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口蹄疫病毒L、2B基因siRNA重組腺病毒質(zhì)粒的構(gòu)建

2017-09-14 18:58賈俊濤郭鳳英烏倫吉如嘎張小宇陳金頂
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2017年16期

賈俊濤++郭鳳英++烏倫吉如嘎++張小宇++陳金頂

摘要:根據(jù)siRNA設(shè)計(jì)原則,分別選擇O型FMDV的L和2B基因上保守序列作為可能的干擾位點(diǎn),設(shè)計(jì)了2個(gè)siRNAs,并將siRNAs克隆到pSIREN-Shuttle中,獲得2個(gè)siRNA重組表達(dá)載體pShuttle-L和pShuttle-2B。用限制性內(nèi)切酶I-Ceu I和PI-Sce I雙酶切siRNA重組表達(dá)載體和腺病毒質(zhì)粒載體pAdeno-X,利用體外連接法獲得了重組質(zhì)粒。經(jīng)PCR擴(kuò)增、酶切鑒定及序列測(cè)定,成功構(gòu)建了重組腺病毒質(zhì)粒pAdeno-L和pAdeno-2B。

關(guān)鍵詞:口蹄疫病毒;RNA干擾;重組腺病毒質(zhì)粒

中圖分類號(hào):S852.65+9.6 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):0439-8114(2017)16-3152-03

DOI:10.14088/j.cnki.issn0439-8114.2017.16.039

Construction of Recombinant Adenovirus Plasmid Containing the L and 2B Gene siRNAs of Foot-and-Mouth Disease Virus

JIA Jun-tao1,GUO Feng-ying1,Wulunjiruga1,ZHANG Xiao-yu1,CHEN Jin-ding2

(1.Vocational and Technical College of Inner Mongolia Agricuitural University, Baotou 014109, Inner Mongolia, China;

2.South China Agricultural University,Guangzhou 510640,China)

Abstract: In this study, the conservative sequence in L and 2B gene of O type FMDV were chose as possible interference sites. Two siRNAs were designed and synthesized. These siRNAs were cloned into the plasmid pSIREN-Shuttle, then the siRNAs recombined expression vectors were obtained including pShuttle-L and pShuttle-2B. The vectors and the adenovirus vector pAdeno-X were digested with restriction endonuclease I-Ceu I and PI-Sce I and connected in vitro, then recombinant plasmids were obtained. The result of PCR, enzyme-cutting and sequencing suggested that the recombined adenovirus plasmids pAdeno-L and pAdeno-2B were constructed successfully.

Key words: Foot-and-mouth disease virus(FMDV); RNA interference(RNAi); recombinant adenovirus plasmid

口蹄疫(Foot-and-mouth disease,F(xiàn)MD)是由口蹄疫病毒(FMDV)引起的偶蹄類動(dòng)物的一種急性、熱性、高度接觸性傳染病[1]。它不僅可使動(dòng)物生產(chǎn)性能下降,而且還限制動(dòng)物及動(dòng)物產(chǎn)品的國際貿(mào)易,有“政治經(jīng)濟(jì)病”之稱,被OIE列為烈性傳染病之首[2]。由于FMDV感染率高、傳染性強(qiáng)、患病動(dòng)物排毒量大,可使爆發(fā)地區(qū)遭受巨大經(jīng)濟(jì)損失,因此該病是世界各國檢疫和防疫的重點(diǎn)對(duì)象。目前,采用免疫接種與撲殺相結(jié)合,再輔以封殺、隔離、消毒、抗體檢測(cè)等綜合措施,但仍不能控制FMDV的感染與傳播,這就迫使人們尋求更加有效的防控方法。RNA干擾(RNA interference,RNAi)是一項(xiàng)可以在體外有效抑制病毒復(fù)制的技術(shù),其是由與靶基因序列同源的dsRNA引發(fā)廣泛存在于動(dòng)植物中的序列特異性基因轉(zhuǎn)錄后的沉默過程[3]。腺病毒載體因具有感染細(xì)胞種類多、感染效率高、外源基因表達(dá)水平高,且既適于體外又適于體內(nèi)研究等特點(diǎn)而被作為轉(zhuǎn)基因載體[4]。本研究構(gòu)建了攜帶有O型FMDV L、2B基因siRNA片段的重組腺病毒質(zhì)粒,為研究腺病毒介導(dǎo)的RNAi抑制FMDV增殖的作用奠定了基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 材料

