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先天性手足分裂畸形的分子遺傳學(xué)及基因診斷研究進(jìn)展

2018-04-09 03:25陳政升陳瓅石文暘許彥王斌韓剛
組織工程與重建外科雜志 2018年1期
關(guān)鍵詞:染色體畸形位點(diǎn)

陳政升 陳瓅 石文暘 許彥 王斌 韓剛

手足分裂畸形(Split-hand/foot m alformation,SHFM)是一種主要影響手/足中心線發(fā)育的先天性畸形。其發(fā)病率約為1/18 000,占所有四肢畸形的8%~17%。手足分裂畸形臨床表現(xiàn)多樣,包括中央列單指發(fā)育不全(圖1),中央列多個(gè)手指的分化發(fā)育異?;蛉笔В▓D2),最嚴(yán)重的是先天性單指,其典型特征是肢端中央列和橈側(cè)列均發(fā)育不全(圖3)。

四肢由胚胎肢芽發(fā)育而來(lái)。肢芽包括兩層細(xì)胞:外胚層細(xì)胞及其包裹的快速增殖的間充質(zhì)細(xì)胞。三個(gè)特定區(qū)域細(xì)胞產(chǎn)生信號(hào)分子調(diào)節(jié)肢芽形成,分別是頂端外胚層嵴(Apical ectodermal ridge,AER),增生區(qū)(Progress zone,PZ)和極性活化區(qū)(Zone of polarizing activity,ZPA),相互作用并從三個(gè)空間維度(遠(yuǎn)近軸、前后軸、腹背軸)決定了肢體的形態(tài)。成纖維細(xì)胞生長(zhǎng)因子(FGFs)、骨形成蛋白(BMPs)及 AER產(chǎn)生的WNT和MSX等信號(hào)分子和轉(zhuǎn)錄因子,將相鄰的間充質(zhì)細(xì)胞維持在持續(xù)增殖和未分化的狀態(tài),從而形成了PZ[1]。PZ的持續(xù)增殖細(xì)胞決定了肢芽的遠(yuǎn)近軸極性。如果AER和PZ無(wú)法維持,則會(huì)影響到遠(yuǎn)端的形成,引起手足分裂畸形。

手足分裂畸形多為散發(fā)。家族性手足分裂畸形大部分按照常染色體顯性的模式遺傳,也發(fā)現(xiàn)過(guò)其他遺傳形式。手足分裂畸形可作為一個(gè)獨(dú)立的病癥出現(xiàn),也可與其他的先天畸形合并發(fā)生,如唇腭裂、外胚層發(fā)育不良/遲緩及精神遲滯等。最常見(jiàn)的手足分裂畸形相關(guān)綜合征有EEC綜合征、LMS綜合征、EEM綜合征、ADULT綜合征和DLDMS綜合征等。除遺傳因素外,環(huán)境因素(如AER中發(fā)生的細(xì)胞凋亡等)也可引起手足分裂畸形的發(fā)生。

本文將詳述非綜合征型手足分裂畸形的基因位點(diǎn)及突變形式,探討引起疾病發(fā)生的分子通路和機(jī)制,為基因診斷和遺傳咨詢(xún)提供依據(jù)。

圖1 中央列缺失和發(fā)育不全Fig.1 Defect and dysplasia of central rays

圖2 中央列多個(gè)指列缺失和分化發(fā)育異常Fig.2 Multiple defect of central rays and abnormality of differentiation

圖3 中央列和橈側(cè)列同時(shí)發(fā)育不全Fig.3 Dysplasia of both central and radial rays

1 SHFM1(7q21)(OMIM 183600)

SHFM1由7q21.3-q22.1區(qū)域染色體重排引起,大多是新發(fā)生的突變,也可由常染色體顯性方式遺傳,常伴有較低的外顯率和多樣的表現(xiàn)型。35%的SHFM1患者合并有神經(jīng)性耳聾[2]。該區(qū)域包括一些肢體發(fā)育的相關(guān)基因,如DSS1、DLX5和DLX6等[3-4]。小鼠DSS1同源基因主要在胚胎肢芽間充質(zhì)細(xì)胞表達(dá)。因此,胚胎發(fā)育早期DSS1表達(dá)減少可能與手足分裂畸形的發(fā)生有關(guān)[3]。DLX5和DLX6引起手足分裂畸形的可能性更大。這兩個(gè)基因?qū)儆赪nt信號(hào)通路,對(duì)于肢體的骨骼發(fā)育和形態(tài)發(fā)生都非常重要[5]。這兩個(gè)基因的產(chǎn)物可幫助保持AER細(xì)胞的增殖活性。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)證明,這兩個(gè)基因同時(shí)敲除,可以引起肢體先天畸形[6]。

