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小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系HMW-GS組成及等位變異分析

2018-06-19 11:49王凌云武宗信賈舉慶張曉軍任文斌
山西農(nóng)業(yè)科學(xué) 2018年6期
關(guān)鍵詞:等位麥草亞基

王凌云,武宗信,賈舉慶,張曉軍,李 欣,任文斌

(1.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所,山西 運(yùn)城 044000;2.山西農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山西 太谷 030801;3.山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物科學(xué)研究所,作物遺傳與分子改良山西省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,山西 太原 030031)

高分子量麥谷蛋白亞基(HMW-GS)是小麥及其近緣物種種子中重要的貯藏蛋白,在面團(tuán)黏彈性性能方面起著重要作用[1]。HMW-GS由位于第一染色體組群長(zhǎng)臂上的Glu-1位點(diǎn)編碼,每個(gè)基因座由2個(gè)緊密連鎖的基因組成,分別為編碼分子量較高的x-型亞基和分子量較低的y-型亞基[2-3]。Glu-1位點(diǎn)的等位基因?qū)π←溒焚|(zhì)的影響有所不同,如對(duì)面包制作影響方面,Glu-1D的復(fù)等位基因5+10被認(rèn)為優(yōu)于2+12[4],Glu-1A上的復(fù)等位基因1和2*,優(yōu)于N等位基因,Glu-1B上的復(fù)等位基因7+8,17+18和13+16優(yōu)于其他等位基因類型[2]。雖然等位基因的類型對(duì)小麥的一些品質(zhì)造成影響,但由于大多數(shù)的等位基因在六倍體小麥的變異中是中性的,所以,它們的功能差異并不大[5],因此,對(duì)從小麥近緣物種中篩選優(yōu)質(zhì)亞基對(duì)于小麥的品質(zhì)改良非常重要。

小麥近緣物種染色體第一同源群上的HMW-GS的同源基因陸續(xù)被發(fā)現(xiàn),如小黑麥中的Glu-R1、大麥中的Glu-Hch1和簇毛麥中的Glu-V1[6]。長(zhǎng)穗偃麥草(Agropyron elongatum)是小麥族重要的物種,其部分編碼HMW-GS的基因也被克隆到,一些亞基類型對(duì)面包制作起到積極影響[5,7-8]。因此,繼續(xù)從小麥近緣物種中發(fā)現(xiàn)新的優(yōu)質(zhì)亞基對(duì)于提高小麥品質(zhì)、改良小麥具有重要意義。

本研究中的98份材料均為來源于小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系,前期對(duì)其白粉及條銹病抗性進(jìn)行鑒定,均為高抗或免疫型。本研究對(duì)小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系HMW-GS進(jìn)行分析,以期發(fā)現(xiàn)新的等位變異及優(yōu)質(zhì)亞基組合,為小麥抗病、優(yōu)質(zhì)新品種選育提供材料與依據(jù)。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)材料

試驗(yàn)材料為普通小麥與八倍體小偃麥7430雜交/回交后選擇的高代品系,2012—2017年分別連續(xù)在四川省成都市和山西省太原市進(jìn)行抗條銹病與白粉病鑒定篩選,共獲得98份兼抗條銹病與白粉病的小偃麥滲入系新品系。八倍體小偃麥7430為源于十倍體長(zhǎng)穗偃麥草與普通小麥雜交的部分雙二倍體。對(duì)照材料選用普通小麥中國(guó)春。

1.2 試驗(yàn)方法

蛋白的提取及SDS-PAGE參考張麗等[9]的方法進(jìn)行。將供試98份材料,取單顆籽粒,從無胚端切取半粒,搗碎后置于1.5 mL離心管中提取HMW-GS。中國(guó)春、7430取整顆籽粒提取HMW-GS。提取后的HMW-GS進(jìn)行SDS-PAGE。

