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不同生態(tài)環(huán)境下籽粒大小相關(guān)性狀QTL定位

2018-05-09 05:59姚曉云王嘉宇黎毛毛
華北農(nóng)學(xué)報(bào) 2018年2期
關(guān)鍵詞:染色體籽粒性狀

劉 進(jìn),姚曉云,王 棋,李 慧,王嘉宇,黎毛毛

(1.江西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院 水稻研究所,水稻國(guó)家工程實(shí)驗(yàn)室(南昌),國(guó)家水稻改良中心南昌分中心,江西 南昌 330200;2.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 水稻研究所,農(nóng)業(yè)部東北水稻生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,遼寧 沈陽(yáng) 110161)

水稻是重要的糧食作物之一,提高稻米產(chǎn)量和品質(zhì)是水稻遺傳育種學(xué)和分子生物學(xué)追求的永恒目標(biāo)。水稻籽粒大小相關(guān)性狀包括粒長(zhǎng)、粒寬、粒厚和千粒質(zhì)量等既是水稻產(chǎn)量的重要構(gòu)成因子之一,也顯著影響稻米的外觀品質(zhì)、加工品質(zhì)、蒸煮和食味品質(zhì)[1-3]。培育適宜大小的籽粒品種將有助于水稻的高產(chǎn)與優(yōu)質(zhì),其遺傳與發(fā)育機(jī)制一直是水稻育種家和分子生物學(xué)家研究的熱點(diǎn)之一[4-5]。

籽粒大小相關(guān)性狀均為多基因控制的數(shù)量性狀,受籽粒的長(zhǎng)、寬、厚、長(zhǎng)寬比和千粒質(zhì)量等性狀直接影響。不同遺傳群體和環(huán)境中檢測(cè)到的QTL存在較大差異,相同群體在不同生態(tài)環(huán)境下所檢測(cè)到的QTL也不盡相同[4-8]。近20年來,研究者利用不同類型的遺傳群體和環(huán)境共鑒定1 265個(gè)籽粒大小相關(guān)的QTL,不均勻地分布于12 條染色體上,多數(shù)QTL的定位區(qū)間較大、貢獻(xiàn)率較小且存在明顯的基因間和基因與環(huán)境間的互作效應(yīng),真正克隆的QTL數(shù)量相對(duì)較少[6-8]。其中,9個(gè)籽粒大小的QTL被克隆,分別是GW2、GS2、GS3、GW5、GS5、GW8、qGL3、GIF1和TGW6,有14個(gè)QTL被精細(xì)定位(http://www.gramene.org/,http://www.ricedata.cn/gene/,2016),包括gw3、gw8.1、gw9.1、qGL3a、GW3、GW6、qGL4b、qGL7、qGS7、qSS7、qGT8、GW11、GW12和qTGW3.2[4-5]。近年來,雖然對(duì)于粒形的分子調(diào)控機(jī)理取得了一定的進(jìn)展,但上述研究也反映出了籽粒大小相關(guān)性狀遺傳調(diào)控的復(fù)雜性,不同品種的籽粒大小性狀的調(diào)控基因存在顯著差異[9-10]。

鑒于此,本研究以龍稻5和中優(yōu)早8雜交衍生的RILs群體為試驗(yàn)材料,對(duì)不同環(huán)境下檢測(cè)到的籽粒大小相關(guān)的QTL進(jìn)行比較分析,以期發(fā)掘穩(wěn)定表達(dá)的主效QTL,進(jìn)一步豐富調(diào)控籽粒大小的分子機(jī)理。

1 材料和方法

1.1 試驗(yàn)材料與田間試驗(yàn)

以龍稻5(Longdao 5,LD5)和中優(yōu)早8(Zhongyouzao 8,ZYZ8)雜交衍生的重組自交系(Recombinant inbred lines,RILs)群體為試驗(yàn)材料,共180個(gè)株系。試驗(yàn)于2015,2016,2016年分別于沈陽(yáng)、南昌和海南試驗(yàn)基地進(jìn)行,單苗栽插,每系種植3行,田間管理同當(dāng)?shù)卮筇镌耘喙芾怼?/p>

