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檸條錦雞兒獸3H基因克隆及功能分析

2017-05-30 20:40:03鄭晟毛玉珊張騰國(guó)聶亭亭
廣西植物 2017年6期
關(guān)鍵詞:非生物脅迫表達(dá)分析基因克隆

鄭晟 毛玉珊 張騰國(guó) 聶亭亭

摘要: 檸條錦雞兒為豆科灌木,對(duì)各種環(huán)境脅迫具有較強(qiáng)的適應(yīng)能力,類黃酮是天然的抗氧化劑,花青素屬類黃酮化合物,逆境脅迫會(huì)影響植物體內(nèi)花青素的合成,而黃烷酮3羥化酶 (F3H) 是花青素生物合成所必需的一種關(guān)鍵酶。該研究成功分離克隆了檸條錦雞兒的F3H基因,命名為CkF3H。CkF3H基因的開放閱讀框 (ORF) 為1 095 bp,編碼364個(gè)氨基酸,推測(cè)的蛋白質(zhì)分子量為41.3 kDa,理論等電點(diǎn)為5.9。生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),CkF3H基因序列與其它植物F3H有較高的一致性,推測(cè)CkF3H蛋白與其它植物F3H蛋白具有相似的功能。利用染色體步移法克隆得到CkF3H起始密碼子ATG上游468 bp的啟動(dòng)子序列,PlantCARE軟件分析表明,該序列具有啟動(dòng)子的基本元件CAATbox和TATAbox以及多種與逆境脅迫相關(guān)的順式調(diào)控元件。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,CkF3H在檸條的根、莖和葉中均有表達(dá),沒(méi)有組織特異性;CkF3H的表達(dá)受低溫、高鹽、干旱和高溫脅迫的誘導(dǎo),并且在低溫脅迫下,CkF3H的表達(dá)還受到光周期的影響。綜上所述,研究結(jié)果表明CkF3H基因在檸條錦雞兒適應(yīng)低溫、高鹽、干旱和高溫脅迫的過(guò)程中發(fā)揮作用。

關(guān)鍵詞: 檸條錦雞兒, CkF3H基因, 基因克隆, 表達(dá)分析, 非生物脅迫

中圖分類號(hào): Q943.2

文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼: A

文章編號(hào): 10003142(2017)06072311

Abstract: Caragana korshinskii is a kind of shrub belonging to the leguminosae category and it has characteristic of tolerance to stressful conditions. Flavonoids are natural antioxidants that include the groups of notable pigments such as anthocyanins. The adversity stress can influence the biosynthesis of anthocyanins in plants. Flavanone 3Hydroxylase (F3H) is a key enzyme needed for the biosynthesis of anthocyanins. In this study, we successfully isolated, cloned F3H gene from C. korshinskii. The full length cDNA of C. korshinskii F3H gene (designated as CkF3H) had an open reading frame (ORF) of 1 095 bp encoding 364 amino acids with a calculated molecular mass of 41.3 kDa as well as an isoelectric point of 5.9. Comparative and bioinformatical analyses revealed that the cloned CkF3H from C. korshinskii has high identity with F3H from other plant species. The deduced CkF3H protein showed similarities with other available plant F3H proteins. The promoter of CkF3H gene was isolated by chromosomal walking and 468 bp sequence was obtained by sequencing. PlantCARE analysis of this sequence showed that the peomoter contained some typical elements CAATbox and TATAbox and kinds of Cisacting elements involved in defence and stress responsiveness. RTPCR analysis revealed that CkF3H was expressed in roots, stems, and leaves with almost no tissue specificity. The transcript level of CkF3H was increased in response to cold, high salt, drought and high temperature stress. The gene expression of CkF3H was influenced by photoperiod in response to cold stresses. The results suggested that CkF3H played an important role during cold, high salt, drought and high temperature stress in C. korshinskii.

