張亞璇,王海洪,樊振川
(1.天津科技大學(xué)大健康生物技術(shù)研究所,天津市大健康生物技術(shù)國際聯(lián)合研究中心,天津科技大學(xué)食品工程與生物技術(shù)學(xué)院,天津 300457;2.華南農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,廣州 510642)
脂肪酸合成代謝是生物細(xì)胞中的基礎(chǔ)代謝之一,是細(xì)胞膜形成的第一步,對細(xì)菌生理有關(guān)鍵作用.根據(jù)合成酶系統(tǒng)的差異,脂肪酸生物合成系統(tǒng)的酶被分為Ⅰ型脂肪酸合成酶系(FASⅠ)和Ⅱ型脂肪酸合成酶系(FASⅡ)[1-2].烯酯酰ACP還原酶是Ⅱ型脂肪酸合成途徑中的關(guān)鍵酶之一,它催化延伸反應(yīng)的最后一步,將反-2-烯酰 ACP還原為飽和酯酰 ACP[3].最早被鑒定的烯酯酰 ACP還原酶基因是大腸桿菌(Escherichia coli)中的fabI,隨著基因組測序的完成,基因組信息揭示了苜蓿中華根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)基因組中有這一基因的同源基因 fabI1和fabI2.這兩個基因都位于環(huán)狀的染色體上,fabI1由smc00005編碼,fabI2由 smc00326編碼[4-5],與脂肪酸合成基因fabBA相鄰.它們與大腸桿菌FABI蛋白的相似度為51%,和50%,,且fabI2的序列與fabI1有66%,的一致性[6],但兩個基因及相應(yīng)酶存在差異.
苜蓿中華根瘤菌(Sinorhizobium meliloti)[7-8]是一類能與豆科苜蓿類植物共生形成根瘤的革蘭氏陰性細(xì)菌.目前對其研究主要集中在共生固氮機(jī)制和抗逆性兩個方面[9],并證明了脂肪酸合成系統(tǒng)對苜蓿中華根瘤菌的共生固氮和抗逆性均有顯著影響,但對于基因 fabI2功能研究還未深入.本實(shí)驗(yàn)制備苜蓿中華根瘤菌烯酯酰 ACP還原酶基因 fabI2的抗體,是順利完成FABI2在蛋白水平表達(dá)模式以及FABI2與其他蛋白互作機(jī)制研究的重要前提,有利于進(jìn)一步對fabI2基因在脂肪酸合成中的功能進(jìn)行深入研究.
1.1.1 菌株和質(zhì)粒
大腸桿菌(Escherichia coli)XL1-blue、BL21(DE3)感受態(tài)細(xì)胞為本實(shí)驗(yàn)室保存.pET-28b-FABI2質(zhì)粒為華南農(nóng)業(yè)大學(xué)王海洪教授提供.
1.1.2 試劑
實(shí)驗(yàn)所用的酶及相對應(yīng)的緩沖液、DNA相對分子質(zhì)量marker和蛋白marker,美國Thermo公司;Ni SepharoseTM6,Fast Flow、Glutathione SepharoseTM4B蛋白純化填料和 Protein A SepharoseTMCL-4B抗體純化填料,美國 GE Healthcare 公司;弗式完全佐劑和不完全佐劑,美國Sigma公司;HRP標(biāo)記的羊抗兔抗體,美國Cell Signaling公司;其他試劑均為國產(chǎn)分析純.
1.1.3 試驗(yàn)動物
新西蘭大白兔 2只,普通級,體質(zhì)量 1.5~2.0,kg,由北京市海淀區(qū)興隆實(shí)驗(yàn)動物養(yǎng)殖場提供,許可證號為SCXK(京)2016-0003.