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 性狀測(cè)定 成熟后取10個(gè)典型稻穗,混合脫粒后選取20個(gè)稻粒測(cè)定籽粒大小性狀,包括粒長(zhǎng)、粒寬、粒厚和千粒質(zhì)量,并計(jì)算長(zhǎng)寬比和籽粒體積,2次重復(fù),取均值統(tǒng)計(jì)分析。

1.2.2 遺傳圖譜構(gòu)建 采用2%的CTAB法提取水稻基因組DNA。PCR擴(kuò)增總體積(12 μL)包括DNA模板2.0 μL、上下游引物(10 μmol/L)各1.5 μL、6 μL的2×Mix混合體系,1.0 μL ddH2O。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃ 4 min;94 ℃ 45 s,55~58 ℃ 45 s,72 ℃ 45 s,32個(gè)循環(huán);72 ℃ 10 min,12 ℃保存。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用4%~5%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),凝膠成像儀拍照保存數(shù)據(jù)。分子遺傳圖譜包括223對(duì)分子標(biāo)記(SSR、InDel和ILP標(biāo)記),覆蓋水稻基因組約1 514.0 cM,標(biāo)記間的平均距離為6.79 cM,平均每對(duì)染色體上的標(biāo)記數(shù)為18.58。

1.2.3 QTL分析 采用Wang等[11]QTL ICI Mapping v4.0的完備區(qū)間作圖(ICIM)方法進(jìn)行QTL分析,LOD的閾值設(shè)為2.40,當(dāng)實(shí)際求得的LOD值大于LOD閾值時(shí),就判定該區(qū)段存在1個(gè)QTL,同時(shí)估算每個(gè)QTL的加性效應(yīng)值和貢獻(xiàn)率大小。QTL的命名遵循McCouch等[12]的原則。

2 結(jié)果與分析

2.1 表型分析

不同生態(tài)環(huán)境下,龍稻5均表現(xiàn)出短小圓粒,籽粒較小,中優(yōu)早8均表現(xiàn)為細(xì)長(zhǎng)大粒,中優(yōu)早8千粒質(zhì)量極顯著大于龍稻5,雙親籽粒大小相關(guān)性狀均存在顯著或極顯著差異;RILs群體中不同株系籽粒大小相關(guān)性狀存在較大幅度變異,呈現(xiàn)雙向超親分離,峰度和偏度值接近于1.00,近似連續(xù)的正態(tài)分布,這表明籽粒大小性狀均為多基因控制的數(shù)量性狀,符合QTL作圖的要求(表1)。

表1 親本和RILs群體籽粒大小相關(guān)性狀表型分析Tab.1 Seed size traits from the parents and RILs population

注:SL.粒長(zhǎng);SW.粒寬;ST.粒厚;SLW.籽粒長(zhǎng)寬比;SV.籽粒體積;TGW.千粒質(zhì)量;*和**分別表示0.05 和0.01 水平的顯著性。表2同。

Note:SL. Seed length;SW. Seed width;ST.Seed thickness;SLW.Seed length/width;SV.Seed volume;TGW.Thousand grain weight;*and**represent significant differences at the 5% and 1% level,respectively.The same as Tab.2.

