張 莉,任衛(wèi)科,李秀麗,路 超,王利麗,鄭 麗,池晶晶,田向?qū)W,韓 偉,鄢明華
(1.農(nóng)業(yè)部獸用藥物與診斷技術(shù)天津科學(xué)觀測實(shí)驗(yàn)站,天津 300381;2.天津市畜牧獸醫(yī)研究所,天津 300381)
豬偽狂犬病(Pseudorabies,PR)是由皰疹病毒科、α-皰疹病毒亞科的偽狂犬病病毒(Pseudorabies viurse,PRV)引起的多種動(dòng)物的一種高度接觸性傳染病[1]。豬是自然宿主。該病可導(dǎo)致懷孕母豬的流產(chǎn)、死胎、木乃伊胎和種豬不育等癥狀;哺乳仔豬常出現(xiàn)神經(jīng)癥狀和死亡;成年豬一般呈亞臨床或隱性感染,成為病毒的貯存宿主,長期排毒,但是自2011年后,我國多地區(qū)豬場中出現(xiàn)偽狂犬病病毒變異毒株,一些成年豬也出現(xiàn)神經(jīng)癥狀和高病死率等情況[2-3]。豬偽狂犬病流行狀況的變化給養(yǎng)豬業(yè)帶來了巨大損失,因此,特異、敏感、快速的診斷方法對(duì)該病的防控至關(guān)重要。
目前,偽狂犬病的診斷方法有很多種,其中g(shù)E-ELISA方法和gB-ELISA常用于豬群的免疫抗體監(jiān)測和預(yù)警,PCR方法和熒光定量PCR則是病原學(xué)診斷的主要方法[4]。PCR-LFD技術(shù)是將PCR技術(shù)、核酸探針雜交技術(shù)與橫向流動(dòng)試紙條(lateral flow dipstick,LFD)三項(xiàng)技術(shù)相結(jié)合,應(yīng)用試紙條直接檢測PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的技術(shù)。此項(xiàng)技術(shù)已在結(jié)核分支桿菌[5]、甲型H1N1病毒[6]、乙型肝炎病毒[7]、轉(zhuǎn)基因黑曲霉[8]、口蹄疫病毒[9]等方面有了成功應(yīng)用的報(bào)道。本研究根據(jù)豬偽狂犬病病毒的gE基因設(shè)計(jì)一套引物和探針,建立了豬偽狂犬病病毒的PCR-LFD特異性檢測方法,為偽狂犬病的診斷提供了一種更為便捷的病原檢測方法。
1.1.1 供試病毒株和菌株 豬偽狂犬病病毒(PRV)SC株,由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所豬烈性傳染病創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)贈(zèng)送;豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2)、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、豬細(xì)小病毒(PPV)、豬流感病毒(SIV)、豬偽狂犬病病毒(PRV)R13028株、豬偽狂犬病病毒(PRV)R13139株、豬肺炎支原體(MP)、副豬嗜血桿菌(Hps)均由天津市畜牧獸醫(yī)研究所實(shí)驗(yàn)室保存;豬鏈球菌2型(SS2)、豬偽狂犬病病毒(PRV)MinA株購自國家獸醫(yī)微生物菌種保藏管理中心;豬偽狂犬病病毒Bartha-K61株(PRV gE基因缺失株)、日本腦炎病毒(JEV)、豬瘟病毒(CSFV)疫苗株為市售疫苗。
1.1.2 主要試劑 rTaqDNA聚合酶、dNTP、2XGCbuffer I、DNA Marker DL 2 000,寶生物工程(大連)有限公司產(chǎn)品;核酸提取試劑盒,金瑞鴻捷生物科技有限公司產(chǎn)品;橫向流動(dòng)試紙條,杭州憂思達(dá)生物技術(shù)有限公司產(chǎn)品。
1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)GenBank數(shù)據(jù)庫中豬偽狂犬病病毒gE基因(GenBank:AY173124)中的一段保守核苷酸序列,采用Primer Preimer5.0軟件設(shè)計(jì)特異性PCR引物和探針,由寶生物工程(大連)有限公司合成(表1)。
表1 引物序列
1.2.2 PCR-LFD方法的建立
1.2.2.1 PCR反應(yīng)條件優(yōu)化 PCR反應(yīng)體系為20 μL:10 μL 2×GC buffer I,0.5 μL rTaqDNA聚合酶(8 U/μL),2 μL dNTPs(2.5 mmol/L),1 μL PRV gE247(10 μmol/L),1 μL PRV gE623(10 μmol/L),5.0 μL模板DNA,0.5 μL超純水。PCR反應(yīng)程序?yàn)椋?5℃ 5 min;94℃ 30 s,53℃至60℃ 30 s,72℃ 30 s,進(jìn)行30個(gè)循環(huán);72℃延伸5 min,4℃ 5 min。
