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中醫(yī)病證本體庫的構建研究

2018-07-09 09:00:28冒宇清李新霞
無線互聯(lián)科技 2018年13期
關鍵詞:病證本體水腫

肖 潔,冒宇清,李新霞

(南京中醫(yī)藥大學 信息技術學院,江蘇 南京 210023)

中醫(yī)在長期的醫(yī)療實踐中積累了大量的數(shù)據(jù),在中醫(yī)古籍中存在大量的病例和藥方,如何挖掘出其中的寶貴經(jīng)驗,具有極大的研究價值。由于從現(xiàn)實生活或中醫(yī)藥古籍中獲取的原始數(shù)據(jù)存在完整性不足、冗余程度高、模糊不清、雜亂無章等問題,易造成知識的無效歸納,且嚴重影響數(shù)據(jù)挖掘算法的執(zhí)行效率,不能直接滿足數(shù)據(jù)挖掘的需要[1]。因此,首先需要構建中醫(yī)病證的本體庫,依據(jù)本體庫對原始數(shù)據(jù)進行預處理操作。

本體庫提供了一套對特定領域知識的共享和共同認識,以實現(xiàn)計算機對領域知識的語義理解。利用本體技術構建領域知識庫,不僅可以清晰地描述領域中的概念及其關系,還可以實現(xiàn)基于本體推理的語義檢索,有利于領域知識的共享和重用[2]。

本文通過建立中醫(yī)病證本體庫,進行數(shù)據(jù)整理操作,優(yōu)化對中醫(yī)藥信息元數(shù)據(jù)的搜索歸納,提高中醫(yī)病證相關數(shù)據(jù)查詢和獲取的效率。

1 本體

1.1 本體的概念

本體(Ontology)的概念來源于哲學領域,原意是關于客觀存在及其本質和規(guī)律的說明,關心的是客觀現(xiàn)實的抽象本質。信息技術和語義網(wǎng)的出現(xiàn)使本體在計算機科學領域得到了廣泛的應用,特指在特定領域公認的對象及對象關系的概念化表達,其中的對象包括實際對象和邏輯對象,領域本體強調領域的本質概念和這些概念之間的關聯(lián)。

1.2 本體的構建方法

目前領域本體主要有以下幾種構建方法:IDEF-5方法、骨架法、TOVE企業(yè)建模法、METHONTOLOGY方法、循環(huán)獲取法、七步法等,經(jīng)過對以上方法的比較分析,本文采用七步法來構建中醫(yī)病證本體庫。

七步法是由斯坦福大學醫(yī)學院開發(fā)的,它將本體構建過程大致分為7個步驟,每個步驟分別確立人物和目標,具體步驟如下:(1)確定本體的專業(yè)領域和范疇,明確本體的構建需求、范圍和目的。(2)考查復用現(xiàn)有本體的可能性。(3)列出領域中的重要術語,方便用戶對本體的理解。(4)定義類和類的等級體系,通過自頂向下法、自底向上法和綜合法等方法完善等級體系。(5)定義類的屬性。(6)定義屬性的分面,分面描述屬性的取值類型、基數(shù)等特征。(7)創(chuàng)建實例[3]。

1.3 本體的構建工具

目前較為成熟的本體開發(fā)工具主要有:KAON,WebODE,OntoEdit,Protégé等,本研究選擇Protégé作為本體構建工具,因為Protégé可以支持多種常見的本體描述語言如XML,OWL,RDF等的導入和導出。

Protégé是斯坦福大學醫(yī)學院生物信息研究中心基于Java語言開發(fā)的本體編輯和知識獲取軟件,既是本體開發(fā)工具,也是基于知識的編輯器,屬于開放源代碼軟件。這個軟件主要用于語義網(wǎng)中本體的構建,是語義網(wǎng)中本體庫的核心開發(fā)工具。Protégé提供了本體概念類、關系、屬性和實例的構建,用戶只需在概念層次上進行領域本體模型的構建,而不需要關心具體的本體描述語言[4]。

2 中醫(yī)病證

在中醫(yī)學中,“病”“癥”和“證”是3個重要的概念,它們都有自己的定義,相互之間也有顯著的區(qū)別。“病”是對疾病發(fā)展全過程中出現(xiàn)的、與其他疾病表現(xiàn)有所不同的特點,以及病情發(fā)展的獨特規(guī)律所做出的概括?!鞍Y”是癥狀、體征,是指患病后出現(xiàn)的背離正常生理范圍的異?,F(xiàn)象,如發(fā)熱、惡寒等,這是人體出現(xiàn)疾病的反映?!白C”即證候,是疾病發(fā)生和演變過程中某階段本質的反映,也可認為是人體生命活動狀態(tài)的劃分,是根據(jù)中醫(yī)四診所獲信息,對病因(如內傷、外感等)、病位(如表、里、臟、腑等)、病性(如寒、熱等)、病機、病勢(如邪正盛衰、疾病發(fā)展趨勢等),以及病人自身的體質和患病時的季節(jié)氣候與周圍環(huán)境等的概括。

在中醫(yī)理論中,辯證就是在中醫(yī)理論指導下,對臨床病情資料進行分析、歸納,從而確定病人患有何證的過程。中醫(yī)的很多病名和癥狀是一致的,比如患者癥狀是下肢水腫,疾病診斷就是水腫;還有些病名和癥狀不一樣,比如患者有發(fā)熱、惡寒、無汗、周身酸楚等癥狀,中醫(yī)診斷則是感冒。以水腫為例,水腫包含風水相搏證、濕毒浸淫證、水濕浸漬證、濕熱壅盛證、脾陽虛衰證、腎陽衰微證等證。而對于同一病名以下的不同的證,又會用不同的治法,采用不同的藥方來進行治療,例如水腫的水濕浸漬證其治法是健脾化濕,通陽利水,采用的藥方是五皮飲合胃苓湯;而濕毒浸淫證其治法卻是宣肺解毒,利濕消腫,采用的藥方則是麻黃連翹赤小豆湯合五味消毒飲[5]。

