婁喜艷 向文華 劉冬梅
摘要:以河南省民權(quán)縣花園鎮(zhèn)棉花枯萎病病株為材料,采用連續(xù)稀釋法和單孢分離法得到枯萎菌單孢菌株,對(duì)該菌株進(jìn)行形態(tài)學(xué)和顯微形態(tài)學(xué)分析。采用真菌通用引物對(duì)所分離的菌株rDNA內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(ITS)PCR擴(kuò)增得到 544 bp 大小的片段(GenBank登錄號(hào)為FJ715505),BLASTn分析結(jié)果顯示,該序列與其他枯萎菌的ITS序列具有很高的同源性,將該ITS序列與GenBank中搜索到的同源性序列構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù),確定商丘地區(qū)棉花枯萎菌為尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum),對(duì)該分離棉花枯萎菌菌株進(jìn)一步進(jìn)行致病力生物學(xué)鑒定。
關(guān)鍵詞:棉花枯萎菌;單孢分離;ITS序列;致病力;分子鑒定;生物學(xué)鑒定;病害防治
中圖分類號(hào): S4356212+4文獻(xiàn)標(biāo)志碼:
文章編號(hào):1002-1302(2017)16-0086-03
收稿日期:2016-08-04
基金項(xiàng)目:國(guó)家自然科學(xué)基金(編號(hào):31571997);河南省高等學(xué)校重點(diǎn)科研項(xiàng)目(編號(hào):16A210036)。
作者簡(jiǎn)介:婁喜艷(1984—),女,河南商丘人,碩士,講師,從事植物生理學(xué)教學(xué)與研究。E-mail:lounan2005@163com。
棉花枯萎菌學(xué)名尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum),屬半知菌亞門鐮刀菌屬,它是棉花上的重要病害,過(guò)去曾作為國(guó)內(nèi)重要植物檢疫對(duì)象,至今在有些?。ㄊ?、區(qū))仍作為植物檢疫對(duì)象??菸鸬目菸≡诿藁缙诤同F(xiàn)蕾期前后常引起大量死苗,殘存的病株結(jié)鈴明顯減少,鈴質(zhì)量減輕直接影響棉花生產(chǎn)和棉農(nóng)收入。此病最早于1892年在美國(guó)發(fā)現(xiàn),以后隨棉種調(diào)運(yùn)而迅速擴(kuò)散蔓延,目前在世界各主要產(chǎn)棉國(guó)均有發(fā)生。我國(guó)于1934年在江蘇南通和上海川沙等縣(市)最早發(fā)現(xiàn)此病,20世紀(jì)七八十年代初期,遍布全國(guó)各主要產(chǎn)棉區(qū),并形成嚴(yán)重危害。20世紀(jì)80年代中期以后,隨大量抗病品種的推廣,枯萎病在我國(guó)南北棉區(qū)基本得到控制,但局部棉區(qū)發(fā)生仍然較重,其中特別是新疆棉區(qū)常造成大片死亡,目前仍是棉花生產(chǎn)上的一個(gè)重要問(wèn)題。本試驗(yàn)采集河南省商丘地區(qū)棉花枯萎病病株,分離棉花枯萎菌單孢菌株,進(jìn)行菌落形態(tài)學(xué)和顯微形態(tài)學(xué)分析,并采用分子生物學(xué)的方法對(duì)該菌株核糖體DNA ITS序列進(jìn)行鑒定,為進(jìn)一步的棉花枯萎病的鑒定及防治提供科學(xué)的理論依據(jù)。
1材料與方法
11材料
河南省民權(quán)縣采集的棉花枯萎病病株。棉花感病品種為冀棉11,由中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所提供。
12方法
121棉花枯萎菌的分離和純化
