高潔 嚴(yán)敏 付婷 邵中軍
丙型肝炎是臨床工作中比較常見(jiàn)的一類(lèi)傳染病,該病主要是由丙型肝炎病毒感染通過(guò)人體的免疫途徑引起正常肝臟細(xì)胞的破壞導(dǎo)致的[1]。丙肝可以通過(guò)血液以及體液等多種方式在人群中間傳播,臨床癥狀有發(fā)熱、惡心、嘔吐等。該病如果不及時(shí)治療,易進(jìn)展為肝硬化甚至導(dǎo)致患者罹患肝癌[2],因此,如何對(duì)丙肝進(jìn)行科學(xué)準(zhǔn)確的診斷成為臨床研究的重點(diǎn)與熱點(diǎn)。根據(jù)現(xiàn)有的技術(shù)與研究,目前主要通過(guò)檢測(cè)致病病毒(HCV)RNA的含量進(jìn)行丙肝的特異性檢測(cè)。該方法科學(xué)準(zhǔn)確,能夠很好的診斷丙型肝炎。提取病毒的RNA有多重方式可以選擇,出于經(jīng)濟(jì)以及可行性等多方面的綜合考慮,臨床主要采取氯仿—異丙醇法以及核酸分離柱兩種方法對(duì)丙型肝炎病毒的RNA進(jìn)行提取[3]。為了研究?jī)煞N提取方法臨床價(jià)值的差異,為臨床工作提供選擇依據(jù),本研究利用治療的110例患者的樣本采用熒光定量PCR的方法對(duì)兩種提取RNA的方法進(jìn)行檢測(cè),具體報(bào)道如下。
選取在2016年9月—2017年9月乙肝防治示范區(qū)醫(yī)院門(mén)診診斷的患有丙型肝炎患者的血清樣本110份進(jìn)行觀察研究。所有提供血清的患者年齡19~63歲,平均年齡(32.12±2.10)歲,按照隨機(jī)化的原則把這些血清樣本分為實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組,保證兩組樣本數(shù)相同。其中實(shí)驗(yàn)組樣本數(shù)55份,樣本提供者女性有20例,男性35例,提供者年齡26~68歲,平均年齡(44.42±3.18)歲;對(duì)照組樣本數(shù)55份,樣本提供者女性有23例,男性32例,提供者年齡27~67歲,平均年齡(45.33±2.97)歲,兩組樣本間對(duì)比,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P>0.05,可比較。
本次研究使用的熒光定量PCR儀器使用的是美國(guó)AB公司的ABI 7500 FAST分析儀。兩種不用的提取方法使用的試劑(提取劑、擴(kuò)增劑)全都購(gòu)買(mǎi)于天根生化科技(北京)有限公司,生化試劑采購(gòu)自Sigma-Aldrich中國(guó)公司。
(1)實(shí)驗(yàn)組血清樣本采用核酸分離柱的方法進(jìn)行RNA的提取。①離心管內(nèi)放入RNA酶的抑制劑,防止RNA被分解[4]。抑制劑的用量選擇20 μl,在同一離心管內(nèi)加入血清標(biāo)本和標(biāo)準(zhǔn)品,同時(shí)放入用于幫助RNA凝結(jié)沉淀的裂解液,該溶劑用量為100 μl,輕柔地把以上溶劑混勻[5],然后進(jìn)行加熱處理,時(shí)間為10分鐘,加熱溫度選擇70℃,對(duì)加熱過(guò)的溶劑離心,時(shí)間5~6秒。將無(wú)水乙醇放入離心管內(nèi),同樣輕柔地?fù)u晃混勻,乙醇用量為110 μl;②以上操作完成后,把離心管內(nèi)物質(zhì)轉(zhuǎn)移入提取柱中,使用裝置的負(fù)壓功能將液體和沉淀分開(kāi),去除液體。然后使用A和B洗滌液對(duì)沉淀進(jìn)行洗滌,洗滌液用量采用500 μl;③操作完成后把提取柱取出,放入離心管中,轉(zhuǎn)速選擇14 000轉(zhuǎn),離心1分鐘。離心完成后再次將其置入新的離心管,向其中加入洗脫液,量為50 μl,加樣的時(shí)候注意應(yīng)置于膜的中央位置,安靜放置1分鐘后,用10 000轉(zhuǎn)的速度進(jìn)行離心,再次加入洗脫液12.5 μl,接著按照熒光定量PCR的操作步驟進(jìn)行RNA的檢測(cè),分析本方法提取RNA的效率以及重復(fù)性。(2)對(duì)照組樣本選擇氯仿-異丙醇的方法對(duì)RNA進(jìn)行提取。①離心管內(nèi)放入裂解液,該溶劑用量為100 μl,在同一離心管內(nèi)加入血清標(biāo)本和標(biāo)準(zhǔn)品,輕柔地用滅過(guò)菌的吸頭把以上溶劑混勻,向其中加入氯仿50 μl,混勻離心。②在另一個(gè)干凈的離心管中加入異丙醇,加入上一步離心產(chǎn)生的上清液,混勻后用13 000 r/min的速度進(jìn)行離心,時(shí)間為15分鐘。棄上清后再次離心,加入DEPC后選擇2 000轉(zhuǎn)的速度離心5分鐘,之后采用PCR進(jìn)行提取結(jié)果的檢測(cè)。
