,丁安娜
甘肅省油氣資源研究重點實驗室/中國科學院油氣資源研究重點實驗室,蘭州 730000
在厭氧環(huán)境中,各種不同的微生物群體將來源于動、植物的有機質(zhì)水解為蛋白質(zhì)、脂肪、纖維素、半纖維素、果膠等大分子物質(zhì),并進一步降解成中、低分子量的化合物。在除去含氧官能團、產(chǎn)氫、耗氫、有機物重新組合后,形成了大量的石油烴類[1]。酶是一種具有催化活性的蛋白質(zhì),具有高度的專一性。溫度壓力增加,有機組份的更替,影響著厭氧微生物的生長和消亡。新的微生物群及其酶系統(tǒng)生成,原來的微生物及酶組分可作為母源輸入,使石油的生成具有多種途徑,多元生成的特征。
產(chǎn)氫菌的發(fā)現(xiàn)是近代微生物學的一大重要進展,地質(zhì)環(huán)境中的氫代謝(H2的生成和利用)是微生物降解有機質(zhì)形成各種低分子烴類的中心環(huán)節(jié)。氫是石油生成中不可缺少的中間體,是厭氧環(huán)境中生化活性的調(diào)節(jié)者,氫代謝快,石油生成也快,氫代謝使石油生成過程可以活躍地進行,氫循環(huán)與碳循環(huán)緊密相關,有機物的氧化還原反應都需要氫的參與,在有機質(zhì)厭氧降解過程中,氫是重要的主產(chǎn)物及中間產(chǎn)物,沒有氫代謝便沒有大量石油飽和烴的生成[2]。
有機物向石油轉化的許多中間產(chǎn)物是缺氫的,如大分子化合物分解為小分子化合物便缺氫,脫去含氧基團也缺氫,烯烴成為飽和烴需要補充氫等。各種有機物中的碳水化合物、脂肪酸、氨基酸等在降解中都有H2的生成,這些氫將由其他非產(chǎn)氫微生物通過氫酶系統(tǒng)消耗,這兩類反應之間的氫轉移是厭氧降解有機質(zhì)區(qū)別于有氧降解有機質(zhì)的最重要特征。
厭氧環(huán)境中存在多種類型的產(chǎn)氫菌,它們能通過發(fā)酵作用,在逐步分解有機物的過程中產(chǎn)生分子氫,表1[3-4]所列出的產(chǎn)氫發(fā)酵細菌是具有代表性的菌屬。氫細菌是一些革蘭式陰性的自養(yǎng)菌,能利用有機物生長,氫細菌的細胞膜上有泛醌、維生素K2及細胞色素等呼吸鏈組分。有機物厭氧發(fā)酵產(chǎn)氫具有高產(chǎn)率、可利用多種底物的能力。
微生物產(chǎn)氫存在多種途徑,其共同特點在于利用體內(nèi)氫酶進行有機物還原分解,同時產(chǎn)生氫氣,以維持體內(nèi)氧化還原代謝的平衡。
根據(jù)微生物的種屬不同,存在多種不同的產(chǎn)氫機制,如短鏈脂肪酸,通過形成丙酮酸和乙酸的發(fā)酵作用而形成氫,厭氧微生物產(chǎn)氫菌大致可以分成以下幾種類型:
(1) 產(chǎn)氫產(chǎn)乙酸細菌(H2-producingacidogens)能將發(fā)酵中產(chǎn)生的丙酸、丁酸、戊酸、乳酸、乙醇等進一步轉化為乙酸,同時產(chǎn)生氫氣。這類細菌為嚴格厭氧菌,目前僅有少數(shù)被分離,相關菌株及其產(chǎn)氫反應列于表2[5-7]。
表1 厭氧產(chǎn)氫微生物代表性菌屬一覽表[3-4]
表2 產(chǎn)氫產(chǎn)乙酸菌及產(chǎn)氫反應[5-7]
(2) 梭菌(Clostridia),通過葡萄糖的酵解產(chǎn)氫,其反應式為:
發(fā)酵過程中產(chǎn)生的丁酸和乙酸的比例決定了從葡萄糖發(fā)酵產(chǎn)H2的量。
(3) 甲基營養(yǎng)型細菌(Methylotrophs),可以從甲烷產(chǎn)生H2。
