朱欽士(美國南加州大學(xué)醫(yī)學(xué)院)
(上接2019年第6期第14頁)
水本來是地球上最豐富的氫原子供體,可惜其中的氫被氧所“占據(jù)”,而氧又是“氧化性”很強(qiáng)的元素,“氧化”這個詞因此而來。氧的氧化還原電位高達(dá)+0.82 V,要將水分子中的氫原子“拿”出來,讓氧原子變回氧氣,就需要比氧更強(qiáng)的氧化物。氧化性比氧還高的元素就只有氟,但在自然界中游離的氟并不存在。即使生物能用氟從水中奪取氫,奪下的氫也與氟結(jié)合在一起,而不能為生物所用,且生成的氟化氫還對生物有毒。而光系統(tǒng)Ⅱ射出電子后的葉綠素分子(因為其吸收峰在680 nm 而被稱為P680,其失去電子的形式叫P680+)氧化還原電位高達(dá)+1.1 V,遠(yuǎn)比氧的+0.82 V 高,因而是比氧還厲害的氧化劑,完全有能力從水分子那里“搶”氫原子中的電子。這個反應(yīng)是通過結(jié)合在光系統(tǒng)Ⅱ上的“釋氧復(fù)合物”(oxygen-evolving complex)實現(xiàn)的。
這個釋氧復(fù)合物,與所有進(jìn)行氧化還原反應(yīng)的酶一樣,含有能改變化學(xué)鍵數(shù)量的輔基。釋氧中心的輔基由4 個錳離子、1 個鈣離子、1~2 個氯離子,若干氧原子、若干碳酸氫根離子組成,經(jīng)驗結(jié)構(gòu)式為Mn4Ca1OxCl1-2(HCO3)y,其中的錳離子可以在3 價和4 價之間變化,4 個錳離子就可以順序給出1、2、3、4 個電子。這就使得P680可以射出電子4 次,從2 個水分子中得回4 個電子,同時釋放4 個氫離子。失去氫原子的2 個氧原子則彼此結(jié)合,成為氧氣釋放。
這個釋氧復(fù)合物有可能是從海中的“鈣錳石”(rancieite)演變而來的。鈣錳石含有鈣離子、錳離子和氧原子,而氯離子和碳酸氫根在海水中就有。如果它有機(jī)會接觸到光系統(tǒng)Ⅱ的P680,就有可能產(chǎn)生最初的氧化水的反應(yīng)。原核生物再將這個無機(jī)的反應(yīng)中心結(jié)合到蛋白分子上,與光系統(tǒng)Ⅱ的反應(yīng)中心聯(lián)系。就是到現(xiàn)在,釋氧復(fù)合物還是很容易與光系統(tǒng)Ⅱ分開,只要用高濃度的鹽溶液就可以將它“洗”下來,而對光系統(tǒng)Ⅱ的其他功能沒有影響,說明這個釋氧復(fù)合物是后來才加到光系統(tǒng)Ⅱ上的。
光系統(tǒng)Ⅱ從水分子中獲得電子,并釋放氧氣,是極為重要的發(fā)展,但此反應(yīng)的好處在單獨的光系統(tǒng)Ⅱ上卻不能發(fā)揮出來。光系統(tǒng)Ⅱ的工作方式是環(huán)狀電子流,目的是產(chǎn)生跨膜氫離子梯度,并不是提供有機(jī)合成所需要的氫原子。環(huán)狀電子流系統(tǒng)既不輸入,也不輸出分子,從水中得到的氫原子“無處可去”。該系統(tǒng)雖可將醌還原為氫醌,但氫醌由于其氧化還原電位過高,并不能還原NADP+,所以氫醌上的氫原子并不容易輸出?,F(xiàn)在沒有一種只擁有光系統(tǒng)Ⅱ的原核生物能進(jìn)行釋氧光合作用,經(jīng)過幾十億年的時間,只擁有光系統(tǒng)Ⅱ的原核生物仍然沒有發(fā)展出氧化水分子的能力(盡管理論上沒有問題),說明只憑光系統(tǒng)Ⅱ自己不能,或者不必,發(fā)展出氧化水的能力。
