周雅寧 山東省實(shí)驗(yàn)中學(xué)
乳酸菌的鑒定方法及在食品工業(yè)中的應(yīng)用
周雅寧 山東省實(shí)驗(yàn)中學(xué)
乳酸菌作為一種自然界中普遍存在,對(duì)于食品工業(yè)有巨大利用價(jià)值的菌類,廣泛應(yīng)用于日常乳制品和發(fā)酵食品的生產(chǎn)加工。因此,掌握且正確選擇乳酸菌的鑒定方法就十分必要了。乳酸菌的鑒定方法各有千秋,分別適合于不同的菌種以及不同的操作環(huán)境。因此,我們應(yīng)具體分析其中的利弊,然后擇優(yōu)選取最適合的鑒定方法。
乳酸菌 鑒定方法 食品工業(yè) 應(yīng)用
乳酸菌是指一類能利用糖類發(fā)酵產(chǎn)生大量乳酸的無(wú)芽孢和革蘭氏陽(yáng)性細(xì)菌的總稱。乳酸菌的種群相當(dāng)龐大和繁雜,在自然界當(dāng)中的存在相當(dāng)普遍。乳酸菌屬于菌類當(dāng)中有益而無(wú)害的一種,在日常乳制品和發(fā)酵食品的生產(chǎn)和加工中應(yīng)用非常廣泛。為了能更好的利用乳酸菌,我們就必須掌握高效的乳酸菌的鑒定方法,了解它們的外在形態(tài)特征、生物學(xué)特點(diǎn)以及生理生化和化學(xué)特性,正確區(qū)分相近物種的乳酸菌。
鑒定乳酸菌的傳統(tǒng)方法就是表型特征鑒定法。這種方法主要依據(jù)受鑒定細(xì)菌的菌體以及所屬菌落的形態(tài)特征、生理生化反應(yīng)和代謝產(chǎn)物等方面來(lái)確定乳酸菌的所屬類別,鑒定花費(fèi)相對(duì)較小,目前依然被用作食品工業(yè)乳酸菌應(yīng)用的重要鑒定依據(jù)。然而,表型特征鑒定方法一般只能鑒定到屬的水平,具有很大的局限性。相比之下,為了提高乳酸菌分類的可靠性和重復(fù)性,人們經(jīng)常采用SDS?-PAGE分析乳酸菌整個(gè)細(xì)胞的蛋白質(zhì)的方法,但是此方法較為復(fù)雜,鑒定工作的工作量較大。除了以上的分類方法,技術(shù)人員也可采用薄層層析法分析有機(jī)酸及脂肪酸甲酯等成分,但成功的概率比較低。因此,要想得到理想的乳酸菌的分類結(jié)果,我們可以采用多種表型方法同時(shí)應(yīng)用來(lái)鑒定乳酸菌。
表型法鑒定具有很多優(yōu)點(diǎn),它操作簡(jiǎn)單,不需要配備特殊的鑒定儀器,在不要求精確結(jié)果的情況下具有很大的實(shí)用性;它也具備一定的缺點(diǎn),那就是鑒定的結(jié)果不精確,只能歸屬于某一個(gè)特定的范圍,而且重復(fù)性差。因此,要想獲得較為精確的鑒定結(jié)果,我們可以采用其他的鑒定方法。
近幾十年以來(lái),隨著生物科技的發(fā)展和應(yīng)用,DNA鑒定方法迅速崛起?;蛐丸b定方法主要是借助PCR擴(kuò)增技術(shù)增加目的基因的數(shù)量來(lái)獲取所需信息。技術(shù)人員可以采用不同的基因型方法來(lái)展示不同的分類水平?;蛐丸b定方法的優(yōu)點(diǎn)很多,最突出的一個(gè)就是乳酸菌的鑒定不會(huì)受到培養(yǎng)條件的影響。
隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA技術(shù)可以對(duì)隨機(jī)的引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,從而得到多態(tài)性的DNA片段,技術(shù)人員會(huì)對(duì)這些DNA片段進(jìn)行凝膠電泳分析,最終根據(jù)分析獲取的信息來(lái)判定菌株種類。RAPD鑒定方法具有分辨率高,免于基因測(cè)序等優(yōu)點(diǎn),但也同時(shí)具有重復(fù)性差的鑒定缺陷,另外,人們也很難利用RAPD技術(shù)將乳酸菌鑒定到種的水平。