Key words: Caragana korshinskii, CkF3H gene, gene cloning, expression analysis, abiotic stress

類黃酮(又稱黃酮類物質(zhì))是一類廣泛分布于高等植物中的多酚類次生代謝產(chǎn)物,是存在于植物中的天然色素(Shirley, 1996)。在植物適應(yīng)特殊生境以及響應(yīng)生物與非生物脅迫時(shí),類黃酮發(fā)揮重要的作用。在植物體內(nèi),類黃酮主要以糖基衍生物的形式存在,是植物花、葉、果實(shí)和種子的主要顯色物質(zhì),同時(shí),類黃酮在植物體內(nèi)也具有很重要的功能。類黃酮具有清除自由基和抗氧化的能力(Jovanovic et al, 1994),此外,類黃酮在人體中也具有多種生物活性,如抗氧化、抗病毒、血管舒張活性、抗癌和防衰老(Pietta, 2000; Heim et al, 2002)。

花青素(Anthocyanidin)為類黃酮化合物,是一種水溶性天然色素,廣泛存于自然界的植物中(Sarma et al, 1997)?;ㄇ嗨厣锖铣赏緩绞屈S酮類代謝途徑中的一個(gè)分支途徑,苯丙氨酸是其生物合成的直接前體,經(jīng)一系列酶促反應(yīng)合成花青素。由苯丙氨酸合成花青素主要過(guò)程如下:苯丙氨酸在苯丙氨酸解氨酶(PAL)作用下脫去氨基,形成肉桂酸;在肉桂酸羥化酶(C4H)的作用下羥基化,形成4香豆酸;在4香豆酸CoA連接酶(4CL)的作用下,形成4香豆酰CoA;4香豆酰CoA和丙二酰CoA在查爾酮合酶(CHS)的催化下合成查爾酮;由查爾酮異構(gòu)酶(CHI)將其轉(zhuǎn)變成4,5,7三氫黃烷酮;4,5,7三氫黃烷酮在黃烷酮3羥化酶(F3H)的催化下形成二氫黃酮醇,這一階段產(chǎn)生的二氫黃酮醇可在不同酶的作用下轉(zhuǎn)化為花青素或其它類黃酮物質(zhì)(二氫榭皮素和二氫楊梅黃酮等)(Holton & Cornish, 1995; WinkelShirley, 2001)。

黃烷酮3羥化酶(flavanone 3 hydroxylase,F(xiàn)3H)基因最早由Martin et al(1991)從金魚草中分離得到。對(duì)矮牽牛的研究表明,F(xiàn)3H是分子量為42 kD的單體蛋白,在這其中His220、His278、Arg222及Ser290氨基酸殘基對(duì)酶活起到了關(guān)鍵作用(Lukacin & Britsch, 1997)。研究發(fā)現(xiàn),F(xiàn)3H基因在擬南芥、矮牽牛、玉米及苜蓿等多種植物中以單拷貝基因的形式存在,而在紫蘇中存在2~3個(gè)拷貝(Gong et al, 1997)。張華玲等(2010)克隆得到苦蕎F3H基因,并對(duì)其進(jìn)行進(jìn)行序列分析。結(jié)果表明,F(xiàn)tF3H基因長(zhǎng)1 369 bp,編碼367個(gè)氨基酸,與葡萄、牽牛F3H的同源性達(dá)到80%左右。預(yù)測(cè)的FtF3H蛋白具有鐵離子結(jié)合位點(diǎn)及2酮戊二酸結(jié)合位點(diǎn)等典型結(jié)構(gòu)。采用電子克隆法,獲得了紅花菜豆F3H基因的cDNA編碼序列,并采用生物信息工具對(duì)紅花菜豆F3H基因的性質(zhì)進(jìn)行研究。結(jié)果表明,紅花菜豆F3H基因開放閱讀框?yàn)? 228 bp,編碼375個(gè)氨基酸,與大豆F3H基因同源性為92% (Ma & Guo, 2014)。F3H基因在花青素合成及環(huán)境脅迫中發(fā)揮著重要作用。研究表明,阻斷擬南芥F3H基因表達(dá)能導(dǎo)致黃酮及花色素水平下降(Wisman et al, 1998)。紅砂在干旱和紫外線輻射脅迫中,F(xiàn)3H基因的表達(dá)量顯著上升,酶活性增強(qiáng),植物花青素含量和抗氧化能力增強(qiáng)(Liu et al, 2013)。鹽脅迫下,F(xiàn)3H基因在茶和轉(zhuǎn)基因煙草中的表達(dá)量及酶活性都顯著增加(Mahajan & Yadav, 2014)。此外,枸杞F3H基因在轉(zhuǎn)基因煙草中過(guò)表達(dá)能夠增強(qiáng)其對(duì)干旱脅迫的耐受性(Song et al, 2016)。由此可見,當(dāng)植物受到逆境脅迫時(shí),F(xiàn)3H促進(jìn)花青素的積累,增強(qiáng)抗氧化能力,從而抵御逆境。目前已陸續(xù)從擬南芥、矮牽牛、玉米、甘藍(lán)型油菜、苜蓿、蘋果、康乃馨、銀杏及苦蕎等多種植物中克隆得到F3H基因,但在檸條錦雞兒中未見報(bào)道。

