馬旭蘭,代蔭梅
(首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京婦產(chǎn)醫(yī)院婦科,北京 100026)
在人類基因組中,穩(wěn)定轉(zhuǎn)錄的蛋白質(zhì)編碼基因比例僅占2%,高達(dá)90%的真核基因組中DNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物均為非編碼RNA[1]。非編碼RNA包括短鏈非編碼RNA(長(zhǎng)度為20~50個(gè)核苷酸,如微RNA、小干擾RNA等),中等鏈非編碼RNA(長(zhǎng)度為50~200個(gè)核苷酸,如核小RNA、核仁小RNA等)和長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs,lncRNAs)[長(zhǎng)度為200~100 000個(gè)核苷酸,如同源異型盒基因轉(zhuǎn)錄反義基因間RNA(HOX transeript antisense intergenitic RNA,HOTAIR)、肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1等][2]。其中,lncRNAs可在不同層面廣泛參與基因組的調(diào)控過程,如表觀遺傳學(xué)、轉(zhuǎn)錄水平及轉(zhuǎn)錄后水平等[3]。HOTAIR是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)的反義轉(zhuǎn)錄lncRNAs,長(zhǎng)為2.2 kb,定位于第12號(hào)染色體的HOXD基因座,由Rinn等[4]在人成纖維細(xì)胞中發(fā)現(xiàn),是目前探究的熱點(diǎn)lncRNAs之一。有研究證實(shí),HOTAIR在乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌、結(jié)直腸癌、宮頸癌等多種腫瘤中高表達(dá),并均可促進(jìn)腫瘤的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移、復(fù)發(fā)和耐藥等惡性生物學(xué)行為的進(jìn)展[5-8]。現(xiàn)對(duì)HOTAIR在腫瘤中轉(zhuǎn)錄調(diào)控及作用機(jī)制的研究進(jìn)展予以綜述。
HOTAIR的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制異常復(fù)雜,受許多因素調(diào)控,但目前各因素在不同腫瘤中的研究較少,有待進(jìn)一步研究。Bhan等[5]研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR轉(zhuǎn)錄受雌激素正向調(diào)控,應(yīng)用17β-雌二醇刺激雌激素受體陽性的人乳腺癌MCF7細(xì)胞后發(fā)現(xiàn),HOTAIR被誘導(dǎo)轉(zhuǎn)錄,且在暴露于雌激素受體抑制劑他莫昔芬后轉(zhuǎn)錄水平受到抑制。研究表明,HOTAIR轉(zhuǎn)錄由核受體共抑制因子維持在基礎(chǔ)狀態(tài),暴露于雌激素時(shí),雌激素通過雌激素-雌激素受體-雌激素受體反應(yīng)元件途徑與多種雌激素受體共調(diào)節(jié)因子共同結(jié)合在HOTAIR啟動(dòng)子上,解除核受體共抑制因子對(duì)HOTAIR的轉(zhuǎn)錄抑制,誘導(dǎo)HOTAIR轉(zhuǎn)錄[5,9]。此外,在子宮內(nèi)膜癌[10]、前列腺癌[11]等腫瘤中,雌激素誘導(dǎo)HOTAIR轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)也得到了證實(shí)。Bhan等[12]進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),雌激素內(nèi)分泌干擾物雙酚A和己烯雌酚也可發(fā)揮類雌激素作用,誘導(dǎo)HOTAIR轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)。
