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耐甲氧西林金黃色葡萄球菌耐藥機(jī)制及檢測方法研究進(jìn)展*

2019-03-18 19:59李雪寒綜述李一榮審校
國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志 2019年5期
關(guān)鍵詞:頭孢西丁西林金黃色

李雪寒 綜述,李一榮 審校

(武漢大學(xué)中南醫(yī)院檢驗科,湖北武漢 430071)

金黃色葡萄球菌常定植于皮膚和鼻腔,致病能力強(qiáng),能導(dǎo)致皮膚軟組織感染、中耳炎、心內(nèi)膜炎及菌血癥等多種感染。20世紀(jì)40年代初期,青霉素G應(yīng)用于臨床后顯著改善了金黃色葡萄球菌感染的治療療效。但是,1942年,臨床上就發(fā)現(xiàn)了耐青霉素G的金黃色葡萄球菌。1959年,為治療耐青霉素G的金黃色葡萄球菌感染,臨床上引入了甲氧西林,一種半合成的耐青霉素酶的β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物,它對產(chǎn)青霉素酶金黃色葡萄球菌有良好的殺傷作用。1961年,JEVONS在英國首次證實了耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)的存在,此后,臨床上MRSA菌株的檢出率逐年增長。到1985年,MRSA開始出現(xiàn)暴發(fā)性流行,成為全球院內(nèi)感染的首要病原體。在2011年,僅在美國一個國家,MRSA就造成了超過8萬例的侵襲性感染[1]。MRSA感染的高發(fā)生率和死亡率已經(jīng)導(dǎo)致巨大的社會和經(jīng)濟(jì)損失?,F(xiàn)就MRSA的流行狀況、耐藥機(jī)制和檢測方法等研究進(jìn)展做一綜述。

1 MRSA的流行狀況

自1961年首株MRSA發(fā)現(xiàn)以來,臨床上MRSA的檢出率逐年升高,到20世紀(jì)80年代后期,MRSA已成為全球發(fā)生率最高的院內(nèi)感染病原菌之一。在印度,1999年MRSA的檢出率已達(dá)80.8%,到2004-2006年,更是增長到了86.5%[2]。在歐洲的羅馬尼亞,2015年,MRSA的檢出率達(dá)到57.2%[3]。還有一些地區(qū),MRSA的檢出率雖然不高但呈持續(xù)增長趨勢。例如澳大利亞,MRSA的檢出率由2000年的12.0%上升到2013年的19.0%。在歐洲的塞浦洛斯和斯洛伐克,MRSA的檢出率從2012年的35.2%和21.7%分別上升到了2015年的43.4%和28.1%[4]。在我國,從2005年中國細(xì)菌耐藥性監(jiān)測開始以來,在檢出的革蘭陽性菌中,金黃色葡萄球菌所占比例一直都是第1位,在33.0%左右波動,而MRSA又是耐藥性金黃色葡萄球菌中最常見的。雖然自2005年以來,我國的MRSA檢出率處于下降趨勢,但局部區(qū)域的MRSA檢出率依然在70.0%以上[5]。

20世紀(jì)90年代以來,MRSA 所致感染的流行病學(xué)發(fā)生了顯著的變化,不僅局限于醫(yī)院內(nèi),而且呈現(xiàn)出向院外蔓延的趨勢,于是提出了MRSA的兩種分型,即醫(yī)院獲得性MRSA(HA-MRSA)和社區(qū)獲得性MRSA(CA-MRSA)。HA-MRSA通常引起住院、免疫力低下或老年患者的感染,這類人群一般是有手術(shù)史、經(jīng)常接觸醫(yī)院衛(wèi)生設(shè)施以及接受抗菌藥物治療的患者。而CA-MRSA則在社區(qū)間相互傳播,傾向于感染健康的年輕人,這些人在發(fā)病前與醫(yī)療機(jī)構(gòu)無任何接觸。美國德克薩斯州的研究表明,大約70.0%的社區(qū)獲得性金黃色葡萄球菌的感染均是CA-MRSA[6]。此外,CA-MRSA也可以引起醫(yī)院感染的暴發(fā),這可能是由于CA-MRSA可以產(chǎn)生殺白細(xì)胞素(PVL)造成的[7]。細(xì)菌和患者在社區(qū)和醫(yī)院間不斷流動,相互傳播,導(dǎo)致了復(fù)雜的MRSA流行狀況。