1.2.2.2 退火溫度的優(yōu)化 固定其他條件不變,設(shè)定53、54、55、56、57、58、59、60℃共8個(gè)溫度梯度,分別進(jìn)行擴(kuò)增,同時(shí)設(shè)立空白水對(duì)照。PCR反應(yīng)結(jié)束,取8 μL PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳,在凝膠成像儀上觀察并記錄結(jié)果。
1.2.2.3 引物濃度的優(yōu)化 經(jīng)上述篩選出最佳退火溫度后,固定反應(yīng)體系其他試劑的添加量,對(duì)引物濃度用量設(shè)定為0.5 μL、1 μL、1.5 μL、2 μL,并設(shè)立空白水對(duì)照。反應(yīng)結(jié)束,用瓊脂糖凝膠電泳檢測結(jié)果。
1.2.2.4 探針雜交反應(yīng)條件優(yōu)化 PCR反應(yīng)結(jié)束后,開蓋加入1 μL Prv-T-bio(10 μmol/L),增加一步雜交反應(yīng),94℃ 30 s,54℃至60℃ 30 s,4℃ 5 min。復(fù)性溫度選擇54、55、56、57、58、59、60℃分別進(jìn)行雜交,摸索最佳反應(yīng)條件。
1.2.2.5 LFD試紙條檢測PCR產(chǎn)物 雜交反應(yīng)結(jié)束后,取PCR產(chǎn)物10 μL加入到100 μL緩沖液,混合均勻;將LFD試紙條插入緩沖液3 min;取出將試紙條水平放置,5 min~10 min內(nèi)讀取結(jié)果。判定標(biāo)準(zhǔn):質(zhì)控線和檢測線顯現(xiàn)棕紅色條帶,為陽性;只有質(zhì)控線顯現(xiàn)棕紅色條帶,為陰性;只出現(xiàn)檢測線為無效。
1.2.3 特異性試驗(yàn) 用已優(yōu)化的PCR反應(yīng)體系檢測偽狂犬病病毒(PRV)SC株、偽狂犬病病毒(PRV)R13028株、偽狂犬病病毒(PRV)R13193株、偽狂犬病病毒(PRV)MinA株、豬偽狂犬病病毒Bartha-K61 株( PRV gE基因缺失株)、豬瘟病毒(CSFV)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2)、豬豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRSV)、豬細(xì)小病毒(PPV)、日本腦炎病毒(JEV)、豬流感病毒(SIV)、豬肺炎支原體(MP)、副豬嗜血桿菌(Hps)、豬鏈球菌2型(SS2)。探針雜交后,用瓊脂糖凝膠電泳法和LFD分別檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,確定所建立方法的特異性。
1.2.4 敏感性試驗(yàn) 將已知TCID50的偽狂犬病病毒稀釋為105~101個(gè)TCID50,按常規(guī)方法提取DNA,分別取5 μL作為模板,其他反應(yīng)條件不變進(jìn)行PCR擴(kuò)增。探針雜交后,用瓊脂糖凝膠電泳法和LFD分別檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,確定所建立方法的敏感性。
1.2.5 瓊脂糖凝膠電泳法和LFD試紙條靈敏度比較 以偽狂犬病病毒SC株DNA為模板,按照優(yōu)化后的PCR條件進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)結(jié)束后,測定PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的核酸含量,并用純水做10倍、100倍、1 000倍稀釋。分別取出20 μL稀釋產(chǎn)物,加入1 μL核酸探針,探針雜交反應(yīng)后,用瓊脂糖凝膠電泳法和LFD試紙條分別檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,比較兩種方法的差異。
1.2.6 重復(fù)性試驗(yàn) 采用同一批次和不同批次提取的豬偽狂犬病病毒DNA作為模板分別進(jìn)行5次PCR擴(kuò)增,用瓊脂糖凝膠電泳法和LFD法檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,確定所建立PCR-LFD方法的重復(fù)性。