1.1.1 病毒、質(zhì)粒和菌株 FMDV O/HKN/2003由華南農(nóng)業(yè)大學(xué)獸醫(yī)學(xué)院微生物實(shí)驗(yàn)室保存。E1、E3區(qū)缺失的腺病毒質(zhì)粒載體pAdeno-X、穿梭質(zhì)粒pSIREN-shuttle由廣州醫(yī)學(xué)院李彬教授惠贈(zèng)。大腸桿菌DH5α購自廣州合達(dá)生物技術(shù)公司。

1.1.2 主要試劑 歸位內(nèi)切酶I-Ceu Ⅰ、PI-Sce Ⅰ購自NEB公司。去內(nèi)毒素質(zhì)粒小量抽提試劑盒為OMEGA公司產(chǎn)品;DNA轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine2000為Invitrogen產(chǎn)品。

1.2 方法

1.2.1 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)腺病毒質(zhì)粒pAdeno-X序列和歸位內(nèi)切酶I-Ceu Ⅰ、PI-Sce Ⅰ的識(shí)別序列,設(shè)計(jì)下列引物:P1:5′-CGGGAAAACTGAATAAGACG-3′;P2:5′-CATCAAACGAGTTGGTGCT-3′,引物由北京賽百盛生物技術(shù)有限公司合成。endprint

1.2.2 siRNA表達(dá)質(zhì)粒的獲得 根據(jù)siRNA的設(shè)計(jì)原則[5],以GenBank中O型FMDV基因組核苷酸序列以及現(xiàn)有的FMDV株O/HKN/2003的序列測(cè)定結(jié)果,選擇非結(jié)構(gòu)蛋白L、2B基因保守序列作為可能的干擾位點(diǎn),設(shè)計(jì)了含有siRNA序列的寡核苷酸片段,命名為siRNA-L、siRNA-2B。將siRNA寡核苷酸片段克隆到pSIREN-Shuttle中,經(jīng)過鑒定獲得陽性克隆。

1.2.3 重組腺病毒穿梭質(zhì)粒載體的獲得 提取鑒定正確的重組質(zhì)粒及腺病毒質(zhì)粒載體pAdeno-X分別進(jìn)行I-Ceu Ⅰ、PI-Sce Ⅰ雙酶切,回收酶切產(chǎn)物,連接回收產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α。以P1、P2為引物進(jìn)行菌落PCR,篩選陽性克隆。PCR條件:94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性45 s,50 ℃退火45 s,72 ℃延伸 1 min,30個(gè)循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。同時(shí)采用質(zhì)粒PCR、Pac Ⅰ酶切及測(cè)序鑒定。

2 結(jié)果與分析

2.1 菌落PCR鑒定

在轉(zhuǎn)化的平板上各選取5個(gè)菌落進(jìn)行菌落PCR來初步篩選陽性克隆,經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后,分別有4個(gè)菌落擴(kuò)增出大小為600 bp左右的電泳條帶,其大小與預(yù)期相符(圖1、圖2)。

2.2 重組腺病毒質(zhì)粒載體PCR鑒定

菌落PCR篩選后,以質(zhì)粒為模板,進(jìn)行質(zhì)粒PCR鑒定,擴(kuò)增出大小約600 bp的電泳條帶,其大小與預(yù)期相符(圖3),進(jìn)一步證實(shí)陽性重組子的可能性。

