵌合比例低于15%~20% 的嵌合體[11],本研究中的7例嵌合體檢出3例,嵌合比例都大于30%。1例QF-PCR結(jié)果為XYY,而染色體核型結(jié)果為46,X,?der(Y)。疑是2個(gè)Y染色體在著絲粒連接成一個(gè)衍生的Y染色體。1例QF-PCR結(jié)果為XY,染色體核型結(jié)果為45,X,未檢出Y染色體。可能是含有Y基因的Y片段易位至X染色體或其他常染色體上,其社會(huì)性別將表現(xiàn)為男性,但未能有生育能力[12]。檢出1例X三體加18三體綜合征的雙三體。雙三體是少見(jiàn)的染色體數(shù)目異常。非整倍體的發(fā)生機(jī)制是由于生殖細(xì)胞分裂過(guò)程中同源染色體不分離所造成,且多發(fā)生于第一次減數(shù)分裂時(shí),其結(jié)果形成三體性或單體性異常。雙三體則由于雙原發(fā)不分離所造成[13]。在18三體綜合征中雙三體病例占5%~10%[13]。
廣東省為地貧高發(fā)區(qū),在某些地區(qū)地貧基因攜帶率可高達(dá)16.83%[14]。中重度地貧患兒的出生會(huì)給家庭和社會(huì)造成巨大疾病和經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。目前通過(guò)采取婚前、孕前檢查,以及產(chǎn)前篩查和診斷等防控措施,可減少重型地貧兒的出生。在進(jìn)行產(chǎn)前地貧基因診斷的同時(shí)進(jìn)行QF-PCR檢測(cè)常見(jiàn)染色體數(shù)目異常,不增加所取的樣本量,就可以避免缺陷兒的出生。在本報(bào)道中的患有地貧的夫婦雙方進(jìn)行產(chǎn)前地貧基因診斷的1 041個(gè)家庭,檢出2例21三體綜合征,1例XXY,及時(shí)終止妊娠,避免了染色體異常胎兒的出生。
QF-PCR技術(shù)用于診斷產(chǎn)前染色體非嵌合型非整倍體如13、18、21、X及Y異常,具有快速,準(zhǔn)確、通量大和操作簡(jiǎn)單等優(yōu)點(diǎn),避免了孕婦及家屬長(zhǎng)時(shí)間等待核型分析結(jié)果的焦慮,也避免了延至妊娠后期流產(chǎn)對(duì)孕婦身體造成較大的創(chuàng)傷。但QF-PCR技術(shù)目前只能檢出5種常見(jiàn)染色體的數(shù)目異常,不能檢出染色體結(jié)構(gòu)異常和其他染色體數(shù)目異常。 因此,QF-PCR技術(shù)同其他快速產(chǎn)前診斷技術(shù)一樣,不能代替?zhèn)鹘y(tǒng)的G顯帶核型分析,僅可作為核型分析的一種有力補(bǔ)充。