另一方面,能提供氫離子的光系統(tǒng)Ⅰ,又不能從水分子中得到氫原子。這是因為它的整個系統(tǒng)都向氧化還原電位低的方向移動了,射出電子的葉綠素分子(P700+,因為這個葉綠素的吸收峰在700 nm),其氧化還原電位就比光系統(tǒng)Ⅱ的P680+低很多,在+0.5 V 左右,根本無法氧化氧化還原電位為+0.82 V 的水分子。這就出現(xiàn)了一個尷尬的局面:能從水得到氫原子的光系統(tǒng)Ⅱ很難“交出”這些氫原子,而需要“交出”氫原子的光系統(tǒng)Ⅰ又不能從水中獲得氫原子。解決這個問題的辦法就是將這2 個光系統(tǒng)串聯(lián)起來,讓光系統(tǒng)Ⅱ從水分子獲得的氫原子能傳遞到光系統(tǒng)Ⅰ去,這就要求原核生物同時具有光系統(tǒng)Ⅱ和光系統(tǒng)Ⅰ,而這在藍(lán)細(xì)菌中實現(xiàn)了。
藍(lán)細(xì)菌(Cyanobacteria)是原核生物中唯一擁有2 個光系統(tǒng),能進(jìn)行釋氧光合作用的細(xì)菌門類。在這個雙系統(tǒng)中,光系統(tǒng)Ⅱ從水分子得到的氫原子還是首先用于還原結(jié)合在其上的醌分子,這樣形成的氫醌也像以前那樣經(jīng)過類似細(xì)胞色素bc1那樣的復(fù)合物建立跨膜氫離子梯度,不過從類似bc1的復(fù)合物出來的電子就不像以前那樣,通過細(xì)胞色素c2又回到光系統(tǒng)Ⅱ的P680+上,形成環(huán)狀電子流動,而是經(jīng)過一個功能上類似細(xì)胞色素c2的電子載體(即也能在細(xì)胞膜外表面滑動的電子傳遞蛋白)傳給光系統(tǒng)Ⅰ的P700+,即作為光系統(tǒng)Ⅰ的電子供體。
因此雙光系統(tǒng)的工作方式,就是將光系統(tǒng)Ⅱ和光系統(tǒng)Ⅰ相串聯(lián),實現(xiàn)線性電子流動,這樣既可讓光系統(tǒng)Ⅱ還原的醌分子像以前那樣通過類似bc1那樣的復(fù)合物建立跨膜氫離子梯度,又可將從水分子得到的氫原子(以電子的形式)通過光系統(tǒng)Ⅰ變?yōu)橛袡C(jī)合成所需要的氫原子。釋氧光合作用的優(yōu)越性,現(xiàn)在才充分顯現(xiàn)。所以光系統(tǒng)Ⅱ以水為電子供體的功能,估計是在旁邊同時有光系統(tǒng)Ⅰ存在,并能與光系統(tǒng)Ⅰ實行電子串聯(lián)后才發(fā)展出來的。
為了實現(xiàn)這個線性電子流動,原來與光系統(tǒng)Ⅱ組成環(huán)狀電子回路的細(xì)胞色素bc1復(fù)合物也有一些變化。細(xì)胞色素b和Rieske 鐵硫蛋白都不變,它們氧化氫醌分子的機(jī)制也不變,仍然是通過分支的電子流動,用醌循環(huán)(Q-cycle)的方式建立跨膜氫離子梯度,改變的是將輸出電子的細(xì)胞色素c1換為細(xì)胞色素f,因此這個復(fù)合物也被稱為細(xì)胞色素bf復(fù)合物。細(xì)胞色素f所含的血紅素輔基和細(xì)胞色素c2一樣,都是c型的血紅素,但是結(jié)合它的蛋白質(zhì)與細(xì)胞色素c1的不同。由于這個復(fù)合物的工作方式與細(xì)胞色素bc1相同,前文將其稱為“類似bc1那樣的復(fù)合物”。
從細(xì)胞色素bf復(fù)合物取得電子,將其傳遞給光系統(tǒng)I 上P700+的電子傳輸?shù)鞍滓膊皇羌?xì)胞色素c2,而是一個含銅離子的蛋白稱為“質(zhì)體藍(lán)素”(plastocyanine),其中的銅離子可以在1 價(Cu+)和2 價(Cu2+)之間轉(zhuǎn)變,起到傳遞電子的作用。
