任嘉紅,常 欣,白變霞,豐 敏
(長(zhǎng)治學(xué)院 生物科學(xué)與技術(shù)系,山西 長(zhǎng)治 046011)
黨參是一種性平味甘的重要中藥,是桔梗科植物黨參(Codonopsis pilosula(Franch.)Nannf)的干燥根,其性味甘平、無(wú)毒,有補(bǔ)中益氣、生津止渴、活血化淤等功效[1]。黨參分布區(qū)域廣,產(chǎn)地多,質(zhì)量差異較大,山西潞黨參為道地藥材[2]。潞黨參主要產(chǎn)于現(xiàn)山西長(zhǎng)治和晉城的平順、陵川、黎城、武鄉(xiāng)、長(zhǎng)治等縣[3]。營(yíng)養(yǎng)需求和施肥管理是黨參人工栽培的理論基礎(chǔ),目前施肥是人工栽培用來(lái)提高黨參產(chǎn)量和品質(zhì)的主要措施[4-5]。目前,以微生物為基礎(chǔ)開(kāi)發(fā)的各種微生物肥料已經(jīng)在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中得到廣泛應(yīng)用,該類肥料具有肥效高、本身無(wú)毒、不污染環(huán)境、成本低、節(jié)約能源等特點(diǎn),是化學(xué)肥料的最有效替代品[6]。
乙烯是植物體內(nèi)的內(nèi)源激素,植物大部分時(shí)候只需要低水平度乙烯,大量乙烯的生成會(huì)阻礙植物生長(zhǎng)[7]。ACC 脫氨酶(ACC deaminase,1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸脫氨酶)可以降解乙烯合成的直接前體ACC使乙烯水平降低,就有可能解除高濃度乙烯對(duì)植物生長(zhǎng)的抑制,從而促進(jìn)植物的生長(zhǎng),有利于植物去抵抗逆境,ACC脫氨酶活性細(xì)菌可以分解植物根際產(chǎn)生的ACC[8,9],該類菌不少菌株還具有一定的產(chǎn)生長(zhǎng)素能力、解磷能力、產(chǎn)嗜鐵素能力,進(jìn)而促進(jìn)植物根的生長(zhǎng)。近年來(lái),ACC脫氨酶已成為國(guó)內(nèi)外的研究熱點(diǎn)之一,具有ACC脫氨酶活性的微生物作為植物根際促生菌(PGPR)的潛力菌株,諸多實(shí)驗(yàn)室開(kāi)展了關(guān)于ACC脫氨酶活性細(xì)菌的篩選分離和ACC脫氨酶活性細(xì)菌功能作用等方面的研究。目前關(guān)于黨參根際產(chǎn)ACC脫氨酶菌株的研究未見(jiàn)報(bào)道。
本研究以前期從潞黨參根際土壤中分離出的一株具有ACC脫氨酶活性的菌株M01為研究對(duì)象,通過(guò)形態(tài)、生理生化、基于16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育分析等對(duì)該菌株進(jìn)行鑒定,以確定其分類地位,并對(duì)其產(chǎn)ACC脫氨酶能力進(jìn)行定性測(cè)定,同時(shí)還對(duì)該菌株解磷、產(chǎn)IAA、嗜鐵素能力等進(jìn)行測(cè)定。本研究為黨參專用生物肥料的開(kāi)發(fā)提供了良好的潛力菌株。以期為黨參生物肥料開(kāi)發(fā)提供優(yōu)良菌種,進(jìn)而為黨參的人工栽培及野生資源保護(hù)以及我國(guó)植物資源多樣性保護(hù)提供理論基礎(chǔ)和技術(shù)支持。
2.1.1 材料
菌株M01分離自山西省長(zhǎng)治陵川潞黨參根際土壤中,該菌株目前保藏于本實(shí)驗(yàn)室。
2.1.2 培養(yǎng)基
LB培養(yǎng)基,牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基,NB種子培養(yǎng)基,富集DF培養(yǎng)基,加富培養(yǎng)基ADF培養(yǎng)基[10],鑒定培養(yǎng)基蒙金娜固體培養(yǎng)基、CAS培養(yǎng)基、MKB培養(yǎng)基[11]。
2.2.1 菌株ACC脫氨酶活性測(cè)定方法
(1)將供試菌株接入50 mL LB液體培養(yǎng)基,28℃培養(yǎng)24 h進(jìn)行活化后,按1%接種量接種至50 mL LB液體培養(yǎng)基,28℃擴(kuò)大培養(yǎng)24 h,離心(9000 r/min,4℃)10 min收集菌體。用不加(NH4)2SO4的DF液體培養(yǎng)基離心洗滌菌體2次,重懸于25 mL ADF培養(yǎng)基中,28℃培養(yǎng)48 h,9000 r/min(4℃)離心10 min,收集菌體。用pH7.6的 Tris-Hcl緩沖液(0.1 mol/L)離心洗滌菌體2次。
