劉 健
(秦皇島市第一醫(yī)院,河北秦皇島 066000)
技術(shù)方法
基于顯微CT多分形譜特征和支持向量機(jī)的骨質(zhì)疏松診斷*
劉 健
(秦皇島市第一醫(yī)院,河北秦皇島 066000)
骨質(zhì)疏松;顯微CT;多分形譜;支持向量機(jī)
骨質(zhì)疏松癥是以骨量減少、骨微觀結(jié)構(gòu)退化為特征,致使骨的脆性增加以及易發(fā)生骨折的一種代謝性骨病。一直以來(lái),骨密度被認(rèn)為是骨質(zhì)疏松癥診斷的臨床標(biāo)準(zhǔn)和骨質(zhì)疏松性骨折的主要預(yù)測(cè)因子。最近研究發(fā)現(xiàn),低骨量只是骨質(zhì)疏松的危險(xiǎn)因素之一,除骨量外,骨小梁的微結(jié)構(gòu)變化對(duì)骨強(qiáng)度起著至關(guān)重要的作用[1-2]。因此,對(duì)于骨小梁微結(jié)構(gòu)的深入研究成為解決骨質(zhì)疏松問(wèn)題的關(guān)鍵[3]。在骨小梁結(jié)構(gòu)研究中,傳統(tǒng)骨組織形態(tài)計(jì)量學(xué)被譽(yù)為骨組織微結(jié)構(gòu)量化分析的“金標(biāo)準(zhǔn)”[4]。但由于骨質(zhì)疏松癥的病理學(xué)改變主要為區(qū)域性組織形態(tài)學(xué)改變,并且骨組織質(zhì)地堅(jiān)硬,活檢困難且局限性大,因此當(dāng)前的病理學(xué)診斷方法無(wú)法進(jìn)行全面、立體、無(wú)創(chuàng)的觀察[5]。由于二維的傳統(tǒng)方法存在諸多缺陷,使得評(píng)價(jià)骨微結(jié)構(gòu)的三維顯微CT方法最近幾年發(fā)展迅速。如Gong等就是利用顯微CT掃描人椎骨體不同部位骨微觀結(jié)構(gòu),用于評(píng)價(jià)微結(jié)構(gòu)相關(guān)的發(fā)生骨折的危險(xiǎn)性[6]。Jiang等發(fā)現(xiàn),高分辨率顯微CT圖像系統(tǒng)能很好地評(píng)價(jià)雌激素缺乏或骨質(zhì)疏松患者中、長(zhǎng)期骨小梁改變,與傳統(tǒng)骨形態(tài)計(jì)量學(xué)比較,顯微CT能夠更早地探及骨結(jié)構(gòu)變化,從而為早期預(yù)防骨質(zhì)疏松癥的發(fā)生提供了依據(jù)[7]。顯微CT評(píng)價(jià)骨微結(jié)構(gòu)的空間參數(shù)方面的研究也獲得了較大進(jìn)展,Geoffrey等[8]研究了基于骨小梁CT圖像空間模式孔隙度分析的骨質(zhì)疏松評(píng)價(jià)方法,Veenland等[9]研究了利用紋理特征來(lái)評(píng)價(jià)骨小梁結(jié)構(gòu)改變的可行性。
在前述研究工作基礎(chǔ)上,本研究提出一種利用多重分形譜特征評(píng)價(jià)骨微結(jié)構(gòu),并利用支持向量機(jī)算法進(jìn)行自動(dòng)分類以診斷骨質(zhì)疏松疾病的方法,并且在骨小梁顯微CT數(shù)據(jù)上驗(yàn)證了該方法的有效性。
用Chaudhuri和Sarker提出的差分盒子計(jì)數(shù)方法進(jìn)行多分形譜特征計(jì)算。對(duì)于一個(gè)給定的尺度s,將M×M的圖像分割為s×s大小的網(wǎng)格,每個(gè)網(wǎng)格中有一列s×s×h大小的盒子,其中h=s×G/M,G是最大的灰度級(jí),M/2≥s>1,s∈N,r=s/M。設(shè)Ps(i, j)為第ns(i, j)個(gè)網(wǎng)格中的概率測(cè)度,對(duì)于每個(gè)網(wǎng)格定義:
則可得:
實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)來(lái)自荷蘭愛(ài)因霍芬科技大學(xué)生物力學(xué)與組織工程的骨小梁顯微CT數(shù)據(jù)集。該數(shù)據(jù)利用Scanco Medical CT 80機(jī)采集,分為兩個(gè)組,14個(gè)正常人作為對(duì)照組,14個(gè)骨質(zhì)疏松病人作為疾病組。