檢測(cè)兩種提取方法提取RNA的效率以及重復(fù)性。
數(shù)據(jù)用SPSS19.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行處理,計(jì)量資料用(x-±s)表示,采用t檢驗(yàn),計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn),P<0.05,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
用PCR方法檢測(cè)兩組提取RNA的效率(HCV RNA濃度高于1.0×103copies/ml可以檢測(cè)到RNA),兩組樣本比較,實(shí)驗(yàn)組樣本提取效率更高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.05。見(jiàn)表1。
表1 提取效率的比較[n(%)]
取同一份樣本用兩種不同的方法連續(xù)提取10次RNA,計(jì)算RNA含量的對(duì)數(shù)值以及10次提取的變異系數(shù)。結(jié)果顯示,實(shí)驗(yàn)組患者為7.82,變異系數(shù)為16.93%;對(duì)照組患者RNA定量為6.79,變異系數(shù)為38.64%。實(shí)驗(yàn)組患者的變異系數(shù)小于對(duì)照組,重復(fù)性高。
丙型肝炎危害大,并發(fā)癥嚴(yán)重,如果不及時(shí)診斷易形成肝硬化,威脅患者的生命健康安全,因此,該病受到臨床的較大重視。研究證明,檢測(cè)丙型肝炎的RNA是一種高效的特異性檢測(cè)方法,可做出明確的診斷[6-7]。檢測(cè)RNA大多采用臨床最新提出的PCR方法,該方法科學(xué)嚴(yán)謹(jǐn),操作過(guò)程不易受到其他因素的干擾或者污染,可以精確地檢測(cè)出送檢血清中是否含有丙型肝炎病毒的RNA并測(cè)量出其具體數(shù)值;而且PCR檢測(cè)結(jié)果測(cè)定較迅速,節(jié)約時(shí)間,過(guò)程也比較簡(jiǎn)便,易于在臨床推廣和普及[8]。
本研究使用的熒光定量PCR的檢測(cè)技術(shù)采用事先提取出的病毒RNA進(jìn)行擴(kuò)增培養(yǎng),可以對(duì)其RNA做出精確的檢測(cè),已經(jīng)成為臨床的常用檢測(cè)手段。在進(jìn)行PCR檢測(cè)前,首先需要提取出病毒的一部分RNA作為檢測(cè)擴(kuò)增的模板,而病毒RNA的提取方式有多種,本次研究選取了最常用的兩種,即核酸提取柱的方法以及氯仿—異丙醇提取方式。相關(guān)資料顯示,前一種方式的提取效率以及重復(fù)性更高。筆者分析認(rèn)為,核酸提取柱的方法有這些優(yōu)點(diǎn)主要與以下原因有關(guān):(1)該方法在提取過(guò)程中需要加入RNA酶的抑制劑,可以有效地降低RNA分解酶的活性,減少RNA的降解,提高了RNA在標(biāo)本血清中的濃度。(2)氯仿—異丙醇提取方法操作更加繁瑣,操作步驟較提取柱的方式更多,需要多次離心與更換離心管,在多次的震蕩離心過(guò)程中,極易造成RNA的丟失與降解,使最終的提取濃度過(guò)低而無(wú)法檢測(cè)。(3)提取柱提取方法加入的裂解液中含有幫助RNA凝聚沉淀的助沉劑,可以促進(jìn)RNA凝聚成固態(tài)物質(zhì)并吸附在提取柱中的吸附膜上,有利于減少RNA的丟失,增加提取RNA的量。本次研究中,采用核酸提取柱的方式提取RNA的實(shí)驗(yàn)組血清標(biāo)本,RNA的提取效率高于對(duì)照組,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,P<0.05;實(shí)驗(yàn)組患者也具有更高的重復(fù)性,P<0.05。這些實(shí)驗(yàn)結(jié)果佐證了以上的分析。
綜上所述,使用熒光定量PCR的方法可以比較好的比較氯仿—異丙醇以及核酸提取柱對(duì)HCV RNA提取的效果差異,核酸提取柱的方式提取RNA效率更高,重復(fù)性更好。
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