2 MRSA的耐藥機(jī)制

2.1葡萄球菌染色體mec基因盒元件(SCCmec)的基本結(jié)構(gòu)和功能 金黃色葡萄球菌通常是通過獲得SCCmec而產(chǎn)生對甲氧西林的耐藥性。SCCmec為可移動遺傳元件,能在葡萄球菌屬內(nèi)菌株間轉(zhuǎn)移。SCCmec的大小為21~67 kb,具有高度多態(tài)性。目前,世界范圍內(nèi)共發(fā)現(xiàn)11 種 SCCmec(Ⅰ~Ⅺ型)。雖然不同類型的SCCmec的大小和基因組成有所差異,但仍具有以下共同特征[1]:(1)攜帶一個mec基因復(fù)合體,由mec基因及其調(diào)控系統(tǒng)組成,與MRSA耐藥相關(guān)的mec基因為mecA和mecC。(2)攜帶一個ccr基因復(fù)合體,由位于復(fù)合體中央的ccr基因和相鄰的7~8個開放閱讀框(ORFs)組成,其中ccr基因包括ccrA、ccrB和ccrC[8]。ccr編碼的重組酶ccrAB或ccrC具有位點特異性,能識別相對應(yīng)的SCCmec元件,使之從葡萄球菌染色體中精確地分離,并通過轉(zhuǎn)移整合到其他葡萄球菌的菌株中,從而實現(xiàn)SCCmec在葡萄球菌屬內(nèi)菌株間轉(zhuǎn)移[9]。如ccrB結(jié)合attB和attS序列能完成SCCmec的剪切或整合,而ccrA盡管不直接參與SCCmec的剪切或整合,但起到促進(jìn)ccrB對序列的識別作用,因而ccrA和ccrB總是成對出現(xiàn)。而ccrC單獨出現(xiàn)即可完成SCCmec的剪切或整合[1]。(3)SCCmec在orfX基因(編碼rRNA甲基轉(zhuǎn)移酶)3′端的attB序列處整合入金黃色葡萄球菌染色體組,且SCCmec的插入對orfX的表達(dá)沒有影響。此外,SCCmec元件還含有3個J區(qū)域,主要起連接作用,也可能攜帶一些其他的抗菌藥物耐藥決定簇,如轉(zhuǎn)座子Tn554(編碼對紅霉素的耐藥)、質(zhì)粒pT181(編碼對四環(huán)素的耐藥)、質(zhì)粒pUB110(編碼對氨基糖苷類的耐藥)等基因元件。J區(qū)域的結(jié)構(gòu)差異性是SCCmec分型的依據(jù)[10]。

