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抗菌肽SMAP-29在大腸桿菌中表達條件的優(yōu)化及純化研究

2018-05-30 04:52吳三橋趙冠杰
江蘇農(nóng)業(yè)科學 2018年9期
關(guān)鍵詞:卡那霉素抗菌肽外源

吳三橋, 趙冠杰, 萬 健, 陳 琛

(陜西理工大學生物科學與工程學院/中德天然產(chǎn)物研究所,陜西漢中 723000)

近年來,抗生素的長期使用所帶來的負面效應(yīng)已越來越引起全社會的高度關(guān)注,藥物殘留和細菌耐藥性等問題日漸嚴重,特別是2010年出現(xiàn)的“超級細菌”[1]事件再一次將濫用抗生素引發(fā)的日益嚴重的耐藥菌株等問題擺在了公眾面前,長期濫用抗生素所引起的食品安全、人類健康、環(huán)境污染等問題也受到了公眾的廣泛關(guān)注。因此,研制安全、高效、環(huán)保型抗生素替代品已迫在眉睫。

抗菌肽(antibacterial peptides)是生物體特定基因編碼產(chǎn)生的一類小分子多肽,具有抵抗外界微生物侵害的作用,是生物天然免疫系統(tǒng)中的一個重要組成部分,與傳統(tǒng)抗生素相比,抗菌肽具有熱穩(wěn)定好、水溶性好、強堿性、廣譜抗菌和作用機制獨特等特點[2-3]。

抗菌肽SMAP-29(sheep myeloid antibacterial peptides-29)是1995年Bagella等從綿羊Cathelicidins前體蛋白的羧基端截取的29個氨基酸殘基序列,具有兩親性α-螺旋結(jié)構(gòu)域,分子量約為3.2 ku,有很強的抗細菌、真菌、病毒等生物學功能[4-11]。抗菌肽SMAP-29天然含量非常低,化學合成成本較高,因此通過基因工程表達具有較好的前景??咕腟MAP-29基因工程表達已有大量研究報道,但是未見采用小分子泛素樣修飾蛋白(small ubiquitin-related modifier,SUMO)融合表達報道。

本試驗以抗菌肽SMAP-29為研究對象,通過已構(gòu)建的表達載體pSUMO-SMAP-29在大腸桿菌中誘導表達融合蛋白SUMO-SMAP-29,優(yōu)化了融合蛋白SUMO-SMAP-29在大腸桿菌中的表達條件,并通過Ni柱親和層析純化了目的蛋白,旨在為其生物活性以及產(chǎn)業(yè)化開發(fā)奠定基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 菌株、試劑

含有pSUMO-SMAP-29表達質(zhì)粒的EscherichiacoliBL21(DE3)菌種由筆者所在實驗室保存。

Protein Marker、IPTG、卡那霉素購自生工生物工程(上海)股份有限公司;Ni Sepharose柱購自美國GE Healthcare公司;其余試劑均為國產(chǎn)分析純。

1.2 融合蛋白SUMO-SMAP-29表達條件的優(yōu)化

1.2.1 細菌培養(yǎng) 將含重組質(zhì)粒pSUMO-SMAP-29的E.coliBL21菌種接種于LB(50 μg/mL卡那霉素)固體培養(yǎng)基,37 ℃過夜培養(yǎng)。挑取新鮮單克隆接種于5 mL LB(50 μg/mL卡那霉素)液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)過夜。

1.2.2 不同濃度IPTG對目的蛋白表達量的影響 細菌培養(yǎng)方法同“1.2.1”節(jié),然后按體積比1 ∶100的轉(zhuǎn)接量將過夜培養(yǎng)的菌液接種于50 mL新鮮LB(50 μg/mL卡那霉素)液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)。當D600 nm約0.6時加IPTG至終濃度為0.25、0.50、1.00、2.00 mmol/L,在 37 ℃ 誘導1 h后各取樣1 mL進行SDS-PAGE電泳分析。通過Quantity One和SPSS軟件,分析融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量,以及IPTG濃度梯度各組之間是否有統(tǒng)計學差異。

1.2.3 不同誘導溫度對目的蛋白表達量的影響 細菌培養(yǎng)方法同“1.2.1”節(jié),然后按體積比1 ∶100的轉(zhuǎn)接量將過夜培養(yǎng)的菌液接種于50 mL新鮮LB(50 μg/mL卡那霉素)液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)。當D600 nm約0.6時加IPTG至終濃度為0.50 mmol/L,分別在25、30、37、42 ℃誘導,1 h 后各取樣1 mL,進行SDS-PAGE電泳分析。通過Quantity One和SPSS軟件分析融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量,以及誘導溫度梯度各組之間是否有統(tǒng)計學差異。

