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運用全因子試驗方法優(yōu)化單抗生物類似藥生產(chǎn)過程中的糖基化分布

2019-05-17 09:36張磊楊沐迪董順劉明秋
生物技術(shù)通報 2019年3期
關(guān)鍵詞:添加物半乳糖糖基化

張磊 楊沐迪 董順 劉明秋

(1. 復(fù)旦大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,上海 200438;2. 上海博威生物醫(yī)藥有限公司,上海 201318)

蛋白質(zhì)糖基化對蛋白質(zhì)的構(gòu)象、溶解度、穩(wěn)定性、免疫原性以及生物學(xué)活性有較大影響[1]。根據(jù)不同的修飾位點,糖基化可分為N-端糖基化和O-端糖基化。對于單抗藥物而言,N-端糖基化是最重要的翻譯后修飾之一,該修飾起始于內(nèi)質(zhì)網(wǎng),結(jié)束于高爾基體,與單抗穩(wěn)定性、生物學(xué)活性、半衰期和免疫原性有關(guān)[1]。常見的N-端糖基化修飾包括半乳糖基化、巖藻糖基化和Man5等,不同糖基化修飾的單抗與Fc受體結(jié)合能力不同,從而影響藥物的生物學(xué)活性。例如,通過半乳糖苷酶切掉單抗的半乳糖殘基后,單抗補體依賴的細胞毒作用(CDC)活性降低了25%,而高半乳糖基化的單抗能夠提高50%的CDC活性[2-3]。此外,具有巖藻糖基化的單抗會降低其抗體依賴細胞介導(dǎo)的細胞毒作用(ADCC)活性[4]。而Man5修飾的單抗不僅血清半衰期短,并且具有較強的免疫原性[5-6],因此,在細胞培養(yǎng)過程中應(yīng)盡量降低Man5修飾。

在動物細胞培養(yǎng)生產(chǎn)抗體藥物過程中,不同宿主細胞、pH、溫度、DO(溶解氧)、二氧化碳分壓、氨氮濃度等都能影響糖基化修飾過程[7-8]。近年來,越來越多的研究開始關(guān)注添加物對單抗糖基化修飾的影響,如在細胞培養(yǎng)中加入天冬酰胺或N-乙酰葡萄糖胺(GlcNAc)均能引起半乳糖基化降低[9-10],而加入半乳糖、錳離子等可提高單抗半乳糖基化[11-13]。另外有研究顯示,添加錳離子或甜菜堿能降低Man5[14-15]。目前,針對單抗巖藻糖基化調(diào)控的報道較少,基本停留在基因工程改良細胞株階段。

本研究以表達單抗的CHO細胞為研究對象,在前期開發(fā)中其半乳糖基化和Man5均與原研藥存在較大差異。通過全因子設(shè)計(FFD),在搖瓶培養(yǎng)中考察半乳糖、尿苷、氯化錳和蛋白水解物對細胞生長、單抗產(chǎn)量和單抗糖基化的影響并建立糖基化調(diào)控模型。在此基礎(chǔ)之上,通過不同規(guī)模的反應(yīng)器培養(yǎng)驗證模型最優(yōu)條件。單抗藥物的糖基化調(diào)控是生物類似藥工藝研發(fā)的重點和難點,本研究通過FFD設(shè)計優(yōu)化單抗糖基化分布,從而為生物類似單抗藥物的糖基化調(diào)控提供重要科學(xué)依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 細胞株 試驗用細胞株為CHO-K1細胞,表達抗核因子κ B受體活化因子配體單抗,由本公司提供。

1.1.2 培養(yǎng)基 基礎(chǔ)培養(yǎng)基Fed-batch、流加培養(yǎng)基Feed 1、半乳糖、尿苷、氯化錳均購于Sigma-Aldrich公司。蛋白水解物購于Kerry公司。地諾單抗(Prolia,Amgen Inc)作為原研藥。

1.2 方法

1.2.1 種子細胞培養(yǎng) 從細胞庫中復(fù)蘇細胞,以0.5×106cells/ mL活細胞密度接種于搖瓶,置于36.5℃、130 r/min和5% CO2的搖床(瑞士科耐Kuhner公司)中培養(yǎng)。每3 d進行細胞傳代,作為試驗用種子細胞。

1.2.2 批次培養(yǎng) 取對數(shù)生長期細胞,以約0.5×106cells/ mL的活細胞密度接種至250 mL搖瓶中,接種體積為50 mL。通過JMP軟件設(shè)計2個中心點24全因子試驗,研究半乳糖(X1)、尿苷(X2)、氯化錳(X3)和蛋白水解物(X4)對單抗糖基化的影響。根據(jù)試驗設(shè)計進行搖瓶試驗。培養(yǎng)周期為14 d。每隔1 d取樣,進行細胞計數(shù)和生化分析。按廠商提供的補料方式進行流加補料。培養(yǎng)結(jié)束后收集培養(yǎng)液,于3 000 r/min離心5 min后,取上清,置于-80℃保存待用。