檸條錦雞兒(Caragana korshinskii)為豆科錦雞兒屬的灌木類植物,具有較為發(fā)達(dá)的根系。主要生長(zhǎng)于內(nèi)蒙古西部、陜西北部、寧夏及甘肅(河西走廊)等地區(qū) (李高等, 2013),生于半固定和固定沙地,是黃土高原植被建設(shè)的優(yōu)良灌木植物。檸條錦雞兒具有廣泛的適應(yīng)性和很強(qiáng)的抗逆性,能耐低溫及酷熱,也具有很強(qiáng)的抗旱能力,是荒漠、荒漠草原地帶的優(yōu)質(zhì)防風(fēng)固沙的植物。另外,檸條錦雞兒是優(yōu)良的可再生生物能源,它枝葉繁茂,產(chǎn)草量高,莖葉營(yíng)養(yǎng)豐富,是畜牧業(yè)優(yōu)良的灌木飼料,還具有抗風(fēng)、不怕埋沒(méi)等特點(diǎn) (劉龍會(huì)等, 2012; 楊杞等, 2013)。近年來(lái),關(guān)于檸條錦雞兒的研究已受到人們?cè)絹?lái)越多的關(guān)注,選擇檸條錦雞兒為實(shí)驗(yàn)材料,為我們的研究提供了更多可能性。

本研究以檸條錦雞兒為研究對(duì)象,從中克隆F3H基因,對(duì)F3H基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,在不同的逆境處理下檢測(cè)F3H基因mRNA轉(zhuǎn)錄水平的變化,分析其在不同脅迫下的基因表達(dá)量,并克隆該基因的啟動(dòng)子,對(duì)其啟動(dòng)子的功能區(qū)進(jìn)行分析,為研究F3H基因及花青素在逆境脅迫下的作用機(jī)制提供參考。

1材料與方法

1.1 材料與培養(yǎng)處理

以檸條錦雞兒(Caragana korshinskii)為材料。于1/2 MS培養(yǎng)基中培養(yǎng)約45 d備用。培養(yǎng)條件:25 ℃,光周期16 h光照/8 h黑暗,光照強(qiáng)度130 μmol·m2·s1。

低溫處理:將檸條錦雞兒放入4 ℃培養(yǎng)箱中分別處理0、12、24、36和48 h,光周期為16 h光照/8 h黑暗,處理時(shí)0 h開始先光照;鹽處理:在NaCl濃度為0、50、100、150和200 mmol·L1的培養(yǎng)液中分別處理檸條錦雞兒植株24 h;干旱處理:在PEG6000質(zhì)量分?jǐn)?shù)為5%、10%、15%和20%的培養(yǎng)液中分別處理檸條錦雞兒植株48 h;高溫處理:將檸條錦雞兒植株分別置于25、30、35、38和40 ℃培養(yǎng)條件下培養(yǎng)6 h。

