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測震波形數(shù)據(jù)存儲和管理系統(tǒng)設(shè)計與實現(xiàn)

2017-12-13 06:32彭克銀
中國科技資源導(dǎo)刊 2017年6期
關(guān)鍵詞:臺網(wǎng)臺站波形

郭 凱 彭克銀 雷 蕾

(中國地震臺網(wǎng)中心,北京 100045)

測震波形數(shù)據(jù)存儲和管理系統(tǒng)設(shè)計與實現(xiàn)

郭 凱 彭克銀 雷 蕾

(中國地震臺網(wǎng)中心,北京 100045)

為了解決日益增長的海量測震波形數(shù)據(jù)在存儲和管理方面存在的性能瓶頸問題,基于測震波形數(shù)據(jù)管理的業(yè)務(wù)需求,選取基于Hadoop大數(shù)據(jù)技術(shù)的分布式文件系統(tǒng)HDFS和分布式計算Spark架構(gòu)進行數(shù)據(jù)的存儲和計算,并開發(fā)基于Web的測震波形數(shù)據(jù)存儲和管理系統(tǒng),實現(xiàn)對海量測震波形數(shù)據(jù)的可視化管理和數(shù)據(jù)運行率檢索。

大數(shù)據(jù);Hadoop;測震數(shù)據(jù);分布式存儲;管理系統(tǒng)

1 引言

從1996年起,中國地震局進行了大規(guī)模數(shù)字地震觀測系統(tǒng)建設(shè),已建成由國家地震臺網(wǎng)、區(qū)域地震臺網(wǎng)和流動地震臺網(wǎng)組成的數(shù)字地震觀測系統(tǒng)[1]。中國地震臺網(wǎng)中心承擔(dān)著全國地震監(jiān)測、地震中短期預(yù)測和地震速報以及各類地震監(jiān)測數(shù)據(jù)的匯集、處理與服務(wù)的重要任務(wù)。僅測震波形數(shù)據(jù),現(xiàn)在每年匯集的數(shù)據(jù)量已經(jīng)達到12TB,目前匯集和管理的測震波形數(shù)據(jù)已經(jīng)超過了100TB。

如此海量的數(shù)據(jù),受制于傳統(tǒng)硬件IO、網(wǎng)絡(luò)以及計算性能的限制,如對一年的測震波形數(shù)據(jù)進行遷移和備份,一般需要超過半個月的時間;針對數(shù)據(jù)運行率計算,主要作為評估數(shù)據(jù)質(zhì)量的指標(biāo)之一,需要對每一條記錄的波形數(shù)據(jù)進行讀取、解壓、計算完整性等一系列計算,僅5年的計算結(jié)果就超過2億條記錄,已經(jīng)超過了傳統(tǒng)的MySql數(shù)據(jù)庫的承受范圍,無法使用傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)庫進行管理,時間和效率上已經(jīng)難以滿足現(xiàn)在地震科學(xué)數(shù)據(jù)管理和科研的需求[2]。因此,做好測震波形數(shù)據(jù)的匯集和管理就顯得非常重要。作為目前應(yīng)用最廣泛的開源大數(shù)據(jù)技術(shù),Hadoop采用合理的框架分布存儲和管理數(shù)據(jù),將數(shù)據(jù)和計算資源進行有效的分配,基于集群的性能和數(shù)量,IO和計算能力可以線性增長。在其他領(lǐng)域處理海量數(shù)據(jù)上如醫(yī)學(xué)基因[3]、電子商務(wù)[4-5]、氣象[6]等領(lǐng)域采用基于Hadoop的技術(shù)架構(gòu)均有較好的表現(xiàn)。因此,本文采用基于Hadoop的技術(shù)架構(gòu)作為研發(fā)系統(tǒng)采用的主要技術(shù),實現(xiàn)對測震波形數(shù)據(jù)的匯集、存儲以及數(shù)據(jù)運行率計算。

2 測震波形數(shù)據(jù)的傳輸與匯集

經(jīng)過多年的努力,中國地震局已經(jīng)初步建成了地學(xué)的多學(xué)科、多門類的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)觀測網(wǎng),包括測震、電磁、形變、流體等四大觀測臺網(wǎng)和測線累計長度達15萬公里的流動物理場觀測系統(tǒng)[7]。按照地震科學(xué)數(shù)據(jù)分類,測震波形數(shù)據(jù)屬于大類地震觀測數(shù)據(jù)(D10000)下面中類的測震數(shù)據(jù)(D11000)。測震波形數(shù)據(jù)對于從事地震學(xué)研究的科研人員有著非常重要的意義,無論是進行區(qū)域速度結(jié)構(gòu)、層析成像,還是大震后對地震序列特征等方面開展研究,都需要大量的地震波形數(shù)據(jù)的支持。

