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維生素D受體基因遺傳變異對(duì)慢性變應(yīng)性鼻炎的預(yù)警作用

2019-06-18 04:02:02陳賽明周小柳周利民李志路張?jiān)葡?/span>
疑難病雜志 2019年6期
關(guān)鍵詞:關(guān)聯(lián)性等位基因多態(tài)性

陳賽明,周小柳,周利民,李志路,張?jiān)葡?/p>

變應(yīng)性鼻炎(allergic rhinitis,AR)又稱為過敏性鼻炎,表現(xiàn)為致敏個(gè)體再次接觸變應(yīng)原后,變應(yīng)原與機(jī)體內(nèi)炎性細(xì)胞表面的特異性IgE結(jié)合,導(dǎo)致機(jī)體出現(xiàn)鼻塞、流涕、噴嚏等一系列癥狀的慢性非感染性炎性反應(yīng)[1],表現(xiàn)為免疫性疾病的特點(diǎn)。而近些年來,維生素D在免疫性疾病中的調(diào)節(jié)作用日益受到重視,比如血清中維生素D的水平與AR的發(fā)生存在相關(guān)性[2]。維生素D受體(vitaminD receptor,VDR)是維生素D的活性形式發(fā)揮信號(hào)傳導(dǎo)作用的關(guān)鍵成分,其結(jié)構(gòu)及活性的改變都可能成為影響維生素D功能的重要因素[3]。近年研究表明,人群中基因多態(tài)性形式是形成個(gè)體差異和疾病發(fā)生的分子基礎(chǔ),可成為疾病發(fā)生和預(yù)警的標(biāo)記[4]。VDR基因存在眾多單核苷酸多態(tài)性(single nuclear polymorphism,SNP)位點(diǎn),而關(guān)于其遺傳多態(tài)性與AR的關(guān)聯(lián)性研究較少。因此,筆者選擇了VDR 5個(gè)SNP位點(diǎn)rs7975232、rs2228570、rs731236、rs1544410及rs11568820進(jìn)行病例對(duì)照研究,以期探尋上述SNP位點(diǎn)與AR的相關(guān)性及預(yù)警價(jià)值。由于基因分型的方法不同,此文僅報(bào)道rs731236、rs1544410及rs11568820三個(gè)位點(diǎn)的研究結(jié)果。

1 資料與方法

1.1 臨床資料 選擇2017年3月—12月海南醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院收治的94例變應(yīng)性鼻炎患者作為試驗(yàn)組(AR組),選擇同期在醫(yī)院健康體檢的健康人113例作為健康對(duì)照組(HC組)。AR組男53例,女41例,年齡30~52(42.13±7.02)歲;健康對(duì)照組男70例,女43例,年齡30~50(41.25±6.88)歲。2組性別、年齡等一般資料比較差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性。本研究已經(jīng)醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),入選者知情同意并簽署知情同意書。

1.2 選擇標(biāo)準(zhǔn) 納入標(biāo)準(zhǔn):(1)所有AR患者均符合診斷標(biāo)準(zhǔn)[5];(2)入選者近期未接受糖皮質(zhì)激素、抗組胺藥等藥物治療。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)變態(tài)反應(yīng)性疾病史者;(2)血液病者;(3)寄生蟲病史者;(4)合并哮喘、特應(yīng)性皮炎等變應(yīng)性疾病者;(5)自身免疫性疾病者。

1.3 基因分型方法 采集所有入選者EDTAK2抗凝血2 ml,取200 μl進(jìn)行基因組DNA提取及質(zhì)量鑒定。委托上海捷瑞生物工程有限公司對(duì)樣本進(jìn)行VDR基因多態(tài)性位點(diǎn)的分型。具體過程如下:合成引物P1(5′-GGTGGGATTGAGCAGTGA-3′)、P2(5′-TCTTGGCATAGAGCAGGTG-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增包含rs731236的193bp的PCR片段;合成引物P3(5′-GTGTGCAGGCGATTCGTAGG-3′)、P4(5′-GGAAGAGGTCAAGGGTCACTG-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增包含rs1544410的185bp的片段;合成引物P5(5′-GAGGGAGGGAGGAAGGAA-3′)、P6(5′-CTGTAGCAATGAAAGCAAACCA-3′)進(jìn)行PCR擴(kuò)增包含rs11568820的199bp的片段。純化后分別對(duì)上述PCR產(chǎn)物進(jìn)行延伸,延伸產(chǎn)物各取10 μl,利用美國ABI公司的3730XL基因測(cè)序儀進(jìn)行序列測(cè)定及數(shù)據(jù)讀取。