DGGE/TGGE技術(shù)在研究非單一種群的微生物群體時(shí)具有優(yōu)勢(shì),因此通常被用來(lái)研究結(jié)構(gòu)復(fù)雜的微生物群落和微生物的多樣性。利用這種方法,我們能夠選擇群落中特定的菌落進(jìn)行特異PCR擴(kuò)增,通過(guò)在TGGE/DGGE膠上分離以及解析類群中的細(xì)菌組成來(lái)獲得群體信息。該方法可以實(shí)時(shí)反映整個(gè)發(fā)酵過(guò)程的真實(shí)情況,在食品發(fā)酵生產(chǎn)、食品質(zhì)量和食品安全檢測(cè)中應(yīng)用較廣。
測(cè)定16SrDNA和16SrRNA的序列是鑒定未知細(xì)菌的好方法,也是目前能準(zhǔn)確鑒定乳酸菌的方法之一。該方法需要分為幾個(gè)相接的步驟,首先,我們需要對(duì)待定的乳酸菌的16SrRNA/rDNA進(jìn)行特異性的擴(kuò)增,然后我們?cè)贉y(cè)定該乳酸菌的核苷酸序列,最后再將此序列與已知乳酸菌序列進(jìn)行對(duì)照,從而確定乳酸菌的確切類別。16SrDNA和16SrRNA方法可以將乳酸菌鑒定提升到種水平,鑒定的精確度大幅提高。但是16SrDNA和16SrRNA方法需要一個(gè)時(shí)間較長(zhǎng)的鑒定過(guò)程,鑒定的成本也相對(duì)較高。
核糖體ITS區(qū)的序列測(cè)定是一種非常有效的細(xì)菌鑒定方法,人們經(jīng)常會(huì)把已知的基因庫(kù)數(shù)據(jù)作為參照物,對(duì)比擴(kuò)增后23SrRNA ISR所測(cè)序列來(lái)鑒定乳酸菌的所屬類別。由于內(nèi)操縱子序列可能產(chǎn)生變化,使用16S-23SrRNA間區(qū)方法鑒定的結(jié)果可能存在不準(zhǔn)確性,有時(shí)也會(huì)存在不易鑒別的情況。
FtsZ是一種與真核生物的微管蛋白類似的蛋白質(zhì),在細(xì)胞分裂時(shí)起著決定性作用,常見(jiàn)于細(xì)菌和古菌的結(jié)構(gòu)中。FtsZ具有某種結(jié)構(gòu)特性,它的蛋白質(zhì)系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu),類似于16SrDNA系統(tǒng)樹(shù)的拓?fù)浣Y(jié)構(gòu)。據(jù)研究表明,16SrRNA的分辨率較FtsZ蛋白序列的分辨率低,同時(shí),由于FtsZ也具有GTPase的活性而且氨基酸序列保守,所以FtsZ更適用于乳酸菌種間的系統(tǒng)分類研究和細(xì)菌系統(tǒng)學(xué)研究。
表型特征鑒定微生物的方法相當(dāng)消耗時(shí)間和力氣,而且容易受環(huán)境條件的限制而導(dǎo)致不同的鑒定結(jié)果,也就是說(shuō),表型特征鑒定法具有不穩(wěn)定性。因此研究人員一直在致力于探索鑒定過(guò)程又快又省力、結(jié)果穩(wěn)定又準(zhǔn)確的微生物分類研究方法。雖然目前已經(jīng)存在諸多行之有效的分類方法并廣泛應(yīng)用于食品工業(yè)和食品發(fā)酵的行業(yè),但是沒(méi)有一種鑒定方法可以將所有的乳酸菌都鑒定出來(lái)。這些方法或者鑒定成本低、過(guò)程快速、結(jié)果不精確,或者精確度高、過(guò)程復(fù)雜、價(jià)格高昂,因此,我們?cè)阼b別時(shí)需要綜合考慮各種方法的利弊,選擇最為適當(dāng)?shù)姆椒▉?lái)進(jìn)行乳酸菌種類的鑒定。
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