吳華莉,涂尾龍,曹建國,都啟晶,常談?dòng)浪?
(1.上海市農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所,上海 201106;2.上海市調(diào)控生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 200241;3.上海種豬工程技術(shù)研究中心,上海 201302;4.青島農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,山東 青島 266109;5.云南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,云南 昆明 650201;6.淮安洪泰良種豬繁育有限公司,江蘇 淮安 223472)
【研究意義】豬肉的品質(zhì)和口感與豬肉的嫩度、風(fēng)味和多汁性相關(guān),而存在于肌纖維束周圍結(jié)締組織中的肌內(nèi)脂肪(IMF)影響著豬肉嫩度。一般認(rèn)為IMF 達(dá)到2 %較為適宜。豬肉IMF的沉積與遺傳變異有關(guān)?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】脂肪酸結(jié)合蛋白家族(FABPs)能夠結(jié)合細(xì)胞內(nèi)的脂肪酸,是運(yùn)輸細(xì)胞內(nèi)脂肪酸最重要的載體,也有研究表明FABPs有可能參與細(xì)胞內(nèi)脂肪酸雙向轉(zhuǎn)運(yùn)過程[1]。心臟型脂肪酸結(jié)合蛋白(heart fatty acid binding protein,H-FABP)是FABPs中的一員。H-FABP基因不僅在各個(gè)組織都有表達(dá),尤其在心肌和骨骼肌細(xì)胞中呈現(xiàn)高表達(dá)[2]。Gerbens等發(fā)現(xiàn)H-FABP基因是調(diào)控豬肉IMF含量的重要候選基因[3]。國內(nèi)學(xué)者發(fā)現(xiàn)H-FABP基因與IMF具有極強(qiáng)的相關(guān)性[4-5]。【本研究切入點(diǎn)】本研究目的在于檢測(cè)H-FABP基因在上海地區(qū)5個(gè)豬群體中的多態(tài)性?!緮M解決的關(guān)鍵問題】以期為上海地區(qū)這5個(gè)豬群肉質(zhì)方面的育種工作提供分子標(biāo)記。
采集組織樣品包括:杜洛克(100頭)、長(zhǎng)白豬(80頭)、大白豬(150頭)來自上海祥欣畜禽有限公司,申農(nóng)豬(80頭)來自上海富民農(nóng)場(chǎng),梅山豬(140頭)來自于上海狀元豬場(chǎng),采集部位為耳組織塊。使用試驗(yàn)試劑Taq酶購于北京康為世紀(jì)生物科技有限公司,HaeШ酶購于寶生物工程有限公司。
1.2.1 DNA提取 采用AXYGEN基因組試劑盒提取組織DNA,測(cè)定DNA濃度,稀釋DNA,使每管濃度達(dá)到30 ng/mL,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2 引物及PCR擴(kuò)增 上游引物:5’-ATTGCTTCGGTGTGTTTGAG-3’;下游引物:5’-TCAGG AATGGGAGTTATTGG-3’[6]。PCR擴(kuò)增條件為: 94 ℃預(yù)變性4 min; 94 ℃變性30 s,58 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共36個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物由1 %瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),要求目的條帶清晰、單一無雜帶,符合條件的PCR產(chǎn)物可以進(jìn)行酶切試驗(yàn),采用1.5 %瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)酶切結(jié)果。
1.2.3 基因型分析 豬H-FABP基因PCR擴(kuò)增片段為816 bp,第2內(nèi)含子區(qū)域存在3處HaeШ酶切位點(diǎn),其中一個(gè)酶切位點(diǎn)存在多態(tài)性,具體的基因型判定標(biāo)準(zhǔn)見表1。根據(jù)瓊脂糖檢測(cè)酶切結(jié)果,不同基因型分別選取3個(gè)樣品進(jìn)行測(cè)序?;蛐团卸〞r(shí)需結(jié)合瓊脂糖檢測(cè)結(jié)果和測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析。
表1 H-FABP基因酶切后基因型判定標(biāo)準(zhǔn)
用瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)酶切結(jié)果,目的條帶大小與預(yù)期一致。圖1顯示,DD型為3條帶,dd型為4條帶,Dd型雜合子為5條帶。根據(jù)電泳檢測(cè)結(jié)果統(tǒng)計(jì)每個(gè)個(gè)體的基因型。
采用PCR-RFLP技術(shù),在5個(gè)豬群體中進(jìn)行H-FABP基因的多態(tài)性檢測(cè)。具體的基因型頻率和等位基因頻率見表2。
