呂錫斌,吳耀領(lǐng),郝 飛,曾祥煉,張巧玲,陳良強(qiáng),袁 頡,羅汝葉,楊 帆,王和玉,王 莉,尉洪濤,韓培杰,白逢彥
(1.貴州茅臺(tái)酒股份有限公司技術(shù)中心,貴州 仁懷 564501;2.中國(guó)科學(xué)院微生物研究所,真菌學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,北京 100101)
中國(guó)白酒是世界上最古老的蒸餾酒之一,在中國(guó)文化和人民日常生活中發(fā)揮著重要作用[1]。醬香型白酒作為中國(guó)基本香型之一的白酒,其獨(dú)特的傳統(tǒng)釀造工藝使得釀造體系中形成了復(fù)雜的微生物群落結(jié)構(gòu),使其具有醬香突出、幽雅細(xì)膩、酒體醇厚、回味悠長(zhǎng)、空杯留香持久等特點(diǎn)。因此,研究醬香型白酒釀造過程微生物群落結(jié)構(gòu),對(duì)解析醬香型白酒釀造機(jī)理、提高醬香型白酒產(chǎn)量及質(zhì)量具有重大意義。
醬香型白酒釀造的工藝特點(diǎn)為:兩次投料“下沙、造沙”、八次堆積發(fā)酵、九次蒸餾、七次取酒,最終由不同風(fēng)格特點(diǎn)的輪次酒長(zhǎng)期貯存,精心勾兌醞釀出高品質(zhì)的醬香白酒。下沙、造沙輪次是醬香型白酒釀造的基礎(chǔ)輪次,其工藝操作關(guān)系到后期輪次發(fā)酵過程中微生物的生長(zhǎng)繁殖[2],同時(shí)下沙、造沙輪次酒醅中可累積更多的微生物代謝產(chǎn)物及產(chǎn)酒輪次所需醬香型白酒前體物質(zhì),有利于后期輪次基酒香味物質(zhì)的形成[3-4]。因此了解和掌握下沙、造沙酒醅微生物的多樣性及其菌群變化,對(duì)揭示醬香型白酒獨(dú)特的香味物質(zhì)的形成機(jī)理,對(duì)保障后期輪次物料供給平衡和微生物代謝平衡,對(duì)醬香型白酒生產(chǎn)都至關(guān)重要,而目前對(duì)此的研究普遍較少。
本研究旨在通過Illumina Miseq PE300高通量測(cè)序平臺(tái)測(cè)序研究分析醬香型白酒下沙、造沙輪次發(fā)酵過程細(xì)菌16S rRNA和真菌ITS高變區(qū),研究堆積、窖內(nèi)發(fā)酵酒醅中的微生物多樣性及其主要功能群落結(jié)構(gòu),深入認(rèn)識(shí)發(fā)酵過程的微生物多樣性,解析制酒過程中細(xì)菌、真菌的組成、變化及其演替規(guī)律。
酒醅:取自貴州茅臺(tái)酒股份有限公司制酒車間。
菌種:細(xì)菌、真菌培養(yǎng)基購(gòu)于國(guó)藥集團(tuán)化學(xué)試劑北京有限公司。
耗材及試劑:菌株DNA提取、16S rDNA片段和真菌ITS擴(kuò)增所用的酶、Marker、dNTPs、Buffer等購(gòu)于生工生物上海股份有限公司;其余試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純。
儀器設(shè)備:Illumina Miseq PE300高通量測(cè)序平臺(tái)測(cè)序;Vortex振蕩器,德國(guó)IKA公司。
1.2.1 取樣方法
每個(gè)輪次醬香型白酒生產(chǎn)分為堆積發(fā)酵和窖內(nèi)發(fā)酵兩個(gè)階段。如圖1所示,在堆積發(fā)酵階段0 d、1 d、2 d、3 d酒醅樣品在堆積表面約20 cm深的D點(diǎn)取樣。入窖時(shí),對(duì)A、B、C、D和E點(diǎn)的5個(gè)酒醅樣品進(jìn)行收集。在窖內(nèi)發(fā)酵過程中,對(duì)距離窖池邊緣約30 cm,深度約120 cm的D點(diǎn)酒醅樣品在發(fā)酵0 d、3 d、6 d、12 d、21 d、30 d以及出窖時(shí)進(jìn)行收集,用于細(xì)菌和真菌的高通量測(cè)序。
圖1 取樣點(diǎn)圖示
1.2.2 高通量測(cè)序分析方法