從2000年年底開始,中國地震臺網(wǎng)中心接入全國48個測震臺站,到2015年12月,中國地震臺網(wǎng)中心已經(jīng)實時接入了包括國家臺網(wǎng)和區(qū)域臺網(wǎng)共1029個測震臺站。中國地震臺網(wǎng)中心匯集的測震波形數(shù)據(jù)采用國際標(biāo)準(zhǔn)的Miniseed格式,以每個測震臺站24小時的數(shù)據(jù)作為一個文件進行存儲。測震臺站采用了高精度的地震儀進行數(shù)據(jù)采集,一般采樣率在100Hz左右,基于所在地的情況選擇有線如SDH或者3G、4G網(wǎng)等方式將數(shù)據(jù)匯集到臺站所在的省級臺網(wǎng)中心,然后省級臺網(wǎng)中心采用流服務(wù)器的方式將測震波形數(shù)據(jù)匯集到中國地震臺網(wǎng)中心,如圖1所示。

測震波形數(shù)據(jù)最初采用磁帶、光盤、硬盤等方式進行存儲,可是存在數(shù)據(jù)量的急劇增長,使用磁帶、光盤存儲的數(shù)據(jù)隨著時間的推移很難恢復(fù),目前測震所有的數(shù)據(jù)又都匯集在NAS存儲上,且受限于網(wǎng)絡(luò)帶寬以及NAS機頭數(shù)量,傳輸速度難以超過100 M/s等問題。在面對TB級規(guī)模的測震波形數(shù)據(jù),單純采用文件方式存儲,在數(shù)據(jù)匯集的速度、穩(wěn)定性和安全性方面已經(jīng)無法滿足要求。

3 基于Hadoop的大數(shù)據(jù)體系結(jié)構(gòu)及架構(gòu)選擇

Google公司于2003年提出了Google文件系統(tǒng)(GFS)的文件存儲方法。當(dāng)面對TB級或者GB級數(shù)據(jù)規(guī)模時,將所有的文件劃分為若干塊存儲,每塊大小64M,每個數(shù)據(jù)塊在3個數(shù)據(jù)塊服務(wù)器上冗余來保證數(shù)據(jù)的可靠性。2006年,Google公司又提出了面向結(jié)構(gòu)化大數(shù)據(jù)的存儲模型Bigtable。這是一個為管理大規(guī)模結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù)而設(shè)計的分布式存儲系統(tǒng),可以擴展到PB級數(shù)據(jù)和上千臺服務(wù)器。Hadoop開源實現(xiàn)了Google上述技術(shù),具體實現(xiàn)了對應(yīng)的分布式文件系統(tǒng)HDFS和分布式數(shù)據(jù)庫Hbase[8]。

圖1 測震波形數(shù)據(jù)的傳輸與匯集

劉堅等[9]提出一種基于Hbase的地震大數(shù)據(jù)存儲方法,通過搭建測試平臺、Java語言開發(fā)測試程序,結(jié)果表明,Hbase存取地震數(shù)據(jù)耗時更低,在數(shù)據(jù)量較多時,其性能更加顯著;李永紅等[10]基于云計算環(huán)境下海量地震數(shù)據(jù)存儲業(yè)務(wù)需求的分析,采用NoSql數(shù)據(jù)庫替代傳統(tǒng)的Mysql進行數(shù)據(jù)的存儲,采用MapReduce進行計算;王丹寧等[11]將測震波形數(shù)據(jù)解壓后放入HBase進行測震波形數(shù)據(jù)的存儲。從本文前述對地震業(yè)務(wù)的分析數(shù)據(jù)來看,由于測震波形數(shù)據(jù)采用基于文件的方式進行存儲,且數(shù)據(jù)的完整性校驗對于系統(tǒng)的吞吐量要求較高,對每一個數(shù)據(jù)文件都要依次并發(fā)進行檢索,因此本文采用基于HDFS的方式對測震波形數(shù)據(jù)進行存儲。目前開源的分布式計算架構(gòu)主要為MapReduce和Spark,由于MapReduce在Map和Reduce階段產(chǎn)生的數(shù)據(jù)存儲在硬盤上導(dǎo)致計算效率相對較低,而Spark則將中間產(chǎn)生的數(shù)據(jù)放在內(nèi)存中,并采用RDD(Resilient Distributed Datasets,彈性分布式數(shù)據(jù)集)提高計算效率[2,12],所以本文將采用Spark計算架構(gòu)完成測震數(shù)據(jù)的運行率計算。