1.2.4 不同誘導時間對目的蛋白表達量的影響 細菌培養(yǎng)方法同“1.2.1”節(jié),然后按體積比1 ∶100的轉(zhuǎn)接量將過夜培養(yǎng)的菌液接種于50 mL新鮮LB(50 μg/mL卡那霉素)液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)。在培養(yǎng)至D600 nm約0.6時,加0.50 mmol/L IPTG,在30 ℃條件下誘導,分別于0、1、3、5、7 h取樣1 mL,進行SDS-PAGE電泳分析。通過Quantity One和SPSS軟件分析融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量,以及誘導時間梯度各組之間是否有統(tǒng)計學差異。

1.3 融合蛋白SUMO-SMAP-29的分離純化

取誘導表達后的菌液離心收集菌體,用Binding Buffer(20 mmol/L Tris,500 mmol/L NaCl,10 mmol/L咪唑,pH值 8.0)重懸菌體,冰浴超聲破菌,離心收集上清。將含目的蛋白的細菌破碎液上樣于Ni-NTA純化柱,調(diào)整流速(≤1.5 mL/min)后,用Wash Buffer(20 mmol/L Tris,500 mmol/L NaCl,20 mmol/L咪唑,pH值8.0)洗去雜蛋白,再用Elution Buffer(20 mmol/L Tris,500 mmol/L NaCl,250 mmol/L 咪唑,pH值8.0)洗脫,收集洗脫液,SDS-PAGE分析,其余樣品用PBS于4 ℃過夜透析,透析液冷凍干燥后存于-80 ℃超低溫冰箱。

2 結(jié)果與分析

2.1 融合蛋白SUMO-SMAP-29誘導表達條件的優(yōu)化

2.1.1 不同IPTG濃度對大腸桿菌表達融合蛋白SUMO-SMAP-29的影響 SUMO標簽蛋白分子量為14 ku,但是實際表現(xiàn)為18 ku,可能與其特殊的三級結(jié)構(gòu)有關(guān)[12]??咕腟MAP-29的分子量為3.2 ku,因此,融合蛋白的分子量表現(xiàn)為21 ku左右。SDS-PAGE電泳結(jié)果(圖1)表明,在21 ku處可以明顯看到融合蛋白SUMO-SMAP-29得到表達。0.25、0.50、1.00、2.00 mmol/L濃度的IPTG均能誘導大腸桿菌表達融合蛋白SUMO-SMAP-29。

通過Quantity One和SPSS軟件,對不同IPTG濃度誘導情況下融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量進行分析,結(jié)果如表1和圖2所示。誘導前,大腸桿菌本底水平表達了微量的融合蛋白,約占總蛋白的0.5%,當IPTG濃度為0.50、1.00 mmol/L時融合蛋白SUMO-SMAP-29的表達量相對較高,分別占菌體總蛋白的9.99%、10.02%,統(tǒng)計學分析顯示兩者差異不顯著。因此,IPTG濃度在0.50~1.00 mmol/L之間均能相對高效地誘導融合蛋白SUMO-SMAP-29的表達,出于節(jié)約成本考慮,在后續(xù)試驗中選擇0.50 mmol/L IPTG為誘導濃度。

表1 不同IPTG濃度融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量

注:同列數(shù)據(jù)后不同小寫字母表示組間差異顯著(P<0.05)。下表同。

2.1.2 不同誘導溫度對大腸桿菌表達融合蛋白SUMO-SMAP-29的影響 由圖2可知,在誘導溫度為25、30、37、42 ℃ 時,均能誘導大腸桿菌表達融合蛋白SUMO-SMAP-29。通過Quantity One軟件對融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量進行分析,結(jié)果如表2和圖2所示,當誘導溫度為30、37 ℃時表達量相對較高,分別占菌體總蛋白的10.10%、9.95%,兩者間差異不顯著,因此30~37 ℃均能相對高效地誘導融合蛋白SUMO-SMAP-29的表達,為了降低對恒溫培養(yǎng)箱的損耗,后續(xù)試驗選擇低一點的溫度30 ℃作為誘導溫度。

表2 不同誘導溫度融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量

2.1.3 不同誘導時間對大腸桿菌表達融合蛋白SUMO-SMAP-29的影響 通過Quantity One和SPSS軟件對融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量進行分析,結(jié)果如圖3和表3所示,誘導表達后,融合蛋白SUMO-SMAP-29表達量0~3 h不斷升高,在5 h處表達量達到相對較高的水平,占菌體總蛋白的11.35%;5 h后,融合蛋白SUMO-SMAP-29的表達量反而有所減少。統(tǒng)計學分析顯示,誘導3、5 h的相對表達量差異不顯著,出于節(jié)約時間的考慮,選取3 h作為誘導時間。

2.2 融合蛋白SUMO-SMAP-29的分離純化

在誘導劑IPTG終濃度為0.50mmol/L、誘導溫度為30 ℃、誘導3 h后收集菌液離心。經(jīng)Ni柱親和層析純化后,分別取樣品、樣品流出液、清洗液以及洗脫液用SDS-PAGE電泳分析(圖4),電泳結(jié)果顯示獲得了融合蛋白SUMO-SMAP-29。