2.2 QTL分析

共檢測(cè)到控制籽粒大小性狀的35個(gè)QTL,分布于第2,3,4,5,8,10,11號(hào)染色體上,LOD值介于2.40~7.97,解釋5.76%~38.88%的表型變異,其中,qST8、qSL11、qSV11和qTGW11能在3個(gè)環(huán)境下被同時(shí)檢測(cè)到,qSV2b、qST3、qSLW3、qSLW8、qTGW8、qSW8和qSV8能在2個(gè)環(huán)境下被重復(fù)檢測(cè)到,其余QTL僅能在單一環(huán)境下被發(fā)現(xiàn)(表2、圖1)。

表2 籽粒大小性狀QTL分析Tab.2 Putative QTL for seed size traits were detected in RILs population

、和■分別表示1、2和3個(gè)環(huán)境下籽粒大小相關(guān)的QTL。,and■QTL for seed size traits were detected one,two and three environments,respectively.

檢測(cè)到2個(gè)調(diào)控籽粒長(zhǎng)度相關(guān)的QTL,分別位于第10,11號(hào)染色體上,其中,qSL11在3種不同生態(tài)環(huán)境下穩(wěn)定表達(dá),增效等位基因來自中優(yōu)早8;共檢測(cè)到2個(gè)影響籽粒寬度相關(guān)的QTL,其中,qSW8能在2個(gè)環(huán)境下被檢測(cè)到,分別解釋18.53%和19.26%的表型變異;檢測(cè)到5個(gè)調(diào)控籽粒厚度相關(guān)的QTL,分別為qST2a、qST2b、qST3、qST8和qST11,其中,qST3和qST8能在不同環(huán)境下被重復(fù)檢測(cè)到;檢測(cè)到3個(gè)影響籽粒長(zhǎng)寬比相關(guān)的QTL,分別位于第2,3和8號(hào)染色體上,qSLW3和qSLW8能在2個(gè)環(huán)境下被檢測(cè)到,增效等位基因均來自龍稻5;檢測(cè)到4個(gè)調(diào)控籽粒體積相關(guān)的QTL,分布于第2,8和11號(hào)染色體上,其中,qSV11在3種生態(tài)環(huán)境下穩(wěn)定表達(dá),分別解釋13.08%,18.25%和7.56%表型變異,qSV2b和qSV8均在沈陽(yáng)和南昌環(huán)境下穩(wěn)定表達(dá),增效等位基因均來自中優(yōu)早8;與千粒質(zhì)量相關(guān)的QTL是qTGW4、qTGW5、qTGW8和qTGW11,其中qTGW8和qTGW11能在2個(gè)以上環(huán)境下被發(fā)現(xiàn),是2個(gè)穩(wěn)定表達(dá)的主效QTL。此外,籽粒大小相關(guān)的QTL成簇分布于第2,3,8和11號(hào)染色體上,位于第8和11號(hào)染色體上檢測(cè)到的2個(gè)QTL簇qSS8(qSW8、qST8、qSLW8、qSV8和qTGW8)和qSS11(qSL11、qSV11和qTGW11)存在明顯的多效性和環(huán)境頓感特性,對(duì)籽粒大小具有明顯的調(diào)控作用。

3 討論與結(jié)論

籽粒大小是直接影響水稻產(chǎn)量和品質(zhì)性狀的重要指標(biāo)之一,其遺傳與發(fā)育機(jī)制一直是水稻育種家和分子生物學(xué)家研究的熱點(diǎn)[2,13-14]。適當(dāng)增加水稻籽粒體積可以提高產(chǎn)量,但隨著籽粒體積的增加,往往導(dǎo)致稻米加工和外觀品質(zhì)惡化,尤其是堊白性狀[15-16]。近年來,隨著經(jīng)濟(jì)社會(huì)的發(fā)展和人們生活水平的日益提高,人們對(duì)優(yōu)質(zhì)稻米的需求日益增強(qiáng)。因此,發(fā)掘與利用籽粒大小相關(guān)基因?qū)ε嘤弋a(chǎn)優(yōu)質(zhì)品種具有重要的意義。