制備PDA培養(yǎng)基,倒平板;棉花病枝經(jīng)自來(lái)水沖洗,將棉花莖剝皮,在超凈工作臺(tái)上,將其切成長(zhǎng)度為10~15 cm的圓柱體,用75%乙醇消毒 30 s 左右,無(wú)菌水沖洗,然后用01%氯化汞進(jìn)行滅菌1 min,用無(wú)菌水沖洗2~3次;圓柱體切成4個(gè)切片或小薄片,每塊組織均應(yīng)為病健相間變色的維管束組織;放入培養(yǎng)基平板上,輕輕按壓,每皿4塊,排放均勻;28 ℃恒溫箱中培養(yǎng)7~8 d。采用連續(xù)稀釋法[3]和單孢分離法[4],純化分離菌株。
122棉花枯萎病菌形態(tài)學(xué)鑒定
肉眼觀察棉花枯萎菌菌株的菌落形態(tài)、生長(zhǎng)狀況;制備水裝片,顯微觀察棉花枯萎菌菌絲、分生孢子、分生孢子梗等特征。
123棉花枯萎菌分子生物學(xué)鑒定
采用改良的CTAB的方法[5-6]提取枯萎菌DNA,1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)提取DNA的完整度;采用真菌核糖體ITS區(qū)段的通用引物ITS1(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′)和ITS4(5′-TCCGTAGGTGAACCTGCGG-3′),對(duì)枯萎菌菌株進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR擴(kuò)增反應(yīng)液25 μL,05 U/μL Taq聚合酶02 μL,dNTP的濃度為2 mmol/L;引物濃度為2 μmol/L,模板DNA 25 ng。反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性45 s,50 ℃退火45 s,72 ℃ 延伸1 min,35個(gè)循環(huán);72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物于瓊脂糖凝膠電泳分離,膠回收試劑盒回收產(chǎn)物,T載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌,交由南京金斯瑞生物科技有限公司測(cè)序。
124數(shù)據(jù)分析
通過(guò)軟件DNAMAN進(jìn)行序列同源性分析。用NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)(http://wwwncbinlmnihgov/)進(jìn)行BLAST分析,從GeneBank中查找所需物種的不同地區(qū)枯萎菌ITS基因序列,通過(guò)MEGA 40以最大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。
125分離棉花枯萎菌菌株致病性分析
棉花枯萎菌接種于查氏液體培養(yǎng)基上,28 ℃恒溫?fù)u床培養(yǎng)14 d左右;4層滅菌紗布進(jìn)行過(guò)濾枯萎菌培養(yǎng)液。血球計(jì)數(shù)板測(cè)量枯萎菌的小孢子密度,稀釋至100萬(wàn)個(gè)/mL;當(dāng)棉花幼苗生長(zhǎng)到1葉1心時(shí),將培養(yǎng)幼苗的塑料杯從托盤上拔起,進(jìn)行斷根,放在枯萎菌菌液中進(jìn)行侵染,感染后10~20 d開(kāi)始觀察記錄。
2結(jié)果與分析
21枯萎菌菌落形態(tài)檢測(cè)結(jié)果
分離培養(yǎng)的枯萎菌,菌絲白色,菌落蓬松,長(zhǎng)勢(shì)迅速。枯萎病菌的病原菌為尖孢鐮刀菌,萎蔫?;?,屬于半知菌亞門鐮刀屬。病原菌在PDA培養(yǎng)基上生長(zhǎng)時(shí),菌絲體呈絨毛狀或棉絮狀,菌落初為白色,后變淡紫色至紫色(圖1)。
22枯萎菌顯微形態(tài)學(xué)鑒定
挑去分離的棉花枯萎菌菌絲制作水裝片于顯微下觀察,該菌株產(chǎn)生大型分生孢子,呈鐮刀形彎曲,具有3~5個(gè)分隔;產(chǎn)生的小型分生孢子多數(shù)為單孢,卵圓形。與鐮刀分類系統(tǒng)比較,確定為尖孢鐮刀菌。
