秦婷玉 劉靜 王小中
選擇性剪接(alternative splicing,AS)是指mRNA前體(pre-mRNA)經(jīng)剪接形成多種不同的成熟mRNA異構(gòu)體,生成結(jié)構(gòu)和功能各異的蛋白質(zhì)一系列過程。研究表明,此過程約在92%~94%的人類基因中發(fā)生,并且每個人類基因平均至少有5個轉(zhuǎn)錄物的異構(gòu)體[1]。諸多研究已證實,大部分腫瘤生物學過程(如代謝、細胞凋亡、細胞周期控制、侵襲、轉(zhuǎn)移和血管生成等)均受到AS 的影響[2-6];同樣在慢性髓系白血?。╟hronic myeloid leukemia,CML)中,也存在著AS事件,對CML 的發(fā)生、進展、耐藥及免疫逃逸具有重要作用。本文綜述AS與CML耐藥的相關(guān)性,從CML的耐藥機制出發(fā),以期發(fā)現(xiàn)新的治療靶點。
AS 主要是由剪接體影響的轉(zhuǎn)錄過程,剪接體是由5 種小核核糖核蛋白(small nuclear ribonucleoproteins,snRNPs:U1、U2、U4、U5、U6)、19 種復(fù)合物(nineteen complex,NTC)以及NTC 相關(guān)復(fù)合物(NTCrelated complex,NTR)等其他輔助蛋白構(gòu)成[7]。研究表明,酵母中含有8 種不同狀態(tài)的剪接體,覆蓋了從組裝到被激活,從兩步交酯反應(yīng)到剪接體解聚的整個剪接通路,其中在預(yù)催化剪接體前體中首次觀察到U1 snRNP 對5'剪接位點的識別[8],剪接為RNA 依賴性ATP酶/解旋酶驅(qū)動的過程[9]。鑒于基因表達調(diào)控的復(fù)雜性,便于進行高保真度的有效剪接,不僅通過富含絲氨酸/精氨酸的蛋白(serine/arginine-rich protein,SR protein)、核不均一核糖蛋白(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein,hnRNP)在內(nèi)的RNA結(jié)合蛋白(RNA binding protein,RBPs)的相互作用[10],還通過剪接位點周圍基因序列突變的順式調(diào)控作用,以及寡聚嘧啶序列影響來調(diào)控基因的AS[11]。最近還發(fā)現(xiàn)可以通過PANDAR、SPA 和asFGFR2等lncRNA調(diào)控靶基因的AS過程[12];甲基轉(zhuǎn)移酶METTL16、去甲基酶ALKBH5 和YTH 結(jié)構(gòu)域蛋 白YTHDC1等N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)修飾也可通過改變SF 與m6A 甲基化RNA 之間的相互作用能力來調(diào)控AS[13]。
腫瘤治療的主要挑戰(zhàn)之一為最初對治療反應(yīng)良好的腫瘤最終對藥物產(chǎn)生耐藥性[14]。如組成型活性AR-V7剪接異構(gòu)體有助于前列腺癌患者對恩雜魯胺和阿比特龍的抗性[15];PIK3CD-S 剪接異構(gòu)體在前列腺癌小鼠異種移植模型中有助于小鼠對PI3Kδ 抑制劑CAL-101的抗性[16];攜帶BRAF剪接異構(gòu)體的黑色素瘤患者表現(xiàn)出對RAF 抑制劑威羅菲尼的抗性[17];BRCA1-Δ11q 異構(gòu)體高表達促進乳腺癌和卵巢癌藥物耐藥的發(fā)生[18];雌激素受體ERα36 亞型與他莫昔芬耐藥乳腺癌中干細胞標志物醛脫氫酶1A1(aldehyde dehydrogenase 1a1)的表達共定位并呈正相關(guān)[19]。同樣,研究表明越來越多剪接調(diào)控因子與耐藥性的誘導(dǎo)有關(guān)。如CLL患者SF3B1 基因突變顯示與氟達拉濱治療耐藥相關(guān)[20];SRSF1癌基因介導(dǎo)肺腺癌對卡鉑和紫杉醇的耐藥性[21];在胰腺癌細胞中通過siRNA 下調(diào)SRPK1導(dǎo)致細胞凋亡和對順鉑和吉西他濱的敏感性增加[22]。針對上述腫瘤耐藥情況的發(fā)生,通過設(shè)計特定的siRNA、反義寡核苷酸(antisense oligonucleotides,ASOs)或小分子抑制劑糾正基因異常剪接,使腫瘤細胞對治療藥物重新敏感。