(4) 產(chǎn)甲烷細菌(Methanogenicbacteria),有的產(chǎn)甲烷菌能降解甲酸形成CO2和H2。
(5) 纖維素厭氧菌,它通過分解碳水化合物生成乙酸、乙醇、甲酸、H2和CO2。
(6) 古細菌(Archaea),嗜熱古細菌中的激烈熱球菌(Pyrococcusfusiasus)含有一種可溶性的含鎳氫酶,能利用碳水化合物和蛋白質(zhì)生成H2。
各種H2的生成和利用都是在氫酶的催化下進行的,有機物結構上的含氫量能活躍地進行循環(huán)。厭氧細菌的氫酶可在細胞質(zhì)中,也可在膜上或周質(zhì)中,從酶蛋白的活性中心金屬出發(fā),氫酶有鎳氫酶、鎳鐵氫酶、鐵氫酶和無金屬氫酶。
大多數(shù)氫酶對一定范圍的高溫能保持其穩(wěn)定性,如深紅紅螺菌(Rhodospirillumrubrum)的氫酶在實驗條件下55 ℃時可持續(xù)放H2在1小時以上,79 ℃時仍可持續(xù)放H2,顯示高溫條件下具有相當大的穩(wěn)定性。
厭氧環(huán)境中的H2代謝是降解各種有機物生成低碳有機物和烴類的重要步驟,是微生物的特殊功能。若環(huán)境中羥基、羧基、羰基等含氧基團存在時,將利用氫形成低碳化合物,這些反應是耗氫反應,使環(huán)境中的H2保持在某一水平之下,從而促進生氫反應的進行。
厭氧微生物對有機質(zhì)降解過程中的氫化反應十分活躍,它可以形成向石油轉化的中間產(chǎn)物,對石油的形成具有重要意義。例如長鏈脂肪酸、脫羧基加氫而成為正構烷烴,氨基酸氫化脫氨,一碳酸、醛、醇氫化為烷烴。其他以氫為能源推動的反應有脫硫孤菌等硫酸鹽還原菌,以氫還原硫酸鹽為硫化氫,產(chǎn)甲烷菌以H2還原CO2形成甲烷,彎曲桿菌等以H2還原元素硫為硫化氫,硝酸鹽還原菌以H2還原硝酸鹽為亞硝酸鹽。微生物利用H2作為還原劑,并在氫的氧化中獲取能源。絕大多數(shù)氫化反應是放能的,因此氫化反應在熱動力學上是易于進行的,氫化反應在生油過程中也易于發(fā)生。
厭氧環(huán)境中,一部分微生物在降解有機物的過程中大量地形成H2,另一部分微生物利用這些H2進行生命活動,使沉積環(huán)境中的氫難以積聚和檢測到。前者稱為產(chǎn)氫微生物,后者稱耗氫微生物,產(chǎn)氫耗氫一直處于一種穩(wěn)定的動態(tài)平衡。這種不同種之間氫的生成和利用的偶聯(lián)現(xiàn)象稱為種間氫轉移。產(chǎn)氫微生物只有在耗氫微生物存在下才能生長,耗氫微生物的耗氫作用將促進產(chǎn)氫反應的連續(xù)進行,產(chǎn)氫微生物與耗氫微生物之間的生長聯(lián)合稱為微生物的互營聯(lián)合,這種種間氫轉移不僅發(fā)生在對有機質(zhì)大分子的降解階段,也發(fā)生在短鏈酸、醇的產(chǎn)氫用氫油氣形成的各個階段。
從松遼盆地濱北地區(qū)西部斜坡帶源巖中的含氧化合物變化來看,隨深度增加,樣品抽提物中飽和烴含量增加,非烴含量減小(圖1)[8],說明樣品中不斷發(fā)生去含氧官能團和產(chǎn)氫用氫反應,從而形成了大量的飽和烴。
微生物生長繁殖受溫度、營養(yǎng)及沉積環(huán)境的影響,每一種微生物種群只能在一定溫度范圍內(nèi)存活,一般最大為40 ℃,有的菌種生存溫度范圍不到十度,大于最高溫度便會死亡。微生物也會相互競爭,營養(yǎng)的改變也影響著菌體的發(fā)育,因此從淺層至深層,微生物菌種是不斷更替的,原有的菌種因環(huán)境改變而死亡,新的菌種又會得到大量繁殖,死亡的微生物輸入至沉積層便成為烴類[9]。