除單拷貝缺失以外,SHFM1位點(diǎn)染色體易位/倒位或調(diào)節(jié)元件受到破壞,都是引起肢體缺陷的可能機(jī)制。Lo Iacono等[7]發(fā)現(xiàn),DLX蛋白和TP63基因編碼的p63轉(zhuǎn)錄因子在AER中共存,且p63結(jié)合DLX5和DLX6啟動(dòng)子調(diào)控其轉(zhuǎn)錄。p63活性抑制或受到p63控制的調(diào)控元件受到破壞,都會(huì)引起Dlx5/Dlx6表達(dá)的下調(diào)[8]。最近,Shamseldin等[9]對(duì)一個(gè)常染色體隱性遺傳的手足分裂畸形家系展開(kāi)研究,發(fā)現(xiàn)位于同源區(qū)的純合子DLX5錯(cuò)義突變會(huì)引起肢體畸型,證明DLX5在人類(lèi)SHFM1的發(fā)病機(jī)理中的直接參與作用。

2 SHFM2(Xq26)(OMIM 313350)

到目前為止,X連鎖遺傳手足分裂畸形家系的報(bào)道只有一個(gè)[10],即巴基斯坦的一個(gè)近親婚姻家系,其中有36名成員出現(xiàn)完全的手足分裂畸形(33名男性和3名女性),主要表現(xiàn)為手部單指或雙指及典型的分裂足。女性雜合子中約有一半表現(xiàn)出輕微的手和/或足的畸形。核型分析排除了X染色體或常染色體異位。連鎖分析將這個(gè)家系的致病位點(diǎn)定位到Xq26,即SHFM2[11]。兩個(gè)定位在該區(qū)域的基因FGF13和TONDU可能是致病基因,但目前尚未在手足分裂畸形患者中發(fā)現(xiàn)這兩個(gè)基因的編碼突變[12]。

3 SHFM3(10q24)(OMIM 246560)

SHFM3定位在染色體10q24區(qū)域,由長(zhǎng)度為325~570 Kb的亞微觀串聯(lián)重復(fù)導(dǎo)致[13-14]。該位點(diǎn)是手足分裂畸形的最高發(fā)突變(約占20%)[15]。定位于該重復(fù)區(qū)域的基因包括:FBXW4、BTRC、POLL和LBX1。SHFM3以常染色體顯性的方式遺傳,大部分情況下引起非綜合征型典型手足分裂畸形,常伴有肢體內(nèi)側(cè)畸形(如拇指三節(jié)指畸形的或/和復(fù)拇畸形)[16]。

Dac小鼠之前被作為人類(lèi)SHFM3研究的一個(gè)動(dòng)物模型。Dac小鼠帶有中間手指缺失,掌/跖骨發(fā)育不全以及并指的癥狀,以半顯性方式遺傳,即雜合子會(huì)表現(xiàn)出前后肢中間手指的缺失,而純合子則表現(xiàn)出更加嚴(yán)重的先天性單指[17-18]。然而,Dac小鼠致病位點(diǎn)雖位于SHFM3區(qū)域,但并非染色體微重復(fù)引起,不能完全模擬人類(lèi)致病機(jī)制。

SHFM3致病機(jī)制尚不明確。可能的解釋有兩種,其一是FBXW4轉(zhuǎn)錄畸變對(duì)野生型等位基因的顯性有不良影響,其二是別的發(fā)生重復(fù)的基因過(guò)表達(dá)。BTRC作為蛋白質(zhì)泛素化因子,存在于許多信號(hào)傳導(dǎo)通路中(如Wnt/β聯(lián)蛋白、SHH和NF-κB)[19]。這些通路都與肢體發(fā)育有關(guān),因此BTRC的表達(dá)失調(diào)可能與SHFM3顯性有量效關(guān)系[13]。

