孟子琦,吳嘉瑞,楊艷平,倪夢蔚,趙 屹,劉殊羽
(1.北京中醫(yī)藥大學(xué)中藥學(xué)院,北京 100102; 2.北京中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院,北京 100029)
濕疹是由多種因素引起的瘙癢性皮膚病,具有明顯滲出傾向,為炎癥反應(yīng)性疾病[1]。目前,西醫(yī)治療濕疹主要采用抗過敏法,在初期控制病情的效果較好,但有不良反應(yīng)大、停藥后易復(fù)發(fā)等缺點[2]。中醫(yī)藥因治療方法多、效果顯著,已成為濕疹臨床治療的研究熱點[3]。現(xiàn)代研究結(jié)果表明,白鮮皮有抗菌、抗炎及抗過敏等作用,可用于濕熱瘡毒、濕疹等癥[4-5]。地膚子具有抗病原微生物、抗炎等藥理作用;同時,地膚子及以其為主的復(fù)方地膚子湯可治療多種皮膚疾病[6]。在華南地區(qū),常用白鮮皮、地膚子二藥制成外用制劑來治療皮膚濕疹[5]。本研究運用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,分析“白鮮皮-地膚子”藥對治療濕疹的分子作用機制,希望為之后的深入研究及臨床合理用藥提供參考。
本研究依托中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫和分析平臺(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)(http://lsp.nwu.edu.cn/)[7]檢索白鮮皮、地膚子的化學(xué)成分,共搜索到82個化合物,其中白鮮皮63個,地膚子19個。
為了獲得潛在的活性成分,采用“OB≥30%,DL≥0.18”分別對白鮮皮、地膚子的化學(xué)成分進行評價與篩選,其中,地膚子的化學(xué)成分齊墩果酸的OB為29.02%,與30%相差不大,且通過查閱文獻[6],齊墩果酸是地膚子中主要的化學(xué)成分,因此也把其納入研究中。最終有21個化合物符合要求,并將其視為候選化合物,見表1。
表1 “白鮮皮-地膚子”藥對中21個候選化合物的基本信息Tab 1 Basic information of 21 compounds of herb pair of “cortex dictamni-fructus kochiae”
本研究通過TCMSP平臺,對篩選出的化合物進行靶點預(yù)測,有部分化合物未找到與之相關(guān)的靶點,故把這部分化合物剔除,最終得到14個化合物,其中,11個來自白鮮皮,3個來自地膚子。
與濕疹相關(guān)的靶點信息來源于治療靶點數(shù)據(jù)庫(therapeutic target database,TTD)(https://db.idrblab.org/ttd/)[8]和遺傳關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫(genetic association database,GAD)(https://geneticassociationdb.nih.gov/),其中,GAD已下線,不過可以在網(wǎng)站上下載數(shù)據(jù)。本研究以“eczema”為關(guān)鍵詞進行搜索,共收集到56個與濕疹有關(guān)的靶點,見表2。
蛋白質(zhì)功能的發(fā)揮不是憑借單個蛋白質(zhì)獨立執(zhí)行,而是依靠蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)相互作用(protein-protein interaction,PPI)執(zhí)行其功能,因此,對PPI網(wǎng)絡(luò)的研究和分析對臨床治療具有重要意義。STRING(https://string-db.org/)[9]數(shù)據(jù)庫是一個包含已知和預(yù)測的蛋白質(zhì)相互作用的數(shù)據(jù)庫。本研究將之前收集到的與濕疹相關(guān)的靶點輸入STRING數(shù)據(jù)庫中進行檢索,選取分值>0.7分的高置信度數(shù)據(jù),以保證數(shù)據(jù)的可靠性。
