趙 璇,張耀文
(1.山西大學(xué)生物工程學(xué)院,山西太原030006;2.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,山西太原030031)
綠豆(Vigna radiata)是我國(guó)傳統(tǒng)的栽培作物,屬于豆科蝶形花亞科紅豆屬。綠豆作為醫(yī)食兩用作物,受到世界各國(guó)人民的歡迎[1]。
近年來(lái),綠豆的育種研究越來(lái)越受到重視[2],其選育優(yōu)良新品種的常用方法是雜交。對(duì)綠豆雜交后代的真假雜種鑒定一直采用傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)辨別法,這種方法需要后代與親本的生理特征作對(duì)比,準(zhǔn)確性易受生長(zhǎng)環(huán)境等外界因素影響,且周期較長(zhǎng)[3]。
目前,分子標(biāo)記在綠豆基因組學(xué)的研究中應(yīng)用越來(lái)越廣泛[4],其中較為常見(jiàn)的就是SSR標(biāo)記,該標(biāo)記具有均勻覆蓋基因組、多態(tài)性高等優(yōu)點(diǎn)[5]。利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)綠豆F1真假雜種進(jìn)行鑒定,時(shí)間短,準(zhǔn)確性高。
本試驗(yàn)利用SSR標(biāo)記對(duì)6個(gè)綠豆雜交組合的F1幼苗進(jìn)行鑒定,通過(guò)田間表型性狀鑒定來(lái)進(jìn)行驗(yàn)證,旨在確定SSR標(biāo)記鑒定綠豆雜種的可行性,為綠豆育種工作提供新的方法。
6個(gè)親本材料為冀綠9號(hào)[6-7](黑色種皮)、晉綠豆3號(hào)[8](綠色種皮)、BIS9805(綠色種皮)、白綠10號(hào)(綠色種皮)、資源331[9](黃色種皮)、資源330(黃色種皮)。
6個(gè)雜交組合為冀綠9號(hào)×?xí)x綠豆3號(hào)(正反交)、白綠10號(hào)×冀綠9號(hào)(正反交)、冀綠9號(hào)×資源330(正反交)、冀綠9號(hào)×BIS9805(正反交)、資源330×?xí)x綠豆3號(hào)(正反交)、資源331×?xí)x綠豆3號(hào)(正反交)。
1.2.1 基因組DNA的提取 親本材料于2018年種植于山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所食用豆課題組實(shí)驗(yàn)室,每個(gè)培養(yǎng)皿內(nèi)放置5粒種子,出苗后取2~3片嫩葉,用于改良CTAB法提取DNA[10-11]。雜交后代F1種植于東陽(yáng)大田,出苗后取嫩葉,提取DNA。具體步驟為:(1)水浴鍋預(yù)熱65℃。(2)嫩葉置于2.0mL離心管內(nèi),加入液氮研磨。(3)在研磨好的葉樣中加入18μL的β-巰基乙醇并混勻,再加入0.8 mL的CTAB混合提取液,旋渦振蕩1 min,預(yù)熱好的水浴鍋中水浴1h。(4)加入0.8mL的氯仿/異戊醇(V/V=24∶1)溶液,15 min混勻。(5)10 000 r/min離心10 min,取上清,加入95%的乙醇0.9 mL,輕輕搖晃2min后,-20℃冰箱冷凍0.5h。再10000r/min離心10 min,棄上清,將沉淀保留。室溫干燥后,加入0.2mL的超純水,-20℃保存。
1.2.2 PCP反應(yīng) PCR反應(yīng)體系(10 μL):DNA 模版 1.5 μL(25 μmol/L),10×Taq buffer 1 μL,DNTP 0.2 μL,10×Taq DNA 聚合酶 0.12 μL,SSR 引物(20 μmol/L)0.75 μL,ddH2O 6.48 μL。
PCR擴(kuò)增程序:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s;各引物相應(yīng)的退火溫度退火30 s;72℃延伸45 s,35 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸 5 min,4 ℃保存。