釋氧光合作用的出現(xiàn),意義極為深遠(yuǎn),它使得生物在利用光能建立跨膜氫離子梯度的同時,得到了水這個大量存在且用之不竭的氫原子的來源,生物的2 個最大的需求,能量和還原性氫原子,都能通過太陽光的能量提供。這使得進(jìn)行釋氧光合作用的生物完全擺脫對現(xiàn)成的還原性物質(zhì)的依賴,成為真正的自養(yǎng)生物。
藍(lán)細(xì)菌雙光系統(tǒng)的巨大優(yōu)越性也被一些真核生物“看中”,將其變成自己的能力而成為自養(yǎng)生物。這就是將藍(lán)細(xì)菌變成自己的細(xì)胞器,讓藍(lán)細(xì)菌替自己進(jìn)行光合作用。這樣的過程曾經(jīng)發(fā)生過多次,說明真核細(xì)胞“收容”藍(lán)細(xì)菌是比較“容易”的事。
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之所以真核生物能比較容易地“收容”藍(lán)細(xì)菌,是因為真核細(xì)胞具有吞食能力。由于擁有線粒體這樣的“動力工廠”,能量充足,細(xì)胞巨大,且由于有“動力蛋白”(即能產(chǎn)生機(jī)械力的蛋白,例如肌球蛋白myosin),以及與其配套的“運動軌道”(例如肌纖蛋白actin),能主動使細(xì)胞膜變形,包裹食物顆粒,所以能將細(xì)胞外的食物顆粒吞進(jìn)細(xì)胞。在多數(shù)情況下,吞進(jìn)去的食物顆粒都被當(dāng)作營養(yǎng)消化了,但也會發(fā)生被吞進(jìn)的藍(lán)細(xì)菌不被消化,而是在真核細(xì)胞中生存下來的情況。由于藍(lán)細(xì)菌利用太陽光合成ATP 和有機(jī)物的功能對吞進(jìn)它的真核細(xì)胞有利,它就和真核細(xì)胞建立了共生關(guān)系:真核細(xì)胞為藍(lán)細(xì)菌提供穩(wěn)定的生活環(huán)境,藍(lán)細(xì)菌賦予真核細(xì)胞具有釋氧光合作用的能力。這樣藍(lán)細(xì)菌就逐漸變成了真核細(xì)胞的一種細(xì)胞器,即葉綠體(chloroplast)。相比之下,當(dāng)初“收容”α-變形菌,將其變?yōu)榫€粒體的生物是原核生物,沒有吞食能力,所以過程要困難得多,在歷史上只發(fā)生過一次,現(xiàn)在所有真核生物的線粒體都是從最初的那個線粒體遺傳下來的。
葉綠體和線粒體一樣,都是真核細(xì)胞中的細(xì)胞器。它們至今還保留有自己的細(xì)胞膜和部分遺傳物質(zhì)DNA,也通過分裂進(jìn)行繁殖,不過在億萬年的演化過程中,它們原先的基因已經(jīng)大部分轉(zhuǎn)移到真核細(xì)胞的DNA 中去了。
吞下藍(lán)細(xì)菌,將其變?yōu)槿~綠體的真核細(xì)胞很可能是生活在水中的,例如生活在藍(lán)細(xì)菌數(shù)量最多的海洋中。這些獲得藍(lán)細(xì)菌,能進(jìn)行釋氧光合作用,仍然生活在水中的真核生物就叫做藻類(algae)。藍(lán)細(xì)菌(Cyanobacteria)曾經(jīng)被稱為“藍(lán)綠藻”(blue-green algae),因為它們和單細(xì)胞的藻類看上去有相似之處,而且常為藍(lán)綠色。其實藍(lán)細(xì)菌是原核生物,與藻類為真核生物不同,在此也改稱之為“藍(lán)細(xì)菌”,以和進(jìn)行釋氧光合作用的真核生物藻類相區(qū)別。