1.2.3 反應(yīng)器培養(yǎng)驗證 選取最優(yōu)模型條件進行1 L、3 L和15 L反應(yīng)器(Applikon)培養(yǎng)驗證,培養(yǎng)體積分別為0.5 L、1.2 L和8.0 L。反應(yīng)器參數(shù)設(shè)置:36.5℃,pH(7.0±0.15),DO 40%,轉(zhuǎn)速 180-250 r/min。通氣方式為Drill Hole Sparger,培養(yǎng)過程中不加堿。

1.2.4 測定和分析方法 通過ViCELL-XR細胞計數(shù)儀(Beckman Coulter)進行細胞計數(shù)和活率分析;氨氮濃度用Nova 400生化分析儀檢測(Nova Biomedical);單抗產(chǎn)量采用POROS A/20色譜柱(2.1 mm×30 mm)進行高效親和色譜檢測;上清收獲液經(jīng)rProtein A親和層析柱純化后,用糖譜分析色譜柱AdvanceBio Glycan Map(2.1 mm×150 mm)進行單抗糖基化檢測,具體分離步驟見產(chǎn)品說明書。其中五聚高甘露糖型(YM)通過檢測直接得到,而半乳糖基化(YG)和巖藻糖基化(YF)通過公式計算得出[13]:

G0表示不含半乳糖殘基,G1表示含一個半乳糖殘基,G2表示含二個半乳糖殘基,G0F表示不含半乳糖殘基但包含一個巖藻糖殘基,G1F表示含一個半乳糖殘基和一個巖藻糖殘基,G2F表示含有二個半乳糖殘基和一個巖藻糖殘基。

2 結(jié)果

2.1 添加物對單抗產(chǎn)量和糖基化的影響

運用JMP軟件進行全因子試驗設(shè)計(Run1-18)并進行搖瓶培養(yǎng),基于預(yù)試驗結(jié)果和Gramer[13]報道,試驗設(shè)計中X1和X2分別選擇40 mmol/L和8 mmol/L作為最高濃度,X3和X4根據(jù)本公司平臺和相關(guān)項目經(jīng)驗分別選擇4 μmol/L和15 g/L為最高濃度。全因子試驗設(shè)計和結(jié)果見表1,結(jié)果顯示不同組合的添加物濃度對單抗產(chǎn)量并無影響。但是糖基化分布受添加物濃度的影響有較大變化,其中YG(%)最低值和最高值分別為5.2和15.2,YF(%)最低值和最高值分別為85.1和91.9,YM(%)最低值和最高值分別為8.8和19.7。

表1 半乳糖、尿苷、氯化錳和蛋白水解物對單抗產(chǎn)量和糖基化的影響

2.2 全因子試驗設(shè)計分析

根據(jù)全因子試驗設(shè)計(Run1-18)結(jié)果(表1),采用JMP軟件分別對響應(yīng)變量YG、YF和YM進行最小二乘法分析建模。發(fā)現(xiàn)YG和YM出現(xiàn)失擬,需加入二次平方項;根據(jù)JMP軟件支持曲線擬合的特性,試驗增加隨機組Run19、Run20(評估系統(tǒng)誤差)和Run21加入模型。

各因素對YG、YF和YM的影響(P< 0.002)經(jīng)JMP軟件擬合得到的回歸方程模型分別為:

從式(1)可知,X1、X2和X3均對YG有顯著正向影響,但平方項X12系數(shù)為負,方程的拋物面開口向下,對于X1存在極大值點。式(2)顯示X4和二階交互X3X4能夠顯著提高YF,但X2和X3對YF有負向影響,需要控制X2和X3的濃度以降低對YF的不利影響。對于YM,X2、X3和X4有顯著負向影響(式3),但平方項X22系數(shù)為正,方程的拋物面開口向上,對于X2存在極小值點。

全因子試驗結(jié)果采用JMP軟件進行方差分析,結(jié)果(表2)顯示YG、YF和YM的回歸方程模型無失擬(Lack Of Fit)(P>0.05),表明模型對實驗的擬合有效。調(diào)整R2(R2Adj)與相關(guān)系數(shù)R2接近且R2>0.9,說明所有模型擬合度良好。