2.1 二值化處理 進(jìn)行濾波、感興趣區(qū)域分割,以及二值化預(yù)處理后,每個(gè)人獲得64張64×64的二值化圖像。經(jīng)過(guò)二值化處理后部分micro切片圖像的對(duì)照示例見(jiàn)圖1,圖1(a)為3個(gè)正常樣本的第40號(hào)切片,圖1(b)為3個(gè)骨質(zhì)疏松樣本的第40號(hào)切片。從圖像上可以看出有差異,但是直接計(jì)算骨量進(jìn)行分類還有一定難度。例如第1個(gè)骨質(zhì)疏松樣本就容易與正常樣本混淆,而第3個(gè)正常樣本和第3個(gè)骨質(zhì)疏松樣本的總骨量區(qū)別也不是太明顯。
圖1 二值化microCT切片圖像示例
2.2 多分形譜計(jì)算 由于骨質(zhì)疏松患者顯微CT圖像呈現(xiàn)不同的紋理模式和復(fù)雜度,本文采用多分形譜理論進(jìn)行特征提取。圖2所示為顯微CT圖像切片經(jīng)計(jì)算得到的多分形譜對(duì)照:圖2(a)為某正常樣本的第40號(hào)切片所對(duì)應(yīng)的f(a)-a圖,圖2(b)為某骨質(zhì)疏松樣本第40號(hào)切片對(duì)應(yīng)譜圖。
圖2 二值化microCT切片多分形譜圖示例
2.3 特征提取與分類 對(duì)每個(gè)樣本所有切片(共64個(gè)切片)計(jì)算多重分形譜數(shù)據(jù),進(jìn)一步提取多個(gè)Hausdorff維、斜率、標(biāo)準(zhǔn)偏差、方差/均值比等指標(biāo)。將每個(gè)樣本所有切片指標(biāo)的平均值作為該樣本對(duì)應(yīng)的特征。對(duì)數(shù)據(jù)集所有樣本提取出的特征用平行坐標(biāo)圖進(jìn)行可視化,如圖3所示。圖中橫坐標(biāo)共有九種取值,分別對(duì)應(yīng)Q=-2, Q=-1,Q=0,Q=1,Q=2時(shí)的Hausdorff維f(a (Q))平均值,以及斜率(slope)和標(biāo)準(zhǔn)偏差、方差/均值比等指標(biāo)。圖中用虛線表示正常樣本f(a (Q)),用帶+號(hào)的實(shí)線表示骨質(zhì)疏松樣本。從圖中可以看出,Q=-2時(shí)正常樣本與骨質(zhì)疏松樣本有明顯差異,正常樣本Hausdorff維平均值偏低,而骨質(zhì)疏松樣本Hausdorff維f(a (Q))平均值高。另外,斜率(slope)和標(biāo)準(zhǔn)偏差、方差/均值比等指標(biāo)也具有較好的判別能力。但是Q=0時(shí)的Hausdorff維f(a (Q))平均值可分性較差。
圖3 兩類特征的平行坐標(biāo)圖
將前述所提取的那些特征用支持向量機(jī)進(jìn)行分類(利用LIBSVM工具箱,徑向基函數(shù)核,5倍交叉驗(yàn)證),并與利用其它分類方法(線性判別LDA、k-近鄰),和采用其他指標(biāo)如:傳統(tǒng)骨礦密度(BMD)指標(biāo)以及采用單切片分形譜指標(biāo)進(jìn)行比較,結(jié)果如附表所示。從表中可以看出,與采用其它分類方法和傳統(tǒng)特征比較,本文方法具有更好的分類性能。
附表 不同算法和特征分類結(jié)果比較表
本研究針對(duì)骨質(zhì)疏松病人和正常人顯微CT圖像間的紋理和復(fù)雜度差異的特點(diǎn),基于多分形譜理論提出了一種多切片分形譜指標(biāo)平均值特征表示方法,并且和支持向量機(jī)結(jié)合,取得了很好的分類效果。本研究提出的多切片分形譜指標(biāo)平均值特征可在一定程度上反映骨的微觀結(jié)構(gòu)性能,對(duì)于輔助醫(yī)生進(jìn)行骨質(zhì)疏松診斷具有較高價(jià)值。
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R318.08
A
1004-6879(2016)03-0232-03
*國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(60873121)
(2015-04-09)