2.3 重組腺病毒質(zhì)粒載體的酶切鑒定

將可能的陽性重組子用Pac Ⅰ酶切后出現(xiàn)兩條亮帶,一條在3 000 bp左右,另一條在30 kb左右,與預(yù)期相符(圖4)。結(jié)果表明,重組質(zhì)粒構(gòu)建成功。

2.4 重組質(zhì)粒載體的序列測(cè)定

將質(zhì)粒PCR鑒定為陽性的重組質(zhì)粒載體pAdeno-L、pAdeno-2B進(jìn)行序列測(cè)定,結(jié)果與預(yù)期序列完全吻合(圖5、圖6)。

3 小結(jié)與討論

口蹄疫是目前危害世界養(yǎng)殖業(yè)的重要疾病之一。FMDV滅活疫苗防治是目前防治該病的重要手段之一,但這種預(yù)防措施只能給動(dòng)物提供短期保護(hù),而且存在病毒逃逸和病毒滅活不徹底的潛在危險(xiǎn)。迅速發(fā)展的RNAi技術(shù)已經(jīng)使其成為一種功能強(qiáng)大的研究動(dòng)物特定基因表達(dá)和功能的工具[3]。已有報(bào)道表明,通過人工轉(zhuǎn)染siRNA能夠有效地誘發(fā)RNAi抵抗病毒的感染[6]。由于RNAi技術(shù)的快速性和特異性,可以彌補(bǔ)目前已有的病毒防御手段的不足??谔阋卟《镜幕蚪M是一條單鏈RNA,其既作為信使RNA又作為復(fù)制模板行使功能,因此口蹄疫是利用RNA干擾技術(shù)防制的理想對(duì)象。

本研究選擇了FMDV L、2B基因保守序列作為可能的干擾位點(diǎn),并設(shè)計(jì)了含有相應(yīng)siRNA序列的寡核苷酸片段。FMDV基因組為單股正鏈RNA,其基因組RNA具有mRNA性質(zhì)。L、2B基因?qū)儆贔MDV的非結(jié)構(gòu)蛋白基因。在FMDV的復(fù)制過程中,Lpro可特異性地降解宿主翻譯起始因子eIF-4G,導(dǎo)致宿主依賴cap的mRNA翻譯關(guān)閉[7,8]。Lpro對(duì)宿主蛋白質(zhì)合成具有抑制作用,因此認(rèn)為是FMDV的毒力因子。2B基因編碼的2B蛋白具有輔助病毒誘導(dǎo)細(xì)胞病變作用,現(xiàn)已表明2B蛋白能增強(qiáng)膜的通透性和阻斷蛋白分泌途徑。FMDV的L和2B基因在病毒復(fù)制周期中發(fā)揮重要作用,因此,如果L、2B基因的表達(dá)被抑制,就會(huì)抑制病毒的增殖。

RNAi表達(dá)載體有質(zhì)粒載體[9]和病毒載體[10,11],其中病毒載體克服了質(zhì)粒轉(zhuǎn)染細(xì)胞效率低的缺點(diǎn),并可體內(nèi)應(yīng)用,實(shí)現(xiàn)長(zhǎng)時(shí)間的靶基因沉默,具有臨床應(yīng)用前景等優(yōu)勢(shì)。腺病毒是目前轉(zhuǎn)基因效率最高的載體之一,被廣泛用于基因治療、基因功能性研究等領(lǐng)域。目前用于基因治療的腺病毒載體多為復(fù)制缺陷型載體,即缺失了腺病毒基因組中某些復(fù)制增殖所必需的基因,這部分基因的功能由輔助細(xì)胞或病毒提供。本研究采用復(fù)制缺陷型腺病毒載體,使用體外連接的方法成功構(gòu)建了重組腺病毒質(zhì)粒pAdeno-L和pAdeno-2B,為研究腺病毒介導(dǎo)的RNAi抑制FMDV增殖的作用奠定了基礎(chǔ)。

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