1.3 亞基命名和評(píng)分

HMW-GS的命名參照PAYNE等[10]的命名系統(tǒng),品質(zhì)的評(píng)分是根據(jù)PAYNE等[2]的依據(jù)給出(評(píng)分標(biāo)準(zhǔn)如表1所示),即等位基因的品質(zhì)評(píng)分按1(劣質(zhì))至4(優(yōu)質(zhì))給出,總的品質(zhì)的分?jǐn)?shù)是將各個(gè)亞基品質(zhì)分?jǐn)?shù)相加而來。

表1 高分子量麥谷蛋白亞基變異位點(diǎn)及品質(zhì)得分

1.4 統(tǒng)計(jì)分析

利用Nei函數(shù)對(duì)每個(gè)位點(diǎn)上的遺傳多樣性進(jìn)行分析,其中,H和Pi分別為遺傳變異函數(shù)和等位基因出現(xiàn)的頻率數(shù)。

2 結(jié)果與分析

2.1 小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系中Glu-1位點(diǎn)的等位變異

通過對(duì)小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系供試材料中的等位基因的類型研究發(fā)現(xiàn),這些滲入系中HMW-GS基因的等位變異及亞基組成類型比較豐富(圖1)。在98份小偃麥滲入系中,共發(fā)現(xiàn)13種不同的等位基因。在Glu-A1位點(diǎn)上有3種亞基類型出現(xiàn),分別為1,2*和N,它們分別由Glu-A1,Glu-A1和Glu-A1這3個(gè)等位基因編碼,其中,N型亞基在所檢測(cè)材料中出現(xiàn)的頻率最高,達(dá)到57.14%,其次為2*型亞基(29.59%),1型亞基所占比例最低,為13.27%。在Glu-B1位點(diǎn)上,發(fā)現(xiàn)6種等位變異,其中,出現(xiàn)頻率最高的是編碼7+9型亞基的為53.06%,其次是編碼17+18型亞基的為28.57%,編碼7+8型亞基的為11.22%,編碼14+15型亞基的為5.10%,編碼13+16型及7型的出現(xiàn)頻率最低,二者都為1.02%。在Glu-D1位點(diǎn)上,亞基類型2+12出現(xiàn)頻率最高,為66.33%,5+10亞基出現(xiàn)頻率為20.41%,2+10亞基出現(xiàn)頻率為12.24%(表 2)。

對(duì)Glu-1遺傳變異率(表2)分析來看,Glu-D1(0.5033)略小于 Glu-A1(0.5683)和 Glu-B1(0.6214),這與Glu-D1等位變異類型相對(duì)少(小于Glu-B1位點(diǎn)的6種),而2+12在后代中出現(xiàn)的頻率又高(66.33%)有關(guān)。

2.2 小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系中亞基組合及品質(zhì)評(píng)分

從獨(dú)立的各個(gè)亞基對(duì)品質(zhì)的貢獻(xiàn)(表2)來看,Glu-A1位點(diǎn)上優(yōu)質(zhì)亞基所占比例略低于劣質(zhì)亞基,1和2*型亞基與N型亞基的比為43.86∶57.14;Glu-B1位點(diǎn)上的情況與Glu-A1位點(diǎn)上類似,但也高頻率的出現(xiàn)了17+18型的優(yōu)質(zhì)亞基。Glu-D1位點(diǎn)上,從能夠賦分的亞基組合(5+12亞基沒有分值)來看,雖然優(yōu)質(zhì)亞基出現(xiàn)頻率低于劣質(zhì)亞基總和,但國(guó)際上公認(rèn)的5+10型優(yōu)質(zhì)亞基所出現(xiàn)的頻率并不低(20.41%),僅次于2+12類型(66.33%)。