從養(yǎng)殖場采集50份病料樣品,用病毒分離培養(yǎng)法和PCR-LFD方法同時(shí)進(jìn)行檢測,比較兩種方法的符合率。
選擇53℃~60℃ 8個(gè)復(fù)性溫度進(jìn)行擴(kuò)增,結(jié)果顯示56℃和55℃均能擴(kuò)增出特異的目的條帶,而且56℃亮度最強(qiáng),因此,最終確定56℃為最適反應(yīng)溫度(圖1)。
1~8.60℃、59℃、58℃、57℃、56℃、55℃、54℃、53℃;9.陰性對(duì)照;M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000
1-8.60℃,59℃,58℃,57℃,56℃,55℃,54℃,53℃;9.Negative control;M.DNA Marker DL 2 000
圖1復(fù)性溫度優(yōu)化
Fig.1 Optimization of the annealing temperature
固定PCR體系中其他試劑的添加量,將引物濃度用量設(shè)定為0.5、1、1.5、2 μL分別進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果顯示,加入0.5 μL引物時(shí),擴(kuò)增條帶稍淺;加入1、1.5、2 μL引物時(shí),擴(kuò)增條帶均清晰,無明顯引物二聚體,因此,1 μL為最佳引物添加量(圖2)。
1.2 μL引物(陽性對(duì)照);2.2 μL引物(陰性對(duì)照);3.1.5 μL引物(陽性對(duì)照);4.1.5 μL引物(陰性對(duì)照);5.1 μL引物(陽性對(duì)照);6.1 μL引物(陰性對(duì)照);7.0.5 μL引物(陽性對(duì)照);8.0.5 μL引物(陰性對(duì)照);M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000
1.2 μL primer(postive control);2.2 μL primer(negnative control);3.1.5 μL primer(postive control);4.1.5 μL (negnative control);5.1 μL primer(postive control);6.1 μL (negnative control);7.0.5 μL primer(postive control);8.0.5 μL (negnative contro);M.DNA Marker DL 2 000
圖2引物濃度優(yōu)化
Fig.2 Optimization of the primer concentration
PCR反應(yīng)液中加入標(biāo)記Biotin的探針,復(fù)性溫度選擇54、55、56、57、58、59、60℃分別進(jìn)行雜交,然后用LFD試紙條檢測,結(jié)果54、59、60℃試紙條檢測線未出現(xiàn)陽性條帶,55、56、57℃時(shí)檢測線有明顯陽性帶,但55℃和56℃的檢測線較淺,57℃檢測線最為明顯,因此認(rèn)為94℃ 30 s,57℃ 30 s,4℃ 5 min為最佳的探針雜交反應(yīng)程序(圖3)。
1~7.54℃、55℃、56℃、57℃、58℃、59℃、60℃;8.陰性對(duì)照
1-7.54℃,55℃,56℃,57℃,58℃,59℃,60℃;8.Negnative control
圖3探針雜交溫度篩選試驗(yàn)結(jié)果
Fig.3 Temperature screening test results of
probe hybridization reaction
本試驗(yàn)建立的豬偽狂犬病病毒PCR-LFD檢測方法檢測偽狂犬病病毒(PRV)SC株、偽狂犬病病毒(PRV)R13028株、偽狂犬病病毒(PRV)R13193株、偽狂犬病病毒(PRV)MinA株、豬偽狂犬病病毒Bartha-K61株(PRV gE基因缺失株)、豬瘟病毒(CSFV)、豬圓環(huán)病毒2型(PCV-2)、豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRS)、豬細(xì)小病毒(PPV)、日本乙型腦炎病毒(JEV)、豬流感病毒(SIV)、豬肺炎支原體(MP)、副豬嗜血桿菌(Hps)、豬鏈球菌2型(SS2)。從圖4可見所建立的PCR-LFD方法只能檢測到偽狂犬病病毒SC株、R13028株、R13139株、MinA株,偽狂犬病病毒Bartha-K61株和其他對(duì)照菌毒株均為陰性,采用瓊脂糖凝膠電泳和試紙條方法觀察的檢測結(jié)果完全一致。
