2015年11月，23位生物學(xué)頂級科學(xué)家策劃了一個(gè)生物學(xué)領(lǐng)域的登月計(jì)劃，地球生物基因組計(jì)劃（Earth BioGenome Project，EBP），旨在用10年時(shí)間對地球上所有真核生物（約150萬種物種）進(jìn)行測序、分類和表征，估計(jì)耗資高達(dá)47億美元。2018年4月24日，24位跨學(xué)科科學(xué)家組成的工作小組在PNAS期刊發(fā)文概述對EBP的科研展望。

十年路線圖

EBP計(jì)劃分三個(gè)階段完成。第一階段（3年），在每個(gè)科（總計(jì)約9300個(gè)）中至少詳細(xì)解讀一個(gè)代表性成員的基因組序列；第二階段（3年），在每個(gè)屬（總計(jì)約15萬個(gè)）中選一個(gè)物種進(jìn)行較為粗略的測序；第三階段（4年），完成對剩下物種的粗略測序。

機(jī)遇與挑戰(zhàn)

樣品采集：制定憑證標(biāo)本收集的全球戰(zhàn)略、完整保存標(biāo)本以進(jìn)行高質(zhì)量的基因組組裝是目前面臨的主要挑戰(zhàn)。這需要博物館、植物園、動物園和水族館等以實(shí)現(xiàn)和保護(hù)生物多樣性為使命的機(jī)構(gòu)積極參與。

運(yùn)算和數(shù)據(jù)科學(xué)：存儲序列數(shù)據(jù)、組裝基因組序列、將相關(guān)物種的基因組與注釋對應(yīng)起來等相關(guān)的運(yùn)算挑戰(zhàn)已解決；目前學(xué)術(shù)超算機(jī)中心已接近后期所需運(yùn)行規(guī)模，但在效率、準(zhǔn)確性和應(yīng)用于復(fù)雜基因組方面有待進(jìn)一步改良；新的計(jì)算工具和分析方法也需要新的架構(gòu)、算法和軟件等來提高質(zhì)量、效率，降低成本，并實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)分析、大數(shù)據(jù)可視化和數(shù)據(jù)共享等。

信息獲取和利用共享：為確保遺傳資源的合理記錄和共享惠益的合規(guī)獲取，EBP將促進(jìn)基因和基因組資源利用的下游監(jiān)控和追蹤，并為滿足國家和國際層面的需求，開發(fā)獲取和惠益共享承諾的相關(guān)系統(tǒng)。

丁陳君（中國科學(xué)院成都文獻(xiàn)情報(bào)中心）編譯自

http：//www.pnas.org/content/115/17/4325

原文標(biāo)題：Earth BioGenome Project：Sequencing life for the future of life