針對以上問題,通過建立一個中醫(yī)病證本體庫,能夠有效地整合現(xiàn)有的中醫(yī)病證相關知識,使得各病證之間的顯性關系以及隱形關聯(lián)能夠通過相應的規(guī)則表現(xiàn)出來,以利于后續(xù)對于中醫(yī)病證相關知識的進一步挖掘與研究。

3 構建中醫(yī)病證本體庫

3.1 收集數(shù)據(jù)

中醫(yī)病證本體庫來源于相關的真實世界數(shù)據(jù),本文通過嚴格的考察與比較,經(jīng)過反復斟酌,從中醫(yī)教材、典籍和名家醫(yī)案中抽取了大量中醫(yī)病證的相關內容,建立了中醫(yī)病證數(shù)據(jù)庫。以病名水腫為例,相關屬性的取值如下。

(1)分型(證型):風水相搏證、濕毒浸淫證、水濕浸漬證、濕熱壅盛證、脾陽虛衰證、腎陽衰微證、瘀水互結證。

(2)治法:疏風清熱,宣肺行水、宣肺解毒,利濕消腫、健脾化濕,通陽利水、分利濕熱、健脾溫陽,利水、溫腎助陽,化氣行水、活血祛瘀,化氣行水。

(3)代表方:越婢加術湯加減、麻黃連翹赤小豆湯合五味消毒飲、五皮飲合胃苓湯、疏鑿飲子、實脾飲、濟生腎氣丸合真武湯、桃紅四物湯合五苓散。

3.2 定義中醫(yī)病證相關聯(lián)系,建立本體庫

使用Protégé工具構建中醫(yī)病證信息的概念以及分類。在中醫(yī)病證本體庫中,建立了4個大類:病名、分型、治法、代表方,其中“病名”下又有兒科、內科、外科、婦科、男科、皮膚科、眼科、耳鼻咽喉口腔科、肛腸科、骨傷科10個小類。定義本體庫中的關系有:“代表方為”“分型是”“包含有”“治法是”“用藥有”“癥狀是”。最后創(chuàng)建中醫(yī)病證本體庫中類的實例,為基于語義的檢索應用奠定基礎[6]。

在Protégé中可以直觀地看到所構建本體的框架圖,與水腫相關的本體詳細展開后如圖1所示。

3.3 本體的存儲

本體在構建完成后,還需要考慮相關的存儲問題。目前本體存儲方法主要有3種:純文本格式存儲、數(shù)據(jù)庫方式存儲和專門管理工具方式存儲。文本格式存儲本體管理方便,然而在進行基于本體規(guī)則的推理時,執(zhí)行效率不高且可移植性不佳;專門管理工具不具備普遍性,擴展性差;而數(shù)據(jù)庫存儲方式能使用SQL語言對本體進行高效管理,對本體的操作可以發(fā)揮數(shù)據(jù)庫技術成熟的優(yōu)勢。因此,本研究對利用Protégé生成的中醫(yī)病證本體文件采用數(shù)據(jù)庫方式進行存儲[7]。

4 結語

在當今大數(shù)據(jù)、“互聯(lián)網(wǎng)+”的時代背景下,如何充分利用中醫(yī)藥領域大量知識密集型數(shù)據(jù),通過計算機對中醫(yī)領域知識的表達和推理,實現(xiàn)名老中醫(yī)經(jīng)驗的挖掘和傳承,具有非常重要的現(xiàn)實意義。構建中醫(yī)病證本體庫是基于語義網(wǎng)的中醫(yī)藥知識發(fā)現(xiàn)的必要條件。本文在對中醫(yī)病證的相關概念全面分析的基礎上,依據(jù)現(xiàn)實世界中的中醫(yī)病證相關數(shù)據(jù),完成了中醫(yī)病證本體的結構設計和實例設計,利用Protégé工具構建了中醫(yī)病證本體庫,為利用OWL語言進行基于本體關聯(lián)關系的規(guī)則推理,實現(xiàn)基于語義的檢索以及進一步的數(shù)據(jù)挖掘工作奠定了基礎。

圖1 以水腫為例的中醫(yī)病證本體庫

[1]付苓.基于本體的單元信息知識庫構建研究[J].現(xiàn)代情報,2017(12):74-78.

[2]王美琴,吳慶斌.基于本體的醫(yī)學知識庫構建方法綜述[J].醫(yī)學信息學雜志,2017(3):73-76.

[3]方芳,徐天馥,沈同平.糖尿病醫(yī)案本體庫的構建及應用研究[J].中醫(yī)學報,2016(11):1680-1683.

[4]馮瑤,馮錫煒.基于元數(shù)據(jù)標準的語義化教育資源本體庫構建與實現(xiàn)[J].電子設計工程,2015(18):12-15.

[5]張俊波.本體庫與數(shù)據(jù)庫相融合的民族信息資源語義檢索研究[D].昆明:云南師范大學,2014.

[6]張志斌,李強,申曉偉,等.關于中醫(yī)病證名詞研究的思考[J].中國中醫(yī)基礎醫(yī)學雜志,2014(1):2-5.

[7]劉瓊,李寶敏.一種果品領域本體庫的構建方法[J].計算機技術與發(fā)展,2009(1):197-199,203.

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