從圖5可見,所建立的PCR方法的最低檢測病毒滴度為102TCID50/100 μL,且采用瓊脂糖凝膠電泳和試紙條方法的檢測結(jié)果完全一致。
用核酸蛋白測定儀測定偽狂犬病病毒PCR擴(kuò)增產(chǎn)物的核酸含量為482.5 ng/μL,將其稀釋10倍、100倍、1000倍后,用瓊脂糖凝膠電泳和LFD試紙條分別檢測,結(jié)果見圖6。從圖中可看出當(dāng)PCR產(chǎn)物稀釋100倍后,已很難通過瓊脂糖凝膠電泳觀察到陽性結(jié)果,但是LFD試紙條仍可見較為清晰的紅色檢測線。說明LFD試紙條的靈敏度是瓊脂糖凝膠電泳的10倍。
A.瓊脂糖凝膠電泳檢測;B.LFD試紙條檢測;1.偽狂犬病病毒SC株;2.偽狂犬病病毒MinA株;3.偽狂犬病病毒R13028株;4.偽狂犬病病毒R13139株;5.偽狂犬病病毒Bartha-K61 株(gE);6.豬圓環(huán)病毒2型;7.豬瘟病毒;8.日本乙型腦炎病毒;9.細(xì)小病毒;10.豬繁殖與呼吸綜合征病毒;11.豬流感病毒;12.豬肺炎支原體;13.副豬嗜血桿菌;14.豬鏈球菌2型;15.空白對(duì)照;M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000
A.Agarose gel electrophoresis; B.LFD strips; 1.PRV SC strain;2.PRV MinA strain;3.PRV R13028 strain;4.PRV R13139;5.PRV Bartha-K61 strain(gE-);6.PCV-2;7.CSFV;8.JEV;9.PPV;10.PRRSV;11.SIV;12.MP;13.Hps;14.SS2;15.Negnative control;M.DNA Marker DL 2 000
圖4 PCR特異性試驗(yàn)
Fig.4 Specificity test of PCR
A.瓊脂糖凝膠電泳檢測;B.LFD試紙條檢測;1.陰性對(duì)照;2~6.101 TCID50~105 TCID50;M. DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000A.Agarose gel electrophoresis; B.LFD strips; 1.Negnative control;2-6.101 TCID50-105 TCID50;M.DNA Marker DL 2 000
A.瓊脂糖凝膠電泳檢測;B.LFD試紙條檢測;1.陰性對(duì)照;2~4.103,102,10稀釋的PCR產(chǎn)物;5.原倍PCR產(chǎn)物;M.DNA 標(biāo)準(zhǔn)DL 2 000
A.Agarose gel electrophoresis; B.LFD strips; 1.Negnative control; 2-4.PCR products diluted 103,102,10 times; 5.The original time PCR procucts; M.DL 2 000 DNA Marker
圖6瓊脂糖凝膠電泳法與LFD試紙條法靈敏度比較試驗(yàn)
Fig.6 The sensitivity comparison of agar gel electrophoresis and LFD strips analysis
取同一次和不同時(shí)間提取的豬偽狂犬病病毒DNA各5份,將其作為模板進(jìn)行5次PCR擴(kuò)增,用LFD試紙條和瓊脂糖凝膠電泳法檢測擴(kuò)增產(chǎn)物,兩種方法結(jié)果完全一致,說明所建立的PCR-LFD方法具有良好的重復(fù)性。
對(duì)養(yǎng)殖場送檢的50份病料樣品用PCR、病毒分離培養(yǎng)法和PCR-LFD方法同時(shí)進(jìn)行檢測,結(jié)果PCR檢測到14份陽性,而病毒分離培養(yǎng)法和PCR-LFD方法為16份,PCR-LFD方法的敏感性要高于常規(guī)PCR方法。從表2可見PCR-LFD方法與病毒分離培養(yǎng)法的符合率為100%,與常規(guī)PCR方法的陽性符合率為100%,陰性符合率為94.4%。用SPSS17.0軟件對(duì)結(jié)果進(jìn)行評(píng)估,PCR-LFD方法與PCR的χ2為0.1904,P>0.05,兩種方法無顯著差別。