23枯萎菌分子生物學(xué)鑒定
231ITS通用引物對(duì)菌株的PCR擴(kuò)增
從圖2可以看出,以ITS1、ITS4為引物的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物條帶在500~750 bp之間,擴(kuò)增條帶清晰、整齊。
232鐮刀菌rDNA ITS區(qū)序列比對(duì)
商丘的棉花枯萎菌菌株ITS區(qū)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物測(cè)序得到544 bp的片段,GenBank序列登記號(hào)為FJ715505。將該棉花鐮刀菌序列和來(lái)自世界各地(包括中國(guó)在內(nèi))的20個(gè)具有代表性的鐮刀菌屬ITS序列進(jìn)行比較,構(gòu)建棉花鐮刀菌的系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)(圖3)。從圖4可以看出,在全世界范圍內(nèi),河南商丘棉花鐮刀與印度、馬來(lái)西亞、希臘鐮刀菌聚在一起,親緣很近,而與美國(guó)北卡州、法國(guó)、墨西哥、澳大利亞菌株親緣關(guān)系稍遠(yuǎn),與南韓、哥倫比亞和意大利的親緣關(guān)系最遠(yuǎn);在中國(guó)范圍內(nèi),與海南、南寧、貴陽(yáng)、北京聚在一起,而與臺(tái)灣、廣州、杭州、雅安相距較遠(yuǎn),和最近的泰安菌株相距最遠(yuǎn)。綜上結(jié)果分析,棉花鐮刀菌屬親緣關(guān)系遠(yuǎn)近和地緣遠(yuǎn)近無(wú)密切相關(guān)性。
24棉花枯萎菌致病力分析
分離的商丘枯萎菌接種棉花幼苗,對(duì)其致病力進(jìn)行觀察分析。幼苗發(fā)病時(shí)葉片最先表現(xiàn)出癥狀,葉片邊緣或主脈呈現(xiàn)淡黃色不規(guī)則斑塊,隨后病斑逐漸擴(kuò)大,變成褐色干枯并逐漸向上發(fā)展,最終侵染入植株的維管束系統(tǒng),使整株植株發(fā)病死亡(圖4)[8],與田間發(fā)病結(jié)果一致(圖1-a),均為青枯型。
3討論與結(jié)論
核糖體DNA(rDNA)ITS序列的保守性作為植物病原菌的分子鑒定檢測(cè)手段,已經(jīng)在植物病害鑒定的研究中得到廣泛[CM(25]應(yīng)用。ITS是介于 18S、58S、28S rDNA 之間的區(qū)域, 該區(qū)域進(jìn)化速度較編碼區(qū)快,在真菌種間存在豐富的變異,在種內(nèi)不同菌株間又高度保守,該區(qū)域DNA核苷酸序列的比較有助于相似種的鑒定。ITS序列已成為系統(tǒng)與進(jìn)化生物學(xué)研究中的重要分子標(biāo)記,并被廣泛應(yīng)用于親緣關(guān)系較近分類群的系統(tǒng)發(fā)育研究[9]。因此,在對(duì)棉花枯萎菌形態(tài)學(xué)研究的基礎(chǔ)上進(jìn)行ITS序列測(cè)定可以作為棉花枯萎菌鑒定的輔助手段,為其檢測(cè)提供快速有效的途徑。而進(jìn)一步利用ITS序列設(shè)計(jì)種的特異性PCR引物可對(duì)棉花枯萎菌進(jìn)行快速鑒定。
本試驗(yàn)采集河南省商丘地區(qū)棉花枯萎病病株,分離出1株棉花枯萎菌單孢菌株進(jìn)行菌落形態(tài)學(xué)和顯微形態(tài)學(xué)分析,并采用分子生物學(xué)的方法對(duì)該菌株核糖體DNA ITS序列進(jìn)行鑒定,結(jié)果表明該菌株為尖孢鐮刀菌(F oxysporum),該試驗(yàn)將為進(jìn)一步的棉花枯萎病的鑒定及防治提供科學(xué)的理論依據(jù)。
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