原癌基因c-Myc也是影響HOTAIR轉(zhuǎn)錄的因素。Ma等[13]對(duì)膽囊癌組織和細(xì)胞的研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR是c-Myc的直接作用靶點(diǎn),c-Myc正向調(diào)控HOTAIR的表達(dá)。具體作用機(jī)制為c-Myc通過識(shí)別并作用于HOTAIR上游區(qū)域的假定E-box元素(c-Myc靶標(biāo)反應(yīng)元件),導(dǎo)致HOTAIR表達(dá)上調(diào),敲減c-Myc可降低HOTAIR的表達(dá)及其啟動(dòng)子活性,上調(diào)c-Myc則可增加HOTAIR表達(dá)及其啟動(dòng)子活性。此外,Li等[14]對(duì)乳腺癌的研究證實(shí),HOTAIR是c-Myc激活其靶基因轉(zhuǎn)錄的關(guān)鍵效應(yīng)因子。轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β1也可刺激HOTAIR轉(zhuǎn)錄上調(diào)。Ren等[15]研究發(fā)現(xiàn),癌相關(guān)成纖維細(xì)胞通過分泌轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β1激活HOTAIR轉(zhuǎn)錄,促進(jìn)乳腺癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移,表明轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β1表達(dá)增加可顯著增強(qiáng)HOTAIR表達(dá),而轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β1抑制劑減弱HOTAI活化,由此可見,轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β1/HOTAIR軸有望成為乳腺癌治療的靶標(biāo)。
Yang等[16]對(duì)多種癌細(xì)胞系進(jìn)行實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),重組人骨橋蛋白可以時(shí)間和劑量依賴方式誘導(dǎo)HOTAIR轉(zhuǎn)錄,而骨橋蛋白可以下調(diào)重組人干擾素調(diào)節(jié)因子1的表達(dá),并通過染色質(zhì)免疫沉淀和熒光素酶活性測(cè)定實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),干擾素調(diào)節(jié)因子1可以與HOTAIR啟動(dòng)子區(qū)域結(jié)合并降低其轉(zhuǎn)錄活性,且細(xì)胞過度表達(dá)的干擾素調(diào)節(jié)因子1可下調(diào)HOTAIR的表達(dá)??梢?,骨橋蛋白作為細(xì)胞外基質(zhì)蛋白可以通過減弱干擾素調(diào)節(jié)因子1的抑制作用來刺激HOTAIR轉(zhuǎn)錄,從而促進(jìn)癌細(xì)胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。此外,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3信號(hào)通路也可調(diào)控HOTAIR的轉(zhuǎn)錄。Sun等[17]對(duì)頭頸部鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞的體內(nèi)外實(shí)驗(yàn)研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR和組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶zeste基因增強(qiáng)子同源物2(enhancer of zeste homolog 2,EZH2)是頭頸部鱗狀細(xì)胞癌中信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的下游效應(yīng)分子,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3可通過與HOTAIR編碼基因的啟動(dòng)子結(jié)合上調(diào)HOTAIR轉(zhuǎn)錄,從而增強(qiáng)EZH2介導(dǎo)的表觀遺傳沉默,表明信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3/HOTAIR信號(hào)軸以依賴EZH2的方式調(diào)控頭頸部鱗狀細(xì)胞癌生長(zhǎng),為靶向信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3/HOTAIR/EZH2信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)治療頭頸部鱗狀細(xì)胞癌提供了理論基礎(chǔ)。