表2 兩種方法檢測結(jié)果比較
豬偽狂犬病是危害養(yǎng)豬業(yè)發(fā)展的重要傳染病之一。對(duì)豬偽狂犬病病毒進(jìn)行快速、及時(shí)、準(zhǔn)確的診斷,是有效防控該病的重要前提。偽狂犬病病毒gE基因是其主要毒力決定因子,為病毒復(fù)制的非必需基因,也是世界動(dòng)物衛(wèi)生組織(OIE)所規(guī)定基因缺失疫苗的缺失基因。以gE序列作為靶序列建立的診斷技術(shù),能夠區(qū)分基因缺失疫苗接種與野毒感染[3]。王香玲等[10]根據(jù)豬偽狂犬病病毒gE基因序列保守區(qū)段,設(shè)計(jì)一對(duì)特異性引物,通過優(yōu)化反應(yīng)條件,建立了可區(qū)分豬偽狂犬病病毒野毒株與基因缺失疫苗株的PCR檢測方法,該方法的敏感性為1.1 pg,有較高的特異性。張志等[11]建立了能夠特異性檢測PRV野毒株的套式PCR方法,該方法檢測極限可達(dá)10個(gè)病毒拷貝/μL。田云等[12]建立檢測偽狂犬病病毒野毒的熒光定量PCR方法,該方法的靈敏度可達(dá)4拷貝。常規(guī)PCR方法檢測成本低,但需要瓊脂糖凝膠電泳觀察結(jié)果,且有時(shí)會(huì)出現(xiàn)假陽性結(jié)果。熒光定量PCR雖然敏感性高于PCR,可實(shí)時(shí)觀看檢測結(jié)果,但是需要昂貴的設(shè)備和試劑成本,不適用于基層實(shí)驗(yàn)室和規(guī)模化豬場使用。
本研究建立了一種基于豬偽狂犬病病毒gE基因的PCR-LFD檢測方法,該方法是將PCR技術(shù)與LFD試紙相結(jié)合的一種可視化檢測方法,在引物設(shè)計(jì)時(shí)將一條引物標(biāo)記了異硫氰酸熒光素(FITC),在PCR反應(yīng)后,體系中加入了一條標(biāo)記生物素(Biotin)的探針,只有目的基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物才能與探針結(jié)合。采用試紙條對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行檢測,雜交形成的復(fù)合體帶有Biotin和FITC兩種標(biāo)記,用試紙條檢測時(shí)檢測線和質(zhì)控線均出現(xiàn)棕紅色條帶。陰性PCR產(chǎn)物、假陽性PCR和引物二聚體不具有雙重標(biāo)記,不能與檢測線結(jié)合,檢測線不顯色。該方法在PCR擴(kuò)增后15 min內(nèi)即可目測判定結(jié)果,與傳統(tǒng)凝膠電泳法相比更快速,且避免使用溴化乙錠(EB)等核酸染料造成的環(huán)境污染[8]。
為了避免PCR結(jié)果出現(xiàn)假陽性,本研究在PCR擴(kuò)增完成以后,增加了特異性探針雜交反應(yīng),進(jìn)一步提高了該方法的特異性。試驗(yàn)結(jié)果表明,該方法可特異性檢測豬偽狂犬病病毒野毒株,與缺失gE基因的Bartha-K61株和其他9種豬病病原無交叉反應(yīng)。此外,對(duì)比LFD試紙條法和瓊脂糖凝膠電泳法對(duì)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測結(jié)果的靈敏度發(fā)現(xiàn),PCR-LFD方法的最低檢測限度為100TCID50/100 μL,其敏感性比應(yīng)用瓊脂糖凝膠電泳方法高10倍。
針對(duì)2011年以來流行的豬偽狂犬病病毒變異株分子特征發(fā)生變化的特點(diǎn),在試驗(yàn)中分別對(duì)偽狂犬病病毒經(jīng)典強(qiáng)毒雙城株(SC株)和閩A株(MinA株),新分離的豬偽狂犬病變異強(qiáng)毒R13139和R13028株,以及豬偽狂犬病病毒缺失gE基因的疫苗株Bartha-K61進(jìn)行了檢測,結(jié)果僅Bartha-K61株檢測結(jié)果為陰性,其他4株P(guān)RV檢測結(jié)果均為陽性,表明建立的方法適用于PRV經(jīng)典強(qiáng)毒和變異的強(qiáng)毒株的檢測。
以上結(jié)果表明,本研究建立的偽狂犬病病毒PCR-LFD檢測方法具有敏感、快速、特異等特點(diǎn),且操作簡便、無需電泳可直接觀察結(jié)果,可用于實(shí)驗(yàn)室、養(yǎng)殖場和基層獸醫(yī)部門對(duì)偽狂犬病的診斷和監(jiān)測預(yù)警,具有廣闊的應(yīng)用前景。