水稻籽粒大小性狀均屬于典型的數(shù)量性狀,受多基因控制,且易受環(huán)境的影響[2,4,17-19]。高方遠(yuǎn)等[20]利用細(xì)長(zhǎng)粒川106B與川345B 構(gòu)建的F2群體對(duì)粒型性狀進(jìn)行QTL分析,檢測(cè)到8個(gè)粒型相關(guān)的QTL,最終將qGT8精細(xì)定位在SG930~SG950的11.2 kb內(nèi);劉丹等[21]利用RILs群體共檢測(cè)到27個(gè)控制粒形性狀的QTL,相關(guān)QTL成簇分布在第3,5,12 號(hào)染色體上,其中,qGW5不同環(huán)境下穩(wěn)定性較好,qGL12b和qGT12b是一個(gè)新的調(diào)控籽粒大小的多效性QTL簇;Yao等[5]以秈-粳和粳-粳交衍生的2種RILs群體為試驗(yàn)材料,對(duì)籽粒大小性狀進(jìn)行QTL分析,共檢測(cè)到78個(gè)相關(guān)位點(diǎn),QTL成簇分布在第3,5,9,10,12號(hào)染色體上,遺傳背景對(duì)籽粒大小相關(guān)性狀QTL檢測(cè)存在顯著影響,GS3和DEP1基因是影響籽粒大小的重要因素;王松鳳等[22]共檢測(cè)到19個(gè)籽粒大小的QTL,其中僅有6個(gè)QTL能在不同環(huán)境下穩(wěn)定表達(dá)。本研究在3個(gè)生態(tài)環(huán)境下共檢測(cè)到35個(gè)控制籽粒大小的QTL,分布于第2,3,4,5,8,10,11號(hào)染色體上,單一QTL解釋5.78%~38.88%表型變異,qST8、qSL11和qSV11、qTGW11能在3個(gè)環(huán)境被檢測(cè)到,qSV2b、qST3、qSLW3、qSLW8、qTGW8、qSW8和qSV8能在2個(gè)環(huán)境下被發(fā)現(xiàn),其余QTL僅能在單一環(huán)境下表達(dá);籽粒大小相關(guān)QTL在第2,3,8,11號(hào)染色體上形成多效性QTL簇,其中,位于第8和11號(hào)染色體上qSS8(qST8、qSW8、qSLW8、qSV8 和qTGW8)和qSS11(qSL11、qSV1和qTGW11)是2個(gè)穩(wěn)定表達(dá)的多效QTL簇,具有明顯的多效性和對(duì)環(huán)境相對(duì)鈍感特性;其中qSS11與Oh等[23]已精細(xì)定位的qTGW11位于相近區(qū)域,而位于第8染色體的RM6976~RM3571區(qū)間的多效性QTL-qSS8能調(diào)控籽粒寬、厚、長(zhǎng)寬比、籽粒體積和千粒質(zhì)量,位于已克隆的GW8/OsSPL16基因下端區(qū)域[24-25],可能是一個(gè)新的環(huán)境鈍感的主效QTL,具有一定的研究和育種價(jià)值,品種資源課題組正在構(gòu)建次級(jí)群體對(duì)主效QTLqSS8進(jìn)行精細(xì)定位和功能分析,以期闡述相關(guān)基因?qū)ψ蚜4笮≌{(diào)控的分子機(jī)理。

此外,與粒長(zhǎng)、粒寬和千粒質(zhì)量相比,有關(guān)籽粒厚度的研究報(bào)道甚少[26-30]??刂扑咀蚜4笮⌒誀畹母骰蚨际蔷o密聯(lián)系、相互依賴的;粒厚與粒寬呈現(xiàn)顯著或極顯著的正相關(guān),與粒重也呈正相關(guān),與長(zhǎng)寬比呈極顯著負(fù)相關(guān)關(guān)系,且粒厚對(duì)稻米品質(zhì)性狀具有明顯的影響[1-3,5,31-32]。本研究中,共檢測(cè)到5個(gè)粒厚相關(guān)的QTL,分布于第2,3,8和11號(hào)染色體上,單一QTL解釋6.33%~16.55%的表型變異;其中qST3和qST8能在不同生態(tài)環(huán)境下穩(wěn)定表達(dá),是2個(gè)新的穩(wěn)定調(diào)控粒厚的主效QTL,是粒厚進(jìn)一步研究的熱點(diǎn)區(qū)域。

參考文獻(xiàn):

[1] 徐正進(jìn),邵國(guó)軍,韓 勇,等. 東北三省水稻產(chǎn)量和品質(zhì)及其與穗部性狀關(guān)系的初步研究[J]. 作物學(xué)報(bào),2006,32(12):1878-1883.