本研究所用菌株為E.coli DH5α,克隆載體為pTG19T。引物合成及測(cè)序服務(wù)均由北京六合華大基因科技有限公司完成。

1.2 方法

1.2.1 檸條錦雞兒總RNA提取及反轉(zhuǎn)錄選取生長(zhǎng)良好的檸條錦雞兒植株,按照Trizol(上海生工生物公司)說(shuō)明書進(jìn)行總RNA的提取??俁NA經(jīng)過(guò)純度檢測(cè)后,按照PrimeScriptTM RT reagent Kit with gDNA Eraser (Perfect Real Time)(TakaRa)試劑盒說(shuō)明書將RNA反轉(zhuǎn)錄為cDNA。

1.2.2 RACE方法克隆檸條錦雞兒F3H基因cDNA全長(zhǎng)檸條錦雞兒F3H基因中間保守片段克?。簭腉enBank中下載已克隆得到的植物F3H基因序列,用DNAstar軟件MegAlign模塊進(jìn)行序列比對(duì),根據(jù)比對(duì)結(jié)果,設(shè)計(jì)簡(jiǎn)并性引物Primer 1和Primer 2,Primer 3和Primer 4(表1)。以反轉(zhuǎn)錄得到的檸條錦雞兒cDNA為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增。擴(kuò)增產(chǎn)物凝膠回收,連入pTG19T載體,4 ℃過(guò)夜連接。連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,37 ℃過(guò)夜培養(yǎng),藍(lán)白斑篩選后挑取白斑進(jìn)行菌液PCR檢測(cè),挑選陽(yáng)性克隆,送北京六合華大基因有限公司測(cè)序。

檸條錦雞兒F3H基因3′RACE克?。禾崛帡l總RNA,按照3′Full RACE Core Set Ver.2.0(TakaRa)試劑盒說(shuō)明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄及3′RACE擴(kuò)增反應(yīng)。以試劑盒中提供的兩個(gè)特異性引物3′RACE D1和3′RACE D2(表1)為下游引物,根據(jù)擴(kuò)增得到的檸條錦雞兒F3H中間片段序列,設(shè)計(jì)3′RACE擴(kuò)增上游引物3′RACE U1和 3′RACE U2(表1)。以反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,3′RACE U1,3′RACE D1為引物進(jìn)行第一次PCR擴(kuò)增,以一擴(kuò)產(chǎn)物為模板, 3′RACE U2,3′RACE D2為引物進(jìn)行第二次PCR擴(kuò)增,得到預(yù)期大小的片段,切膠回收,連接pTG19T載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,篩選陽(yáng)性克隆測(cè)序。

檸條錦雞兒F3H基因的5′RACE克?。禾崛帡l錦雞兒總RNA,按照5′RACE System for Rapid Amplification of cDNA Ends,Version 2.0(TakaRa)的說(shuō)明書進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄及5′RACE擴(kuò)增反應(yīng)。以試劑盒中提供的兩個(gè)特異性引物5′RACE U1和 5′RACE U2(表1)為上游引物,根據(jù)擴(kuò)增得到的檸條錦雞兒F3H中間片段序列,設(shè)計(jì)5′RACE擴(kuò)增下游引物5′RACE D1和5′RACE D2(表1)。5′RACE U1和5′RACE D1為引物進(jìn)行一次PCR擴(kuò)增,再以一擴(kuò)產(chǎn)物為模板,以5′RACE U2和5′RACE D2為引物進(jìn)行二次PCR擴(kuò)增,得到預(yù)期大小的片段,切膠回收,連接pTG19T載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,篩選陽(yáng)性克隆測(cè)序。