2.2mecA基因介導(dǎo)的耐藥機(jī)制 mecA大小為2 129 bp,位于Ⅰ~Ⅹ型SCCmec上,編碼一種新的青霉素結(jié)合蛋白PBP2a。PBP2a與β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物的親和力很低。因此,PBP2a不受β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物的影響,繼續(xù)發(fā)揮細(xì)胞壁黏肽合成酶的功能,催化細(xì)胞壁的合成,從而導(dǎo)致MRSA的產(chǎn)生[11]。mecA的表達(dá)受其相鄰的mecR1-mecI系統(tǒng)的調(diào)控,這個系統(tǒng)與金黃色葡萄球菌中調(diào)控β-內(nèi)酰胺酶表達(dá)的blaR1-blaI系統(tǒng)同源。mecR1編碼感受器蛋白MecR1,mecI編碼與MecR1相耦聯(lián)的抑制蛋白MecI。MecR1是一種金屬內(nèi)肽酶原,能通過胞外的青霉素結(jié)合區(qū)域感受到β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物的存在。當(dāng)β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物結(jié)合到MecR1的感受器結(jié)構(gòu)域,MecR1被激活,其構(gòu)象發(fā)生改變,誘導(dǎo)胞內(nèi)感受器區(qū)域自動裂解,直接或間接導(dǎo)致MecI分裂,從而阻礙MecI結(jié)合到mecA啟動子區(qū)域,去除MecI對mecA的抑制作用,mecA開始表達(dá),生成大量的PBP2a,使細(xì)菌產(chǎn)生耐藥性[1]。

2.3mecC基因介導(dǎo)的耐藥機(jī)制 2007年,在一項關(guān)于奶牛乳腺炎的研究中發(fā)現(xiàn)了金黃色葡萄球菌菌株LGA251,它具有MRSA的表型,對苯唑西林和頭孢西丁耐藥,但是對mecA和PBP2a進(jìn)行驗證時卻反復(fù)顯示為陰性。隨后對其作全基因組測序顯示,LGA251菌株攜帶一種新型的mecA同源基因,起初命名為mecALGA251,于2012年更名為mecC[12]。在此之后,在瑞典[13]、西班牙[14]、斯洛文尼亞[15]等地相繼發(fā)現(xiàn)mecC。mecC大小為2 198 bp,位于Ⅺ型SCCmec上,其核苷酸序列與mecA的同源性為69%。BALLHAUSEN等[16]用mecC敲除菌株(W44646ΔmecC)進(jìn)行實驗,發(fā)現(xiàn)該菌株對頭孢西丁的最小抑菌濃度(MIC)值由16.00 μg/mL下降到4.00 μg/mL,對苯唑西林的MIC值由8.00 μg/mL下降到0.25 μg/mL。將敲除的mecC恢復(fù)后,菌株恢復(fù)對頭孢西丁和苯唑西林的耐藥性(MIC值上升為64.00 μg/mL),從而證明了mecC與MRSA的形成有關(guān)。該研究還對mecA和mecC進(jìn)行了對比研究,發(fā)現(xiàn)mecA和mecC的啟動子和操縱子的核苷酸序列也有所不同。mecA啟動子-10區(qū)域的序列為TAT ACT,而mecC該處序列為TAT TAT,該差異可能是導(dǎo)致mecA啟動子的活性在轉(zhuǎn)錄水平上高于mecC啟動子的原因。在MecI的結(jié)合位點處,mecA操縱子上包含一個30 bp的回文序列,由2個緊密相連的15 bp序列組成。而mecC操縱子上的回文結(jié)構(gòu)則被一個8 bp的連接肽分為兩段14 bp的序列。這些差異表明,mecC的轉(zhuǎn)錄調(diào)控系統(tǒng)與mecA的存在差異。mecC的調(diào)控元件為mecISCCmecⅪ和mecR1SCCmecⅪ,分別編碼mecC轉(zhuǎn)錄抑制蛋白和感受器蛋白。其編碼的蛋白與MecI和MecR1同源性分別為66%和45%[16]。與mecA類似,mecC也編碼一種青霉素結(jié)合蛋白,稱為PBP2c。PBP2c與mecA編碼的PBP2a同源性為63%。KIM等[17]對PBP2c的性質(zhì)進(jìn)行研究,發(fā)現(xiàn)PBP2c具有藥物偏好性,相對頭孢西丁而言,其對苯唑西林的親和力更高,其對苯唑西林的親和力是PBP2a的4倍,因此表現(xiàn)為對頭孢西丁的高度耐藥,對苯唑西林處于中介耐藥甚至是敏感水平,而PBP2a則沒有這種現(xiàn)象。此外,兩者在熱穩(wěn)定性方面也表現(xiàn)出了差異,在37 ℃時PBP2a的活性最高且穩(wěn)定,而PBP2c則在25 ℃時表現(xiàn)出穩(wěn)定的高活性。