總體基因組DNA直接從樣本中提取[5],利用Illumina Miseq PE300高通量測(cè)序平臺(tái)測(cè)序。細(xì)菌的16S rRNAV3—V4擴(kuò)增引物為338F(5'-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3')和 806R(5'-GGACTACNNGGG TATCTAAT-3'),真 菌 擴(kuò) 增 引 物 為ITS3(5'-GCATCGATGAAGAACGCAGC-3')和ITS4(5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3')。PCR反應(yīng)體系:12.5 μL 2× Taq PCR MasterMix,3 μL BSA(2 ng/μL),2 Primer(5 μM),2 μL 模板 DNA,和5.5μL ddH2O。反應(yīng)參數(shù):95℃預(yù)變性5 min;95 ℃ 變性45 s,55 ℃退火50 s,72 ℃延伸45 s,32個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min終止。擴(kuò)增序列通過Illumina MiSeq平臺(tái)進(jìn)行Paired-end測(cè)序,下機(jī)數(shù)據(jù)經(jīng)過QIIME(v1.8.0)軟件過濾、拼接、去除嵌合體,去除得分低于20分、堿基模糊、引物錯(cuò)配或測(cè)序長(zhǎng)度小于150 bp的序列。
經(jīng)過上述步驟后,將標(biāo)簽分組具有97%序列相似性的高質(zhì)量的OTU序列[6-8],細(xì)菌得到的每個(gè)OTU代表序列比對(duì)silva數(shù)據(jù)庫(kù)和NT數(shù)據(jù)庫(kù),真菌得到的OTU代表序列比對(duì)UNITE數(shù)據(jù)庫(kù)和NT數(shù)據(jù)。最后再通過人工進(jìn)行檢查以獲得物種信息。稀疏曲線使用R語(yǔ)言繪制來(lái)評(píng)估微生物多樣性。
計(jì)算下沙(XS)、造沙(ZS)輪次Chao1指數(shù)以確定物種豐富度,Shannon指數(shù)以確定物種多樣性,pielou指數(shù)反映微生物個(gè)體數(shù)目分配的均勻程度,以描述堆積、窖內(nèi)發(fā)酵酒醅樣品中細(xì)菌、真菌群落的多樣性。
2.1.1 稀疏曲線分析(圖2)
由圖2可知,下沙、造沙輪次的樣品細(xì)菌、真菌稀疏曲線都趨向平坦,說(shuō)明各樣本細(xì)菌、真菌的測(cè)序數(shù)據(jù)量合理,測(cè)序深度已足夠。
2.1.2 Shannon指數(shù)、Pielou指數(shù)分析(表1)
由表1可看出,下沙、造沙堆積發(fā)酵細(xì)菌及下沙堆積發(fā)酵真菌Shannon指數(shù)、pielou指數(shù)均高于窖內(nèi)發(fā)酵,說(shuō)明堆積樣品中微生物的多樣性及物種均勻程度高于窖內(nèi)發(fā)酵,造沙窖內(nèi)發(fā)酵真菌則反之。也說(shuō)明了同輪次不同發(fā)酵階段及不同輪次間的微生物多樣性存在一定差異。
注:XS:下沙;ZS:造沙;stack:堆積;pit:窖內(nèi)。
表1 不同發(fā)酵過程中酒醅樣品Shannon指數(shù)及Pielou指數(shù)
2.2.1 下沙、造沙輪次細(xì)菌分類
對(duì)下沙(XS)、造沙(ZS)輪次發(fā)酵過程中酒醅樣品細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)在屬分類水平上的結(jié)果進(jìn)行對(duì)比(相對(duì)豐度<0.1%及未鑒定出的種類歸入“其他”),結(jié)果見表2。
表2 下沙、造沙發(fā)酵過程中酒醅主要細(xì)菌群類占比
對(duì)酒醅樣品中細(xì)菌群落的高通量測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn):下沙、造沙輪次分別檢測(cè)到203個(gè)、184個(gè)細(xì)菌屬。在下沙輪次發(fā)酵過程中乳酸菌為豐度最高的細(xì)菌,其中Lactobacillus(50.80%)、Weissella(25.08%)、Pediococcus(17.94%)、Lentibacillus(0.92%)、Kroppenstedtia(0.91%)為下沙輪次主要細(xì)菌屬;造沙輪次發(fā)酵過程中乳酸菌同為豐度最高的細(xì)菌屬,其中Lactobacillus(78.08%)、Pediococcus(6.57%)、Acetobacter(5.91%)、Lentibacillus(2.23%)、Bacillus(2.06%)、Kroppenstedtia(1.52%)、Oceanobacillus(1.42%)為造沙輪次主要細(xì)菌屬。