最近研究表明,酪氨酸激酶抑制劑(tyrosine kinase,TKI),如伊馬替尼(imatinib,IM)、吉非替尼和厄洛替尼等耐藥的發(fā)生不僅與BCR-ABL 基因激酶結(jié)構(gòu)域中出現(xiàn)點突變有關(guān),也與CML 中廣泛異常的AS事件存在密切聯(lián)系。外顯子芯片研究表明[23],與正常K562 細胞相比,伊馬替尼(imatinib,IM)處理的K562細胞共有185個差異表達基因和227個異常AS事件。如BCR-ABL35INS[24]、m-GSK3β[25]、Bcl-2 家族成員(Mcl-1、Bcl-x 和BID)[26]、BIM-γ[27]、PKM2[28]、Gfi1b-sp2[29]、CD44R1[30]等AS 異常剪接事件的發(fā)生與CML耐藥密切相關(guān)。本文選取研究較為深入的基因進行詳細論述,從而尋求更為安全有效的臨床治療手段。
在CML 患者中,BCR-ABL1 激酶結(jié)構(gòu)域中的點突變?yōu)門KI 治療失敗的最常見原因。O'Hare 等[31]研究表明,BCR-ABL 剪接突變體BCR-ABL1 35INS(外顯子8、9 之間的部分內(nèi)含子保留)不能在穩(wěn)轉(zhuǎn)的Ba/F3 和K562 細胞中賦予對TKI 的抗性,但BCR-ABL1 35INS 可能在野生型BCR-ABL1 存在下賦予TKI 抗性。Abdullaev 等[32]研究表明,外顯子7 缺失的BCRABL1剪接體翻譯后未經(jīng)歷蛋白酶體降解,并與“野生型”BCR-ABL1 蛋白異二聚化,該過程可引起構(gòu)象變化,并導(dǎo)致與“野生型”BCR-ABL1酪氨酸激酶的ATP結(jié)合位點相結(jié)合的抑制劑被破壞,從而導(dǎo)致對第一代和第二代TKI的抗性。
Bcl-x 通過AS 編碼長型抗凋亡蛋白Bcl-xl 和短型促凋亡蛋白Bcl-xs,其中Bcl-xl[33]為線粒體介導(dǎo)的細胞凋亡的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,通過結(jié)合促凋亡的BAK,抑制線粒體外膜發(fā)生通透化(mitochondrial outer membrane permeab lisation,MOMP)、細胞色素C 等凋亡因子的釋放來抑制BCR-ABL1 細胞凋亡,也可促進粒系-巨噬系祖細胞(granulocyte-macrophage progenitors,GMP)異常獲得干細胞特性惡化為G0期的白血病干細胞(leukemia stem cells,LSCs),LSCs 可以積累額外的突變,使得細胞的耐藥性進一步增強[34]。采用常規(guī)TKIs 處理K562 細胞,雖然導(dǎo)致大量的BCR-ABL+細胞死亡,但并不能有效清除LSCs。ABT-199靶向G0期LSCs,增加CML細胞對TKIs等藥物的敏感性,對于CML 急變期的TKI 耐藥患者,使用低至納摩爾濃度的ABT-199 即可誘導(dǎo)CML 細胞凋亡,ABT-199和TKIs聯(lián)合使用時,Bcl-xs上調(diào),Bcl-xl下調(diào),CML 小鼠生存期延長,抗白血病能力增強[35]。此外,研究已證明Bcl-2促凋亡家族BIM為IM介導(dǎo)的BCR-ABL 陽性白血病細胞凋亡的主要效應(yīng)物之一,與各種抗凋亡Bcl-2家族成員結(jié)合并使之失活,加強BAX 和BAK 在膜間線粒體空間中的促凋亡作用[36]。有研究提示,BIM 中外顯子3 的缺失多態(tài)性是除BCR-ABL1 激酶結(jié)構(gòu)域突變外影響TKI 敏感性的其他突變[37]。
PKM 通過AS 編碼包含外顯子9 的PKM1 和包含外顯子10 的PKM2,其中PKM1 和PKM2 分別與三羧酸循環(huán)和糖酵解相關(guān)。與正常細胞不同,腫瘤細胞即使在有氧環(huán)境中也傾向于糖酵解,而非三羧酸循環(huán)來代謝葡萄糖,該現(xiàn)象被稱為Warburg 效應(yīng),此效應(yīng)通過調(diào)節(jié)丙酮酸激酶PKM1 和PKM2 亞型的表達實現(xiàn)的。研究表明,定位在線粒體的PKM2可通過穩(wěn)定Bcl-2 調(diào)節(jié)氧化應(yīng)激誘導(dǎo)的細胞凋亡[38]。在CML中,BCR-ABL 通過mTOR/c-Myc/hnRNP/PKM 軸上調(diào)PKM2 的表達,導(dǎo)致自噬受損;IM 通過miR-124/PTBP1 信號級聯(lián)促進PKM2 轉(zhuǎn)化為PKM1,擾亂了Warburg 效應(yīng),代償性激活線粒體脂肪酸氧化(fatty acid oxidation,F(xiàn)AO)反應(yīng)[39],F(xiàn)AO 對LSCs 存在至關(guān)重要。