2.4fem基因介導(dǎo)的耐藥機(jī)制 除mecA、mecC之外,金黃色葡萄球菌染色體上還有一些基因也參與MRSA耐藥性的產(chǎn)生。這些基因一般與肽聚糖的合成、細(xì)胞的分裂和細(xì)胞壁的代謝相關(guān)。fem就是一種獨立于mecA和mecC的基因。與mecA和mecC不同,fem既存在于耐藥菌中,也存在于敏感菌中。敏感菌中的fem基因被滅活,可使菌株對β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物敏感性提高。目前,已被確定的fem有6種:femA、femB、femC、femD、femE和femF。如femA和femB分別編碼FemA和FemB兩種胞質(zhì)蛋白,分別添加第2個和第3個甘氨酸殘基以及第4個和第5個甘氨酸殘基到細(xì)胞壁上的五甘氨酸肽間橋,從而參與細(xì)胞壁五甘氨酸肽間橋的形成。當(dāng)femA和femB失活時,五甘氨酸肽間橋被單甘氨酸取代,使細(xì)胞壁肽聚糖成分發(fā)生改變,細(xì)菌對甲氧西林耐藥性降低[18]。femC是谷氨酰胺合成酶抑制因子,當(dāng)femC失活時,谷氨酰胺合成酶基因(glnA)的轉(zhuǎn)錄減少,主干肽鏈的D-谷氨酸的酰胺化減少,從而使谷氨酰胺生成減少,使細(xì)菌細(xì)胞壁的正常結(jié)構(gòu)遭到破壞,細(xì)菌對甲氧西林的耐藥性降低。 femD編碼磷酸葡萄糖胺變位酶,催化葡萄糖-6-磷酸與葡萄糖-1-磷酸的相互轉(zhuǎn)化,femD失活會影響肽聚糖前體物質(zhì)的合成,使細(xì)菌對甲氧西林的耐藥性降低[19]。

3 MRSA的檢測方法

快速精準(zhǔn)地檢測MRSA對臨床抗感染治療具有重要的作用。MRSA檢測方法較多,主要包括MRSA表型檢測(苯唑西林以及頭孢西丁紙片擴(kuò)散法、苯唑西林瓊脂篩選法、膠乳凝集法檢測PBP2a、顯色培養(yǎng)基法等)和MRSA耐藥基因檢測。2008年,美國臨床實驗室標(biāo)準(zhǔn)化協(xié)會(CLSI)將頭孢西丁紙片擴(kuò)散法列為MRSA的推薦檢測方法。2011年,DATTA等[20]比較了5種MRSA表型檢測方法的性能,證明頭孢西丁紙片擴(kuò)散法為一種非常好的MRSA表型檢測方法,但他們認(rèn)為還需要使用其他的方法作為補充來提高檢測的靈敏度。實驗數(shù)據(jù)顯示,乳膠凝集法的靈敏度為100.0%,特異度為99.2%,因此,推薦使用頭孢西丁紙片擴(kuò)散法與乳膠凝集法聯(lián)合檢測。之后,F(xiàn)ARAHANI等[21]也通過實驗證明了頭孢西丁紙片擴(kuò)散法是臨床首選的MRSA檢測方法。PCR法檢測mecA基因一直以來被認(rèn)為是檢測MRSA的“金標(biāo)準(zhǔn)”。KOUPAHI等[22]對比了PCR法和4種表型檢測方法,結(jié)果顯示,頭孢西丁紙片擴(kuò)散法和PCR法的靈敏度和特異度均為100.0%,苯唑西林紙片擴(kuò)散法、苯唑西林瓊脂稀釋法和顯色培養(yǎng)基法的靈敏度分別為95.45%、97.22%和98.13%,并認(rèn)為頭孢西丁紙片擴(kuò)散法可以在沒有分子檢測設(shè)備的情況下作為“金標(biāo)準(zhǔn)”的替代方法用于檢測MRSA。