表2 回歸模型擬合度分析

原研藥的平均YG、YF和YM值分別為13.9%、93.0%和8.6%,而空白對照組(表1,Run1)為5.2%、89.4%和17.5%,兩者單抗糖基化分布分別相差8.7%、3.6%和8.9%。為了減少與原研藥糖基化修飾的差異,需要提高YG、YF并降低YM。根據(jù)式1,當(dāng)X1在20-25 mmol/L時YG有極大值,結(jié)合中心點實驗結(jié)果選擇最優(yōu)X1濃度為20 mmol/L。根據(jù)式2,當(dāng)X2在2-4 mmol/L時其Man5有極小值,選擇2 mmol/L作為最適X2濃度。結(jié)合式2和式3,當(dāng)X4為15 g/L時能最大化提高YF并降低YM。為了盡量減少X3對YF的不利影響(式2),通過JMP軟件進行求值,得到最優(yōu) X3的濃度為 1 μmol/L。該條件下 YG、YF、YM預(yù)測值分別為11.4%、90.9%和9.6%,與原研藥差距分別為2.5%、2.1%和1%。

2.3 添加物對細胞密度和YM的影響

在細胞培養(yǎng)生產(chǎn)過程中,活細胞密度是單抗產(chǎn)量的重要決定因素。為了考察不同添加物對最終活細胞密度的影響,將各實驗組(Run1-18)按添加物情況進行分組,并通過雙樣本t檢驗對數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計學(xué)分析。結(jié)果(圖1)顯示添加X1實驗組(P=0.43)和添加X3實驗組(P=0.74)均不影響最終活細胞數(shù),而添加X2實驗組(18.6±1.4)最終活細胞數(shù)低于無X2組(20.9±2.6)(P=0.04)。此外,添加X4實驗組(21.7±2.3)最終活細胞數(shù)高于無X4組(18.1±0.8)(P=0.01),該結(jié)果表明添加X4有利于細胞生長。

圖1 加入蛋白水解物對最終活細胞數(shù)的影響

Pacis等[14]報道過氨氮濃度和YM之間存在正相關(guān)性,因此有必要對培養(yǎng)過程中的氨氮濃度和YM之間關(guān)系進行系統(tǒng)的分析。根據(jù)模型優(yōu)化的結(jié)果(式3),高濃度X2會提高YM,將添加X2實驗組(5.6±0.75)和無X2組(3.9±0.56)的最終氨氮濃度進行雙樣本t檢驗,兩組存在顯著差異(P<0.000 1),表明加入X2能顯著提高培養(yǎng)液中氨氮濃度(表3)。將收獲時氨氮濃度與YM進行作圖,發(fā)現(xiàn)有一定正相關(guān)性(圖2-A)。由于添加物X4可產(chǎn)生氨氮并降低YM,為了確認X2的影響,將添加X4的實驗組去掉,氨氮濃度(x)與YM(y)接近線性相關(guān)(y=0.285 5x+0.414 7,R2=0.815 1)(圖 2-B)。

2.4 反應(yīng)器培養(yǎng)驗證

選取最優(yōu)添加物濃度(X1為20 mmol/L,X2為2 mmol/L,X3為 1 μmol/L,X4為 15 g/L)在 1L、3L、15L反應(yīng)器(BR)中進行模型驗證,結(jié)果顯示不同規(guī)模反應(yīng)器之間細胞生長,細胞活率和單抗產(chǎn)量基本一致(圖3)。無X4條件(1L-BR*)其培養(yǎng)第8天之后活細胞數(shù)逐漸低于其他實驗組(圖3-A),但最終細胞活率維持較高(圖3-B)。另外,所有實驗組的單抗產(chǎn)量并無明顯差異(表4)。推測添加X4雖能提高活細胞數(shù),但也會導(dǎo)致培養(yǎng)后期營養(yǎng)物質(zhì)缺失,因此后續(xù)試驗有必要對流加補料工藝進行進一步探討。不同規(guī)模的反應(yīng)器(1/3/15L-BR)中糖基化分布基本相同(表4),以15 L反應(yīng)器為例,其YG、YF、YM實際值分別為11.2%、91.4%和8.2%,其中YG和YF與模型預(yù)測值差異小于0.5%,而YM差異為1.4%。同空白對照組(Run 1)相比YG、YF分別提高了6.0%和2.0%,而YM降低了9.3%,說明添加物能夠有效改善單抗糖基化分布。無X4條件(1LBR*)相比于15 L反應(yīng)器其YF下降了6.9%,而YM提高了6.1%,該試驗結(jié)果與模型預(yù)測公式一致(表 4)。

表3 尿苷對氨氮濃度的影響

圖2 細胞收獲液中氨氮濃度和YM水平的關(guān)系,所有實驗組(A)與僅考慮X2實驗組(B)

圖3 不同反應(yīng)器規(guī)模中活細胞密度(A)和細胞活率(B)

