文開新
許多既有應(yīng)用前景又令人興奮的技術(shù)正在不斷地被推出,它們能夠幫助人們應(yīng)對作物的霉菌毒素污染問題,其中一個突破就是宿主誘導(dǎo)基因沉默技術(shù)。研究已證明了如何使用這項技術(shù)來減少收獲前玉米中的黃曲霉毒素。
中圖分類號:S852.4+4 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:C 文章編號:1001-0769(2018)05-0001-03
霉菌毒素是由各種真菌產(chǎn)生的有害于動物健康的化合物。據(jù)世界衛(wèi)生組織(World Health Organization,WHO)估計,全球大約1/4的食物至少會被一種霉菌毒素污染。依據(jù)對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)損失和動物健康影響來說,問題最為嚴(yán)重的霉菌毒素是黃曲霉毒素。黃曲霉毒素由多種曲霉菌(Aspergillus Fungus)產(chǎn)生。由于其會影響動物健康,許多國家在法律上對人的黃曲霉毒素的攝入量都進(jìn)行了規(guī)定,美國對食物中黃曲霉毒素含量的限定最為嚴(yán)格,要求不得超過20 μg/kg,而歐盟對嬰兒奶粉中黃曲霉毒素的含量要求不得高于0.025 μg/kg。
數(shù)十年來,對于如何降低食品/飼料中黃曲霉毒素含量的問題,商業(yè)界和學(xué)術(shù)界進(jìn)行了多方面的研究。這些研究包括用不產(chǎn)霉菌毒素的曲霉菌來競爭天然產(chǎn)毒的曲霉菌、在易感作物中培育抗真菌或抗霉菌毒素的品種、使用螯合劑結(jié)合霉菌毒素來使其失去生物學(xué)活性。盡管人們做了很多努力,但是,據(jù)估計每年各類作物因黃曲霉毒素含量超標(biāo)就要損失數(shù)百萬噸,這其中以玉米為主。
1 降低玉米中黃曲霉毒素的含量
玉米在全球范圍被大量用于食物/飼料,而且很容易被黃曲霉毒素污染。據(jù)估計全球每年約有50億人食用玉米,且主要集中在發(fā)展中國家,人們因食用受到霉菌毒素污染的玉米而導(dǎo)致霉菌毒素的長期攝入。然而,能夠降低生長期玉米籽粒中黃曲霉毒素水平的RNA干擾(RNA interference,RNAi)抑制技術(shù)已經(jīng)得到成功應(yīng)用。這種新方法利用了近期的兩項科學(xué)研究發(fā)現(xiàn):一是所有的真核細(xì)胞都擁有基因抑制機(jī)制,包括一種被稱為Dicer的蛋白質(zhì),這種蛋白質(zhì)使用“一個由小干擾RNA(Small Interfering RNA,siRNA)組成的模板分子”;另一個發(fā)現(xiàn)是這些siRNA分子能夠在植物宿主和污染病原體之間穿越;當(dāng)帶有特殊序列的siRNA分子被引入病原體并在其中表達(dá)時,它會開始降解含有與引入siRNA同源序列的內(nèi)源轉(zhuǎn)錄子;其結(jié)果是,通過引入專門設(shè)計的siRNA,病原體體內(nèi)的靶基因表達(dá)表現(xiàn)為沉默或受到抑制。如果某一基因的RNA轉(zhuǎn)錄能夠通過這種方式被抑制,那么該轉(zhuǎn)錄就不能被翻譯成蛋白質(zhì)。同時,由于蛋白質(zhì)的缺失,相應(yīng)的酶會失去活性;在本例中,該靶酶是毒素生物合成途徑的一個組成部分,因此病原體就不能產(chǎn)生毒素。如果需要沉默的基因位于表達(dá)病原體本身的siRNA中,那么該技術(shù)被稱作RNAi技術(shù)。該技術(shù)被證實(shí)是研究各種生物體基因功能的一項有用技術(shù)。如果該siRNA在某一生物體(如宿主細(xì)胞)中表達(dá)(本文指玉米細(xì)胞),而此靶基因在污染病原體體內(nèi)會被抑制,RNAi抑制就超越了物種界限,這就是宿主誘導(dǎo)基因沉默(Host-Induced Gene Silencing,HIGS)技術(shù)。