不少學者如彼得斯K E等[10]、盛國英等[11]、王鐵冠[12]等研究了生物標志物的生源輸入,認為油、巖中許多藿烷類化合物、重排甾烷、β胡蘿卜烷、角鯊烷、異戊二烯類化合物等均來自細菌,其余為經(jīng)過細菌改造的生物標志物(表3)[10]。
表3 微生物生源與微生物改造有關的生物標志物和沉積環(huán)境[10]
續(xù)表
類別化合物生物來源沉積環(huán)境微生物改造的生源飽和烴:C15~C23(奇數(shù))環(huán)己基烷粘球藻Gloeocap-samorpha prisca(?)扁枝烷針葉樹陸相C27~C29甾烷藻(C27)藻和高等植物(C29)各種沉積環(huán)境C3024-正丙基甾烷(4-去甲基甾烷)金藻(Chrysophy-ealgae)海相重排甾烯藻類或高等植物富含黏土礦物巖石甲藻甾烷(Dinosterane)溝鞭藻海相,三疊紀或比三疊紀年輕的地質(zhì)時代23,28-二降羽扇烷高等植物?陸相4β(H)-桉葉油烷(eudes-mane)高等植物陸相18α(H)-奧利烷(Olean-ane)高等植物(被子植物)白堊紀或比白堊紀更年輕的地質(zhì)時代孕甾烷,升孕甾烷未知超鹽環(huán)境C24四環(huán)萜烷未知超鹽環(huán)境降藿烷(C29藿烷)多種生物來源碳酸鹽/蒸發(fā)鹽C19~C30三環(huán)萜烷塔斯瑪尼亞(Tasman-nites)藻?非專屬沉積環(huán)境芳烴:苯并噻吩,烷基二苯并噻吩未知碳酸鹽/蒸發(fā)鹽沉積環(huán)境Trimethylated2-methyl-2-trimethylde-cylchromans三甲基化的2-甲基-2-三甲基癸基色滿未知咸水環(huán)境
根據(jù)目前的研究成果,應用分析手段,在原油中,已經(jīng)區(qū)分出細菌生源和高溫菌生源:
(1) 細菌生源,膜脂是由甘油和脂肪酸通過酯鏈結合而成的脂肪酸甘油酯,非極性鏈,一般是C14~C28(C15~C18占優(yōu)勢)的脂肪酸,常見的有以下類型:
a. CH3[CH2]nCOOH
b. CH3CH[CH2]nCOOH
c. CH3CH2CH[CH2]nCOOH
在高溫菌中,發(fā)現(xiàn)了一些常溫菌未曾有的特殊脂肪酸
a. (C6H11)CH2[CH2]9COOH (11-環(huán)己烷十一酸)
b. (C6H11)CH2[CH2]11COOH (13-環(huán)己烷十三酸)
c. (C7H13)CH2[CH2]8CH2COOH (11-環(huán)庚烷十一酸)
CH3
e. HOOC[CH2]11— CH[CH2
(2) 醚酯是古細菌的特有標志。C20和C40植烷醇與甘油通過醚鍵結合衍生出兩類基本的醚,即植烷醇甘油和植烷醇甘油四醚(圖2)。
圖2 植烷醇甘油三醚(a)和二植烷醇二甘油四醚(b)Fig.2 Structures of phytanol glycerin triether(a) and diphytanol diglycerin four-ether(b)
酶是一種具有催化活性的高分子化合物,微生物的一切生命活動都離不開酶。一種酶只能催化一種反應或一類反應的完成。微生物降解有機質(zhì)形成烴類有多個途徑、多個階段,每個途徑、階段都有獨特的微生物菌群,各類細菌群的有效代謝相互連貫、相互促進。成油和成氣[13]都有自己的酶系統(tǒng),酶在完成專屬代謝途徑后,可轉化成石油組分。
產(chǎn)甲烷菌所具有的輔酶F430可能是葉綠素向卟啉轉化的中間產(chǎn)物,從結構上看,F(xiàn)430同葉綠素和卟啉結構極其相似:
(1) 都是四吡咯結構,再加上各種取代基構成;
(2) 在四個吡咯環(huán)之間絡合的金屬是鎳和釩;
(3) 取代基中有甲基和氫原子;
(4) 9位取代基為氧,同葉綠素一致。
輔酶是指與酶蛋白不是以共價鍵連接,彼此結合松馳,容易將它們分開的一種成分。在沉積物中,只要具備還原條件,產(chǎn)甲烷菌便能從植物中迅速獲取營養(yǎng),合成輔酶。輔酶F430直接參與催化反應,起到傳遞電子、氫原子、羧基等化學基團的作用,它的存在有利于天然氣的形成。
釩、鎳是構成F430輔酶最重要的金屬,也是卟啉化合物中最常見的成分。鎳、釩金屬元素在微生物機體中的生理作用主要是參與了酶的組成,構成酶的最大活性,維持細胞結構的穩(wěn)定性,提高機體的代謝能力。產(chǎn)甲烷菌在生長過程中,如果缺乏這些元素,會導致機體生理活性的降低。
圖3 卟啉的形成途徑[14]Fig.3 The formation pathway of porphyrin[14]
F430在產(chǎn)甲烷古菌中含量豐富,約為0.23~0.80 μmol/g細胞干重,大部分F430緊密結合于產(chǎn)甲烷菌的蛋白質(zhì)部分,產(chǎn)甲烷菌體內(nèi)的Ni含量高時,F(xiàn)430含量也高,均大于227 μmol/L,非產(chǎn)甲烷菌體內(nèi)的Ni含量低,F(xiàn)430含量也低,均<10 μmol/L。當產(chǎn)甲烷菌在有Ni存在的條件下生長時, Ni中的50%~70%被吸收用于合成F430。
F430輔酶脫羧后的產(chǎn)物是卟啉。卟啉化合物廣泛分布于各時代的沉積物及石油中,大部分卟啉是以金屬絡合物的形式存在于地質(zhì)體中,與卟啉絡合的最常見的金屬除鎳和釩外,極少數(shù)還有鐵、鈷、鋅等。卟啉的金屬絡合物相當穩(wěn)定,在漫長的地質(zhì)年代中能夠保存下來(表4)。
由表4可以看出:
(1) 葉綠素是有機質(zhì)的重要組成部分,泥質(zhì)沉積物中鎳卟啉和釩卟啉含量均高于砂質(zhì)沉積物和碳酸鹽巖,這同泥質(zhì)沉積物中有機質(zhì)豐度高有關。
(2) 卟啉在古生代、中生代、第三紀地層中普遍存在,說明產(chǎn)甲烷菌存在的普遍性,產(chǎn)甲烷菌的生理活動不僅形成了天然氣,而且參與了石油的形成。
(3) 鎳卟啉、釩卟啉在前寒武紀地層中大量存在,說明產(chǎn)甲烷菌是地球形成過程中存在時間最長、年代最早的古菌。
(4) 卟啉的形成有一個過程。在進入?yún)捬鯒l件后,產(chǎn)甲烷菌等微生物群體可迅速將葉綠素轉化成F430輔酶。這是產(chǎn)甲烷過程最活躍的階段,進入成巖階段后,F(xiàn)430便轉化為石油中的卟啉。
根據(jù)微生物學家Thaueretal.[16]的發(fā)現(xiàn),在熱自養(yǎng)甲烷菌中鑒定出了具有卟吩骨架的天然鎳絡合物,也說明了卟啉的微生物成因。
隨著沉積物埋藏深度的增加,地層溫度增加,溫度促進了有機質(zhì)的熱裂解,它同微生物作用相互促進,加速了石油的生成[17]。
從石油聚集的區(qū)域分布來看,同地溫特征有一定關聯(lián)。如我國西部盆地(如新疆)的地溫梯度僅2.0 ℃/100m,而東部諸盆地高達3.5~4.5 ℃/100m。同一時代相比,西部成油門限的深度大而東部小。泌陽凹陷下第三系生油門限值僅1 800 m,86 ℃;松遼盆地白堊系青一段為1 250 m,60 ℃~65 ℃。這一現(xiàn)象又同源巖母質(zhì)有關,東部以Ⅰ~Ⅱ型為主,西部Ⅱ~Ⅲ型居多。