1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法 利用SNPStats軟件進(jìn)行分析,連鎖不平衡分析采用Hardy-Weinberg模型,基因型分布頻率采用Logistic 回歸分析,基因型的組間差異用共顯性、顯性、隱性模型3個(gè)模型驗(yàn)證。利用SPSS 25.0軟件對(duì)等位基因的分布頻率進(jìn)行χ2分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié) 果

2.1 VDR基因3個(gè)SNP的基本信息 本研究選取3個(gè)SNP位點(diǎn)作為研究對(duì)象,根據(jù)NCBI(SNP)數(shù)據(jù)庫中的信息,rs731236位于編碼區(qū)內(nèi),存在T/C兩種形態(tài),其中T為野生型等位基因,全球發(fā)生頻率為0.720,突變基因型C屬于次要等位基因,全球發(fā)生頻率為0.280;rs1544410和rs11568820屬于內(nèi)含子突變,均存在G/A兩種多態(tài)性,前者野生型等位基因?yàn)镚,全球發(fā)生頻率為0.700,后者野生型等位基因?yàn)锳,全球發(fā)生頻率為0.543;在NCBI數(shù)據(jù)庫給出的信息中,rs731236突變可能存在臨床意義,而其他兩個(gè)SNP位點(diǎn)的突變則未發(fā)現(xiàn),見表1。

表1 VDR基因3個(gè)SNP位點(diǎn)的基本信息

注:本表信息提取于2018年10月18日NCBI(SNP)數(shù)據(jù)庫

2.2 VDR基因3個(gè)SNP的基因型檢測(cè)及與AR相關(guān)性分析 rs11568820在受試人群中均檢測(cè)出GG、AG、AA 3種基因型,在AR組和對(duì)照組中的分布頻率分別為29.8%/34.5%、51.1%/51.3%、19.1%/14.2%,SNPState在線分析結(jié)果顯示共顯性模型、顯性模型、隱性模型的檢測(cè)結(jié)果差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。rs731236和rs1544410在受試人群中均檢測(cè)出野生型純合子和雜合子2種基因型,rs731236野生型純合子TT和雜合子CT在試驗(yàn)組和對(duì)照組中的分布頻率分別為87.2%/90.3%、12.8%/9.7%,AR組中雜合子的發(fā)生頻率高于對(duì)照組,說明突變可能與AR相關(guān),但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);rs1544410的野生型純合子GG和雜合子AG在AR組和對(duì)照組中的發(fā)生頻率分別為90.4%/90.3%、9.6%/9.7%,差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表2。

2.3 3個(gè)SNP位點(diǎn)等位基因發(fā)生頻率及與AR相關(guān)性分析 rs11568820位點(diǎn)突變等位基因A在AR組中的分布頻率高于對(duì)照組,但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。rs731236、rs154410兩個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的等位基因分布頻率組間比較差異亦無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見表3。

3 討 論

AR屬于多基因遺傳變態(tài)反應(yīng)性疾病,并以嗜酸性粒細(xì)胞趨化、轉(zhuǎn)移并聚集于鼻黏膜組織為主要病理學(xué)特征,同時(shí)可釋放大量炎性介質(zhì)進(jìn)而加重鼻黏膜損傷[6]。研究表明,許多參與細(xì)胞增殖分化及凋亡的信號(hào)通路與AR的發(fā)生密切相關(guān),例如Notch信號(hào)通路、維生素D信號(hào)通路,均可通過影響免疫細(xì)胞的生命活動(dòng)而對(duì)鼻炎的發(fā)生發(fā)展產(chǎn)生密切調(diào)節(jié)和影響[7-8]。維生素D信號(hào)通路的主要成分包括維生素D結(jié)合蛋白(GC)、細(xì)胞色素P450家族成員(CYP2R1)、維生素D受體等。維生素D代謝通路除了影響鈣磷代謝之外,還參與多種疾病的發(fā)生發(fā)展過程。喬俊英等[9]研究發(fā)現(xiàn),適量1,25-(OH)2D3可能通過調(diào)控HMGB1/TLR4/NF-κB信號(hào)通路在哮喘發(fā)病中起重要作用。桂明才等[10]則認(rèn)為維生素D3可通過調(diào)控PI3K/AKT信號(hào)通路誘導(dǎo)喉癌細(xì)胞凋亡。

表3 維生素D受體3個(gè)SNP位點(diǎn)等位基因分布頻率與AR關(guān)聯(lián)性分析 [基因數(shù)(%)]