表4 反應(yīng)器中單抗產(chǎn)量和糖基化分布

3 討論

生物類似藥相比新藥研發(fā)投資小,成功率高。歐洲藥品管理局在批準第一個生物類似藥-紅細胞生成素之后,陸續(xù)開始批準更多的生物類似藥[16]。面對競爭日益激烈的生物藥市場,如何快速獲得安全、有效的生物類似藥至關(guān)重要。而單抗糖基化修飾不僅影響單抗的結(jié)構(gòu)、活性以及藥代動力學(xué),更是單抗藥物重要的質(zhì)量屬性,因此在細胞培養(yǎng)過程中需要嚴格控制。在本研究中,通過添加半乳糖、氯化錳和尿苷均能有效提高單抗半乳糖基化。但同時發(fā)現(xiàn),較高濃度的半乳糖卻難以進一步提高單抗半乳糖基化,這與之前的報道一致。在Gamer等[13]的研究中,將半乳糖和氯化錳的濃度分別從40 mmol/L和0.016 mmol/L提高到100 mmol/L和0.04 mmol/L后,僅提高了2%半乳糖基化。另外較高濃度半乳糖會導(dǎo)致滲透壓升高,抑制細胞生長。不僅如此,St Amand等[12]發(fā)現(xiàn),較高濃度的半乳糖和氯化錳還能影響蛋白產(chǎn)量,同時引起Man5增加。為了進一步提高單抗半乳糖基化的優(yōu)化空間,可以選擇半乳糖的替代糖源,Hossler等[17]發(fā)現(xiàn)松三糖或乳糖可提高半乳糖基化并降低Man5。

本研究發(fā)現(xiàn)較高濃度的尿苷可導(dǎo)致Man5增加。加入尿苷的搖瓶最終氨氮濃度偏高,并且伴隨著Man5的增加,說明氨代謝與Man5存在內(nèi)在聯(lián)系。該結(jié)果與Pacis[14]試驗結(jié)論一致。氨氮是尿苷最終分解代謝產(chǎn)物,濃度過高會加重氨代謝負擔(dān),引起鳥氨酸積累從而導(dǎo)致Man5增加[15]。另外,氨氮對蛋白糖基化的影響因素還包括:(1)影響UDPGlcNAc轉(zhuǎn)運蛋白活性[18];(2)提高細胞內(nèi)pH,影響高爾基體內(nèi)糖基化酶的活性[19];(3)降低β-(1,4)半乳糖苷轉(zhuǎn)移酶的表達,在細胞培養(yǎng)中添加15 mmol/L氨氮濃度能降低40%半乳糖基化[20]。因此用尿苷進行糖基化調(diào)控,需要摸索最適作用濃度。

蛋白水解物是蛋白經(jīng)過酶水解之后得到的多肽混合物,是一種常用的細胞培養(yǎng)添加劑[21]。本研究加入的蛋白水解物可促進細胞生長,且對單抗產(chǎn)量基本無影響,與之前Spearman[22]的研究結(jié)果一致,但該報道中蛋白水解物不影響蛋白糖基化。根據(jù)Ho等[23]的研究,蛋白水解物可提高半乳糖基化。而本研究所使用的蛋白水解物可提高巖藻糖基化并降低Man5。該現(xiàn)象可能與不同水解物的來源和生產(chǎn)工藝有關(guān)。通常認為,蛋白水解物能為細胞提供較好的氧化還原環(huán)境,使得細胞內(nèi)各個細胞器能夠正常工作。例如,加入具有抗氧化作用的還原性谷胱甘肽能降低Man5[15]。由于蛋白水解物產(chǎn)品存在批次差異,會導(dǎo)致最終單抗藥物質(zhì)量不穩(wěn)定,所以大多數(shù)生物制藥企業(yè)對蛋白水解物的使用持謹慎態(tài)度。但越來越多的水解物生產(chǎn)商推出了成分明確的蛋白水解物產(chǎn)品,如BD Recharge,該類水解物批間差異小,適合商業(yè)化生產(chǎn)。后續(xù)研究應(yīng)考察該類蛋白水解物對于糖基化修飾的影響。

4 結(jié)論

在重組CHO細胞培養(yǎng)過程中,通過加入半乳糖、尿苷和氯化錳能夠顯著提高半乳糖基化,其中尿苷過量會提高Man5。而添加蛋白水解物能降低單抗Man5并提高巖藻糖基化。本研究成功利用上述添加物將生物類似藥的糖基化水平調(diào)控至與原研藥相當(dāng)。本研究所使用的添加物對單抗產(chǎn)量基本無影響,卻能極大地改善單抗糖基化分布,適用于已有的細胞培養(yǎng)工藝基礎(chǔ)上進行糖基化調(diào)整。

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