由表2可見,H-FABP基因各基因型在5個(gè)豬群體中的分布情況不同:在杜洛克群體中以dd型為主要基因型,有較少的雜合子Dd的基因型和DD基因型,占優(yōu)勢(shì)的是d等位基因;在大白豬群體中占優(yōu)勢(shì)的是Dd基因型,D和d等位基因頻率均勻分布;在申農(nóng)豬群體中檢測(cè)出3種基因型,主要為dd型,d等位基因頻率高于D等位基因頻率;在長(zhǎng)白豬群體中只檢測(cè)出dd基因型;在梅山豬群體中只檢測(cè)出DD基因型。本研究結(jié)果顯示H-FABP基因在杜洛克、大白、申農(nóng)豬群體中檢測(cè)出3種基因型,但在長(zhǎng)白和梅山豬群體中出現(xiàn)偏態(tài)現(xiàn)象。
H-FABP基因不僅參與骨骼肌胞內(nèi)脂肪酸的轉(zhuǎn)運(yùn),并且在脂類代謝方面發(fā)揮重要作用[7]。H-FABP基因突變位點(diǎn)已被證實(shí)和杜洛克*梅山豬、杜洛克、杜洛克*長(zhǎng)白豬的脂肪性狀有關(guān)[8]。有研究表明HaeШ酶切位點(diǎn)產(chǎn)生dd型比DD型的H-FABP基因mRNA表達(dá)量低,比DD型閹豬的背最長(zhǎng)肌IMF高0.24,達(dá)到顯著水平(P<0.05),比DD型母豬的背最長(zhǎng)肌IMF高0.02,影響不顯著[2]。本研究在梅山豬群體內(nèi)只檢測(cè)出DD型,這與已報(bào)道我國地方豬種在此位點(diǎn)缺乏多態(tài)性的研究結(jié)果一致[9-10]。本研究在長(zhǎng)白豬群體內(nèi)只檢測(cè)出dd型,這與林萬華等檢測(cè)H-FABP基因在長(zhǎng)白群體中檢測(cè)出3個(gè)基因型的結(jié)果不同,造成差異的原因①可能與本次樣品都為長(zhǎng)白母豬有關(guān),②采樣豬種來源不同,但以上推論需要進(jìn)一步驗(yàn)證。
圖1 H-FABP基因酶切檢測(cè)Fig.1 Results of H-FABP gene digested by endonuclease
表2 H-FABP基因在5個(gè)豬群體中的基因型頻率和等位基因頻率
此外,研究者發(fā)現(xiàn)H-FABP基因5'上游區(qū)域存在HinfⅠ酶切位點(diǎn)、第2內(nèi)含子區(qū)域存在MspⅠ和HaeⅢ酶切位點(diǎn),這些位點(diǎn)與不同豬種IMF相關(guān)性并不完全一致[11-12]。研究證實(shí)國外豬種3個(gè)酶切位點(diǎn)產(chǎn)生“aa-dd-HH”型與豬高肌內(nèi)脂肪含量相關(guān)。檢測(cè)110 kg體重杜洛克時(shí),發(fā)現(xiàn)dd型的IMF含量較高,而DD型豬背膘較低。H-FABP基因多態(tài)性影響IMF含量變化原因可能在于能更有效的增加脂肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)或者調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)脂肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)的不同[3]。Pang等也證實(shí)dd型脂肪細(xì)胞的沉積能力高于DD型[13]。 Chao等研究證實(shí)DD型個(gè)體瘦肉率高于dd型[14]。本研究檢測(cè)H-FABP基因在dd型在杜洛克、長(zhǎng)白和申農(nóng)豬群體內(nèi)頻率均大于0.5以上,在育種過程中要關(guān)注這3個(gè)豬群體DD型個(gè)體比例,可改善豬肉合適IMF含量。
有學(xué)者研究H-FABP基因的mRNA 表達(dá)水平與蛋白質(zhì)濃度時(shí),發(fā)現(xiàn)兩者之間相關(guān)性較低,說明該基因的表達(dá)調(diào)節(jié)不受轉(zhuǎn)錄調(diào)控,而受翻譯調(diào)控。豬體內(nèi)IMF特性變化與脂肪沉積的生長(zhǎng)周期有關(guān),在豬生長(zhǎng)過程中觀察IMF含量變化,不適當(dāng)?shù)牟杉c(diǎn)監(jiān)測(cè)H-FABP基因mRNA 量和蛋白質(zhì)水平并不能表明IMF的遺傳變異情況,通常選擇脂肪沉積后180 d日齡屠宰測(cè)定[2]。此外,背最長(zhǎng)肌的纖維類型有可能也影響H-FABP基因檢測(cè)結(jié)果[15]。
動(dòng)物育種工作者們關(guān)于H-FABP基因mRNA、蛋白質(zhì)以及不同酶切位點(diǎn)的多態(tài)性分析,目的都是為提高或者降低豬肉IMF,改善豬肉品質(zhì)方面的育種提供輔助遺傳標(biāo)記。本研究的結(jié)果可為5個(gè)豬群體IMF改良提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。尤其在實(shí)際育種過程發(fā)現(xiàn)本實(shí)驗(yàn)室選育“長(zhǎng)白*大白*二花臉”雜交品系申農(nóng)豬的脂肪性狀不理想,這可能與申農(nóng)豬群體中H-FABP基因dd型較多有關(guān),接下來可結(jié)合申農(nóng)豬IMF測(cè)定結(jié)果進(jìn)行相關(guān)分析,期望為該品系肉質(zhì)改良提供有價(jià)值的參考。
本研究對(duì)H-FABP基因第2個(gè)內(nèi)含子區(qū)域HaeШ酶切位點(diǎn)進(jìn)行多態(tài)分析,確定5個(gè)豬群體中該位點(diǎn)的優(yōu)勢(shì)基因型,后續(xù)可結(jié)合IMF性狀進(jìn)一步分析,從而進(jìn)行標(biāo)記輔助育種工作。
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