2.1HOTAIR通過與多梳蛋白抑制復(fù)合體2(polycomb repressive complex 2,PRC2)和賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶1結(jié)合發(fā)揮作用 LncRNA HOTAIR最經(jīng)典的作用機(jī)制是發(fā)揮lncRNAs支架分子的功能,招募并結(jié)合PRC2和賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶1復(fù)合體,形成組蛋白修飾復(fù)合物,定位至特定的HOX基因位點(diǎn),使該位點(diǎn)發(fā)生表觀遺傳學(xué)沉默,促進(jìn)腫瘤惡性生物學(xué)行為的進(jìn)展。其中,HOTAIR的3′端結(jié)構(gòu)域招募賴氨酸特異性組蛋白去甲基化酶1復(fù)合體,發(fā)揮去除染色體組蛋白H3第4位賴氨酸二甲基化狀態(tài)(即去甲基化)的作用,通過調(diào)控靶基因表達(dá)發(fā)揮促癌作用。而PRC2復(fù)合體與其5′端結(jié)構(gòu)域結(jié)合,具有組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶活性,其核心成分主要由EZH2、EED、SUZ12亞基構(gòu)成,通過介導(dǎo)染色體組蛋白H3第27位賴氨酸三甲基化導(dǎo)致一系列細(xì)胞生長(zhǎng)所必需基因的沉默[18-19]。Betancur和Tomari[20]對(duì)細(xì)胞中純化出的PRC2的各個(gè)組分的研究發(fā)現(xiàn),EED負(fù)責(zé)調(diào)節(jié)EZH2、SUZ12的RNA結(jié)合活性,是PRC2的伴侶蛋白,而EZH2和SUZ12可以直接與RNA結(jié)合,其中EZH2是發(fā)揮主要作用的亞基。EZH2的失調(diào)與多種腫瘤的表觀遺傳畸變都存在聯(lián)系。多項(xiàng)研究表明,HOTAIR通過與EZH2結(jié)合在多種腫瘤中發(fā)揮促癌作用[21-24]。Gonzalez等[25]的研究證明,在轉(zhuǎn)錄激活因子中,EZH2還具有PRC2非依賴性功能,也可單獨(dú)發(fā)揮作用。
2.2HOTAIR作為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA發(fā)揮作用 競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA是在轉(zhuǎn)錄后水平相互調(diào)控的一類RNA的總稱,具有相同的微RNA(microRNA,miRNA)應(yīng)答元件,可通過該應(yīng)答元件競(jìng)爭(zhēng)同一種miRNA,從而實(shí)現(xiàn)自身間的相互作用及參與靶基因的表達(dá)調(diào)控[26]。多項(xiàng)研究表明,lncRNA HOTAIR可作為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA,通過“海綿效應(yīng)”招募并結(jié)合miRNA抑制其表達(dá),從而促進(jìn)腫瘤的發(fā)生與發(fā)展(表1)[10,23,27-35]。以上發(fā)現(xiàn)有助于對(duì)腫瘤發(fā)生與發(fā)展機(jī)制的理解,并為治療該腫瘤提供新的研究方向和治療靶點(diǎn)。
2.3HOTAIR通過激活信號(hào)通路發(fā)揮作用 HOTAIR可通過調(diào)節(jié)Wnt/β聯(lián)蛋白信號(hào)通路的活性來調(diào)控腫瘤的進(jìn)展。Guo等[36]納入北京協(xié)和醫(yī)院病理科標(biāo)本庫中48例接受順鉑作為新輔助化療的非小細(xì)胞肺癌患者的組織進(jìn)行研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR通過調(diào)節(jié)Wnt信號(hào)通路對(duì)非小細(xì)胞肺癌順鉑耐藥發(fā)揮重要作用,可能是影響非小細(xì)胞肺癌患者臨床預(yù)后的重要因素。Cheng等[37]經(jīng)過一系列實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),敲減HOTAIR可上調(diào)miR-34a抑制磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B和Wnt/β聯(lián)蛋白信號(hào)通路,從而抑制胃癌細(xì)胞對(duì)順鉑的耐藥性。Xiao等[30]的研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR可通過調(diào)節(jié)miR-203a-3p的表達(dá)水平及Wnt/β聯(lián)蛋白信號(hào)通路的活性調(diào)節(jié)結(jié)直腸癌的進(jìn)展和化學(xué)耐藥性。
此外,HOTAIR還通過其他信號(hào)通路發(fā)揮作用。Yu等[38]研究表明,HOTAIR可通過調(diào)節(jié)p53/蛋白激酶B/c-Jun氨基端激酶信號(hào)通路調(diào)節(jié)乳腺癌細(xì)胞的增殖、凋亡、遷移和侵襲。Liu等[39]研究顯示,慢病毒介導(dǎo)的HOTAIR沉默通過激活凋亡相關(guān)基因Bax/胱天蛋白酶3抑制肺腺癌中的轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-α/表皮生長(zhǎng)因子受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路,從而恢復(fù)腫瘤細(xì)胞對(duì)吉非替尼的敏感性。