[2] 黃海祥,錢 前. 水稻粒形遺傳與長(zhǎng)粒型優(yōu)質(zhì)粳稻育種進(jìn)展[J]. 中國(guó)水稻科學(xué),2017,31(6):665-672.

[3] 厲新民,林鴻宣. 全基因組關(guān)聯(lián)分析實(shí)現(xiàn)水稻粒型自然變異的分子解析[J]. 植物學(xué)報(bào),2016,51(4):411-415.

[4] Huang R Y,Jiang L R,Zheng J S,et al. Genetic bases of rice grain shape:so many genes,so little known[J]. Trends in Plant Science,2013,18(4):218-226.

[5] Yao X Y,W J Y,Liu J,et al. Comparison and analysis of QTLs for grain and hull thickness related traits in two recombinant inbred line populations(RILs)in rice(OryzasativaL.)[J]. Journal of Integrative Agriculture,2016,15(11):2437-2450.

[6] Bai X,Luo L,Yan W,et al. Genetic dissection of rice grain shape using a recombinant inbred line population derived from two contrasting parents and fine mapping a pleiotropic quantitative trait locusqGL7[J]. BMC Genetics,2010,11(1):16.

[7] Fan C,Xing Y,Mao H,et al.GS3,a major QTL for grain length and weight and minor QTL for grain width and thickness in rice,encodes a putative transmembrane protein[J].Theoretical and Applied Genetics,2006,112(6):1164-1171.

[8] Weng J,Gu S,Wan X,et al. Isolation and initial characterization ofGW5,a major QTL associated with rice grain width and weight[J]. Cell Research,2008,18(12):1199-1209.

[9] 黎毛毛,徐 磊,任軍芳,等. 粳稻粒形性狀的數(shù)量性狀基因座檢測(cè)[J]. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2009,42(7):2255-2261.

[10] 劉 進(jìn),李 清,張 宇,等. 不同年份水稻粒形性狀的QTL分析[J]. 核農(nóng)學(xué)報(bào),2014,28(12):2153-2158.

[11] Wang J K,Li H H,Zhang L Y,et al. Users′manual of QTL IciMapping V4[EB/OL],2014.

[12] McCouch S R,Cho Y G,Yano M,et al. Report on QTL nomenclature[J]. Rice Genet Newslett,1997,14:11-13.

[13] 李興星,鄭 劍,周軍杰,等. 粳稻資源熱粳35重要農(nóng)藝性狀的QTLs定位[J]. 植物生理學(xué)報(bào),2016,52(8):1176-1190.

[14] Segami S,Yamamoto T,Oki K,et al. Detection of novel QTLs regulating grain size in Extra-large grain rice (OryzasativaL.) lines[J]. Rice,2016,9:34.

[15] 王 軍,朱金燕,周 勇,等. 基于染色體單片段代換系的水稻粒形QTL定位[J]. 作物學(xué)報(bào),2013,39(4):617-625.

[16] 周立軍,江 玲,劉 喜,等. 水稻千粒重和堊白粒率的QTL 及其互作分析[J]. 作物學(xué)報(bào),2009,35(2):255-261.

