王勇,李玉玲,蘇來曼·艾則孜,孫鋒,伍國紅,駱強偉*
(新疆維吾爾自治區(qū)葡萄瓜果研究所,新疆鄯善 838200)
葡萄是種植廣泛的重要果樹之一。目前,全世界保存的葡萄資源約5000~15 000個品種[1]。這些品種主要通過雜交、實生選種、芽變、誘變等方法獲得[2]。雜交育種是葡萄育種的重要途徑,這種方式是在人工控制下,通過兩個不同基因型品種的配子結合而獲得新品種[3]。開展葡萄雜交遺傳情況研究,從微觀角度開展遺傳分析,有助于更好地指導葡萄雜交組合選配,把握育種方向,提高育種效率。
SSR標記(Simple Sequence Repeats Maker)是一類由幾個核苷酸(一般為1~6個)為重復單位組成的長達幾十個核苷酸的串聯重復序列。這些簡單重復序列均勻、隨機,廣泛地分布于真核生物的基因組上,具有數量豐富、多態(tài)性、高信息量、多等位基因、共顯性等特點,被廣泛用于遺傳圖譜的構建[4]、目標基因的標定[5]、指紋圖的繪制[6]等研究中。
試驗于2016年3月至2018年12月在新疆維吾爾自治區(qū)葡萄瓜果研究所完成。
新疆維吾爾自治區(qū)葡萄瓜果研究所育種材料資源圃7年生歐亞種的‘新郁’葡萄和‘無核白雞心’葡萄及‘新郁(♀)×無核白雞心(♂)’5年生雜交群體62株雜交單株,詳見表1。
表1 試驗材料Table 1 Test materials
表2 特異性引物序列Table 2 Specific primer sequences
1.3.1 引物序列(表2)
1.3.2 樣品基因組DNA的提取
采用改良的CTAB法[7]提取葡萄葉片的基因組DNA,通過瓊脂糖凝膠電泳,檢測提取的基因組DNA的片段長度、濃度和純度;通過分光光度計測定并計算DNA溶液的OD260/OD280、OD260/OD230值,若前者值在1.60~1.90,后者值>2.0可用于PCR擴增。
1.3.3 PCR反應體系及反應程序
使用PCR反應體系為:PCR MiX混合液(ng/μL)10 μL,SSR雙引物混合液(ng/μL)0.8 μL,模板(20 ng/μL)2.0 μL,ddH2O 7.2 μL,總反應體系為20 μL,PTC-100型PCR儀上進行反應。
擴增程序:94 ℃預變性4 min;94 ℃變性40 s,45~65 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,35個循環(huán);最后一個循環(huán)72 ℃延伸10 min;4 ℃保存。在操作中根據各引物差異進行體系優(yōu)化。
1.3.4 PCR產物的電泳分離
(3)上海“快樂30分”。上海目前93%的公辦小學已提供晚托服務,開設了“快樂30分”綜合活動和看護服務兩項內容。長寧區(qū)已實現晚托服務公民辦小學全覆蓋;嘉定區(qū)則把為學生積淀人文素養(yǎng)、強健體魄和培育特長相融合,99.29%的家長對此表示滿意,30%的孩子已經由原先學費高昂的培訓學校“回流”到學校。
采用8%非變性聚丙烯酰胺凝膠電泳。制膠加入ddH2O 40 mL,10×TBE 4 mL,40%Acr-Bis 8 mL,TENMED 40 μL,10%APS 400 μL,在電磁攪拌器上攪拌均勻后,搖勻后迅速倒入凝膠槽中,若有氣泡,將氣泡趕到邊上,迅速裝好梳子。待凝膠完全凝固后,將凝膠槽安放于電泳槽中,加入足夠量的0.5×TBE于電泳槽中,輕輕拔下梳子,使電泳槽中緩沖液覆蓋凝膠。
準備DNA樣品液:在點樣板各小坑中,加PCR產物約5 μL,均勻點樣。每排第一個點樣孔點一個PCR Marker作為分子量標記,接好電泳儀的正負極,樣品池應連接負極,打開電源進行電泳。約3 h,指示劑遷移到一定距離時,結束電泳。置凝膠于LED發(fā)光箱下,觀察分離的DNA條帶,照相。
1.3.5 PCR產物的電泳分離
在電腦上對凝膠電泳圖片進行分析,每張圖片上,第一個泳道是分子量標記PCR Marker,第二個是母本,第三個是父本。通過Marker找到目的條帶所處的大致位置,進而找到父本泳道的特異條帶,然后與后面的各株對應的泳道進行比較,觀察那些泳道出現與目的帶在一條線上的條帶,記下這些單株。
表3 ‘新郁’與‘無核白雞心’之間6對多態(tài)性特異引物的多態(tài)性與父本特異性Table 3 Polymorphism and paternity specificity of six pairs of polymorphic specific primers between 'Xinyu' and 'Centennial Seedless'
表4 引物Vchr4a對‘新郁’與‘無核白雞心’雜交群體遺傳多態(tài)性與特異性檢測情況Table 4 Detection of genetic polymorphism and specificity of 'Xinyu' and 'Centennial Seedless' hybrids by primer Vchr4a
