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瓠瓜種質(zhì)資源主要果實(shí)性狀的主成分與聚類分析

2018-08-07 03:49張兆輝姜玉萍陳春宏
中國蔬菜 2018年8期
關(guān)鍵詞:單瓜苦味種質(zhì)

張兆輝姜玉萍陳春宏*

(1上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院莊行綜合試驗(yàn)站,上海 201415;2上海市設(shè)施園藝技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 201403)

瓠 瓜〔Lagenaria siceraria(Molina)Standl.〕亦稱瓠子、夜開花、葫蘆等,是葫蘆科葫蘆屬中的栽培種,為一年生攀緣草本植物,原產(chǎn)非洲,在我國南北方各地均有栽培,是我國蔬菜產(chǎn)業(yè)中重要的瓜類蔬菜(趙芹 等,2014;胡雪丹 等,2016;張兆輝 等,2017)。

主成分分析法與聚類分析法是蔬菜作物品種綜合評(píng)價(jià)常用的方法,該方法已在黃瓜、番茄、西瓜等主要蔬菜作物育種研究中廣泛應(yīng)用(鐘金仙 等,2017;朱子成 等,2017;芮文婧 等,2018),通過對(duì)不同種質(zhì)之間的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析及分類,探究不同種質(zhì)資源間的親緣關(guān)系,為種質(zhì)資源的利用提供了依據(jù),也大大提高了育種的效率。國內(nèi)關(guān)于蔬菜作物種質(zhì)果實(shí)性狀的主成分與聚類分析的研究比較多,鐘金仙等(2017)對(duì)49份黃瓜種質(zhì)資源的12個(gè)果實(shí)性狀進(jìn)行了主成分分析以及綜合評(píng)價(jià),篩選出多份優(yōu)良的黃瓜種質(zhì)材料;張紫薇等(2018)以115份番茄品種為試材,對(duì)8個(gè)果實(shí)性狀進(jìn)行了主成分分析和聚類分析,從中篩選出78份果實(shí)性狀良好的材料,為番茄優(yōu)良親本的選配提供了依據(jù);趙衛(wèi)星等(2017)以國內(nèi)收集到的56份西瓜主栽品種為材料,對(duì)7個(gè)果實(shí)性狀進(jìn)行了主成分分析和聚類分析,認(rèn)為在育種過程中優(yōu)先選擇單果質(zhì)量、果皮厚、中心糖含量和邊糖含量等4個(gè)指標(biāo)有利于加速新品種的選育和改良。關(guān)于瓠瓜種質(zhì)資源果實(shí)性狀的研究鮮有報(bào)道,因此有必要開展相關(guān)研究工作,鑒于此,本文緊緊圍繞119份瓠瓜種質(zhì)資源,針對(duì)其主要果實(shí)性狀進(jìn)行了相關(guān)研究,利用主成分、聚類分析研究了其遺傳多樣性,進(jìn)一步明確了不同瓠瓜種質(zhì)資源的遺傳關(guān)系,以期為瓠瓜種質(zhì)資源創(chuàng)新和利用及瓠瓜新品種選育、應(yīng)用提供科學(xué)依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

參試瓠瓜材料共計(jì)119份,其中90份引自中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所(農(nóng)作物種質(zhì)資源平臺(tái)-蔬菜種質(zhì)資源子平臺(tái))、29份收集自國內(nèi)部分省份(表1)。

表1 瓠瓜種質(zhì)資源及其來源

1.2 試驗(yàn)設(shè)計(jì)與方法

試驗(yàn)于2017年2~7月在上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院莊行綜合試驗(yàn)站連棟大棚內(nèi)進(jìn)行,2月20日穴盤育苗,3月23日定植。采用隨機(jī)區(qū)組設(shè)計(jì),每小區(qū)種植15株,3次重復(fù)。在不同生育期分別調(diào)查皮色、果實(shí)形狀、單瓜質(zhì)量等主要果實(shí)性狀,按李開銀等(2003)、沈鏑和李錫香(2008)的描述規(guī)范及中華人民共和國行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)(NY/T 2504—2013)分別賦值(表2),并對(duì)瓠瓜的果實(shí)性狀進(jìn)行主成分與聚類分析。

利用Shannon-Weaver遺傳多樣性信息指數(shù)來衡量種質(zhì)資源的遺傳多樣性,計(jì)算公式為:遺傳多樣性指數(shù)H’=-Σpi×lnpi,其中pi為某一性狀第i級(jí)別內(nèi)材料份數(shù)占總份數(shù)的百分比,ln為自然對(duì)數(shù)。