4 系統(tǒng)設(shè)計與實現(xiàn)

4.1 數(shù)據(jù)存儲

測震波形數(shù)據(jù)文件按照每個臺站的每個測向(一般為BHZ、BHE、BHN)以天為單位進行存儲,采用Miniseed格式。它由512個字節(jié)組成,分為數(shù)據(jù)頭段和數(shù)據(jù)體兩部分。其中,數(shù)據(jù)頭段長度為64字節(jié),包含了該條波形數(shù)據(jù)的屬性,如所屬的臺網(wǎng)、臺站、經(jīng)緯度信息以及波形數(shù)據(jù)產(chǎn)生時間等;數(shù)據(jù)體為448字節(jié)的壓縮過的地震波形數(shù)據(jù),數(shù)據(jù)體中的數(shù)據(jù)根據(jù)Steim2算法進行解壓縮。

采用HDFS存儲測震波形數(shù)據(jù)。首先將測震波形數(shù)據(jù)從NAS、硬盤、光盤等匯集到Hadoop集群的存儲上,HDFS提供了許多Shell命令來實現(xiàn)訪問文件系統(tǒng)的功能,而這些命令構(gòu)建在HDFS File System API之上,通過Shell命令將測震波形數(shù)據(jù)推送到HDFS上,HDFS的Block設(shè)置為256MB。Hadoop提供了基于Web的數(shù)據(jù)顯示界面,匯集到HDFS上的測震波形數(shù)據(jù)如圖2所示。

圖2 測震波形數(shù)據(jù)的在HDFS上的存儲顯示界面

圖3 測震波形數(shù)據(jù)的匯集和管理流程圖

完成數(shù)據(jù)的匯集后,需要對數(shù)據(jù)進行運行率計算,對數(shù)據(jù)進行完整性校驗,這是評估匯集數(shù)據(jù)質(zhì)量的重要參考指標(biāo)之一。測震波形數(shù)據(jù)基于Hadoop技術(shù)的存儲流程如圖3所示。由于入庫的數(shù)據(jù)量較大,為了避免入庫中斷而導(dǎo)致重復(fù)數(shù)據(jù)的入庫情況,還需要對入庫的數(shù)據(jù)提供日志功能,這里采用MySql數(shù)據(jù)庫記錄已經(jīng)入庫的數(shù)據(jù)。

4.2 數(shù)據(jù)運行率計算

基于Hadoop 搭建的集群配置環(huán)境,采用Spark進行測震波形數(shù)據(jù)運行率的分布式計算。計算流程如圖4所示,首先數(shù)據(jù)處理模塊的主線程獲取HDFS上的數(shù)據(jù)目錄集合,并將目錄集合以任務(wù)集的方式提交至計算節(jié)點進行計算。計算數(shù)據(jù)運行率的單位為小時,計算節(jié)點每次取出一天的數(shù)據(jù)進行計算,計算完畢后將解析獲得的臺網(wǎng)代碼、臺站代碼、當(dāng)前小時值以及24個小時的連續(xù)率一起推送到HBASE進行存儲。由于該任務(wù)是基于Hadoop的分布式計算,其效率得到了較大提升。一般地,采用6臺機器構(gòu)成的Hadoop集群計算效率相對單機可以提升6倍[2],,并且該效率將隨著集群規(guī)模的增大呈線性增長。

4.3 系統(tǒng)功能設(shè)計和展示

在完成基于Hadoop技術(shù)的數(shù)據(jù)存儲和運行率計算后,為了及時掌握測震臺網(wǎng)的數(shù)據(jù)匯集狀態(tài),系統(tǒng)提供了以下兩個功能:一是基于Web的展示功能,能夠動態(tài)監(jiān)控臺站、臺網(wǎng)的數(shù)據(jù)傳輸鏈路;二是為有效地了解全國各測震臺站歷史波形數(shù)據(jù)匯集和實時運行情況,能夠以日、月、周、年等方式自動生成測震波形數(shù)據(jù)統(tǒng)計報表,包括運行率、異常臺站等信息。