例4是少年閏土對(duì)“我”說的話。井上紅梅選用了日語(yǔ)的敬體表達(dá),難免有些不妥。因?yàn)樯倌陼r(shí)的閏土和“我”年齡尚小,還不懂得身份尊卑。井上紅梅將其譯得如此恭敬謙卑,明顯和少年閏土的形象不符。難以和下文30年后的閏土對(duì)“我”畢恭畢敬,形成鮮明對(duì)比。而竹內(nèi)好譯運(yùn)用了簡(jiǎn)單口語(yǔ)化的表達(dá),突出了少年閏土的天真,不拘世俗。所以筆者認(rèn)為竹內(nèi)好的翻譯更能表達(dá)原文內(nèi)容,給目的語(yǔ)讀者帶去的感受更接近原文給中國(guó)的讀者帶來的感受。

[17] 高志強(qiáng),占小登,梁永書,等. 水稻粒形性狀的遺傳及相關(guān)基因定位與克隆研究進(jìn)展[J]. 遺傳,2011,33(4):314-321.

[18] Sun L,Ma D P,Yu H H,et al. Identification of quantitative trait loci for grain size and the contributions of major grain-size QTLs to grain weight in rice[J]. Molecular Breeding,2013,31(2):451-461.

[19] 李生強(qiáng),崔國(guó)昆,關(guān)成冉,等. 基于水稻單片段代換系的粒形QTL定位[J]. 中國(guó)水稻科學(xué),2011,25(2):163-168.

[20] 高方遠(yuǎn),羅正良,任鄄勝,等. 水稻粒厚主效位點(diǎn)qGT8精細(xì)定位和候選基因分析[J]. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué),2015,48(24):4859-4871.

[21] 劉 丹,王嘉宇,柴永山,等. 利用秈粳交RILs群體的水稻粒形QTLs定位[J]. 沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2015,46(4):385-390.

[22] 王松鳳,李 輝,劉 喜,等. 水稻粒形相關(guān)性狀及千粒重QTL的穩(wěn)定性分析[J]. 南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào),2008,31(3):1-7.

[23] Oh J M,Balkunde S,Yang P,et al. Fine mapping of grain weight QTL,tgw11 using near isogenic lines from a cross betweenOryzasativaandO.grandiglumis[J]. Genes Genomics,2011,33(3):259-265.

[25] Xie X B,Song M H,Jin F X,et al. Fine mapping of a grain weight quantitative trait locus on rice chromosome 8 using near-isogenic lines derived from a cross betweenOryzasativaandOryzarufpogon[J]. Theoretical and Applied Genetics,2006,113(5):885-894.

[26] 佘 東,劉強(qiáng)明,李大露,等. 利用Ⅱ-32B/A7444組合CSSL群體定位水稻7個(gè)穗部性狀QTL[J]. 作物學(xué)報(bào),2017,43(5):658-668.

[27] 方先文,張?jiān)戚x,肖西林,等. 基于重組自交系群體的水稻粒形QTL定位[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào),2017,33(2):241-247.

[28] 葉乃忠,曾 蓋,唐 偉,等. 日本晴/R1126水稻重組自交系群體粒形性狀 QTL 定位[J]. 華北農(nóng)學(xué)報(bào),2016,31(1):90-95.

[29] Fang N,Xu R,Huang L J,et al. Small grain 11 controls grain size,grain number and grain yield in rice[J]. Rice,2016,9:64.

[30] 汪玉瓊,楊窯龍,冷語(yǔ)佳,等. 水稻小?;騍G10的鑒定和精細(xì)定位[J]. 中國(guó)水稻科學(xué),2017,31(6):580-589.

[31] Sun L,Li X,F(xiàn)u Y,et al.GS6,a member of the GRAS gene family,negatively regulates grain size in rice[J]. Journal of Integrative Plant Biology,2013,55(10):938-949.

[32] Wan X Y,Wan J M,Jiang L,et al. QTL analysis for rice grain length and fine mapping of an identified QTL with stable and major effects[J]. Theoretical and Applied Genetics,2006,112(7):1258-1270.

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