根據(jù)檸條錦雞兒F3H基因RACE測(cè)序結(jié)果與之前得到的中間片段進(jìn)行拼接,得到全長(zhǎng)基因,設(shè)計(jì)引物擴(kuò)增F3H基因的全長(zhǎng),以驗(yàn)證得到的序列是否正確。PCR產(chǎn)物純化回收后,連接載體,轉(zhuǎn)化大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞DH5α,37 ℃過(guò)夜培養(yǎng),藍(lán)白篩選陽(yáng)性克隆,送華大基因公司測(cè)序。

1.2.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR以反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,以ActinF,ActinR為管家基因引物, F3HDL U,F(xiàn)3HDL D為目的基因引物(表1),對(duì)檸條錦雞兒F3H基因的表達(dá)量進(jìn)行分析。按照SYBR Premix Ex Taq TM(TakaRa)操作說(shuō)明書于25 μL反應(yīng)體系進(jìn)行PCR擴(kuò)增, 每個(gè)樣品做3個(gè)平行重復(fù), 每

一種脅迫處理做3次生物學(xué)重復(fù)。

反應(yīng)體系如下:SYBR Premix Ex TaqTM 12.5 μL,F(xiàn)3HDL U、F3HDL D或ActinF、ActinR (10 μmol·L1)各1 μL,cDNA 2 μL,ddH2O 8.5 μL。擴(kuò)增程序:95 ℃ 30 s;95 ℃ 5 s,60 ℃ 20 s,40個(gè)循環(huán);55~95 ℃每30 s漸進(jìn)升高0.5 ℃,81個(gè)循環(huán)。擴(kuò)增結(jié)束后,采用2-△△Ct法分析數(shù)據(jù),確定基因的相對(duì)表達(dá)量。

1.2.4 克隆檸條錦雞兒F3H基因啟動(dòng)子選取生長(zhǎng)良好的檸條錦雞兒植株,用Universal Genomic DNA Extraction Kit Ver.5.0(TakaRa)試劑盒提取其幼嫩葉片中的基因組DNA,根據(jù)已知的檸條錦雞兒F3H基因全長(zhǎng)序列設(shè)計(jì)特異性引物,按照Genome Walking Kit(TakaRa)試劑盒克隆CkF3H基因的啟動(dòng)子序列。根據(jù)染色體步移的測(cè)序結(jié)果及CkF3H基因的全長(zhǎng)序列設(shè)計(jì)一對(duì)基因特異性引物,以基因組DNA為模板,按照Premix Ex Taq DNA Polymerase(TakaRa)說(shuō)明書進(jìn)行PCR擴(kuò)增,進(jìn)一步驗(yàn)證啟動(dòng)子克隆的正確性。

1.2.5 檸條錦雞兒F3H基因的生物信息學(xué)分析用DNAstar軟件的Protean模塊對(duì)檸條錦雞兒F3H基因進(jìn)行氨基酸組成成分和蛋白基本特征分析,用Clustal方法構(gòu)建以氨基酸序列為基礎(chǔ)的系統(tǒng)進(jìn)化樹;用在線工具SOPMA預(yù)測(cè)檸條錦雞兒 F3H蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu);根據(jù)生物信息學(xué)軟件TopPred (http://services.cbib.Ubordeaux2.fr/pise/Toppred.htm1)、TMHMM (http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM2.0/)、SOSUI (http://bp.nuap.nagoyau.ac.jp/sosui/) 在線分析檸條錦雞兒F3H蛋白的親水/疏水性以及跨膜結(jié)構(gòu)域。用在線分析軟件PlantCARE (http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/plantcare/html/)分析檸條錦雞兒F3H基因啟動(dòng)子序列,根據(jù)啟動(dòng)子序列中所含的功能元件預(yù)測(cè)啟動(dòng)子的功能。