表2 瓠瓜果實(shí)性狀及其代碼

1.3 統(tǒng)計(jì)分析

各統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)、遺傳多樣性指數(shù)等均使用Excel 2007軟件計(jì)算和處理,主成分分析和聚類分析采用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)軟件處理。

2 結(jié)果與分析

2.1 瓠瓜主要果實(shí)性狀的遺傳多樣性分析

表3反映了瓠瓜主要果實(shí)性狀的遺傳多樣性。由表3可知,119份瓠瓜種質(zhì)資源的果實(shí)性狀存在較廣泛的遺傳多樣性,多樣性信息指數(shù)在0.394 8~2.063 6之間,平均多樣性指數(shù)為0.937 1。其中果實(shí)形狀的遺傳多樣性指數(shù)最大,達(dá)到2.063 6,皮色和單瓜質(zhì)量的遺傳多樣性指數(shù)次之,分別為1.258 8、0.885 8,說明瓠瓜的形狀、皮色、單瓜質(zhì)量等3個(gè)果實(shí)性狀的遺傳多樣性最豐富。

表3 瓠瓜果實(shí)性狀的遺傳多樣性

2.2 瓠瓜主要果實(shí)性狀的主成分分析

表4反映了瓠瓜果實(shí)性狀的主成分特征值及累計(jì)貢獻(xiàn)率。由表4可以看出,第一主成分的貢獻(xiàn)率為37.24%,第二主成分的貢獻(xiàn)率為23.33%,第三主成分的貢獻(xiàn)率為14.71%,第四主成分的貢獻(xiàn)率為9.44%,前4個(gè)主成分特征值累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到84.72%,因此可以用前4個(gè)主成分代替果實(shí)的8個(gè)性狀對(duì)瓠瓜果實(shí)性狀進(jìn)行評(píng)價(jià)。

根據(jù)4個(gè)主成分與瓠瓜果實(shí)性狀相關(guān)指標(biāo)之間的關(guān)系,可以計(jì)算得到瓠瓜果實(shí)性狀相關(guān)矩陣的特征向量(表5)。由得出的特征向量可導(dǎo)出前4個(gè)主成分的函數(shù)表達(dá)式:

第一主成分:y1=0.034 9x1-0.562 9x2-0.595 3x3+0.012 4x4-0.702 8x5+0.697 1x6+0.591 7x7+0.580 0x8

第二主成分:y2=0.662 6x1+0.729 9x2+0.675 5x3-0.196 7x4-0.269 4x5+0.259 4x6+0.375 7x7+0.344 5x8

第三主成分:y3=0.022 6x1+0.064 7x2+0.195 3x3+0.854 4x4-0.380 8x5+0.303 5x6-0.275 2x7-0.301 9x8

第四主成分:y4=-0.697 2x1+0.226 5x2+0.220 8x3+0.092 1x4-0.077 0x5-0.050 4x6+0.369 1x7+0.210 8x8

由表5及以上4個(gè)主成分函數(shù)表達(dá)式可知,由于苦味有無和風(fēng)味的特征值(絕對(duì)值)比較大,因此第一主成分以風(fēng)味為主,主要體現(xiàn)果實(shí)的品質(zhì)因子,此時(shí)果實(shí)的苦味有無存在最大負(fù)向載荷,表明瓠瓜種質(zhì)資源中風(fēng)味好的材料無苦味;由于瓜皮斑的特征值(絕對(duì)值)比較大,因此第二主成分以瓜皮斑為主,以皮色、斑紋色為輔,主要體現(xiàn)果實(shí)的外觀因子;由于肉質(zhì)的特征值(絕對(duì)值)比較大,因此第三主成分以肉質(zhì)為主,主要體現(xiàn)果實(shí)品質(zhì)因子;第四主成分以皮色的特征值(絕對(duì)值)比較大,因此以皮色為主,以果實(shí)形狀為輔,主要體現(xiàn)果實(shí)的外觀因子。根據(jù)各主成分的貢獻(xiàn)率可知,在果實(shí)的8個(gè)性狀中影響最大的分別是風(fēng)味、瓜皮斑、肉質(zhì)和皮色等4個(gè)性狀指標(biāo)。