1.2.1 pGEX-2T-FABI2原核表達(dá)載體的構(gòu)建
設(shè)計(jì)帶有 BamHⅠ和 HindⅢ酶切位點(diǎn)的引物從pET-28b-FABI2質(zhì)粒中擴(kuò)增目的片段,引物設(shè)計(jì)為上游引物加入 BamHⅠ酶切位:5′-ATGGATCCATG AACGGATTGATGAAC-3′,下游引物加入 HindⅢ酶切位點(diǎn):5′-ATAAGCTTTTAATCCGCGTCTGCGAC-3′.反應(yīng)條件:95,℃ 2,min;95,℃ 30,s;56,℃ 30,s,30個循環(huán);72,℃ 1,min;72,℃終延伸 15,min.利用瓊脂糖凝膠回收試劑盒回收擴(kuò)增產(chǎn)物后,再用 BamHⅠ和HindⅢ分別將回收的目的基因片段、pGEX-2T載體進(jìn)行酶切;然后用 T4,DNA連接酶連接后,轉(zhuǎn)入E.coli XL1-blue感受態(tài)細(xì)胞,經(jīng) PCR、雙酶切驗(yàn)證后,篩選出符合要求的陽性克隆,并進(jìn)行測序鑒定.
1.2.2 融合蛋白的誘導(dǎo)表達(dá)及鑒定
采用化學(xué)轉(zhuǎn)化的方法將 pET-28b-FABI2和pGEX-2T-FABI2轉(zhuǎn)入大腸桿菌 BL21(DE3),分別挑取單菌落至5,mL LB液體培養(yǎng)基(分別含100,μg/mL卡那霉素和 120,μg/mL氨芐青霉素),37,℃搖床過夜培養(yǎng).再以1∶50的比例放大培養(yǎng)至A600為0.6~0.8時,加入0.1,mmol/L IPTG于20,℃、185,r/min條件下誘導(dǎo) 6,h使蛋白大量表達(dá).4,℃、6,000,r/min離心5,min后收集菌體,用PBS溶液漂洗兩次后用細(xì)胞破碎儀超聲裂解 30,min.分別取誘導(dǎo)前、全蛋白、上清液和沉淀與 2×蛋白質(zhì)上樣緩沖液混合后進(jìn)行 13%,SDS-PAGE電泳檢測蛋白表達(dá)[10-11].
1.2.3 融合蛋白的純化
6×His-FABI2融合蛋白誘導(dǎo)表達(dá)后,將收集的菌體于裂解液(20,mmol/L NaH2PO4、200,mmol/L NaCl、20,mmol/L 咪唑)中超聲破碎,4,℃、12,000,r/min離心 15,min.取上清液用 0.45,μm 濾膜過濾后加入到預(yù)先用裂解液平衡好的Ni SepharoseTM6,Fast Flow純化柱中,室溫結(jié)合 1,h后,分別用含有50,mmol/L、100,mmol/L咪唑的裂解液進(jìn)行漂洗,除去結(jié)合不牢的蛋白.最后用含有 500,mmol/L咪唑的裂解液進(jìn)行洗脫,得到純化后的目的蛋白.將上述收集的流出液組分、漂洗液組分以及洗脫液組分分別用13%, SDS-PAGE檢測蛋白純度[12].
pGEX-2T-FABI2融合蛋白誘導(dǎo)表達(dá)后進(jìn)行超聲破碎,4,℃、12,000,r/min離心 15,min.取上清液過膜后加入到預(yù)先平衡好的 Glutathione SepharoseTM4B純化柱中,室溫結(jié)合1,h后,用10倍柱體積的裂解液(1×PBS)進(jìn)行漂洗,除去結(jié)合不牢的蛋白.最后用含有 20,mmol/L還原型谷胱甘肽的裂解液洗脫目的蛋白,得到純化后的目的蛋白.將上述收集的流出液組分、漂洗液及洗脫液組分分別用13%, SDS-PAGE檢測蛋白純度.
1.2.4 免疫
將純化后的 6×His-FABI2融合蛋白稀釋到1,mg/L,取 2,mL蛋白與等體積的弗氏佐劑混合后乳化完全,免疫新西蘭大白兔.采用頸背部多點(diǎn)注射法,初次免疫使用弗氏完全佐劑且免疫前進(jìn)行耳緣靜脈采血[13]作為陰性對照血清.之后每 10,d進(jìn)行加強(qiáng)免疫,使用弗氏不完全佐劑,一共加強(qiáng)免疫 3次.最后 1次加強(qiáng)免疫后進(jìn)行耳緣靜脈采血,利用間接ELISA法測定抗血清的效價(jià).效價(jià)合格后,股動脈采血,4,℃靜置過夜后收集血清,分裝凍存.