2結(jié)果與分析

2.1 CkF3H基因的克隆

利用已經(jīng)克隆報(bào)道的植物F3H基因序列,通過(guò)分析在其保守區(qū)設(shè)計(jì)兩對(duì)簡(jiǎn)并引物,從檸條錦雞兒葉片中提取總RNA,并以其反轉(zhuǎn)錄的cDNA為模板,擴(kuò)增得到500 bp和400 bp左右的兩條單一條帶(圖1:A)。將這兩個(gè)基因片段經(jīng)測(cè)序后拼接得到一條長(zhǎng)度為760 bp的中間片段。再通過(guò)3′RACE和5′RACE分別擴(kuò)增得到530 bp與400 bp大小的基因片段(圖1:B, C),經(jīng)過(guò)測(cè)序后發(fā)現(xiàn),與前面擴(kuò)增得到的中間片段核苷酸序列有完全一致的重疊部分,說(shuō)明以上克隆得到的片段均屬于同一條基因。

將擴(kuò)增得到的中間片段以及3′RACE和5′RACE擴(kuò)增得到的片段序列進(jìn)行拼接,得到了一條全長(zhǎng)1 437 bp的基因序列(圖2),包含一個(gè)1 095 bp的開放閱讀框(ORF),編碼364個(gè)氨基酸。起始密碼子ATG前面有一段115 bp的5′非翻譯區(qū)(5′UTR),終止密碼子TAG后面有一段227 bp的3′非翻譯區(qū)(3′UTR),包含15 bp的polyA。為了進(jìn)一步確定以上拼接序列的正確性,我們用特異引物對(duì)全長(zhǎng)序列進(jìn)行了擴(kuò)增克隆,經(jīng)比對(duì)與拼接序列的核苷酸組成完全相同。

與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中的序列進(jìn)行比對(duì),該片段與其它物種F3H基因的序列相似性為73%~89%,由此可以確定獲得的該序列片段屬于檸條錦雞兒中的F3H基因,我們命名為CkF3H。

2.2 CkF3H預(yù)測(cè)氨基酸序列與其他植物氨基酸序列比對(duì)分析

根據(jù)得到的CkF3H基因全長(zhǎng)序列,利用Vised11軟件推導(dǎo)其氨基酸序列(圖2)。通過(guò)SOPMA對(duì)檸條錦雞兒F3H預(yù)測(cè)蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu)進(jìn)行預(yù)測(cè),結(jié)果顯示:其蛋白包含37.09%的α螺旋(Alpha helix)、22.8%的延伸鏈(Extended strand)、11.26%的β轉(zhuǎn)角(Beta turn)和28.85%的無(wú)規(guī)則卷曲(Random coil)。

從Genbank中下載已經(jīng)克隆得到的植物F3H基因序列,利用ClustalX 2.1軟件對(duì)檸條錦雞兒、紅豆草、蒺藜苜蓿、大豆、鷹嘴豆、煙草、擬南芥、玉米F3H基因編碼的氨基酸序列進(jìn)行比對(duì)(圖3)。進(jìn)一步分析發(fā)現(xiàn),CkF3H與紅豆草OvF3H同源性最高,達(dá)到了89.3%,與蒺藜苜蓿MtF3H,大豆GmF3H,鷹嘴豆CaF3H,棉花GhF3H,兔眼藍(lán)莓VaF3H,擬南芥AtF3H的同源性分別為85.8%,85.0%,83.9%,79.3%,78.1%,73.6%。同時(shí),利用MEGA 5.02軟件,對(duì)已報(bào)道的部分F3H蛋白進(jìn)行了聚類分析,構(gòu)建了F3H基因的系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖4)。

2.3 CkF3H基因啟動(dòng)子的克隆及分析

以檸條錦雞兒中提取到的總DNA為模板,進(jìn)行巢式PCR擴(kuò)增,經(jīng)過(guò)第3次PCR擴(kuò)增后在600 bp處有一明顯條帶(圖5),回收后測(cè)序。結(jié)果表明,成