利用Cytoscape 3.6.0(http://www.cytoscape.org/)[10]軟件構(gòu)建“白鮮皮-地膚子”藥對的化合物-預(yù)測靶點網(wǎng)絡(luò);并將化合物-預(yù)測靶點網(wǎng)絡(luò)與濕疹相關(guān)的PPI網(wǎng)絡(luò)合并,取重合的靶點構(gòu)建與濕疹相關(guān)的化合物-潛在靶點網(wǎng)絡(luò)。
表2 與濕疹相關(guān)的56個靶點Tab 2 56 target spots related to eczema
“白鮮皮-地膚子”藥對的化合物-預(yù)測靶點網(wǎng)絡(luò)見圖1,共包括204個節(jié)點(14個化合物節(jié)點和190個靶點節(jié)點),組成369條化合物-預(yù)測靶點聯(lián)系;其中,正方形節(jié)點表示化合物,八邊形節(jié)點表示靶點,節(jié)點大小與度值成正比例關(guān)系。
圖1 “白鮮皮-地膚子”藥對的化合物-預(yù)測靶點網(wǎng)絡(luò)Fig 1 Network of compound-potential target spots of the herb pair of “cortex dictamni-fructus kochiae”
將在TTD、GAD中檢索到的56個靶點輸入STRING數(shù)據(jù)庫中,檢索與其相互作用的二級蛋白,并剔除獨立于網(wǎng)絡(luò)之外的靶標蛋白,得到了PPI網(wǎng)絡(luò),見圖2,共包括87個與濕疹相關(guān)的蛋白和643條蛋白質(zhì)相互作用關(guān)系。
圖2 與濕疹相關(guān)的PPI網(wǎng)絡(luò)Fig 2 PPI network related to eczema
與濕疹相關(guān)的化合物-潛在靶點網(wǎng)絡(luò)見圖3,共包括26個節(jié)點(9個化合物節(jié)點和17個靶點節(jié)點)和38條邊,菱形節(jié)點表示化合物,圓形節(jié)點表示靶點,節(jié)點大小與度值成正比例關(guān)系。運用Cytoscape中的Network Analysis對化合物-潛在靶點網(wǎng)絡(luò)進行分析,得到網(wǎng)絡(luò)中潛在靶點的度值,靶點的度值表示“白鮮皮-地膚子”藥對中化合物可能作用于靶點的數(shù)目,度值越大,說明化合物通過該靶點發(fā)揮作用的可能性越大。本研究中,有6個靶點的度值>平均度值(2.24),說明其很可能是“白鮮皮-地膚子”藥對中化合物發(fā)揮作用的潛在靶點。與濕疹相關(guān)的“白鮮皮-地膚子”藥對中化合物的潛在靶點信息見表3。
圖3 與濕疹相關(guān)的化合物-潛在靶點網(wǎng)絡(luò)Fig 3 Network of compound-potential target spots related to eczema
蛋白質(zhì)名稱基因名稱度值視黃酸受體RXR-αRXRA6核受體共激活因子2NCOA26雄激素受體AR3轉(zhuǎn)錄因子p65RELA3腫瘤壞死因子TNF3白細胞介素6IL63白細胞介素10IL102白細胞介素2IL22干擾素γIFNG2雌激素受體ESR11核因子κB抑制劑αNFKBIA1白細胞介素4IL41核因子κB激酶亞基α抑制劑CHUK1白細胞介素1αIL1A1白細胞介素1βIL1B1超氧化物歧化酶[銅-鋅]SOD11核受體共激活因子1NCOA11