1.2.5 多克隆抗體效價(jià)的檢測
采用 ELISA法檢測抗血清的效價(jià),以 GSTFABI2蛋白作為包被抗原,4,℃包被過夜,用 PBST洗3次以去掉結(jié)合不牢的蛋白.用5%,的脫脂乳粉封閉 1,h后,以所得的抗血清為一抗,一抗的稀釋倍數(shù)分別為 1∶1,000、1∶2,000、1∶4,000、1∶8,000、1∶16,000、1∶320,000、1∶640,000、128,000,HRP 標(biāo)記的羊抗兔抗體為二抗,稀釋倍數(shù)為 1∶20,000,最后經(jīng)過TMB顯色,測定450,nm處的吸光度,并計(jì)算出抗血清的效價(jià).以實(shí)驗(yàn)組血清 A450與陰性對照血清A450的比值大于2即為陽性,其最高稀釋度即為抗血清的效價(jià).
1.2.6 多克隆抗體的Protein A親合純化
由于 Protein A專一性吸附 IgG,可以去除 IgG之外的其他抗體分子,所以采用 Protein A對抗血清進(jìn)行親合純化.取 1,mL抗血清加入 13,mL 結(jié)合液(20,mmol/L Na2HPO4,pH 7.0)平衡血清.將平衡后的血清經(jīng) 0.45,μm 濾膜過濾后加入預(yù)先平衡好的純化柱中,室溫下與填料結(jié)合 30,min.結(jié)合完畢后放出流出液,用 0.1,mol/L 甘氨酸洗脫后得到純化后的抗體,經(jīng) 1,mol/L Tris-HCI(pH 9.0)調(diào)節(jié)洗脫液至中性后于-80,℃保存.
1.2.7 免疫印跡法檢測多克隆抗體的特異性
對 4次免疫后經(jīng) Protein A 純化后的抗體進(jìn)行免疫印跡檢測多克隆抗體的特異性.樣品為誘導(dǎo)表達(dá)的另一標(biāo)簽抗原 GST-FABI2,將誘導(dǎo)表達(dá)后的細(xì)胞超聲破碎后離心取上清液,進(jìn)行13%, SDS-PAGE,轉(zhuǎn)膜后,用5%,脫脂乳粉封閉1,h.將純化后的多克隆抗體按一定的比例稀釋,稀釋度分別為 1∶300、1∶600、1∶1,000、1:1,200、1∶2,400、1∶4,800,室溫?fù)u床孵育1,h,PBST洗3次.將AP標(biāo)記的羊抗兔抗體稀釋 10,000倍后,室溫?fù)u床孵育 1,h,最后進(jìn)行 AP顯色.
用 Excel 2010軟件分析數(shù)據(jù),計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)偏差并制圖.
為了獲得 5′-末端攜帶 GST標(biāo)簽的 FABI2融合蛋白,構(gòu)建了 pGEX-2T-FABI2表達(dá)載體.以提取的pGEX-2T-FABI2質(zhì)粒為模板,用之前設(shè)計(jì)好的FABI2引物進(jìn)行 PCR驗(yàn)證和雙酶切驗(yàn)證,獲得條帶大小約為 807,bp的片段.最后經(jīng)測序驗(yàn)證序列完全正確,沒有突變位點(diǎn),表明表達(dá)載體構(gòu)建成功(圖1).
圖1 fabI2的PCR驗(yàn)證和重組載體的雙酶切驗(yàn)證Fig. 1 PCR amplification of fabI2 and restriction identification of recombinant expression plasmids
SDS-PAGE檢測重組表達(dá)載體 pET-28b-FABI2和pGEX-2T-FABI2在E.coli BL21(DE3)中的表達(dá),結(jié)果如圖2所示.由圖2可知,在0.1,mmol/L IPTG、20,℃、185,r/min條件下誘導(dǎo) 6,h后,含有 pET-28b-FABI2和 pGEX-2T-FABI2質(zhì)粒的大腸桿菌BL21(DE3)菌株分別在約 2.8×104和 5.4×104處大量表達(dá)目的蛋白,且蛋白的表達(dá)主要集中在上清液.