4 SHFM4(3q27;TP63)(OMIM 605289)

SHFM4定位在3q27區(qū)域,并與TP63基因的突變直接相關(guān)[20]。該位點(diǎn)是唯一的常染色體顯性遺傳的單基因致病位點(diǎn)。TP63基因編碼一種轉(zhuǎn)錄因子,通過(guò)維持外胚層細(xì)胞增殖,調(diào)節(jié)肢芽頂端外胚層脊的形成與分化[21-22]。缺少p63蛋白小鼠無(wú)法形成正常的外胚層結(jié)構(gòu),表現(xiàn)出皮膚、頭發(fā)、牙齒、顱面骨骼、乳腺和肢體的發(fā)育缺陷,例如分裂手或無(wú)肢[21-22]。這些小鼠的肢芽由于沒(méi)有完整頂端外胚層脊,會(huì)出現(xiàn)個(gè)體無(wú)肢現(xiàn)象,這說(shuō)明p63蛋白對(duì)該結(jié)構(gòu)的發(fā)生十分重要[20]。

人類(lèi)的大約10%~16%的散發(fā)型手足分裂畸形由TP63變異所導(dǎo)致;另外,93%的EEC綜合征(肢體發(fā)育不良為主要癥狀之一)患者的該基因也發(fā)生了突變,說(shuō)明這一位點(diǎn)突變?cè)谙嚓P(guān)疾病中的具有重要作用[13,23]。

5 SHFM5(2q31)(OMIM 606708)

在一些手足分裂畸形(包括單指/趾畸形)的患者中發(fā)現(xiàn)了2q31染色體區(qū)域的缺失,這個(gè)區(qū)域中包含了整個(gè)HOXD基因群(HOXD1-HOXD13)[24-26]。 Goodman 等[27]報(bào)道了兩個(gè)患有肢體發(fā)育不良病例的家系。第一個(gè)家系中,父親和女兒都帶有 HOXD基因 5'端缺失 (HOXD9-HOXD13),并且HOXD13上游只延伸出包括EVX2基因在內(nèi)的85 Kb區(qū)域,引發(fā)并多指畸形(SPD)。第二個(gè)家系中,先證者患有雙側(cè)分裂足畸形,2q31-q33區(qū)域缺失,包括完整的HOXD基因群(HOXD1-HOXD13)、EVX2、DLX1 和 DLX2,一直到微衛(wèi)星標(biāo)記D2S294(位置在離EVX2大約5 Mb遠(yuǎn)處)。因此,與EVX2相連的5'端HOXD基因的單倍體不足造成并多指畸形,但不會(huì)造成手足分裂畸形;而位于該區(qū)域內(nèi)的DLX1和DLX2這兩個(gè)基因是分裂手可能的候選基因,這兩個(gè)基因也都在頂外胚層脊和發(fā)育區(qū)域中表達(dá)。然而,不論是純合子和雜合子的Dlx1/Dlx2單敲除小鼠,還是Dlx1-/Dlx2-雙敲除小鼠,都未發(fā)生肢體發(fā)育不良[28]。因此,其在手足分裂畸形中的作用尚不明確。

6 SHFM6(12q13;WNT10B)(OMIM 225300)

SHFM6由WNT10B基因純合突變導(dǎo)致。WNT蛋白是多個(gè)信號(hào)通路配體,在肢體的形態(tài)發(fā)生和發(fā)育中起主要作用,調(diào)控了肌肉、肌腱、骨骼等結(jié)構(gòu)的位置與形態(tài)[29]。

Uhur等[30]發(fā)現(xiàn),在Yurkish這個(gè)近親家庭中所有受影響的個(gè)體都攜帶有一個(gè)純合的錯(cuò)義突變(p.R332W)。在另一個(gè)常染色體隱性遺傳的手足分裂畸形的報(bào)道中,一位瑞士患者WNT10B上有一個(gè)純合的4 bp的重復(fù)(c.458dupAGCA)[31]。