2 靶向特定基因
在研究中,HIGS技術(shù)通過表達(dá)一種能夠在真菌黃曲霉毒素通路中靶向作用生物合成基因的RNAi盒來抑制被曲霉菌污染的玉米產(chǎn)生毒素。選擇通過RNAi技術(shù)來靶向抑制的基因為真菌聚酮合成酶基因(即aflC)。之所以選擇這個基因,是因為它編碼的一種蛋白質(zhì)是生成全部四種黃曲霉毒素化合物的生物合成前體所必需的,因而抑制該酶的合成將導(dǎo)致曲霉菌不能產(chǎn)生毒素。另外,聚酮合成酶的編碼基因很大,因此選擇它作為抑制的目標(biāo),以提高在RNAi盒中使用該基因區(qū)域的可行性。RNAi盒只對曲霉菌基因有效,對宿主玉米或任何下游消費(fèi)者(如人類、豬、牛等)表達(dá)的任何基因都不會表現(xiàn)出顯著的同源性。具體而言,所選擇的三個特定區(qū)域長度大約為200 bp,是真菌聚酮合成酶基因在可食用玉米籽粒部分中構(gòu)建能夠表達(dá)RNAi抑制盒的區(qū)域。經(jīng)生物信息學(xué)分析可知,所選曲霉菌aflC基因的三個區(qū)域與玉米、人、豬或牛的基因組沒有同源性。所選靶基因的三個區(qū)域?qū)煌耆种?,而不是僅僅縮短其長度,使編碼的酶仍保留一定的活性,或者是降低污染性黃曲霉菌產(chǎn)生耐藥性的概率,因為谷物的耐藥性可能由該病原體中aflC基因的三個正在突變的目標(biāo)域組成。研究人員已經(jīng)成功培育出轉(zhuǎn)基因玉米,同時分子分析顯示它能表達(dá)具有除草劑抗性的選擇性標(biāo)記物Bar基因和插入式RNAiaflC基因盒。在RNAiaflC基因盒成功插入前,這種RNAiaflC表達(dá)水平最高的轉(zhuǎn)基因玉米采用自我授粉。研究人員種植了這種來自表達(dá)植物的玉米籽粒,但授粉10 d后玉米棒上仍生長出了一種可產(chǎn)生黃曲霉毒素的知名曲霉菌且數(shù)量相同。該感染在玉米籽粒的生長期持續(xù)保持30 d。在感染的最后,研究人員收集每個感染點(diǎn)周圍的玉米籽粒,并將每一株玉米的籽粒混合在一起以檢測毒素的含量。每個玉米棒感染3~4次,每個感染點(diǎn)周圍有6~8顆籽粒。研究人員檢測了所有非轉(zhuǎn)基因?qū)φ沼衩鬃蚜?,測試結(jié)果為黃曲霉毒素含量介于1 000 μg/kg~220 000 μg/kg;然而,研究人員未能從轉(zhuǎn)基因玉米籽粒中檢測到毒素(圖1)。
隨后,研究人員使用定量反轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction,RT-PCR)方法測定從感染玉米組織中提取到的RNA,結(jié)果顯示,該目標(biāo)aflC基因在與轉(zhuǎn)基因籽?;プ鞯恼婢M織中都沒有表達(dá),但在非轉(zhuǎn)基因玉米籽粒中有表達(dá),而另一個用作表達(dá)對照的幾丁質(zhì)合成酶在轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因的受污染玉米籽粒中都有同等水平的表達(dá)。這些研究結(jié)果表明HIGS技術(shù)能用來減少生長期玉米籽粒中黃曲霉毒素的污染,從而能夠降低全球食物/飼料中的黃曲霉毒素水平。