Klawitter 等[40]利用核磁共振波譜法對IM敏感和耐藥的CML 細胞株進行代謝分析發(fā)現(xiàn),糖酵解活性升高與IM耐藥有關(guān)。與IM敏感組比較,PKM2在IM耐藥CML 細胞中高表達,且PKM2/PKM1 比值顯著升高。高表達PKM2 促進CML 糖酵解,進而導(dǎo)致CML 耐藥現(xiàn)象。研究表明,脂肪酸衍生物AIC-47 促進PKM2轉(zhuǎn)化為PKM1,抑制腫瘤特異性糖酵解以及IM代償激活的FAO 過程,并誘導(dǎo)CML 細胞發(fā)生自噬。與單獨使用的AIC-47或IM相比,兩者聯(lián)合治療對CML細胞殺滅作用更強[39]。
研究表明,LSCs的自更新及耐藥的發(fā)生,均與在Wnt 通路中β-連環(huán)蛋白的異常激活有關(guān),LSCs 的自更新則支持CML 進展為急變期[41]。正常狀態(tài)下,β-連環(huán)蛋白由絲氨酸/蘇氨酸激酶酪蛋白激酶Ⅰ(casein kinase Ⅰ,CKⅠ)和糖原合成酶-3(glycogen synthase kinase 3β,GSK3β)進行泛素化和降解。在CML中,GSK3β 異常剪接導(dǎo)致GMP 中WNT/β-連環(huán)蛋白通路的異常激活[42]。Abramsson等[43]進行cDNA測序分析顯示,在急變期CML 祖細胞中,外顯子8 和9 缺失導(dǎo)致的GSK3β 異常剪接異構(gòu)體(m-GSK3β)的出現(xiàn),阻止β-連環(huán)蛋白磷酸化,促進LSCs自更新,進而導(dǎo)致耐藥的發(fā)生。在體外動物模型導(dǎo)入全長GSK3β,則CML 重建和侵襲能力下降[43]。與單獨使用GSK3β 抑制劑鋰或尼洛替尼相比,兩者聯(lián)合治療則BCR-ABL 癌蛋白水平降低,自噬增加,該現(xiàn)象的發(fā)生可能與m-GSK3β表達下調(diào)有關(guān)[44]。
上述研究均強調(diào)了異常pre-mRNA 剪接在CML發(fā)生和耐藥中的關(guān)鍵作用,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了許多CML 特異性剪接事件,包括但并不限于:BCR-ABL35INS[24]變體(外顯子8、9 之間的部分內(nèi)含子保留)導(dǎo)致編碼與TKI 結(jié)合的激酶部分的蛋白提前終止;m-GSK3β[42]剪接異構(gòu)體(缺失外顯子8 和9)導(dǎo)致WNT/β-連環(huán)蛋白通路的異常激活,促進LSCs 的自更新;BIM-γ[27]缺失外顯子4編碼BH3結(jié)構(gòu)域,該區(qū)域?qū)τ贐IM的促細胞凋亡功能是必需的,采用BH3模擬藥物治療CML,可有效緩解BIM-γ 導(dǎo)致耐藥;Bcl-2 家族成員[26](Mcl-1、Bcl-x和BID)是介導(dǎo)細胞凋亡的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,抑凋亡異構(gòu)體的表達促進LSCs 存活和耐藥的發(fā)生;CML 可以在氧化應(yīng)激情況下通過定位在線粒體的PKM2[38]與Bcl-2之間的相互作用抑制細胞凋亡;IM 誘導(dǎo)的Gfi1b-sp2[29]剪接異構(gòu)體(缺失外顯子9編碼鋅指結(jié)構(gòu)域)過表達可能導(dǎo)致費城染色體陰性CML 的出現(xiàn);長型CD44R1[30]剪接異構(gòu)體有助于LSCs黏附到基質(zhì)細胞表面,從而抵御機體免疫攻擊,促進LSCs自更新?;谕怙@子芯片的基因組學研究揭示了耐藥CML 中廣泛的異常剪接[23],癌癥基因組學研究的不斷深入將為開發(fā)癌癥精準醫(yī)學的新型診斷和治療策略奠定基礎(chǔ)。
TKI作為針對BCR-ABL的主要治療藥物現(xiàn)已廣泛應(yīng)用于臨床,然而伴隨出現(xiàn)的耐藥也已成為其治療的最主要障礙,盡管針對其耐藥機制進行了長期研究,但耐藥患者的療效仍無明顯改善。綜上所述,部分關(guān)鍵基因的AS 對CML 耐藥的發(fā)生具有重要意義。隨著對CML耐藥相關(guān)基因異常剪接認識的不斷加深,以關(guān)鍵剪接體元件或特定CML 耐藥相關(guān)基因剪接異構(gòu)體作為治療靶點,具有重要的臨床意義和廣闊的應(yīng)用前景。