最早獲得藍(lán)細(xì)菌,并使其變?yōu)槿~綠體的真核生物可能是灰胞藻(Glaucophyte)。它的葉綠體比較原始,稱為藍(lán)小體(cyanelles)。藍(lán)小體含有由肽聚糖(peptidoglycans)組成的細(xì)胞壁,估計是藍(lán)細(xì)菌細(xì)胞壁的殘留。藍(lán)小體和藍(lán)細(xì)菌一樣,含有藻膽素(phycobilin,見后文)。在灰胞藻分支出去以后,這樣的真核細(xì)胞還隨后分化成為綠藻(green algae,學(xué)名Chlorophyte)和紅藻(red algae,學(xué)名Rhodophyte)。
除了綠藻和紅藻,還有一大類藻叫做褐藻(brown algae,學(xué)名Phaeophyceae)。海帶(kelp)就是一種褐藻。與綠藻和紅藻不同的是,褐藻的葉綠體被3 層甚至4 層膜包裹,說明這種葉綠體不是最初吞食藍(lán)細(xì)菌而形成的,而是某種真核細(xì)胞吞食已經(jīng)含有葉綠體的綠藻或紅藻而獲得的,所以除了藍(lán)細(xì)菌自己的2 層細(xì)胞膜外,還含有它們所在的真核細(xì)胞的膜,因此這種葉綠體屬于“二手貨”。因此,褐藻不被認(rèn)為是光合真核生物的“嫡系部隊”,而屬于“雜牌軍”。
有趣的是,有些被吞進(jìn)的綠藻和紅藻的細(xì)胞核還能幸存,例如在隱藻(Cryptophyta)中,這些被吞進(jìn)的藻類的細(xì)胞核就位于葉綠體的2 層膜和更外面的膜之間,形成共生核(nucleomorph)。它們周圍殘留的細(xì)胞質(zhì)中含有80S 核糖體,說明它們是真核生物的遺跡。它們含有很小的染色體(只有幾十萬堿基對),說明是在退化的過程中。
即使是原來沒有葉綠體的真核生物,重復(fù)十幾億年前捕獲藍(lán)細(xì)菌,使其變?yōu)槿~綠體的過程,也能再次發(fā)生。一種淡水生活,單細(xì)胞,類似變形蟲的絲足蟲(Paulinelle chromatophora),看來就在“最近”(約6 000 萬年前)捕獲了藍(lán)細(xì)菌,并開始將其改造成葉綠體,盡管到現(xiàn)在這些藍(lán)細(xì)菌還沒有完全變成葉綠體。絲足蟲的細(xì)胞內(nèi)含有1~2 個臘腸形的色素細(xì)胞(chromoatophores),它們的前身是藍(lán)細(xì)菌中的聚球菌(Synechococcus),但已經(jīng)不能離開寄主細(xì)胞而單獨生活。色素細(xì)胞的DNA 含有100 萬個堿基對和約850 個基因,遠(yuǎn)高于葉綠體的12 萬~17 萬個堿基對和約100 個基因,但是又少于藍(lán)細(xì)菌的約1 500 個基因。寄主細(xì)胞核中來自色素細(xì)胞的DNA 只占0.3%~0.8%,遠(yuǎn)低于植物中的11%~14%,說明藍(lán)細(xì)菌基因向寄主細(xì)胞核轉(zhuǎn)移的過程才進(jìn)行“不久”。
有趣的是,有些動物也“看上了”葉綠體進(jìn)行光合作用,制造有機(jī)物的能力,將其組入自己的細(xì)胞中,讓它們?yōu)樽约褐圃煊袡C(jī)物。例如海蛤蝓(Elysia,又叫“海蝸?!?,屬于軟體動物)以海藻為食。它們將海藻消化后,留下葉綠體。接著,消化道的內(nèi)皮細(xì)胞將這些葉綠體吞進(jìn)去,讓它們在這些內(nèi)皮細(xì)胞中生活,為自己制造營養(yǎng)。葉綠體在這些內(nèi)皮細(xì)胞中存活的時間不同,有的幾天就得換一次,有的能夠存活10 個月之久。綠葉海蛤蝓(Elysia chlorotica)只需食用海藻2 周,就能終生保有它們的葉綠體。為了更好地利用這些葉綠體進(jìn)行光合作用,綠葉海蛤蝓還將自身變得像一片葉子,既是動物,又像植物。