3 探索計劃外的基因抑制
RNAi和HIGS技術(shù)在很大程度上依靠靶序列的特異性來抑制目標(biāo)基因的表達(dá)。這種技術(shù)的一個潛在風(fēng)險就是引入的siRNA分子可能不僅僅與靶基因具有序列同源性,甚至可能與其他所希望的目標(biāo)基因也有同源性;就HIGS來說,其可能會與互作的生物體共用相似的基因而引起不必要的基因抑制。這種不必要的基因抑制通常會在生物技術(shù)群體中產(chǎn)生“計劃外的表現(xiàn)型”或“非靶向”表達(dá)。本研究向玉米籽粒中引入了siRNA分子,其目的是研究隨著RNAiaflC盒的引入是否會對內(nèi)源性玉米RNA轉(zhuǎn)錄子產(chǎn)生任何不必要的抑制。試驗用的RNA提取自2個非轉(zhuǎn)基因?qū)φ沼衩缀?個表達(dá)RNAiaflC的轉(zhuǎn)基因玉米。所有RNA轉(zhuǎn)錄樣本通過一個新的兩兩比較法進(jìn)行彼此間比較,尤其要注意轉(zhuǎn)基因玉米和非轉(zhuǎn)基因?qū)φ沼衩椎?組比較。盡管轉(zhuǎn)基因組和非轉(zhuǎn)基因組的每一兩兩比較能產(chǎn)生70~100個顯著轉(zhuǎn)錄差異,但是在對這6個轉(zhuǎn)基因和非轉(zhuǎn)基因玉米的兩兩比較時,研究人員發(fā)現(xiàn)與非轉(zhuǎn)基因?qū)φ战M相比較,轉(zhuǎn)基因樣本中的任何一個轉(zhuǎn)錄均始終未見到始終如一的顯著差異。這說明當(dāng)對兩個樣本(轉(zhuǎn)基因/非轉(zhuǎn)基因)進(jìn)行比較時,由于玉米作物在自身的微環(huán)境和所處的生長階段上略微不同,它們在轉(zhuǎn)錄水平上還存在微小的差異。
然而,為了研究所引入的RNAi盒的表達(dá)在玉米籽粒中是否會出現(xiàn)轉(zhuǎn)錄上的差異,研究人員分析了6組兩兩對比,結(jié)果沒有在轉(zhuǎn)基因玉米籽粒中發(fā)現(xiàn)有持續(xù)不同的轉(zhuǎn)錄水平。如果所引入的RNAiaflC盒由于與玉米內(nèi)源性基因具有同源性而引起非靶向表達(dá),那么我們可以期待此RNA轉(zhuǎn)錄分析應(yīng)該顯示。與2個非轉(zhuǎn)基因?qū)φ战M相比,3個轉(zhuǎn)基因組的基因表達(dá)會被持續(xù)地抑制。這表明如果用來構(gòu)建RNAi抑制盒的序列特異性地靶向作用于需抑制的基因,那么就不會發(fā)生非靶向或計劃外表型的事件。證明在RNAiaflC轉(zhuǎn)基因玉米籽粒和對照組玉米上的轉(zhuǎn)錄無顯著差異是朝著證明實(shí)質(zhì)上等值的第一步,在本質(zhì)上證明了該生物技術(shù)產(chǎn)品能在各個方面(引入的特性除外)與非轉(zhuǎn)基因?qū)φ障喈?dāng),這是在生物技術(shù)特性邁向商業(yè)化時的一個調(diào)控手段。
該研究還表明,對于減少收獲前玉米中黃曲霉毒素的含量,HIGS技術(shù)是一項既有應(yīng)用前景又令人興奮的手段;基于此,此項技術(shù)還可引入到其他對黃曲霉毒素敏感的作物,并可用于抑制其他真菌產(chǎn)生霉菌毒素。應(yīng)用HIGS技術(shù)來抑制霉菌毒素合成路徑對提高人類健康以及增強(qiáng)全球食品安全性和穩(wěn)定性來說是一個強(qiáng)大的工具。