2.2.2 下沙、造沙輪次真菌分類(表3)
表3 下沙、造沙發(fā)酵過程中酒醅主要真菌群類占比(%)
下沙、造沙輪次分別檢測(cè)到160個(gè)、109個(gè)真菌屬。在下沙輪次發(fā)酵過程中畢赤酵母屬為豐度最高的真菌,其中Pichia(84.78%)、Saccharomyces(6.23%)、Thermoascus(1.95%)、Aspergillus(1.45%)、Monascus(0.8%)為下沙輪次主要真菌屬;造沙輪次主要真菌屬為Pichia(77.71%)、Saccharomyces(13.80%)、Thermoascus(2.65%)、Thermomyces(1.0%)、Aspergillus(0.67%)。
2.3.1 下沙、造沙輪次發(fā)酵過程中細(xì)菌群落的演替規(guī)律分析(圖3、圖4)
圖3 下沙發(fā)酵過程中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化
圖4 造沙發(fā)酵過程中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化
下沙輪次堆積開始時(shí),酒醅通過網(wǎng)羅大曲和環(huán)境獲得了豐富的微生物資源,其中Pediococcus acidilactici(27.82%)、Lentibacillus sp.(14.38%)、Thermoactinomyces sanguinis(11.11%)為優(yōu)勢(shì)菌,同時(shí)還有其他細(xì)菌種屬,如Weissella paramesenteroides(9.02%)、Oceanobacillus sp.(7.63%)、Bacillus amyloliquefaciens(7.53%)、Oceanobacillus indicireducens(3.41%)、Staphylococcus condimenti(3.33%)、Bacillus sp.(3.09%)、Kroppenstedtia eburnea(2.9%)、Lactobacillus plantarum(1.16%)等。經(jīng)高溫堆積發(fā)酵至發(fā)酵結(jié)束,不同取樣位置、堆積時(shí)間的微生物相對(duì)豐度略有波動(dòng),優(yōu)勢(shì)菌主要為Weissella paramesenteroides、Pediococcus acidilactici、Lactobacillus plantarum等乳酸菌,且相對(duì)豐度為80%以上。
在窖內(nèi)發(fā)酵初期,細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與堆積后期相近,至窖內(nèi)發(fā)酵7 d,菌群結(jié)構(gòu)發(fā)生較大變化,Lactobacillus panis相對(duì)豐度增至76.21%,占絕對(duì)優(yōu)勢(shì)地位。窖內(nèi)發(fā)酵結(jié)束,Lactobacillus panis豐度回落至51.92%,與Lactobacillus acetotolerans(34.66%)同為優(yōu)勢(shì)菌,同時(shí)有Pediococcus acidilactici(3.31%)、Lactobacillus plantarum(3.02%)、Lactobacillus pontis(1.93%)、Lactobacillus buchneri(1.47%)等均為乳酸菌。