表4 主成分特征值及貢獻(xiàn)率

表5 前4個(gè)主成分的特征向量

2.3 瓠瓜主要果實(shí)性狀的聚類分析

由圖1可以看出,在遺傳距離為24.0處,將119份瓠瓜種質(zhì)分為兩大類群。第一大類群包括62份瓠瓜種質(zhì),其中風(fēng)味中等且無苦味的種質(zhì)為37份、風(fēng)味佳(濃)且無苦味的種質(zhì)為18份,風(fēng)味差(淡)且無苦味的種質(zhì)為3份,風(fēng)味差且有苦味的種質(zhì)為4份,而其果實(shí)形狀主要為保齡球形、圓筒形、長(zhǎng)圓筒形、長(zhǎng)棒形、長(zhǎng)頸圓球形,分別為7、9、16、26份和4份,單瓜質(zhì)量主要為重、中,分別為31份和31份。第一大類群在遺傳距離7.5處又可被分為四小類,第一小類包括B2、B3、B10、B12、B15、B18、B19、B20、B104、B111、B113、B120等31份瓠瓜種質(zhì),這類種質(zhì)大部分為圓筒形、長(zhǎng)圓筒形和長(zhǎng)棒形,且單瓜質(zhì)量均為中等;第二小類 包 括 B16、B17、B61、B62、B92、B94、B72、B71、B81、B83、B134、B110等20份瓠瓜種質(zhì),這類種質(zhì)大部分為長(zhǎng)圓筒形和長(zhǎng)棒形,其單瓜質(zhì)量均較重;第三小類包括B103、B119、B73、B76、B30等8份瓠瓜種質(zhì),這類種質(zhì)大部分為保齡球形,其單瓜質(zhì)量均較重;第四小類包括B122、B123、B124等3份瓠瓜種質(zhì),這類種質(zhì)有2份為長(zhǎng)頸圓球形、1份為長(zhǎng)棒形,其單瓜質(zhì)量均較重。

第二大類群包括57份瓠瓜種質(zhì),其中風(fēng)味中等且無苦味的種質(zhì)為26份,風(fēng)味佳且無苦味的種質(zhì)為6份,風(fēng)味差的種質(zhì)為4份,風(fēng)味中等偏下(淡、中)且有苦味的種質(zhì)為21份;而其果實(shí)形狀則以扁圓形、近圓形、鴨梨形、長(zhǎng)把梨形、葫蘆形、保齡球形、圓筒形為主,分別為1、3、18、8、19、7份和1份;其單瓜質(zhì)量以輕、中為主,分別為11份和42份,單瓜質(zhì)量較重的種質(zhì)為4份,且均為近圓形、鴨梨形或長(zhǎng)把梨形。第二大類群在遺傳距離12.5處又可被分為兩小類,第一小類包括B39、B77等2份瓠瓜種質(zhì),這類種質(zhì)分別為鴨梨形和長(zhǎng)把梨形,其單瓜質(zhì)量均為中等;第二小類包括 B131、B126、B115、B40、B41、B5、B6、B8、B9、B11、B1、B4等55份瓠瓜種質(zhì),這類種質(zhì)大部分為鴨梨形、長(zhǎng)把梨形和葫蘆形,其單瓜質(zhì)量以輕、中為主。

圖1 119份瓠瓜種質(zhì)資源聚類圖

3 結(jié)論與討論

我國瓠瓜種質(zhì)資源十分豐富、種類繁多,但對(duì)瓠瓜種質(zhì)資源主要果實(shí)性狀的研究不夠深入,本試驗(yàn)通過對(duì)瓠瓜種質(zhì)的主要果實(shí)性狀進(jìn)行調(diào)查,開展不同瓠瓜種質(zhì)之間的遺傳多樣性研究,最后進(jìn)行主成分、聚類分析,對(duì)指導(dǎo)我國瓠瓜資源的創(chuàng)新利用及新品種選育、應(yīng)用等具有重要的現(xiàn)實(shí)意義。

① 遺傳多樣性信息指數(shù)是代表不同種質(zhì)間性狀變異的綜合指標(biāo),其值越高,說明表型性狀越豐富、越均勻(葉新如 等,2017)。本試驗(yàn)以瓠瓜種質(zhì)資源的皮色、果實(shí)形狀、單瓜質(zhì)量等8個(gè)主要果實(shí)性狀為考察指標(biāo),分析結(jié)果表明,瓠瓜種質(zhì)的8個(gè)主要果實(shí)性狀存在廣泛的遺傳多樣性,其中以果實(shí)形狀的遺傳多樣性指數(shù)最大,皮色和單瓜質(zhì)量的遺傳多樣性指數(shù)次之,表明瓠瓜種質(zhì)在果實(shí)形狀、皮色、單瓜質(zhì)量3個(gè)果實(shí)性狀上的遺傳多樣性最豐富。