中藥具有多組分、多靶標和多途徑協(xié)同作用的特點,因此,很難闡釋清楚其物質(zhì)基礎(chǔ)及作用原理,而網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)的出現(xiàn)為中藥的研究提供了全新的視角[11-12]。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)把之前“一個靶點,一種成分”的藥物研究模式轉(zhuǎn)變?yōu)?“多靶點,多成分”的新模式,從而能夠更好地揭示中藥多成分、多靶點之間的復(fù)雜關(guān)系[13]。
本研究構(gòu)建了與濕疹相關(guān)的“白鮮皮-地膚子”藥對的化合物-潛在靶點網(wǎng)絡(luò),共包含9個化合物和17個作用靶點,由此可見,“白鮮皮-地膚子”藥對治療濕疹的多成分、多靶點的特點。其中,17個靶點分別為視黃酸受體RXR-α(RXRA)、核受體共激活因子2(NCOA2)、雄激素受體(AR)、轉(zhuǎn)錄因子p65(RELA)、腫瘤壞死因子(TNF)、白細胞介素6(IL-6)、白細胞介素10(IL-10)、白細胞介素2(IL-2)、干擾素γ(IFNG)、雌激素受體(ESR1)、核因子κB抑制劑α(NFKBIA)、白細胞介素4(IL-4)、核因子κB激酶亞基α抑制劑(CHUK)、白細胞介素1α(IL-1α)、白細胞介素1β(IL-1β)、超氧化物歧化酶[銅-鋅](SOD1)及核受體共激活因子1(NCOA1)。網(wǎng)絡(luò)分析可得,度值大于平均值的關(guān)鍵靶點為RXRA、NCOA2、AR、RELA、TNF及IL-6,推測“白鮮皮-地膚子”藥對的有效成分可能是通過上述靶點發(fā)揮治療濕疹的作用。轉(zhuǎn)錄因子p65也稱為核因子κB p65亞基,是由RELA基因編碼的蛋白質(zhì)[14]。核因子κB于1986年首次由Sen和Baltimore發(fā)現(xiàn),在細胞免疫和炎癥反應(yīng)中的細胞存活和增殖方面發(fā)揮重要作用[15-16]。研究結(jié)果表明,miR-124通過直接靶向抑制核因子κB家族成員p65的表達來治療特應(yīng)性濕疹[17]。因此,推斷“白鮮皮-地膚子”藥對治療濕疹的作用機制可能與調(diào)控RELA的表達有關(guān)。TNF是一種天然免疫防御分子,在維持細胞、組織和生物體內(nèi)的穩(wěn)態(tài)方面起著重要作用,可以調(diào)節(jié)炎癥反應(yīng)[18];其與慢性炎癥性疾病、風(fēng)濕病及皮膚病等疾病的發(fā)生有關(guān)[19]。TNF-α是TNF/TNF受體細胞因子超家族的成員[20]。研究結(jié)果表明,一些中藥可通過下調(diào)TNF-α的表達而起到治療濕疹的作用[21-23]。因此,推斷“白鮮皮-地膚子”藥對治療濕疹的作用機制可能與下調(diào)TNF的表達有關(guān)。IL-6是一種細胞因子,由多種類型的具有多效性的細胞產(chǎn)生,抗IL-6治療可減少炎癥并具有抗血管生成作用[24]。有研究結(jié)果表明,降低細胞因子IL-2、IL-6及IL-10的表達是藥物對濕疹發(fā)揮療效的作用機制之一[25-26]。因此,推斷“白鮮皮-地膚子”藥對治療濕疹的作用機制可能與下調(diào)IL-2、IL-6及IL-10的表達有關(guān)。
綜上所述,本研究應(yīng)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,對“白鮮皮-地膚子”藥對治療濕疹的多成分、多靶點復(fù)雜網(wǎng)狀關(guān)系進行研究。研究結(jié)果初步驗證了“白鮮皮-地膚子”藥對治療濕疹的相關(guān)機制,為進一步深入研究奠定了良好的基礎(chǔ),也為“白鮮皮-地膚子”藥對的臨床應(yīng)用提供了很好的參考。但是,本研究未考慮白鮮皮、地膚子在煎煮過程中可能發(fā)生的化學(xué)變化及其在體內(nèi)的相互作用,可能會在一定程度上影響分析結(jié)果的準確性;并且,研究結(jié)果多由預(yù)測得出,尚需進一步的實驗驗證。