(2)將菌體重懸于600 uL 0.1 mol/L Tris-Hcl緩沖液(pH=8.5)中,加入30 uL甲苯,迅速振蕩30 s,破碎細(xì)胞,即為粗酶液,取100uL粗酶液,4℃貯存,用于蛋白測(cè)定,其余粗酶液立即用于ACC脫氨酶活性測(cè)定。
(3)取200 uL粗酶液于1.5 mL離心管,加入20 uL 0.5 mol/L ACC混勻,置于30℃水浴15 min,隨即加入1 mL 0.56 mol/L Hcl終止反應(yīng)。并設(shè)2組平行對(duì)照,不加粗酶液和不加ACC。12000 r/min離心5 min,取上清。
(4)在10 mL管中,每1 mL上清液加800 uL 0.56 mol/L HCl和300 vuL 0.2%2,4-二硝基苯肼溶液(濃硫酸中溶解),30℃保溫30 min,加入2 mol/L NaOH混勻,540 nm測(cè)吸光值。
(5)繪制α-酮丁酸標(biāo)準(zhǔn)曲線,使用Bradford蛋白定量試劑盒定量測(cè)定蛋白質(zhì),以牛血清蛋白作為標(biāo)準(zhǔn)蛋白做標(biāo)準(zhǔn)曲線[12]。采用下列公式計(jì)算ACC脫氨酶比活力:
2.2.2 菌株鑒定
(1)形態(tài)和生理生化鑒定
將M01接種于牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基平板上,28℃培養(yǎng)24 h,觀察其菌落形態(tài)特征。并對(duì)該菌株分別進(jìn)行革蘭氏染色、芽孢染色及鞭毛染色。并參照《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊(cè)》(第9版)及《常見(jiàn)細(xì)菌鑒定手冊(cè)》開(kāi)展M01菌株的生理生化鑒定[13~15]。
(2)16SrDNA序列的測(cè)定與系統(tǒng)發(fā)育分析
采用修改CTAB法提取M01菌株的基因組DNA。以基因組DNA為模板,用細(xì)菌的16S rDNA通用引物對(duì)細(xì)菌基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增[16]。引物分別為:PA(5-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3)和 PB(5-AAGGAGGTGATCCAGCCGCA-3);采用50uL體系進(jìn)行擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增程序?yàn)椋?4℃2 min,94 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 1.5 min,30個(gè)循環(huán),72℃7min。2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)獲得目的條帶(1500bp左右),將該條帶切膠回收后與pMD19-T載體連接,轉(zhuǎn)入大腸桿菌JM109感受態(tài)細(xì)胞中,采用藍(lán)白斑篩選和菌落PCR檢測(cè),挑選出陽(yáng)性克隆斑后送至北京華大基因進(jìn)行測(cè)序,將得到的16S rDNA序列進(jìn)行BLAST,并用MEGA 5.0構(gòu)建該菌株系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)。并將該序列提交至GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)獲取基因登錄號(hào)。
2.2.3 M01菌株的促生潛力測(cè)定(1)溶磷能力的鑒定
將M01菌株點(diǎn)接種于蒙金娜固體培養(yǎng)基平板上,30℃培養(yǎng)7 d,觀察解磷圈,并統(tǒng)計(jì)解磷圈直徑(D)與菌落直徑(d)的比值,初步判定其解磷能力的大小。
將M01菌株活化后接種于NB種子培養(yǎng)基,30℃振蕩培養(yǎng)18~24 h制成種子液,取0.5 mL種子液接種于含50 mL蒙金娜液體培養(yǎng)基的100 mL三角瓶中,以接0.5 mL空白種子液的蒙金娜液體培養(yǎng)基為對(duì)照,每個(gè)處理3個(gè)重復(fù),30℃,180 r/m振蕩培養(yǎng) 4 d后,發(fā)酵液(4℃,12857×g)離心 10 min,采用鉬銻抗比色法測(cè)定上清液有效磷含量[17],同時(shí)計(jì)算溶磷率[18];
(2)產(chǎn)生長(zhǎng)素測(cè)定
參照文獻(xiàn)[19]中的方法對(duì)M01菌株進(jìn)行分泌生長(zhǎng)素(IAA)能力的定性定量鑒定。(3)產(chǎn)嗜鐵素測(cè)定