2.4HOTAIR通過上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化途徑發(fā)揮作用 HOTAIR可通過參與上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化途徑調(diào)控腫瘤的發(fā)生。Dasgupta等[40]研究發(fā)現(xiàn),miR-203可抑制HOTAIR表達(dá),并通過上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化途徑調(diào)節(jié)腎細(xì)胞癌的發(fā)生。Lu等[41]研究顯示,在口腔鱗狀細(xì)胞癌中,HOTAIR過度表達(dá)增強(qiáng)了癌細(xì)胞的轉(zhuǎn)移潛能和上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化特征,還發(fā)現(xiàn)HOTAIR的表達(dá)與間充質(zhì)標(biāo)記呈正相關(guān),與臨床樣本中的上皮標(biāo)記呈負(fù)相關(guān)。此外,Kaplan-Meier生存分析表明,高水平的HOTAIR是口腔鱗狀細(xì)胞癌患者生存率低的強(qiáng)預(yù)測(cè)因子。綜上所述,HOTAIR介導(dǎo)的癌癥干性(具有能夠自我更新和分化的干細(xì)胞特性)和轉(zhuǎn)移與上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化的調(diào)節(jié)相關(guān)。
轉(zhuǎn)錄因子Snail是細(xì)胞特性和上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化的主要調(diào)節(jié)因子,直接抑制廣泛的上皮基因庫。Battistelli等[24]研究顯示,HOTAIR介導(dǎo)Snail和EZH2的增強(qiáng)子之間的相互作用,將EZH2募集到特定的基因組位點(diǎn)。Snail活性抑制取決于Snail/HOTAIR/EZH2HOTAIR:同源異型盒基因轉(zhuǎn)錄反義基因間RNA;miRNA:微RNA;NPM1:核仁磷酸蛋白1;notch3:notch3信號(hào)通路;Ki67:細(xì)胞核增殖抗原;PCNA:增殖細(xì)胞核抗原;Wnt/β-catenin:Wnt/β聯(lián)蛋白;BCL2:B淋巴細(xì)胞瘤2基因;NRP2:神經(jīng)纖毛蛋白質(zhì)2;GPC5:磷脂酰肌醇蛋白聚糖家族成員5;PTPN14:蛋白酪氨酸磷酸酶14;GLS:谷氨酰胺酶三聯(lián)復(fù)合物的形成。以上結(jié)果證明,HOTAIR在Snail介導(dǎo)的上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化中起關(guān)鍵作用。
表1 HOTAIR在腫瘤中作為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA發(fā)揮作用的機(jī)制
2.5HOTAIR促進(jìn)蛋白質(zhì)泛素化 HOTAIR還可通過促進(jìn)蛋白質(zhì)泛素化來調(diào)控腫瘤的發(fā)展。Yoon等[42]對(duì)人HeLa細(xì)胞、人成纖維細(xì)胞IDH4和WI-38以及小鼠胚胎成纖維細(xì)胞的實(shí)驗(yàn)研究顯示,HOTAIR可作為蛋白質(zhì)泛素化的平臺(tái),幫助組裝E3泛素連接酶與其各自底物相結(jié)合,促進(jìn)該復(fù)合物泛素化,并加速其降解。Mex3b和Dzip3為E3泛素連接酶,具有與HOTAIR結(jié)合的特定RNA結(jié)合域。其中,Mex3b存在于細(xì)胞核和細(xì)胞質(zhì)中,相應(yīng)的泛素化底物為Snurportin-1蛋白。而Dzip3只存在于細(xì)胞質(zhì)的囊泡中,可促進(jìn)Ataxin-1蛋白的泛素化。