功克隆得到了CkF3H基因起始密碼子ATG上游啟動(dòng)子序列468 bp。采用PlantCARE軟件進(jìn)行基礎(chǔ)啟動(dòng)子區(qū)及調(diào)控元件分析(圖6),發(fā)現(xiàn)該序列具有啟動(dòng)子基本元件CAATbox和TATAbox。三個(gè)高水平轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子5′UTR嘧啶密集區(qū)5UTR Pyrich stretch,分別位于-506 bp、-508 bp、-510 bp處。一個(gè)與缺氧有道相關(guān)的元件ARE,位于+178 bp處。一個(gè)光反應(yīng)元件ATCTmotif、BoxI、BoxIII、Gbox、兩個(gè)Sp1,分別位于-36 bp、-261 bp、+382 bp、-257 bp、+229 bp和+302 bp。一個(gè)真菌誘導(dǎo)應(yīng)答元件BoxW1,位于+298 bp。兩個(gè)分生組織特意表達(dá)調(diào)控元件CCGTCCbox,分別位于+460 bp和-603 bp。一個(gè)與Me Ja和ABA等激素響應(yīng)相關(guān)的作用元件CGTCAmotif, 位于+422 bp處。一個(gè)胚乳中特意表達(dá)所需的正調(diào)控元件GCN4motif,位于-49 bp 處。一個(gè)與高溫脅迫相關(guān)的調(diào)控元件HSE,位于+263 bp處。一個(gè)赤霉素應(yīng)答元件Pbox,位于+258 bp處。一個(gè)激素敏感型順式作用元件TGAelement,位于-438 bp處。一個(gè)茉莉酸甲酯作用元件,位于-422 bp處。一個(gè)WRKY轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)W box,位于+298 bp處。此外,通過(guò)軟件分析還發(fā)現(xiàn)該啟動(dòng)子還具有Cbox,MNF1等高效作用元件。

2.4 CkF3H基因表達(dá)分析

以檸條錦雞兒根、莖和葉中提取的mRNA反轉(zhuǎn)錄得到的cDNA為模板,進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR,分析CkF3H基因在不同組織的表達(dá)。結(jié)果表明,CkF3H基因在檸條錦雞兒的根、莖、葉中均有表達(dá),沒(méi)有組織特異性(圖7)在葉片中表達(dá)量最高,其次是莖和根。

通過(guò)在4 ℃低溫處理我們發(fā)現(xiàn),CkF3H基因的表達(dá)受低溫脅迫誘導(dǎo)。將檸條錦雞兒植株在4 ℃處理12、24、36和48 h后,CkF3H基因轉(zhuǎn)錄水平與對(duì)照(0 h)相比,分別提高了25.81、7.62、52.71和23.75倍(圖8)。CkF3H基因的表達(dá)量呈現(xiàn)先上升后下降的趨勢(shì),在4 ℃處理36 h達(dá)到最大,轉(zhuǎn)錄水平最高。

通過(guò)鹽脅迫處理我們發(fā)現(xiàn),CkF3H基因的表達(dá)也受高濃度NaCl的誘導(dǎo)。當(dāng)培養(yǎng)基中NaCl濃度為50、100、150和200 mmol·L1時(shí),CkF3H基因的表達(dá)與對(duì)照相比,分別提高了2.53、4.06、4.86和3.51倍,其表達(dá)呈先上升后下降的趨勢(shì)。當(dāng)NaCl濃度為150 mmol·L1時(shí),CkF3H基因的轉(zhuǎn)錄水平達(dá)到最大值,表達(dá)最強(qiáng) (圖9)。

通過(guò)模擬干旱脅迫我們發(fā)現(xiàn),培養(yǎng)基中添加5%、10%、15%和20%的PEG6000后,CkF3H基因轉(zhuǎn)錄水平與對(duì)照相比,分別提高了2.62、28.25、52.35和22.94倍,其表達(dá)量也呈現(xiàn)先升高后下降的趨勢(shì),在PEG6000質(zhì)量分?jǐn)?shù)為15%時(shí)達(dá)到最高 (圖10)。說(shuō)明CkF3H基因在適應(yīng)干旱脅迫的過(guò)程中發(fā)揮作用。