其余報(bào)道中的家系分別出現(xiàn)了WNT10B基因的純合無(wú)義突變(p.T329R)、4 bp 長(zhǎng)度的缺失(c.1165delAAGT)和 7 bp長(zhǎng)度的重復(fù)(c.300dupAGGGCGG)。這些家庭是來(lái)自巴基斯坦的4個(gè)近親婚姻的家庭。因此,SHFM6遺傳咨詢(xún)應(yīng)注重近親婚姻導(dǎo)致的常染色體隱形遺傳疾病的高發(fā)[32-33]。

7 其他SHFM位點(diǎn)

伴長(zhǎng)骨缺損的手足分裂畸形(SHFLD)一般影響脛骨和腓骨,常伴隨17p13.3區(qū)域的重復(fù);另有12%不涉及長(zhǎng)骨的手足分裂畸形由17p13.3區(qū)域的重復(fù)所導(dǎo)致。首次報(bào)道的病例是一個(gè)巴西家族,該家族SHFLD綜合征的致病位點(diǎn)被定位到了17p13.1-p13.3的841 Kb的區(qū)段。Lezirovitz等[34]將這一區(qū)段縮小到BHLHA9單個(gè)基因,發(fā)現(xiàn)是由該區(qū)段重復(fù)所致。動(dòng)物實(shí)驗(yàn)確定了這一基因在肢體發(fā)育中的功能[15]。與17p13.3區(qū)域相關(guān)的SHFLD呈現(xiàn)出了明顯的與性別相關(guān)的外顯率降低,大約50%的該區(qū)段復(fù)制攜帶者(尤其是女性)未受影響,可能的解釋是X染色體上的激素相關(guān)元件或調(diào)節(jié)器因子與17p13.3重復(fù)的共同作用,導(dǎo)致了SHFLD的發(fā)生[15]。

Aten等[35]報(bào)道了一個(gè)散發(fā)的男性病例,可能由19p13.11染色體區(qū)域上的長(zhǎng)度為1 Mb的缺失所導(dǎo)致,該區(qū)段中EPS15L1基因可能是致病基因。EPS15L1蛋白作為底物參與酪氨酸激酶在上皮生長(zhǎng)因子受體中的活動(dòng),從而與肢體生長(zhǎng)相關(guān)聯(lián)[36]。Bens等[37]在一個(gè)患者身上檢測(cè)到一個(gè)與上述拷貝區(qū)域部分重合的新型缺失,在一定程度證實(shí)了EPS15L1基因是手足分裂畸形的可能基因。

8 診斷與遺傳咨詢(xún)

對(duì)手足分裂畸形患者的診斷,需要結(jié)合細(xì)致的臨床檢查和相關(guān)的基因/分子檢查。

如上所述,手足分裂畸形最主要的遺傳方式是常染色體顯性遺傳[4]、常染色 體 隱形遺傳[9,31,33,38]和 X 染 色 體連鎖的 遺傳[10]。散發(fā)型手足分裂畸形可能來(lái)自于新發(fā)生的突變,在這種突變中,先證者的兄弟姐妹的再顯率很低,但子女再顯率很高,可達(dá)30%~50%[31]??紤]到較低的外顯率、多樣的表型、非孟德拉遺傳、偏分離和性別偏倚[15],還有從患病父親到兒子的基因選擇性傳遞[39],都導(dǎo)致手足分裂畸形的家族性遺傳和散發(fā)病例的遺傳咨詢(xún)變得十分困難且具有挑戰(zhàn)性。許多手足分裂畸形由復(fù)雜基因突變/染色體畸變的組合導(dǎo)致,是雙基因甚至是多基因的障礙,更增加了診斷與基因咨詢(xún)的困難。因此,手足分裂畸形的遺傳咨詢(xún)必須建立在相關(guān)基因的檢測(cè)上,才能提供有效信息且足夠可信。但是,即便患者接受了全部可能致病基因檢測(cè),仍可能有基因的缺陷未被了解,這些患者的再顯率無(wú)法被準(zhǔn)確判斷,只能通過(guò)經(jīng)驗(yàn)進(jìn)行預(yù)測(cè)。