維生素D受體作為維生素D信號(hào)通路中的關(guān)鍵成分,其結(jié)構(gòu)與功能對(duì)維生素D的代謝及功能發(fā)揮起著至關(guān)重要的作用。尤其是關(guān)于VDR基因多態(tài)性與疾病發(fā)生的相關(guān)性研究越來越多,有研究表明VDR受體基因多態(tài)性與北京地區(qū)老年男性原發(fā)性高血壓的發(fā)生密切相關(guān)[11],陳詠等[12]研究發(fā)現(xiàn)VDR多態(tài)性與多囊卵巢綜合征的發(fā)生存在關(guān)聯(lián),王麗等[13]則研究了VDR受體基因多態(tài)性與鼻咽癌的關(guān)聯(lián)性。

在本研究中,選擇了2017年在醫(yī)院住院治療的AR患者及健康對(duì)照者進(jìn)行對(duì)照研究,多態(tài)性位點(diǎn)rs11568820檢測(cè)出野生型純合子、雜合子、突變型純合子3種基因型,而所選擇的其他2個(gè)位點(diǎn)rs731236、rs1544410 則只檢測(cè)出野生型純合子及雜合子2種基因型。對(duì)rs11568820的3種基因型進(jìn)行遺傳學(xué)模型統(tǒng)計(jì)分析,結(jié)果表明共顯性模型、顯性模型、隱性模型組間比較差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。對(duì)rs731236、rs1544410這2個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,結(jié)果表明差異亦無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。此外,對(duì)AR組和健康對(duì)照組3個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的等位基因分布頻率進(jìn)行了分析,結(jié)果差異亦無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

表2 VDR基因多態(tài)性與AR的關(guān)聯(lián)性分析 [例(%)]

rs11568820位于12號(hào)染色體(47908762),該區(qū)域?qū)儆赩DR基因的啟動(dòng)子區(qū)。NCBI數(shù)據(jù)庫中有超過80條文獻(xiàn)對(duì)該位點(diǎn)與血清維生素D的水平及疾病的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行了研究。Yin 等[14]研究發(fā)現(xiàn)此SNP位點(diǎn)與中國人群的胃癌發(fā)生存在關(guān)聯(lián),Yang等[15]則發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)與中國華北地區(qū)人群的食管癌有關(guān)。這說明rs11568820可能通過影響VDR的表達(dá)而影響維生素D信號(hào)通路的作用。本研究首次報(bào)道了rs11568820與變應(yīng)性鼻炎的關(guān)聯(lián)性,結(jié)果表明,3種基因型在2組中的分布頻率并未呈現(xiàn)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,提示該位點(diǎn)的多態(tài)性與慢性變應(yīng)性鼻炎的關(guān)聯(lián)性不強(qiáng)。

rs731236屬于VDR編碼區(qū)密碼子的同義突變,目前NCBI的數(shù)據(jù)庫中有超過200條文獻(xiàn)報(bào)道了該位點(diǎn)與機(jī)體性狀及疾病的關(guān)聯(lián)性。rs1544410屬于VDR編碼基因的內(nèi)含子突變。Tian等[16]在2015年報(bào)道了關(guān)于上述2個(gè)SNP位點(diǎn)與中國人群AR的關(guān)聯(lián)性研究,未發(fā)現(xiàn)顯著關(guān)聯(lián)性。本次針對(duì)rs731236及rs1544410的研究也未發(fā)現(xiàn)與AR的關(guān)聯(lián)性,這與Tian等的研究結(jié)果一致,同時(shí)也提示rs731236堿基的形態(tài)變化未影響密碼子的功能及蛋白質(zhì)的結(jié)構(gòu),而內(nèi)含子突變r(jià)s1544410也未對(duì)VDR的表達(dá)產(chǎn)生影響。

綜上,本研究的3個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)在慢性變應(yīng)性鼻炎患者及健康對(duì)照者之間的基因型分布頻率、等位基因分布頻率均不存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,說明這些位點(diǎn)不是慢性變應(yīng)性鼻炎的易感位點(diǎn)。因而,在后續(xù)的研究中,一方面建議增加研究對(duì)象的數(shù)量,另一方面建議選取更多的SNP位點(diǎn)進(jìn)行研究,以期尋找AR的易感SNP位點(diǎn),從而為其診斷及預(yù)警機(jī)制的構(gòu)建提供依據(jù)。

利益沖突:無

作者貢獻(xiàn)聲明

陳賽明:設(shè)計(jì)研究方案,監(jiān)督實(shí)施過程,論文撰寫;周小柳、周利民:實(shí)施研究過程,資料搜集整理;李志路:進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析;張?jiān)葡迹禾岢鲅芯克悸?,分析試?yàn)數(shù)據(jù),論文修改、審核

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