表2 小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系的HMW-GS等位變異及頻率

表3 小麥-長(zhǎng)穗偃麥草滲入系的HMW-GS組成及品質(zhì)評(píng)分

從各亞基的組合(表3)來看,在98份滲入系材料中,3個(gè)基因位點(diǎn)上的等位基因共出現(xiàn)了22種組合。從組合出現(xiàn)的頻率看,N,9+7,2+12組合出現(xiàn)的頻率最高,為 28.57%,其次為 2*,17+18,2+12組合,頻率為15.31%。有6個(gè)組合,即1,13+16,5+10;2*,14+15,5+10;1,7+9,5+10;1,17+18,2+12;2*,7+8,5+12;N,7,2+12,出現(xiàn)頻率最低,都為1.02%。從組合后的品質(zhì)看,品質(zhì)達(dá)到10分的材料有11份,頻率為11.1%,其中在這11份材料中Glu-D1上的5+10型亞基對(duì)此貢獻(xiàn)最大,出現(xiàn)頻率為100%。品質(zhì)為8~10分的材料有31份,頻率達(dá)到31.5%。品質(zhì)不高(≤5分)的亞基組合占所測(cè)群體的1/3(34.7%)左右,這些材料中Glu-A1位點(diǎn)編碼N型亞基,Glu-D1位點(diǎn)編碼2+10或2+12亞基。

3 討論

明確小麥品種/系中的HMW-GS組成,發(fā)現(xiàn)新的HMW-GS等位變異對(duì)于提高小麥加工品質(zhì)非常重要。本研究中,在Glu-A1位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了3個(gè)等位變異,其中,N型亞基在所測(cè)材料中出現(xiàn)的頻率最高,超過了1和2*型亞基的總和,這與中國(guó)小麥品種中Glu-A1位點(diǎn)以1和N型為主的狀況一致[12]。但在本研究中2*型亞基出現(xiàn)頻率高于1型亞基,其可能與親本組合中以2*型亞基為主有關(guān),這對(duì)于提高品質(zhì)有所幫助。在Glu-B1位點(diǎn)發(fā)現(xiàn)了多個(gè)優(yōu)質(zhì)亞基類型,如 14+15,7+8,13+16和 17+18,總出現(xiàn)頻率接近50%,劣質(zhì)亞基7型出現(xiàn)頻率只有1.02%,這些都為高頻率出現(xiàn)高品質(zhì)亞基組合提供了可能。Glu-D1位點(diǎn)上,國(guó)際上公認(rèn)的高品質(zhì)亞基5+10出現(xiàn)頻率達(dá)到20.41%,排第2位。此外,還出現(xiàn)了亞基5+12,出現(xiàn)頻率與其在中國(guó)小麥中出現(xiàn)頻率相近,都較低(1%左右)[12],但其目前被認(rèn)為比5+10亞基更優(yōu)[13]。從亞基組合上看,高分值(≥9)的亞基組合為1/2*,7+8/14+15/17+18/13+16,5+10組合,共有15份材料,這為選育高品質(zhì)品種提供了種質(zhì)資源。

小麥的野生近緣種屬植物含有豐富的HMW-GS 等位基因[14-18],在中間偃麥草[6,19-20]和長(zhǎng)穗偃麥草[5,7-8]中也發(fā)現(xiàn)了多個(gè)HMW-GS等位基因。但是本研究中并沒有發(fā)現(xiàn)新的等位基因,這可能與群體規(guī)模小有關(guān),因此,新的等位基因的發(fā)掘工作有待于繼續(xù)開展。偃麥草中蘊(yùn)含豐富的抗病基因,經(jīng)過前期的抗病性調(diào)查,本研究中的98份材料對(duì)小麥條銹病和白粉病都具有優(yōu)良的抗性,結(jié)合本研究的結(jié)果,可以從中選育優(yōu)質(zhì)抗病的小麥種質(zhì)資源,此外還可對(duì)篩選出的優(yōu)質(zhì)種質(zhì)資源進(jìn)行抗逆性評(píng)價(jià),篩選抗逆的優(yōu)質(zhì)資源,為小麥抗逆和抗病育種服務(wù)。

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