通過(guò)高溫脅迫處理我們發(fā)現(xiàn),CkF3H基因轉(zhuǎn)錄水平的表達(dá)也受高溫誘導(dǎo)。將檸條植株在30、35、38和40 ℃的處理下,CkF3H基因的轉(zhuǎn)錄水平與對(duì)照相比,分別上升了76.64、34.3、37.27和89.26倍 (圖11),在40 ℃時(shí),CkF3H基因的轉(zhuǎn)錄水平達(dá)到最大。以上結(jié)果表明CkF3H基因?qū)Ω邷孛{迫的誘導(dǎo)較為敏感。

3討論

黃酮類苯環(huán)上的羥基是具有抗氧化活性的關(guān)鍵基團(tuán),對(duì)氧自由基有很強(qiáng)的清除作用(郭春梅等, 2012; 陳季武等, 2002)。當(dāng)植物處于逆境脅迫時(shí),它可將自身的氫供給脂類化合物的自由基,抑制脂類的進(jìn)一步氧化,從而減少膜質(zhì)損傷。黃烷酮3羥化酶(F3H)是重要的生物合成中間產(chǎn)物酶,參與黃酮醇、兒茶酚、花青素以及原花青素的生物合成(Prescott & John, 1996)。研究表明,生物脅迫與非生物脅迫能夠誘導(dǎo)F3H基因的表達(dá)(Jeong et al, 2004)。在干旱、高鹽、低溫以及激素脅迫下,F(xiàn)3H基因的表達(dá)均有上升(Shinozaki & YamaguchiShinozaki, 1996)。許志茹等(2008)對(duì)蕪菁F3H在UVA誘導(dǎo)下的表達(dá)量進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)F3H基因的表達(dá)量與UVA處理的時(shí)間呈相關(guān)性。范敏等(2008)研究表明,馬鈴薯F3H基因的表達(dá)量在不同干旱脅迫下都有不同程度的增加,且葉中F3H基因受干旱誘導(dǎo)的時(shí)間比根中長(zhǎng),說(shuō)明F3H基因參與了馬鈴薯的抗旱反應(yīng)。

本研究從檸條錦雞兒中克隆了CkF3H基因,并分析了在逆境脅迫下其轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)量的變化:在低溫、高鹽以及干旱脅迫下,CkF3H基因的表達(dá)量均呈現(xiàn)先升高后下降趨勢(shì),且均高于對(duì)照水平。由此可見,CkF3H基因在檸條錦雞兒抵御低溫、高鹽和干旱脅迫過(guò)程中發(fā)揮了重要作用。其中,在低溫脅迫處理下,CkF3H基因在0、24、48 h時(shí)表達(dá)較低,12、36 h的表達(dá)量較高,可能受到光周期的影響 (圖8);先前研究發(fā)現(xiàn),在光處理?xiàng)l件下葡萄皮中F3H基因表達(dá)以及花青素含量均顯著高于黑暗處理(Azuma et al, 2012),將蘋果從暗處轉(zhuǎn)移至光照條件下,其表皮中F3H基因表達(dá)顯著上調(diào)(Feng et al, 2013)。因此,在低溫脅迫下,CkF3H基因表達(dá)可能受低溫及光照共同影響。此外,對(duì)CkF3H基因啟動(dòng)子區(qū)進(jìn)行生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn):其啟動(dòng)子含有與光、ABA及高溫等脅迫誘導(dǎo)相關(guān)的順勢(shì)作用元件。CkF3H基因在轉(zhuǎn)錄水平表達(dá)量的變化也表明了該基因受高溫的誘導(dǎo),且溫度越高,表達(dá)量變化越明顯。由于類黃酮在植物營(yíng)養(yǎng)及生理方面具有重要作用,因此,了解類黃酮代謝途徑是非常必要的??寺》治鼍幋a此途徑中關(guān)鍵酶的基因,是認(rèn)識(shí)類黃酮生物合成調(diào)控機(jī)制的重要途徑,也是進(jìn)一步了解類黃酮生物學(xué)意義的基礎(chǔ)。

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