在CAS培養(yǎng)基上,對(duì)M01菌株進(jìn)行點(diǎn)接種,30℃培養(yǎng)72 h,如果菌株周邊有黃綠色暈圈產(chǎn)生,即表明該菌株具有產(chǎn)嗜鐵素的能力。并對(duì)M01菌株產(chǎn)嗜鐵素進(jìn)行定量測(cè)定,按1%的量接入到30 mL液體MKB培養(yǎng)基中,28℃、200 r/min培養(yǎng) 24 h后,離心(10,000 r/min,10℃)15 min取上清液,與等體積CAS藍(lán)色檢測(cè)液混勻。以不接菌的MKB培養(yǎng)液為對(duì)照。室溫下充分1h后,測(cè)定樣品(As)與對(duì)照(Ar)OD630的值,用如下公式計(jì)算鐵載體產(chǎn)量:
對(duì)M01菌株進(jìn)行產(chǎn)ACC酶活力測(cè)定,測(cè)定發(fā)現(xiàn)該菌株所產(chǎn)的ACC脫氨酶的活性為11.5 U/mg。這說(shuō)明該菌株產(chǎn)ACC脫氨酶能力較強(qiáng)。
菌株M01接種于牛肉膏蛋白胨平板上培養(yǎng)24h后,長(zhǎng)出的菌落不透明,較小,污白色,有光澤,圓形,邊緣整齊。該菌株桿狀,革蘭氏陽(yáng)性,好氧、具運(yùn)動(dòng)性,不產(chǎn)芽孢;生理生化特征分別是:KOH實(shí)驗(yàn)陰性、接觸酶陽(yáng)性、氧化鎂陰性、卵磷脂酶陰性、油脂水解陰性、淀粉水解陰性、丙二酸鹽利用陽(yáng)性、吲哚試驗(yàn)陰性、甲基紅陽(yáng)性、V·P陰性、硝酸鹽還原陽(yáng)性。
以M01菌株16S rDNA的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠(2%)電泳檢測(cè),如圖1所示,在1500 bp附近有目的條帶。將該條帶進(jìn)行切膠回收后與T載體連接,轉(zhuǎn)入大腸桿菌JM109感受態(tài)細(xì)胞中,采用藍(lán)白斑篩選和菌落PCR檢測(cè),挑選出陽(yáng)性克隆斑,送交測(cè)序公司進(jìn)行測(cè)序。對(duì)M01菌株測(cè)序得到的16S rDNA序列進(jìn)行BLAST比對(duì),能在數(shù)據(jù)庫(kù)中找到同源性非常高的相似菌株系列,與Pseudomonas brassicacearum(EU391388)菌株的同源性達(dá)到99%。構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),可見(jiàn)菌株M01與模式菌株 Pseudomonasbrassicacearum(EU391388)處于同一分支上。因此,結(jié)合M01菌株的形態(tài)特征和生理生化鑒定的結(jié)果,可將其鑒定為Pseudomonas brassicacearum。將M01菌株的16S rDNA序列提交至GenBank數(shù)據(jù)庫(kù),獲取登錄號(hào)為MG687531。
圖1M01菌株16S rDNA PCR產(chǎn)物電泳結(jié)果Fig.1 Result of 2%agarose gel electrophoresis of 16S rDNA PCR product of strain M01
圖2 菌株M01的16S rDNA全序列的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)形圖Fig.2 Phylogenetic tree of strain M01 based on its 16S rDNA sequences
3.4.1 M01菌株溶磷能力的鑒定
具有溶磷能力的菌株表現(xiàn)為在菌落周圍形成透明的溶磷圈。將M01菌株點(diǎn)接種于蒙金娜培養(yǎng)基檢測(cè)平板上,從圖3可以看出,平板上出現(xiàn)明顯的解磷透明圈。透明圈直徑(D)與菌落生長(zhǎng)直徑(d)的比值表示解磷菌相對(duì)解磷能力的指標(biāo),可初步測(cè)定菌株解有機(jī)磷的效果[20]。M01菌株的D/d比為1.5。對(duì)其解磷能力進(jìn)行定量測(cè)定,結(jié)果表明該菌株的對(duì)有機(jī)磷的解磷率可達(dá)到18.35%。這說(shuō)明M01菌株是一株解有機(jī)磷能力強(qiáng)的產(chǎn)ACC脫氨酶菌株。
圖3.M01菌株產(chǎn)生的解磷圈Fig.3 The phosphate-dissolving zone of M01 strain
3.4.2 產(chǎn)生長(zhǎng)素(IAA)能力
