張高陽+鄧接樓+柯維忠+黃思齊+李德芳
摘要:干旱是限制植物生長分布和影響作物產(chǎn)量形成的重要非生物因素之一,在響應(yīng)干旱脅迫過程中植物細胞壁發(fā)揮著重要的調(diào)節(jié)作用,肌醇加氧酶是植物細胞壁合成的前體物質(zhì)UDP-葡萄糖醛酸合成中的關(guān)鍵酶。為研究該基因在紅麻(Hibiscus cannabinus L.)抗旱和耐鹽過程中的作用,通過紅麻轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫篩選到肌醇加氧酶(myo-inositol oxygenase)基因的核心片段,利用染色體步移技術(shù)獲得肌醇加氧酶基因的cDNA全長,命名為HcMIOX;生物信息學(xué)分析表明,HcMIOX基因編碼序列長948 bp,編碼315個氨基酸,相對分子量為31.9 ku,等電點為4.75;RT-PCR分析表明,HcMIOX基因在紅麻根、莖、葉中均有表達,根中表達量最高,該研究結(jié)果對分析該基因功能和了解紅麻抗旱的分子機制具有重要意義。
關(guān)鍵詞:紅麻;轉(zhuǎn)錄組;肌醇加氧酶;分離;表達分析
中圖分類號: S563.501 文獻標志碼: A 文章編號:1002-1302(2017)18-0048-02
收稿日期:2016-04-01
基金項目:江西省教育廳科學(xué)技術(shù)研究項目(編號:GJJ151050));中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院創(chuàng)新工程(編號:ASTIP-IBFC03);上饒師范學(xué)院2014年博士科研啟動基金(編號:001055)。
作者簡介:張高陽(1982—),男,河南駐馬店人,博士,主要從事植物生物技術(shù)研究。Tel:(0793)8153721;E-mail:gyzhang2015@163.com。
通信作者:李德芳,博士,研究員,主要從事農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究。Tel:(0731)88998506;E-mail:chinakenaf@126.com。 干旱、鹽堿和極端溫度等是目前世界范圍內(nèi)嚴重影響作物生長發(fā)育和產(chǎn)量形成的主要非生物因素[1-2]。紅麻(Hibiscus cannabinus L.)是錦葵科木槿屬一年生草本韌皮纖維多用途經(jīng)濟作物,在我國廣大地區(qū)都有種植,因其纖維可以與棉混紡而應(yīng)用于紡織工業(yè),越來越受到人們的重視。因此,通過基因工程技術(shù)培育紅麻耐旱品種,在我國廣大干旱地區(qū)種植,實現(xiàn)其不與糧爭地等具有重要意義。
干旱脅迫下,植物葉片細胞生長受阻與細胞壁的硬化密切相關(guān),可有效減少植物綠葉面積,進而明顯降低綠葉的蒸騰失水。因此,植物細胞延伸生長與細胞膨壓、細胞壁伸展性變化等,可在響應(yīng)干旱脅迫過程中應(yīng)對植物失水過程[3]。植物體內(nèi)的肌醇在加氧酶作用下通過氧化還原生成UDP-葡萄糖醛酸,葡萄糖醛酸是植物細胞壁主要成分葡糖醛酸、木糖、芹菜糖和阿拉伯糖等合成的主要前體物質(zhì)[4-5]。維生素C在植物體內(nèi)不僅參與生長發(fā)育,還作為一種能清除超氧自由基的抗氧化劑,以緩解其對植物細胞造成的傷害。已有大量研究表明,抗壞血酸參與了對植物逆境脅迫下的保護作用,肌醇加氧酶基因在植物維生素C的生物合成中具有重要作用,在擬南芥中過量表達肌醇加氧酶基因,植物體內(nèi)維生素C含量比對照提高了2~3倍,植株的抗旱性也能有所增強[6-7]。因此,可以認為該基因在應(yīng)對植物干旱脅迫過程中發(fā)揮著重要作用。
有關(guān)該基因在植物中的研究,目前只見在水稻中有報道[8],本研究旨在分離紅麻肌醇加氧酶基因,并對其在各個組織中的表達情況進行分析,為今后了解該基因在植物干旱脅迫分子應(yīng)答中的作用奠定基礎(chǔ)。
1 材料與方法
1.1 材料
紅麻(Hibiscus cannabinus L.)抗旱品種“非引四號”保存于中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究室,Taq plus DNA聚合酶、載體pMDl9-T、逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(TaKaRa AMV Ver 3.0)、dNTPs均購自寶生物工程(大連)有限公司,感受態(tài)細胞DH5α保存于筆者所在實驗室,其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.2 方法
1.2.1 紅麻莖皮總RNA提取及引物設(shè)計 取田間生長旺盛的紅麻莖皮組織,迅速放入液氮中帶回實驗室,按TaKaRa公司RNA提取試劑盒操作方法提取總RNA,以2 μL總RNA為模板,按TaKaRa公司反轉(zhuǎn)錄試劑盒反應(yīng)體系和方法合成cDNA第1條鏈,并作為后續(xù)反應(yīng)的模板。以從紅麻轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中篩選的MIOX基因核心片段為基礎(chǔ),利用primer premier 5.0軟件設(shè)計染色體步移引物,MIOX基因3′端擴增引物為3F1:(5′-TGACGAAACTGTCTGGAATCGC-3′),3F2:(5′-TTCGCTTACTCTACGGTTCACG-3′);5′端擴增引物為5F1:(5′-CGGTGGTGAACATTTCGCTACAG-3′),5F2:(5′-GAAGTTACGGTGAGGAGCAGG-3′)。
