青云
在生命數(shù)十億年的發(fā)展歷程中,進化起到了至關(guān)重要的作用。進化是一種偉大的自然力量,因此科學(xué)家希望在實驗室里模仿生命的進化方法,實現(xiàn)生物大分子(主要是蛋白質(zhì))的快速進化。這種掌控生物分子進化的方法,被稱為“定向進化”。美國科學(xué)家弗朗西絲·阿諾德、喬治·史密斯和英國科學(xué)家格雷戈里·溫特,因為在定向進化研究領(lǐng)域的開創(chuàng)性貢獻,獲得了2018年諾貝爾化學(xué)獎。
在生物體內(nèi)含有的各種蛋白質(zhì)中,酶是一種重要的蛋白質(zhì)。酶是一類生物催化劑,可加速各種生物中的化學(xué)反應(yīng)。如果沒有酶,我們將很難進行消化吸收、細胞修復(fù)、消炎排毒等。如果我們失去了酶,生命也就走向了終點。
酶除了作為生命延續(xù)的重要工具,還能運用于多種原材料的生產(chǎn)。比如,醬油、食醋、酒的生產(chǎn)就是在酶的作用下完成的;洗衣粉中加入酶,可以使洗衣的效率提高。各種酶制劑在臨床上的應(yīng)用也越來越普遍。由于酶的應(yīng)用廣泛,酶的提取和合成就成了重要的研究課題。1993年,阿諾德進行了第一次酶的定向進化,并獲得了新的酶。
從第一次工業(yè)革命開始,人們就希望能快速合成一些自然界中存在或不存在的分子。在1990年以前,科學(xué)家在人工設(shè)計新蛋白質(zhì)分子方面,一直沒有獲得太大的進展?,F(xiàn)如今,這樣的合成技術(shù)越來越多且越來越成熟。但是,因為生物大分子是自然界中最復(fù)雜的分子,所以科學(xué)家設(shè)計和合成生物大分子時,還是感到十分吃力。
定向進化是在實驗室中快速完成蛋白質(zhì)的進化過程?試管
人工連接酶
而半路出家的阿諾德打破以傳統(tǒng)的化學(xué)方法來設(shè)計蛋白質(zhì)分子的常規(guī)思維,借助進化的力量從而獲得了成功。阿諾德對進化的力量充滿了好奇。自從第一批生物的種子在約37億年前誕生以來,地球上幾乎每一寸空間都充滿著包括微生物在內(nèi)的多樣化生命體。生命在各種極端的環(huán)境下都能存活下來,這是因為構(gòu)成生命的蛋白質(zhì)在數(shù)億萬年的進化歷程中,已經(jīng)被改變、優(yōu)化和更新,創(chuàng)造出了難以置信的多樣性。
進化的本質(zhì)是基因突變和自然選擇。而阿諾德在實驗中,通過改變微生物培養(yǎng)液中各種化學(xué)成分的濃度,讓可產(chǎn)生酶的微生物發(fā)生隨機的基因突變,再用合適的方法加以篩選,找出自己所需的目標微生物,最終利用這些微生物生產(chǎn)出自己所需的新酶。
以往工業(yè)生產(chǎn)中所用到的酶,通常是在自然界中篩選出來的。但是這種方法運作周期很長,而且效率也偏低。酶的定向進化技術(shù),是從基因?qū)用鎸ιa(chǎn)酶的微生物進行改造,從而快速獲得酶,或是進化出性能更加好的新酶。阿諾德的定向進化方法,可讓工業(yè)界以更加環(huán)保節(jié)能的方式生產(chǎn)酶,對制藥、化工生產(chǎn)、綠色能源開發(fā)等方面都有著十分重要的作用。
抗體是生物體內(nèi)能夠抵御外敵入侵的一種蛋白質(zhì),是生命防線中的重要成員之一??贵w主要有兩類:一類是正??贵w,比如A型血人的體內(nèi)有對抗B型血輸入的抗體;另一類是免疫抗體,通常用于抵御有毒有害的致病微生物。目前科學(xué)家研究比較多的,是可以治病救人的免疫抗體。
如何發(fā)現(xiàn)某個基因能否產(chǎn)生新的抗體?科學(xué)家一直在找一個“好演員”,希望它能夠把這種基因很好地展示出來。1985年,史密斯率先發(fā)現(xiàn)了這個“好演員”,它就是噬菌體。就像它的名字一樣,噬菌體是一種能夠感染和吞食細菌的病毒。
科學(xué)家將可能產(chǎn)生新抗體的基因,通過特殊的方法插入到噬菌體的基因后發(fā)現(xiàn),這些基因編碼的蛋白質(zhì)和噬菌體的外殼蛋白質(zhì)完美地融合在一起,展示在噬菌體的外殼上。因此,科學(xué)家把這種獨特的技術(shù)叫作“噬菌體展示技術(shù)”。由于新培育的蛋白質(zhì)能明明白白地展示在噬菌體的表面,科學(xué)家就很容易從中找到適合做新抗體的蛋白質(zhì),也能反推出產(chǎn)生這種新抗體的決定性基因。
由于噬菌體生命周期短,繁殖速度快,能讓科學(xué)家快速地找到新抗體。通常只需要2周時間,科學(xué)家就能找到某個抗體對應(yīng)的基因,這就增加了科學(xué)家對新抗體的挑選余地。經(jīng)過近30年的發(fā)展和完善,噬菌體展示技術(shù)已開始造福人類。這種技術(shù)被廣泛應(yīng)用于抗原抗體庫建立、藥物設(shè)計、疫苗研究、病原檢測、基因治療等領(lǐng)域。
噬菌體展示系統(tǒng)模擬了自然免疫系統(tǒng),使我們有可能模擬體內(nèi)抗體生成的過程,讓抗體能夠加速進行定向進化,從而大大地提高了免疫藥物的研發(fā)和生產(chǎn)速度。噬菌體展示技術(shù)在定向分子進化過程中發(fā)揮了極大的作用,不僅在抗體研究領(lǐng)域成果顯著,而且還能在酶及其活性的研究中發(fā)揮效力。許多科學(xué)家都利用史密斯開發(fā)出的噬菌體展示技術(shù)進行科學(xué)研究,其中具有顯著成效的是溫特。
在獲知史密斯的噬菌體展示技術(shù)后,溫特開展了大量的抗體定向進化研究。他不斷地使用在實驗室中獲得的特定基因,將其插入到噬菌體基因中,然后分析噬菌體產(chǎn)生的新蛋白質(zhì),最后從中篩選出新的抗體。他因此成了第一個利用抗體定向進化技術(shù)發(fā)明新藥的人。這個藥物是阿達木單抗(單克隆抗體),從2002年開始正式用于治療類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、銀屑病和炎癥性腸病。
定向進化是人類對生命認知的一次重大變革,它將對未來地球生命產(chǎn)生重大而深遠的影響。如果用好這些工具,我們不但可以健康長壽,而且還可以讓人類的生命家園更加美好。當(dāng)然,我們也得警惕定向進化被壞人利用,從而設(shè)計出不利于人類的奇特生物,那很可能會改變地球生態(tài),給人類帶來難以想象的災(zāi)難。