圖2 SDS-PAGE檢測重組表達(dá)載體 pET-28b-FABI2 和pGEX-2T-FABI2在E. coli BL21(DE3)中的表達(dá)Fig. 2 SDS-PAGE analysis of the expression of recombinant vectors pET-28b-FABI2 and pGEX-2TFABI2 in E. coli BL21(DE3)
選用 6×His-FABI2融合蛋白作為免疫用抗原.將 6×His-FABI2融合蛋白破碎離心后取上清液,加入含有Ni SepharoseTM6,Fast Flow填料的重力柱中室溫結(jié)合1,h或者4,℃過夜.由于融合蛋白的His標(biāo)簽特異性與上述填料結(jié)合,最后經(jīng)過洗滌、洗脫等步驟可得到純度較高的目的蛋白,純度達(dá) 95%,以上(圖3(a)),作為免疫動物所用抗原.
GST-FABI2融合蛋白用于效價(jià)的測定和免疫印跡.將破碎后的 GST-FABI2 融合蛋白離心后取上清液,加入含有Glutathione SepharoseTM4B填料的純化柱中進(jìn)行親和純化,經(jīng)20,mmol/L還原型谷胱甘肽洗脫后得到目的蛋白(圖3(b)).
圖3 pET-28b-FABI2重組蛋白和 pGEX-2T-FABI2重組蛋白的SDS-PAGE檢測Fig. 3 SDS-PAGE analysis of the purified recombinant proteins pET-28b-FABI2 and pGEX-2T-FABI2
用純化得到的6×His-FABI2蛋白免疫新西蘭大白兔,4次免疫后從耳緣靜脈處取少量血,室溫靜置2,h或4,℃過夜后獲得析出血清,通過ELISA法測定抗血清的效價(jià),利用酶標(biāo)儀測定A450后計(jì)算抗血清的效價(jià),結(jié)果如圖4所示.由圖4可知1號兔抗血清的效價(jià)大于128,000,2號兔抗血清效價(jià)大于256,000.
圖4 間接ELISA法測定抗血清的效價(jià)Fig. 4 ELISA test results of anti-FABI2 polyclonal antiserum
本研究對4次免疫后經(jīng)過Protein A純化的抗血清進(jìn)行免疫印跡,結(jié)果如圖 5所示,在 5.4×104處出現(xiàn)單一的特異性條帶,證明抗血清與 FABI2蛋白特異性結(jié)合良好.
圖5 免疫印跡法驗(yàn)證抗體特異性Fig. 5 Antibody specificity detected by Western blot
設(shè)計(jì)帶有 BamHⅠ和 HindⅢ酶切位點(diǎn)的引物,從實(shí)驗(yàn)室已有的 pET-28b-FABI2質(zhì)粒中擴(kuò)增出目的片段后,構(gòu)建帶有 GST標(biāo)簽的表達(dá)載體.通過摸索合適的誘導(dǎo)條件,發(fā)現(xiàn)在 0.1,mmol/L IPTG、20,℃、185,r/min條件下誘導(dǎo) 6,h,pET-28b-FABI2和 pGEX-2T-FABI2質(zhì)粒分別在2.8×104和5.4×104處大量表達(dá)蛋白,且集中在上清液中.由于表達(dá)的蛋白為水溶性,因此純化得到的融合蛋白空間結(jié)構(gòu)完好.除此之外,選擇 6×His-FABI2融合蛋白作為免疫用抗原,由于其標(biāo)簽相對分子質(zhì)量小,因此與 GST標(biāo)簽相比而言,免疫動物產(chǎn)生的免疫反應(yīng)更?。?次免疫后測效價(jià),合格后股動脈取血.最后對血清進(jìn)行Protein A親和純化并進(jìn)行特異性檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)血清可與 FABI2蛋白特異性結(jié)合,標(biāo)志著多克隆抗體制備成功.在進(jìn)行免疫印跡法檢測時,以所得的抗體為一抗,另一個標(biāo)簽的抗原進(jìn)行上樣,排除了His標(biāo)簽產(chǎn)生的抗體對標(biāo)簽的識別作用.后續(xù)將會采用免疫熒光技術(shù)對該抗體進(jìn)行定位.