利用葡萄SSR標記引物Vchr4a和Vchr15a分別對‘新郁’與‘無核白雞心’進行了PCR擴增和電泳檢測,分析結果見表3。引物Vchr4a在‘新郁’與‘無核白雞心’之間擴增出了6條多態(tài)性條帶,其中4條是在‘新郁’上擴增的,2條是在‘無核白雞心’上擴增的,且條帶長度在100~200 bp,根據條帶大小順序編號為m1、m2、m3、m4、m5、m6。m2和m4是‘無核白雞心’所具有,視為特異條帶。引物Vchr15a在‘新郁’與‘無核白雞心’之間擴增出了5條多態(tài)性條帶,其中3條是在‘新郁’上擴增的,2條是在‘無核白雞心’上擴增的,且條帶長度在100~200 bp,根據條帶大小順序編號為n1、n2、n3、n4、n5。n1和n3是‘無核白雞心’所具有,視為特異條帶。
利用葡萄SSR標記引物Vchr4a對62株‘新郁×無核白雞心’雜交組合進行PCR擴增和電泳檢測,結果見表4和圖1。引物Vchr4a在親本‘新郁’與‘無核白雞心’之間擴增的6條多態(tài)性條帶,在‘新郁×無核白雞心’F1代的遺傳上表現為7種類型。m1+m3+m4+m5+m6型最多為29個,占46.78%;其次為m3+m5型為18個,占29.03%。母本‘新郁’所具有的4條條帶分布于整個群體。父本‘無核白雞心’具有的2個條帶與母本‘新郁’所具有的4個條帶組合表現為5種類,共分布于41個單株中。這說明引物Vchr4a所標記的基因,就‘新郁’而言,遺傳給后代的能力強。該標記至少能確定群體中41個單株是‘無核白雞心’的雜種。
圖1 引物Vchr4a對‘新郁×無核白雞心’雜交組合的擴增結果Figure 1 Amplification results of primer Vchr4a in 'Xinyu×Centennial Seedless' hybrid combinations
利用葡萄SSR標記引物Vchr15a對62株‘新郁×無核白雞心’雜交組合進行PCR擴增和電泳檢測,結果見表5和圖2。引物Vchr15a在親本‘新郁’與‘無核白雞心’之間擴增的5條多態(tài)性條帶,在‘新郁×無核白雞心’F1代的遺傳上表現為4種類型。n2+n4型最多為48個,占77.42%,其次為n3+n5型為12個,占19.35%。母本‘新郁’所具有的3個條帶分布于整個群體。父本‘無核白雞心’具有的2個條帶與母本‘新郁’具有4個條帶組合表現為3種類,共分布于14個單株中。這說明引物Vchr15a所標記的基因,就‘新郁’而言,遺傳給后代的能力也很強。該標記至少能確定群體中14個單株是‘無核白雞心’的雜種。
圖2 引物Vchr15a對‘新郁×無核白雞心’雜交組合的擴增結果Figure 2 Amplification results of primer Vchr15a in 'Xinyu×Centennial Seedless' hybrid combinations
分子標記技術是一種以DNA多態(tài)性為基礎,通過檢測DNA分子由于缺失、插入、易位、倒位、重排或存在長短與排列不一的重復序列等機制而產生多態(tài)性的技術。該技術不受環(huán)境因素及發(fā)育階段的影響,具有快速、簡單、準確、可靠、穩(wěn)定、經濟等特點,特別是SSR標記技術因具有較好的穩(wěn)定性和多態(tài)性,在葡萄的分子標記輔助育種中應用的比較廣泛。Thomas等[8]、Bowers等[9-10]、Sefc等[11]相繼開發(fā)了9個適合葡萄品種鑒定的SSR引物:VVS2、VVMD5、VVMD7、VVMD32、VVMD28、VVMD27、VVMD25、VrZAG79、VrZAG62。在國際上,法國、德國、意大利等利用該9對引物建立了葡萄品種分子數據庫(www.vivc.de),在線為葡萄科研工作者提供查詢服務,為國際上葡萄品種的鑒定與交換奠定了基礎。但遺憾的是,該數據庫中不包含中國育成品種。目前,在葡萄基因組上已經定位了753個SSR標記[12],這為葡萄雜交真?zhèn)涡澡b別提供了理論依據。李貝貝等[13]利用SSR分子標記技術對314份葡萄品種進行了DNA指紋數據庫構建和遺傳多樣性分析。樊秀彩等[14]以山葡萄、河岸葡萄以及239株二者的雜交后代為材料,利用SSR引物作為雜種鑒定的標記,進行了有效地葡萄屬種間雜種真?zhèn)涡澡b定。憲立杰等[15]利用SSR標記技術對45個葡萄品種進行了遺傳多樣性分析,并建立了葡萄品種SSR基因型指紋庫。杜晶晶[16]應用9對SSR引物構建了80份葡萄種質的有效分子身份證。郭春苗等[17]利用4條SSR標記引物構建了新疆44個適宜制干葡萄品種DNA指紋圖譜。在此基礎上,本文從中選擇2對標記開展‘新郁’與‘無核白雞心’基因測定,研究定位基因遺傳情況,進一步完善分子標記輔助育種技術,為自育葡萄雜交真?zhèn)涡澡b定和指紋圖譜構建奠定基礎。
本文認為,兩個SSR引物所標記的母本‘新郁’的遺傳物質能夠在雜交群體中普遍遺傳,父本‘無核白雞心’的遺傳物質在雜交群體中表現為部分遺傳。SSR標記引物Vchr4a與Vchr15a可以用來鑒定該組合的雜交真?zhèn)涡?,Vchr4a所標記的基因比Vchr15a標記的遺傳能力強。但葡萄是具有高度雜合基因的多年生植物,單靠1條或2對引物不能完成群體的雜交真?zhèn)涡澡b定。