臨床上對于MRSA的檢測主要是根據(jù)MRSA對苯唑西林和頭孢西丁高度耐藥的表型以及通過驗證mecA和PBP2a來判定的。但是,對于mecC MRSA,由于其對頭孢西丁高度耐藥而對苯唑西林敏感的表型以及mecA和PBP2a陰性,可能會將其誤判為甲氧西林敏感金黃色葡萄球菌(MSSA)。因此,在進(jìn)行檢測時,選用頭孢西丁進(jìn)行藥敏試驗比苯唑西林對mecC MRSA的檢測結(jié)果更準(zhǔn)確[23]。當(dāng)然,僅根據(jù)藥敏試驗結(jié)果檢測mecC MRSA是不夠可靠的。與傳統(tǒng)MRSA的檢測相似,應(yīng)用PCR技術(shù)驗證mecC是檢測mecC MRSA的“金標(biāo)準(zhǔn)”。STEGGER等[24]應(yīng)用多重PCR技術(shù)對185株金黃色葡萄球菌同時進(jìn)行mecA和mecC的檢測,結(jié)果顯示靈敏度和特異度均為100%。此外,該項技術(shù)還能同時檢測PVL毒力基因和進(jìn)行spa分型。PICHON等[25]應(yīng)用四重實時PCR技術(shù)同時檢測mecA、mecC、PVL毒力基因和nuc,此項技術(shù)不僅能精確檢測出4種基因,并且能將檢測時間縮短到1 h以內(nèi),這為臨床上檢測MRSA提供了更為快速且全面的方法。BECKER等[26]利用Xpert MRSA Gen 3系統(tǒng)聯(lián)合PCR技術(shù)同時檢測mecA、mecC和SCCmec-orfX連接區(qū)域,這項技術(shù)大大增加了MRSA檢測的特異度。SEIDEL等[27]將核酸側(cè)流免疫分析(NALFIA)技術(shù)與PCR技術(shù)相結(jié)合用于檢測mecA和mecC基因來檢測MRSA。相對于普通PCR和實時PCR技術(shù)來說,PCR D核酸橫向流動免疫檢測技術(shù)有更精密的檢測限度,并可以區(qū)分mec的不同等位基因,且耗時較短,這使MRSA的檢測向著更精準(zhǔn)快速的方向邁進(jìn)。

4 總 結(jié)

MRSA被世界衛(wèi)生組織列入了2017年“重點致病菌”名單,其所造成的感染在今后相當(dāng)長時間內(nèi)依然是棘手的全球公共衛(wèi)生問題。臨床微生物室通常使用紙片擴(kuò)散法或顯色培養(yǎng)法來鑒定MRSA,但是由于mecA和mecC的基因序列與調(diào)控序列均存在一定差異,金黃色葡萄球菌體內(nèi)mecA和mecC表達(dá)的PBP2a和PBP2c結(jié)合β-內(nèi)酰胺類抗菌藥物的能力不同,從而呈現(xiàn)不同的耐藥表型。mecA介導(dǎo)的耐藥表型已引起高度關(guān)注,但mecC介導(dǎo)的耐藥表型(頭孢西丁耐藥/苯唑西林敏感或輕度耐藥)易被忽視甚至誤認(rèn)為甲氧西林敏感,從而導(dǎo)致治療失敗。因此,了解MRSA的耐藥機(jī)制及其檢測方法,特別是mecC基因介導(dǎo)的耐藥機(jī)制及相應(yīng)的檢測方法,對于指導(dǎo)臨床抗感染治療具有重要意義。

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