1.2.2 紅麻MIOX基因全長cDNA的克隆 紅麻MIOXT基因3′末端擴增參照TaKaRa公司試劑盒。使用接頭引物進行RNA反轉(zhuǎn)錄,然后通過與接頭引物部分重疊的3′-OUT、3′-IN引物分別與基因特異性引物3F1、3F2進行巢式PCR,5′端克隆利用末端脫氧核苷酸轉(zhuǎn)移酶法(TdT),在cDNA的3′末端加上1個多聚的dC尾,然后用5′-OUT、5′-IN以及基因特異性引物5F1、5F2進行巢式PCR,RT-PCR體系為25 μL,含無菌去離子水(17.5 μL)、10×PCR buffer(2.5 μL)、10 mmol/L dNTP Mix(2.5 mmol/L,2 μL)、上下游引物(10 μmol/L)各2.5 μL、10 U μL/L Taq(0.2 μL)、DNA聚合酶(2 U)。反應(yīng)程序:預(yù)變性95 ℃ 3 min;變性94 ℃ 40 s,退火55 ℃ 50 s,延伸72 ℃ 3 min,35個循環(huán);最后72 ℃延伸 10 min),PCR產(chǎn)物用天根生物有限公司瓊脂糖膠回收試劑盒回收純化,連入pMDl8-T載體,熱激轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細胞,菌落PCR和質(zhì)粒酶切驗證正確的單克隆送華大基因測序。利用DNAMAN軟件拼接MIOXT基因的3′末端、5′末端和核心片段。endprint
1.2.3 紅麻MIOX基因序列及表達分析 采用ProtParam分析HcMIOX基因的各種基本理化特性,采用在線軟件NCBI ORFfinder尋找MIOXT基因的編碼區(qū)及其推倒的氨基酸序列。紅麻成長至50 d后,采用20%PEG6000誘導(dǎo)處理后分別取根、莖和葉組織中的RNA樣品,紅麻18S RNA為內(nèi)參,對不同組織中的MIOXT基因進行半定量分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 紅麻RNA提取
紅麻是一種富含多糖、多酚和其他次生代謝物質(zhì)的植物,高質(zhì)量的RNA獲取比較困難,筆者參照陳美霞等的提取方法[9],利用SDS法并稍作改進獲得高質(zhì)量的RNA,總RNA主帶清晰,條帶鋒利,無明顯降解,28S條帶約為18S的2倍,提取的RNA濃度為876 ng/μL,D260 nm/D280 nm=2.02,其濃度和純度較好,可滿足下一步試驗的要求。
2.2 紅麻HcMIOX基因克隆
通過對紅麻轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫的篩選,獲得紅麻MIOX基因的核心片段,根據(jù)核心片段設(shè)計擴增該基因的5′端和3′端末端引物,在5′末端克隆中,以5′-IN和5′F2為引物擴增得到1條502 bp的片段,3′末端擴增反應(yīng)中,以3′-IN和3′F2為引物擴增得到約213 bp的條帶;最后利用基因特異引物擴增獲得包括5′UTR部分序列的MIOX基因cDNA全長1 216 bp的片段(圖1)。
2.3 紅麻HcMIOX基因序列及表達分析
利用DNAMAN軟件對測序結(jié)果進行拼接后得到948 bp的核苷酸序列,編碼1段含有315個氨基酸的推導(dǎo)性蛋白質(zhì)(圖2),分子量為31.9 ku,等電點為4.75。圖3表明,紅麻HcMIOX在根、莖、葉中均有表達,在根中的表達量最高。
3 結(jié)論與討論
肌醇加氧酶是植物細胞壁合成中前體物質(zhì)UDP-葡萄糖醛酸和抗壞血酸的生物合成中的關(guān)鍵酶,在植物的逆境成長發(fā)育過程中,抗壞血酸起著重要的保護作用,有關(guān)植物肌醇加氧酶的研究只在水稻中有報道[4-6]。王海光等研究了不同
水稻肌醇加氧酶基因水分脅迫下的表達情況,結(jié)果表明,在旱稻(IRAT109)中OsMIOX基因的表達上調(diào),在旱稻(IRAT109和毫格勞)中的表達量明顯高于水稻(越富和日本晴)品種,這說明水稻和旱稻中存在不同的分子響應(yīng)機制以應(yīng)對水分脅迫[8]。肌醇加氧酶基因在紅麻不同組織中都有表達,但根中表達量最高,水分脅迫直接影響著根部的生理代謝活動,很可能是因為紅麻主要通過根部生理變化、基因表達來應(yīng)對干旱脅迫。
本研究通過分析紅麻干旱脅迫轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),篩選到1個紅麻受干旱脅迫誘導(dǎo)高效表達的基因(MIOX)片段,利用染色體步移技術(shù)獲取該基因全長cDNA序列。生物信息學(xué)分析表明,HcMIOX基因編碼序列長948 bp,編碼315個氨基酸,相對分子量為41.8 ku,等電點為4.86。干旱脅迫誘導(dǎo)表達分
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析表明,MIOX基因在紅麻根、莖和葉組織中均有表達,在根中的表達量最高。這是在纖維作物紅麻中首次分離得到該基因,研究結(jié)果為下一步分析該基因的功能和了解紅麻抗旱的分子機制提供參考。
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