表3 不同誘導時間對融合蛋白SUMO-SMAP-29的相對表達量

3 討論

大腸桿菌具有培養(yǎng)條件簡單、生長繁殖快、安全性好、可高效表達外源基因等優(yōu)點,是目前抗菌肽表達采用最多的表達系統(tǒng)??咕腟MAP-29因本身具有抗菌活性,對宿主菌具有殺傷作用,直接表達較困難。另外,因分子量小和陽離子特性容易被細胞中的蛋白酶降解,目前表達抗菌肽時常采用融合表達。融合表達模擬了抗菌肽在生物機體內(nèi)合成時的前體結(jié)構(gòu)[13],分子伴侶的作用類似于天然抗菌肽的前體部分。SUMO標簽蛋白能促進目的蛋白的可溶性表達和正確折疊[14];對熱和蛋白酶有很強的抗性,有利于保持目的蛋白的穩(wěn)定性;SUMO分子量較小,表達融合蛋白中目的蛋白占比例較大,提高目的蛋白得率。

外界條件如IPTG濃度、誘導溫度、誘導時間等對大腸桿菌表達外源蛋白有著十分重要的影響。研究發(fā)現(xiàn),通過優(yōu)化上述條件能夠獲得更高的表達量,但因表達菌株、質(zhì)粒和外源蛋白的差異,最佳的表達條件也各不相同。

誘導劑IPTG濃度過低時,啟動子沒有完全啟動,大腸桿菌無法最大化分泌外源蛋白;但IPTG濃度過高可能會對大腸桿菌有抑制作用,且IPTG一般價格不便宜,會造成試驗經(jīng)費上的浪費。本試驗通過研究不同IPTG濃度對大腸桿菌表達SUMO-SMAP-29的影響發(fā)現(xiàn),隨著IPTG濃度的升高,融合蛋白SUMO-SMAP-29表達量增加,當IPTG濃度為 0.50、1.00 mmol/L時融合蛋白SUMO-SMAP-29表達量相對較高,統(tǒng)計分析顯示表達量差異不顯著;但IPTG濃度為 2.00 mmol/L 時,表達量反而下降,這可能與高濃度的IPTG對大腸桿菌有抑制作用相關(guān),出于成本考慮,在本試驗選擇 0.50 mmol/L IPTG作為誘導濃度。

溫度不僅影響大腸桿菌的生長,也對外源蛋白的穩(wěn)定性有著一定的影響。在溫度相對偏低時,菌體生長速率緩慢,代謝速率較低,外源蛋白表達量偏低。但在另一方面,低溫有助于維持穩(wěn)定外源蛋白的結(jié)構(gòu),高溫可能會破壞外源蛋白的結(jié)構(gòu),研究發(fā)現(xiàn)溫度過高(如42 ℃)時,融合蛋白SUMO-SMAP-29的表達量有所降低。本試驗中發(fā)現(xiàn)誘導溫度為30、 37 ℃ 時,融合蛋白SUMO-SMAP-29表達量相對較高,統(tǒng)計分析顯示30、37 ℃誘導時融合蛋白SUMO-SMAP-29相對表達量之間差異不顯著,為了降低對恒溫培養(yǎng)箱的損耗,本試驗選擇低一點的溫度(30 ℃)作為誘導溫度。

誘導表達時間的優(yōu)化影響著外源蛋白的最終產(chǎn)量。從外源蛋白開始被大腸桿菌表達至培養(yǎng)基中養(yǎng)分耗盡的過程中,外源蛋白的表達是一個不斷變化的過程。因為隨著誘導時間的延長,表達的外源蛋白越來越多,但是,外源蛋白也不斷被蛋白酶降解。在本試驗中,大腸桿菌在0~5 h這段時間大量表達融合蛋白SUMO-SMAP-29;5 h后,由于大腸桿菌表達SUMO-SMAP-29的速率下降,低于SUMO-SMAP-29被降解的速率,所以SUMO-SMAP-29開始減少。統(tǒng)計學分析顯示,誘導3、5 h的相對表達量差異不顯著,出于節(jié)約時間的考慮,選取3 h作為誘導時間。

相對于表達載體的構(gòu)建和蛋白的誘導表達,外源蛋白的純化更加困難和繁瑣。Ni柱親和層析是通過蛋白質(zhì)暴露在表面的一些氨基酸殘基(如組氨酸)和樹脂上的金屬離子之間的特異性結(jié)合進行純化目的蛋白的,具有配體簡單、吸附性強、分離條件適宜以及不影響蛋白質(zhì)自身的生物活性等優(yōu)點。融合標簽SUMO自身帶有6×His標簽,因此本試驗利用Ni柱親和層析純化重組融合蛋白SUMO-SMAP-29,且純化效率較好。

本試驗結(jié)果表明,融合蛋白SUMO-SMAP-29相對最優(yōu)的誘導表達條件為IPTG終濃度0.50 mmol/L、誘導溫度 30 ℃、誘導表達時間3 h。這為進一步研究抗菌肽SMAP-29的生物學活性及產(chǎn)業(yè)化開發(fā)奠定了必要的基礎(chǔ)。

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