Web應(yīng)用主要采用了以下技術(shù):前端采用基于HTML5技術(shù)的BootStrap框架,后端采用Spring MVC框架,圖表控件采用Echats,地圖控件采用百度地圖以及Openlayes。如圖5所示,該系統(tǒng)運行界面分為上下兩部分進行展示:在上面部分,左側(cè)以動態(tài)地圖匯聚的形式展現(xiàn)全國各臺站實時的運行狀態(tài),以省級臺網(wǎng)為單位進行數(shù)據(jù)的匯集顯示;右側(cè)展現(xiàn)近一小時內(nèi)全國各臺站連續(xù)率運行率排名,排序方式為連續(xù)率由高到低進行排序。在下面部分,左側(cè)顯示系統(tǒng)的任務(wù)調(diào)度情況;右側(cè)為整體臺網(wǎng)每個小時的連續(xù)運行率情況。

系統(tǒng)提供了按時間范圍查詢統(tǒng)計全國所有臺網(wǎng)、省級臺網(wǎng)以及單個臺站的運行率,基于查詢目標(biāo)在查詢中選擇統(tǒng)計類型為“全部臺網(wǎng)數(shù)據(jù)查詢”“臺網(wǎng)內(nèi)各臺站運行率”“單一臺站運行軌跡”進行統(tǒng)計。統(tǒng)計結(jié)果包括:全國臺網(wǎng)整體運行率,省級臺網(wǎng)的整體運行率,單個臺站的運行率。其中,“單一臺站運行軌跡”統(tǒng)計結(jié)果以陰影圖的形式進行顯示,顯示內(nèi)容為所選臺站的整體運行率的變化狀況,查詢結(jié)果如圖6、圖7、圖8所示。

5 結(jié)論

圖4 測震波形數(shù)據(jù)運行率計算流程圖

圖5 系統(tǒng)運行界面

圖6 系統(tǒng)查詢省級臺網(wǎng)

圖7 省級臺網(wǎng)所屬臺站

圖8 單個臺站的運行率結(jié)果

本文利用大數(shù)據(jù)技術(shù)進行了測震波形數(shù)據(jù)存儲和管理系統(tǒng)設(shè)計與實現(xiàn),取得以下主要成果。

(1)基于Hadoop的HDFS進行了測震波形數(shù)據(jù)的分布式存儲,采用Spark技術(shù)對測震波形數(shù)據(jù)運行率進行計算,計算效率基于集群的數(shù)量可以呈線性增加。

(2)實現(xiàn)了基于Web的測震波形數(shù)據(jù)匯集和管理系統(tǒng),以小時為單位的顆粒度實現(xiàn)對全國測震臺網(wǎng)波形數(shù)據(jù)匯集情況的可視化,實現(xiàn)了對省級臺網(wǎng)、單個臺站波形數(shù)據(jù)運行率的查詢統(tǒng)計。

(3)基于大數(shù)據(jù)技術(shù)的多副本技術(shù),相對于將數(shù)據(jù)放入NAS可以提高數(shù)據(jù)的安全性和完整性,同時在數(shù)據(jù)處理效率上也有了較大的提升,便于對海量測震波形數(shù)據(jù)的管理。

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Design and Implementation of the Seismic Waveform Data Management System

GUO Kai, PENG Keyin, LEI Lei
(China Earthquake Networks Center, Beijing 100045)

In order to solve the performance bottleneck of seismic waveform data of the growing mass in the storage and management,based on the seismic business requirements, use the distributed fi le system of HDFS and distributed computing structure of Spark which based on the Hadoop big data technology to realize data storage and computation, and development of the seismic waveform data storage and management system based on Web, the realization of visualization management with massive seismic waveform data and query for data run rate.

big data, Hadoop, seismic data,distributed storage, management system

P315.73

A

10.3772/j.issn.1674-1544.2017.06.011

郭凱(1986—),男,碩士,中國地震臺網(wǎng)中心工程師,主要研究方向:測震數(shù)據(jù)處理與共享、大數(shù)據(jù)技術(shù)應(yīng)用(通訊作者);彭克銀(1964—),男,博士,中國地震臺網(wǎng)中心數(shù)據(jù)服務(wù)部主任,研究員,主要研究方向:科學(xué)數(shù)據(jù)管理;雷蕾(1983—),女,中國地震臺網(wǎng)中心助理工程師,主要研究方向:地震信息公共服務(wù)。

科技基礎(chǔ)性工作專項重點項目“科技基礎(chǔ)性工作數(shù)據(jù)資料集成與規(guī)范化整編”(2013FY110900);地震行業(yè)科研專項“中國全球地震臺網(wǎng)建設(shè)預(yù)研”(201508007)。

2017年7月14日。

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