所有這些能進(jìn)行釋氧光合作用的生物都有合成有機(jī)物的巨大能力,使它們變?yōu)椤俺壣a(chǎn)者”,地球上的食物鏈也從原先的以細(xì)菌為基礎(chǔ)變?yōu)橐栽孱惡椭参餅榛A(chǔ),這就極大地擴(kuò)張了食物鏈的供給能力,也使得動物,特別是大型動物的出現(xiàn)成為可能。現(xiàn)在世界上糧食年產(chǎn)量在20 億噸左右,供養(yǎng)著大約70 億人,而這些糧食都是釋氧光合作用制造出來的。2010年,世界總共生產(chǎn)了180億只雞、15 億頭牛、9.5 億只豬、10.5 億只羊,而要生產(chǎn)1 kg 雞肉需要2.1~3.0 kg 的谷物,生產(chǎn)1 kg豬肉需要4.0~5.5 kg 谷物,生產(chǎn)1 kg 牛肉更需要10 kg 以上的谷物,這些糧食都來自釋氧光合作用。
作為釋氧光合作用“副產(chǎn)品”的氧氣,也改變了大氣的組成。一開始生物釋放的氧氣還不能在大氣中積累,各種能被氧氣氧化的還原物質(zhì)(例如海水中的亞鐵離子)會消耗掉這些初期釋放的氧氣,只有當(dāng)這些物質(zhì)被大規(guī)模氧化后,大氣中的氧氣濃度才開始上升。大氣中氧氣濃度明顯上升的時間大約在2.4 億—2.2 億年前,稱為大氣的“大氧化事件”(Great Oxygenation Event),釋氧光合作用出現(xiàn)的時間應(yīng)該比這更早。由于進(jìn)行光合作用的生物利用二氧化碳合成有機(jī)物,所以伴隨大氣中氧含量的增加,二氧化碳的含量則大幅減少。二氧化碳是一種溫室氣體,它濃度的下降使得地球表面的溫度降低到更適合生物生存的程度。
不僅如此,大氣中氧氣的出現(xiàn)又使異養(yǎng)生物(真菌和動物)從大氣中方便地獲得氧化還原反應(yīng)所需要的電子受體(氧氣),使這些生物從食物分子的高效氧化中獲取大量能量。大氣中無處不在的氧氣也使得動物有到處移動的自由。目前大氣中的氧氣含量約為20%,在3 億年前的石炭紀(jì)(Carboniferrous period)時期,大氣中的氧含量曾經(jīng)高達(dá)35%,使得許多昆蟲由于氧化還原反應(yīng)能高速獲得大量的能量而變得體型巨大,例如蜻蜓的翼展可以達(dá)到75 cm,蝎子體長1.5 m。
有些原核生物只擁有一種光系統(tǒng),或擁有光系統(tǒng)Ⅰ,或擁有光系統(tǒng)Ⅱ(見后文)。既然真核生物具有吞食能力,將這些原核生物吞進(jìn)去,變成只擁有一個光系統(tǒng)的“葉綠體”,理論上也是可能的。但是這樣的真核生物從來就沒有被發(fā)現(xiàn)過,或許根本就不存在。這個事實也證明雙光系統(tǒng)的優(yōu)越性遠(yuǎn)高于單光系統(tǒng),只擁有單個光系統(tǒng)的原核生物就被真核生物“看不上”。
至此,好像一切都很完滿,其實對這2 個光系統(tǒng)的介紹還不完全。葉綠素分子的面積太小,只靠光反應(yīng)中心的葉綠素分子是無法捕獲到足夠的光能的。之所以光系統(tǒng)能有效地工作,還要依靠能收集光能的“葉綠素天線”的幫助。
(待續(xù))