造沙堆積開始時(shí),Lentibacillus sp.(22.57%)、Bacillus amyloliquefaciens(14.72%)、Pediococcus acidilactici(10.94%)、Oceanobacillus sp.(10.01%)為優(yōu)勢(shì)菌,同時(shí)還有Thermoactinomyces sanguinis(9.23%)、Oceanobacillus indicireducens(4.15%)、Staphylococcus condimenti(3.02%)、Kroppenstedtia eburnea(3.0%)、Lactobacillus panis(2.22%)、Bacillus kokeshiiformis(2.06%)、Acetobacter ghanensis(1.91%)等。經(jīng)高溫堆積至發(fā)酵結(jié)束,優(yōu)勢(shì)菌主要為L(zhǎng)actobacillus panis、Pediococcus acidilactici、Acetobacter ghanensis,均為產(chǎn)酸微生物,且相對(duì)豐度為90%以上。
窖內(nèi)發(fā)酵的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化較大,發(fā)酵初期Lactobacillus panis相對(duì)豐度為76.22%,為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)菌,窖內(nèi)厭氧發(fā)酵過程中Lactobacillus panis、Lactobacillus sp.、Lactobacillus acetotlerans呈現(xiàn)升高后降低的趨勢(shì),至窖內(nèi)發(fā)酵結(jié)束,Lactobacillus sp.(78.62%)、Lactobacillus acetotolerans(16.07%)、Lactobacillus panis(3.86%),乳酸菌成為優(yōu)勢(shì)菌,相對(duì)豐度為98%以上。
2.3.2 下沙、造沙輪次發(fā)酵過程中真菌群落的演替規(guī)律分析(圖5、圖6)
圖5 下沙發(fā)酵過程中真菌群落結(jié)構(gòu)變化
下沙輪次真菌微生物多樣性比較單一,從下沙堆積至窖內(nèi)發(fā)酵結(jié)束,Pichia kudriavzevii是絕對(duì)優(yōu)勢(shì)菌株。堆積0 d至堆積發(fā)酵結(jié)束,Pichia kudriavzevii相對(duì)豐度由41.28%升至91.28%,Saccharo-myces cerevisiae則先升后降至1.63%。窖內(nèi)發(fā)酵階段真菌群落結(jié)構(gòu)變化不大,到發(fā)酵結(jié)束,Pichia kudriavzevii(89.56%)、Pichia manshurica(7.74%)為優(yōu)勢(shì)菌,Saccharomyces cerevisiae降至1.35%。
圖6 造沙發(fā)酵過程中真菌群落結(jié)構(gòu)變化
造沙輪次發(fā)酵過程中Pichia kudriavzevii在窖內(nèi)發(fā)酵結(jié)束降至48.78%,Saccharomyces cerevisiae先升后降至22.32%,Pichia manshurica則升高至14.67%。但整體與下沙輪次發(fā)酵過程相比,Pichia kudriavzevii相對(duì)豐度下降明顯,Saccharomyces cerevisiae與Pichia manshurica均有較大幅度增長(zhǎng)。
圖7 不同發(fā)酵階段細(xì)菌主成分分析
通過主成分分析,將多維變量降維成兩個(gè)變量進(jìn)行分析,細(xì)菌群落第一主成分(PC1)貢獻(xiàn)率達(dá)46.1%,第二主成分(PC2)貢獻(xiàn)率達(dá)27.7%;真菌群落第一主成分(PC1)貢獻(xiàn)率達(dá)93.1%,第二主成分(PC2)貢獻(xiàn)率達(dá)4.4%。結(jié)果顯示,下沙堆積、窖內(nèi)及造沙堆積、窖內(nèi)各自聚為一類,說(shuō)明不同輪次不同發(fā)酵階段菌群結(jié)構(gòu)及微生物多樣性存在顯著差異(p<0.05)。
圖8 不同發(fā)酵階段真菌主成分分析
本研究基于醬香型白酒下沙、造沙輪次酒醅高通量測(cè)序結(jié)果對(duì)其堆積發(fā)酵及窖內(nèi)發(fā)酵過程中的細(xì)菌、真菌多樣性進(jìn)行了分析。