基因檢測(cè)的順序可由基因突變出現(xiàn)頻率決定。目前,最大的分裂手足患者實(shí)驗(yàn)群體有56例病例,其中出現(xiàn)最頻繁的基因突變/染色體畸變是 10q24.3(SHFM3)和 17p13.3(SHFM/SHFLD)的亞微觀重復(fù),分別占20%和16%[15]。在這一發(fā)現(xiàn)的基礎(chǔ)上,Sowinska-Seidler等[40]提出手足分裂畸形基因檢測(cè)可以從10q24和17p13.3的拷貝數(shù)變異檢測(cè)開(kāi)始。aCGH作為這一檢測(cè)的工具,不僅能檢測(cè)出上述變化,而且能檢測(cè)出其他的非平衡染色體畸變,例如影響到不同區(qū)域的亞顯微重組(如SHFM1和SHFM5)。此外,aCGH在全部的手足分裂畸形突變位點(diǎn)的檢測(cè)也可以被數(shù)量檢測(cè) (例如MLPA和qPCR)替代[6]。另一個(gè)重要的分裂手足畸形患者的基因診斷方法是TP63基因的測(cè)序。該基因的點(diǎn)突變?cè)斐傻纳l(fā)型手足分裂畸形占散發(fā)型總病例的10%~16%,且出現(xiàn)新型突變的概率較高。這一突變?cè)斐傻幕尉哂袠O高的外顯率,但是表達(dá)較為多樣[13]。由于一些手足分裂畸形由較大的染色體畸變?cè)斐?,常?guī)的染色體核型檢測(cè)就足夠作出診斷,例如7q21-q22(SHFM1)區(qū)域[31]的缺失或轉(zhuǎn)位[3,4,41]或者 2q31 區(qū)域(SHFM5)的缺失[27,38]。因此,傳統(tǒng)的GTG條帶檢測(cè)可用于aCGH之后,主要檢測(cè)SHFM1和SHFM5位置上的突變,尤其是在SHFM5中常見(jiàn)的合并其他先天異?;蛘呔襁t滯的情況下[41]。而其他已報(bào)道的散發(fā)性的分裂手足病例 (除小部分的SHFM3)的染色體核型均正常。相對(duì)于aCGH而言,染色體核型分析的重要優(yōu)點(diǎn)是可以檢測(cè)出染色體的平衡重組 (如在SHFM1中較為少見(jiàn)的易位),且費(fèi)用較低,因此仍有較大的利用價(jià)值。

SHFM6區(qū)域包含了WNT10B基因[30],其變異以常染色體隱形的方式遺傳,多為純合子致病或WNT10B的組合雜合子致病。此外,常染色體隱性遺傳的家族型手足分裂畸形,還可由DLX5基因同源域變異的純合子導(dǎo)致[9]。在隱性遺傳的模型中,先證者的兄弟姐妹的再顯率為25%,而除非是近親婚姻,否則子女再顯率極低[31]。因此,常染色體隱性遺傳的手足分裂畸形十分少見(jiàn),主要出現(xiàn)在近親婚姻的家庭中。在診斷的最后可以考慮WNT10B和DLX5基因的測(cè)序。在排除了上述所有已知的可能選項(xiàng)后,基因診斷(如全基因組測(cè)序/全外顯子測(cè)序)為一些還未確診的病例提供了確認(rèn)機(jī)會(huì),從而幫助發(fā)現(xiàn)新的手足分裂畸形變異位點(diǎn)(圖4)[40]。

圖4 基因診斷流程Fig.4 Diagnostic flow-chart of genetic diagnostics

包括aCGH在內(nèi)的分子診斷技術(shù)的發(fā)展與應(yīng)用,使包含手足分裂畸形在內(nèi)的四肢畸形遺傳診斷有了長(zhǎng)足進(jìn)步。確定具體致病基因可以讓患者理解疾病原因,并且提供預(yù)防或支持措施,為風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估建立堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ),讓相關(guān)家庭能進(jìn)行生育前或移植前的診斷。

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作者聲明

本人作為通訊作者在《組織工程與重建外科》雜志2016年第3期上發(fā)表的《淋巴管內(nèi)皮細(xì)胞標(biāo)志物的研究進(jìn)展》一文,和在2016年第6期上發(fā)表的《改良小鼠后肢淋巴水腫模型的構(gòu)建》一文,均受?chē)?guó)家自然科學(xué)基金資助,項(xiàng)目編號(hào)為81371700和81501571。

特此聲明。

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