通過(guò)產(chǎn)IAA定性鑒定,由圖4可見(jiàn),M01菌株具有一定的產(chǎn)生長(zhǎng)素能力。對(duì)M01進(jìn)行產(chǎn)生長(zhǎng)素(IAA)定量測(cè)定,該菌株的產(chǎn)生的IAA可以達(dá)到5.381μg/mL。
圖4 M01菌株的產(chǎn)IAA能力Fig.4.IAA producing effect of M01 strain
3.4.3 產(chǎn)嗜鐵素能力的鑒定
產(chǎn)生嗜鐵素的菌株表現(xiàn)為在CAS平板接種菌落周圍形成橘黃色暈圈。采用產(chǎn)嗜鐵素檢測(cè)CAS平板對(duì)對(duì)M01菌株進(jìn)行產(chǎn)嗜鐵素能力的定性測(cè)定,發(fā)現(xiàn)其具有非常明顯的產(chǎn)嗜鐵素能力,如圖5所示,M01菌株能在CAS平板形成橘黃色暈圈(嗜鐵圈),可合成嗜鐵素。對(duì)M01菌株在MKB液體培養(yǎng)基中的鐵載體產(chǎn)生能力進(jìn)行測(cè)定,結(jié)果表明,該菌株在上清液中鐵載體含量為48.12%。
圖5 M01菌株的產(chǎn)嗜鐵素能力Fig.5.The production of siderophore by M01 strain
假單胞菌是報(bào)道的產(chǎn)ACC脫氨酶的常見(jiàn)屬[21-22]。國(guó)外學(xué)者已經(jīng)證實(shí),以ACC為唯一碳源且可以產(chǎn)生ACC脫氨酶的假單胞菌都是植物根際促生菌[23]。本實(shí)驗(yàn)室前期從潞黨參根際分離篩選出一株具有ACC脫氨酶活性的細(xì)菌M01,經(jīng)形態(tài)特征、生理生化及16S rDNA序列的測(cè)定與系統(tǒng)發(fā)育分析將其鑒定為假單胞菌屬的Pseudomonas brassicacearum。通過(guò)測(cè)定M01菌株的其它促生機(jī)制后發(fā)現(xiàn),該菌株除了具有溶有機(jī)磷能力,還具有明顯的產(chǎn)鐵載體和產(chǎn)IAA能力。總體而說(shuō),菌株M01除具有較強(qiáng)的ACC脫氨酶活性外,還具有其他的一些促生機(jī)制,這說(shuō)明M01菌株是一株很有潛力的植物促生菌,同時(shí)表明該菌株可能通過(guò)幾種機(jī)制共同起作用來(lái)發(fā)揮其促生作用。而幾種機(jī)制共同作用對(duì)黨參的促生作用的效果有待后續(xù)的植物回接實(shí)驗(yàn)。另外,國(guó)內(nèi)外開(kāi)展了不少關(guān)于植物內(nèi)生及根際產(chǎn)ACC脫氨酶細(xì)菌的研究,但是在該類菌的ACC脫氨酶作用機(jī)制、ACC脫氨酶活性影響因素等方面存在諸多欠缺,有待加強(qiáng)。
本研究首次開(kāi)展了山西潞黨參根際具ACC脫氨酶活性菌株的相關(guān)研究。我們分離自潞黨參根際的M01菌株具有較好的ACC脫氨酶活性,這表明該菌株可利用乙烯的前體1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸(ACC)作為唯一氮源進(jìn)行生長(zhǎng),是典型的含ACC脫氨酶的根際促生菌。M01菌株在分類地位上隸屬于假單胞菌屬中的Pseudomonas brassicacearum。目前關(guān)于Pseudomonas brassicacearum大多是作為植物病害生防菌進(jìn)行報(bào)道[24-25],我們的研究結(jié)果為其作為植物PGPR提供了更多證據(jù)。
通過(guò)對(duì)M01菌株其它促生機(jī)制的測(cè)定,發(fā)現(xiàn)該菌株具有較強(qiáng)的產(chǎn)嗜鐵素能力,這暗示該菌株一方面能通過(guò)分泌嗜鐵素,為植物生長(zhǎng)提供鐵營(yíng)養(yǎng),植物達(dá)到更好生長(zhǎng)的目的;另一方面產(chǎn)生的嗜鐵素結(jié)合鐵去競(jìng)爭(zhēng)土壤中病原菌生存所需的鐵,從而抑制病原菌的生長(zhǎng)。此外,M01產(chǎn)IAA能力和溶磷能力都很強(qiáng),這暗示其可以在植物根際分泌較多的IAA和磷酸酯酶,促進(jìn)植物的生長(zhǎng)和提供給植物更多可利用的磷。不少研究證明,IAA在促進(jìn)植物生長(zhǎng)的同時(shí)還能提高植物的抗逆能力[26]。Bianco等發(fā)現(xiàn)接種高產(chǎn)IAA的苜蓿中華根瘤菌可以增強(qiáng)宿主的抗鹽性[27]。另外,關(guān)于M01菌株具體的定殖能力尚不確定,因而不能完全客觀的保證該菌株的實(shí)際利用和操作,只有通過(guò)開(kāi)展進(jìn)一步的宿主植物定殖研究,才能更有效的去利用該菌株。
長(zhǎng)治學(xué)院學(xué)報(bào)2018年2期