將干酪根加熱,可產(chǎn)生各種烴類及可溶性瀝青,這就是干酪根熱降解成油說。在干酪根裂解產(chǎn)物的主要系列化合物中,除含有大量的正構烷烴外,還含有大量的正構烯烴、類異戊間二烯烴和烯烴(圖4)[18]。而一般原油中烯烴含量很低,其模擬實驗的溫度為300 ℃~500 ℃,遠遠高于地質(zhì)體中的實際溫度。雖然高溫可以彌補時間的不足,但過高溫度未必能全面反映地層中生油的實際情況。
從江漢盆地源巖及甘南泥炭樣品28 ℃~38 ℃時進行富集培養(yǎng)本源菌類發(fā)酵的模擬實驗來看,發(fā)酵樣品鏈烷烴分布呈明顯變化[19]。正構烷烴碳數(shù)范圍拓寬,均為飽和烴,無烯烴。低碳數(shù)和偶數(shù)正烷烴含量增加,CPI和OEP值接近1(0.93~1.01),奇偶均勢。類異戊二烯烴系列被檢出,植烷具有很強的優(yōu)勢(圖5)[19],更近似于石油的生成。
溫度的作用使有機質(zhì)中C-C鍵斷裂發(fā)生得更加頻繁。厭氧微生物的降解作用也使有機質(zhì)發(fā)生降解(使大分子有機質(zhì)變成小分子有機質(zhì)),二者方向相同,互為融合,使有機質(zhì)的裂解加速。微生物對有機質(zhì)改造形成烴類的作用還有去氧作用,脫去含氧官能團,產(chǎn)氫菌產(chǎn)氫、用氫形成飽和烴,因而作用更為全面、重要。
表4 不同時代樣品中卟啉的含量[15]
注:Nip.鎳卟啉;VoP.釩卟啉
圖4 南陽凹陷盤里藻腐泥型(Ⅰ1)和Ⅱ2型干酪根熱解氣相色譜[18]a.盤星藻腐泥型(Ⅰ1);b.Ⅱ2型干酪根Fig.4 Pyrolysis gas chromatographies of sapropelic kerogen (type I1) from discoctaster algae and type II2 kerogen in Nanyang sag, Jianghan Basin[18]
圖5 本源菌發(fā)酵反應前后飽和烴總離子流圖[19]Fig.5 Total mass chromatograms of saturated hydrocarbon fraction in original and fermentative samples[19]
厭氧微生物多途徑、多種方式參與了石油的形成。微生物細胞體積極小,而所面臨的環(huán)境多變,每個細胞要在這樣復雜的環(huán)境條件下求得生存和發(fā)展,就必須具備一套發(fā)達的代謝調(diào)節(jié)系統(tǒng),以保證上千種酶能有條不紊地進行極其復雜的新陳代謝反應。在生理上具有一定特點,能適應高溫、高壓、高鹽等極端環(huán)境,保持膜的功能。氫代謝是厭氧微生物最重要的地質(zhì)特征,沉積物中的氫化反應十分豐富,對地質(zhì)體中的物質(zhì)循環(huán)、石油的形成和演化具有重要意義。沉積物中厭氧微生物發(fā)育著許許多多群體,不同演化階段有不同的微生物,各有不同的作用,新老交替,不斷更新。石油的生成是一個多元化、長期的過程。
致謝 感謝恩師葉連俊先生、黃弟藩教授、黃汝昌教授、王大珍教授;感謝中石油廊坊分院、東北石油大學、農(nóng)業(yè)部成都沼科所以及準噶爾盆地、柴達木盆地、松遼盆地等各盆地各石油勘探開發(fā)研究院、研究所的同事、朋友們,謝謝你們對我們工作的指導、幫助與支持,尤其是我們在開展《石油天然氣形成過程中微生物地質(zhì)作用》研究時給予的鼎力協(xié)作,再次表示衷心的感謝。