下沙、造沙分別檢測(cè)到細(xì)菌203個(gè)屬和184個(gè)屬,乳酸菌為優(yōu)勢(shì)細(xì)菌貫穿了下沙、造沙堆積發(fā)酵,窖內(nèi)發(fā)酵的整個(gè)過程,說(shuō)明了乳酸菌對(duì)醬香型白酒發(fā)酵的重要性。在堆積發(fā)酵結(jié)束,Weissella paramesenteroides、Pediococcus acidilactici、Lactobacillus panis占比可達(dá)80%以上,窖內(nèi)發(fā)酵結(jié)束,Lactobacillus panis、Lactobacillus sp.、Lactobacillus acetotolerans占比可達(dá)90%以上。而清香型白酒發(fā)酵過程中優(yōu)勢(shì)乳酸菌比較單一,Lactobacillus fuchuensis相對(duì)豐度始終保持在較高的水平[9];濃香型白酒發(fā)酵過程中占絕對(duì)優(yōu)勢(shì)地位的是Lactobacillus acetotolerans,其在發(fā)酵3 d后相對(duì)豐度可占整個(gè)乳酸菌屬98%以上,并持續(xù)至發(fā)酵結(jié)束[10-12]。
下沙、造沙分別檢測(cè)到真菌160個(gè)屬和109個(gè)屬,優(yōu)勢(shì)菌屬均為酵母菌,下沙期間,Pichia kudriavzevii為絕對(duì)優(yōu)勢(shì)菌,占比在90%左右,造沙窖內(nèi)發(fā)酵時(shí),Saccharomyce scerevisiae大量繁殖,至窖內(nèi)發(fā)酵結(jié)束達(dá)到22.32%,Pichia kudriavzevii占比仍達(dá)48.78%。下沙、造沙輪次是醬香型白酒的非產(chǎn)酒輪次,酵母菌作用則主要表征在產(chǎn)香及產(chǎn)前體物質(zhì)方面[13-15]。Saccharomyces cerevisiae是白酒發(fā)酵過程中的主要產(chǎn)酒微生物,在不同香型的發(fā)酵過程中都不可或缺[16-17],但其在醬香型白酒造沙窖內(nèi)發(fā)酵期間才大量生長(zhǎng),占比可達(dá)20%~40%之間。Pichia kudriavzevii、Pichia membranifaciens、Candida krusei、Zygosaccharomyces bailii等均對(duì)酸、醇具有較強(qiáng)酯化能力,產(chǎn)生的物質(zhì)對(duì)酒體風(fēng)格形成具有重要作用[16,19-23],其中Pichia kudriavzevii在不同香型白酒發(fā)酵過程中的演替規(guī)律存在顯著差異,在醬香型白酒發(fā)酵過程中其相對(duì)豐度最高可達(dá)95%以上,清香型白酒發(fā)酵起始時(shí),Pichia kudriavzevii相對(duì)豐度最大(85.12%),到發(fā)酵20 d豐度降至最小(32.85%),至發(fā)酵結(jié)束升至43.29%[18];濃香型白酒占主體地位的主要為Saccharomyces cerevisiae[24-25]。
由此可見,白酒發(fā)酵過程中主要微生物菌群結(jié)構(gòu)的差異是造成不同香型白酒差異明顯的因素之一,也是醬香型白酒不同輪次間白酒香氣成分差異的主要因素。但是目前仍不清楚不同乳酸菌、酵母菌間相互作用對(duì)于白酒釀造過程的影響,且醬香型白酒發(fā)酵過程中溫度、酒醅糊化程度、水分、淀粉、酸度、微生物間相互作用等的變化均為影響微生物生長(zhǎng)代謝的環(huán)境因素,從而形成不同發(fā)酵階段微生物多樣性的差異。因此,后續(xù)將在下沙、造沙輪次微生物多樣性和演替規(guī)律的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步結(jié)合可培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)對(duì)發(fā)酵過程中微生物的功能及相互作用進(jìn)行研究,為更好地揭示醬香型白酒釀造機(jī)理和控制白酒品質(zhì)提供生物學(xué)依據(jù)。