Xue等[43]應(yīng)用RNA-蛋白質(zhì)相互作用預(yù)測(cè)軟件篩選可能與Runt相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子3(Runt-related transcription factor 3,Runx3)(一種在胃癌中發(fā)揮抑癌作用的重要轉(zhuǎn)錄因子)結(jié)合的lncRNAs發(fā)現(xiàn),HOTAIR與Runx3蛋白結(jié)合并鑒定HOTAIR的相關(guān)片段后,通過RNA免疫沉淀和RNA敲減實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證了HOTAIR與Runx3之間的相互作用,通過免疫共沉淀評(píng)估E3泛素連接酶Mex3b和Dzip3在HOTAIR誘導(dǎo)的Runx3泛素化中的作用,利用Pearson相關(guān)性分析HOTAIR信使RNA表達(dá)與Runx3蛋白表達(dá)之間的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn),Mex3b可作為E3泛素連接酶參與HOTAIR誘導(dǎo)的Runx3普遍降解過程,沉默HOTAIR或Mex3b的表達(dá)減弱Runx3的降解。由此可見,HOTAIR與Mex3b相互作用可誘導(dǎo)Runx3蛋白的泛素化,增強(qiáng)胃癌細(xì)胞的侵襲能力,并為胃癌的轉(zhuǎn)移提供潛在的治療靶點(diǎn)。目前,關(guān)于HOTAIR促進(jìn)蛋白質(zhì)泛素化的相關(guān)研究較少,HOTAIR在不同腫瘤中參與不同蛋白質(zhì)的泛素化過程仍存在很大的研究潛力和意義,有待進(jìn)一步研究。
2.6HOTAIR調(diào)控自噬的發(fā)生 自噬也稱為細(xì)胞的“自我消化”,是一種高度保守的生物學(xué)行為,有助于維持細(xì)胞新陳代謝的穩(wěn)定,不僅在正常細(xì)胞中發(fā)揮作用,還在腫瘤細(xì)胞適應(yīng)缺氧、耐受外界刺激和誘導(dǎo)腫瘤化療耐藥性中發(fā)揮重要作用,已成為近年來研究的焦點(diǎn)[44]。Wang等[44]利用小干擾RNA干擾口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞中HOTAIR的表達(dá),并通過透射電鏡、Western blotting法及流式細(xì)胞術(shù)檢測(cè)細(xì)胞的自噬及凋亡,評(píng)估HOTAIR對(duì)中位致死劑量順鉑敏感性影響的研究表明,HOTAIR在口腔鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞中作為致癌基因可加速細(xì)胞自噬作用,減少細(xì)胞凋亡,并增加口腔鱗狀細(xì)胞癌對(duì)順鉑的耐藥性。Yu等[45]研究發(fā)現(xiàn),卵巢癌細(xì)胞中沉默HOTAIR可抑制自噬相關(guān)基因7和微管相關(guān)蛋白1輕鏈3Ⅱ/Ⅰ的表達(dá),從而抑制自噬過程,而自噬相關(guān)基因7和微管相關(guān)蛋白1輕鏈3Ⅱ/Ⅰ的表達(dá)水平可隨順鉑濃度的增加而增加,下調(diào)自噬相關(guān)基因7可抑制順鉑誘導(dǎo)的自噬,隨后下調(diào)HOTAIR表達(dá)聯(lián)合順鉑刺激后發(fā)現(xiàn),卵巢癌細(xì)胞增殖和自噬水平受到抑制,抗凋亡蛋白Bcl-2的表達(dá)下降,而促凋亡蛋白Bax表達(dá)升高,細(xì)胞凋亡增加,可見下調(diào)HOTAIR的表達(dá)可通過抑制順鉑誘導(dǎo)的自噬提高順鉑對(duì)卵巢癌的敏感性,從而提高順鉑治療卵巢癌的效果。此外,HOTAIR可促進(jìn)自噬的發(fā)生,導(dǎo)致非小細(xì)胞肺癌[46]、子宮內(nèi)膜癌[47]、乳腺癌[48]、軟骨肉瘤[49]、肝細(xì)胞癌[50]等腫瘤細(xì)胞對(duì)化療藥物耐藥性增加。
近年來,有關(guān)lncRNA HOTAIR的研究不僅局限于HOTAIR對(duì)多種腫瘤組織和細(xì)胞的表達(dá)水平以及對(duì)腫瘤細(xì)胞增殖、凋亡、侵襲和遷移的影響,還深入研究了HOTAIR在不同腫瘤中的具體轉(zhuǎn)錄調(diào)控及作用機(jī)制等,取得了顯著的成果。但還有待對(duì)整個(gè)HOTAIR復(fù)雜的調(diào)控機(jī)制進(jìn)行深入研究,尤其是一些相對(duì)冷門的腫瘤中HOTAIR作用機(jī)制的研究。因此,進(jìn)一步闡明HOTAIR在不同腫瘤中的具體作用機(jī)制是實(shí)現(xiàn)腫瘤精準(zhǔn)治療的理論基礎(chǔ)。
目前,尚未將HOTAIR具體作用機(jī)制的研究成果應(yīng)用于臨床。開發(fā)通過血液、尿液或其他體液等檢測(cè)HOTAIR表達(dá)水平的試劑盒等,可實(shí)現(xiàn)多種腫瘤的早發(fā)現(xiàn)、早診斷、早治療以及準(zhǔn)確評(píng)估預(yù)后等,還可將能夠敲低HOTAIR或影響其發(fā)揮作用的上下游分子制成靶向藥物應(yīng)用于臨床,下調(diào)HOTAIR水平,從而治療腫瘤和解決化療耐藥性等。隨著HOTAIR的相關(guān)研究思路、方法、技術(shù)等的不斷更新與完善,積極開發(fā)HOTAIR的臨床應(yīng)用潛力,將使其成為判定惡性腫瘤發(fā)生和預(yù)后的生物標(biāo)志物以及治療惡性腫瘤的新靶點(diǎn)。