1.2.3 擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠檢測(cè) 把2 μL的Londing buffer加入到擴(kuò)增產(chǎn)物中混合均勻,利用8%的聚丙烯酰胺非變性凝膠電泳分離擴(kuò)增產(chǎn)物,AgNo3染色,甲醛顯色后拍照記錄。
1.2.4 SSR分子標(biāo)記的篩選 利用6個(gè)親本材料,對(duì)實(shí)驗(yàn)室的100對(duì)SSR分子標(biāo)記進(jìn)行篩選,篩選出帶型清晰、差異明顯的SSR分子標(biāo)記[12]。
1.2.5 雜種鑒定 用篩選出來(lái)的SSR標(biāo)記對(duì)F1DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增,親本帶型都具有的則為真雜種。
1.2.6 田間種皮色鑒定 將雜交后代F2群體種植于山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院臨汾基地,成熟后觀察其種皮色是否發(fā)生分離。若種皮色發(fā)生分離,確定真雜種;若種皮色未發(fā)生分離,確定為假雜種[13-15]。
通過(guò)對(duì)6個(gè)親本材料的多態(tài)性分析(圖1),挑選出了 5個(gè)多態(tài)性較好的SSR引物(E15212,E52717,G27240,G3202,Vr2-436),具體如表 1[16]所示。
表1 SSR引物序列
通過(guò)挑選出來(lái)的5個(gè)SSR引物對(duì)食用豆課題組提取的6個(gè)組合的43個(gè)F1后代進(jìn)行鑒定,一個(gè)組合由2對(duì)引物重復(fù)鑒定,結(jié)果如表2[17]所示。F1為真雜種的,同時(shí)具有親本的帶型(圖2)[18]。
表2 F1真假雜種鑒定結(jié)果
王麗俠等[19-21]研究表明,不同種皮色的雜交后代會(huì)出現(xiàn)分離。本次試驗(yàn)選取了不同種皮色的親本配制雜交組合,收取F2種子后脫粒,對(duì)其顏色進(jìn)行調(diào)查。F2種子出現(xiàn)分離的為真雜種,未出現(xiàn)分離的記為假雜種。在冀綠9號(hào)×資源330組合的7個(gè)雜交莢后代中,有5個(gè)后代出現(xiàn)了黃種皮與黑種皮的分離,有1個(gè)后代均為黑種皮,1個(gè)后代均為黃種皮。田間種皮色鑒定結(jié)果與實(shí)驗(yàn)室SSR標(biāo)記鑒定結(jié)果一致[22]。
綠豆雜種鑒定通常采用葉片結(jié)構(gòu)、株型差異等形態(tài)標(biāo)記來(lái)作為鑒定標(biāo)準(zhǔn)。這種傳統(tǒng)的鑒定方法都需要比較親本與后代的差異,所以,周期較長(zhǎng),并且容易受到生長(zhǎng)環(huán)境等外界因素的影響,造成很大的誤差。利用SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)綠豆的真假雜種進(jìn)行鑒定,不僅鑒定時(shí)間短、不受環(huán)境影響,又是利用分子技術(shù)從遺傳角度進(jìn)行鑒定,準(zhǔn)確度高,結(jié)果更真實(shí)可靠。目前,SSR分子標(biāo)記技術(shù)已經(jīng)在綠豆研究的各個(gè)領(lǐng)域被廣泛使用[23-25]。本試驗(yàn)通過(guò)SSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)綠豆種皮色雜交組合后代進(jìn)行雜種鑒定,其結(jié)果準(zhǔn)確性由2個(gè)SSR引物鑒定1個(gè)組合的對(duì)照組來(lái)確保;田間后代種皮色的分離統(tǒng)計(jì)結(jié)果,與實(shí)驗(yàn)室SSR鑒定結(jié)果相一致。綜上所述,通過(guò)SSR分子標(biāo)記技術(shù)鑒定綠豆真假雜種與傳統(tǒng)鑒定相比,不僅準(zhǔn)確,優(yōu)點(diǎn)更多,可以廣泛使用。