② 采用主成分分析方法對(duì)8個(gè)果實(shí)性狀進(jìn)行歸納,前4個(gè)主成分特征值累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到84.72%,其中第一主成分以風(fēng)味為主,主要體現(xiàn)果實(shí)的品質(zhì)因子;第二主成分以瓜皮斑為主,主要體現(xiàn)果實(shí)的外觀因子;第三主成分以肉質(zhì)為主,主要體現(xiàn)果實(shí)品質(zhì)因子;第四主成分以皮色為主,主要體現(xiàn)果實(shí)的外觀因子,這4個(gè)因子能夠客觀地反映瓠瓜種質(zhì)資源性狀特征,因此在采用果實(shí)性狀對(duì)瓠瓜種質(zhì)進(jìn)行評(píng)價(jià)時(shí),應(yīng)優(yōu)先考慮果實(shí)的品質(zhì)因子、外觀因子進(jìn)行評(píng)判。但由于試驗(yàn)中僅對(duì)主要果實(shí)性狀指標(biāo)進(jìn)行了分析,因此對(duì)于瓠瓜種質(zhì)的綜合評(píng)價(jià)仍有待于進(jìn)一步的研究和分析。

③ 通過對(duì)119份瓠瓜種質(zhì)資源的8個(gè)果實(shí)性狀進(jìn)行調(diào)查,并進(jìn)行聚類分析,可以將119份瓠瓜種質(zhì)資源分為兩大類群。第一大類群包括62份瓠瓜種質(zhì),其總體品質(zhì)較好,以風(fēng)味中等偏上且無苦味的種質(zhì)為主,占比達(dá)88.7%,其中風(fēng)味佳的種質(zhì)占比達(dá)29.03%;果實(shí)形狀以圓筒形、長(zhǎng)圓筒形、長(zhǎng)棒形為主,占比達(dá)82.3%;單瓜質(zhì)量以中、重為主,占比分別為50.0%。說明這一類群的瓠瓜種質(zhì)在品質(zhì)和外觀方面均表現(xiàn)較好,大部分能夠滿足市場(chǎng)對(duì)優(yōu)質(zhì)、商品性佳的瓠瓜的需求。第二大類群包括57份瓠瓜種質(zhì),其總體品質(zhì)稍差,雖然以風(fēng)味中等偏上且無苦味的種質(zhì)為主,但其中風(fēng)味佳的種質(zhì)僅占10.5%,風(fēng)味中等偏下且有苦味的種質(zhì)占比卻達(dá)43.9%;果實(shí)形狀以鴨梨形、長(zhǎng)把梨形、葫蘆形為主,占比達(dá)78.9%;單瓜質(zhì)量以中為主,占比達(dá)73.7%。說明這一類群瓠瓜種質(zhì)的品質(zhì)和果實(shí)形狀均不夠理想,大部分不能滿足市場(chǎng)的需求。

④ 針對(duì)市場(chǎng)上對(duì)圓筒或棒形、優(yōu)質(zhì)瓠瓜的需求,并結(jié)合119份瓠瓜種質(zhì)資源果實(shí)性狀的綜合評(píng)價(jià),認(rèn)為第一大類群中的B2、B3、B10、B12、B15、B18、B19、B21、B23、B26、B28、B33、B45、B55、B56、B58、B69、B74、B80、B82、B84、B85、B86、B111、B113、B122、B35、B91、B92、B94、B79、B16、B17、B61、B62、B63、B64、B65、B34、B42、B43、B72、B81、B83、B134、B110等46份瓠瓜材料與第二大類群中的B66可以作為優(yōu)選的瓠瓜種質(zhì)資源,為下一步瓠瓜新品種的選育奠定了基礎(chǔ)。

雖然通過果實(shí)形狀和單瓜質(zhì)量可以初步判斷瓠瓜種質(zhì)之間的親緣關(guān)系,聚類結(jié)果也與果實(shí)形狀、皮色、單瓜質(zhì)量遺傳多樣性最豐富的結(jié)論存在一定相關(guān)性,但仍有待于對(duì)瓠瓜種質(zhì)的其他農(nóng)藝性狀進(jìn)行調(diào)查分析,以判斷聚類的可靠性。同時(shí),由于受到環(huán)境、栽培管理技術(shù)及人為判斷等因素的影響,更有必要借助分子生物學(xué)的手段對(duì)瓠瓜種質(zhì)資源之間的親緣關(guān)系做進(jìn)一步鑒定。

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