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應(yīng)用依賴(lài)解旋酶DNA擴(kuò)增技術(shù)檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆

2016-11-11 08:15章晶晶張翠俠馬超峰河北省食品檢驗(yàn)研究院河北省食品安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室河北石家莊05007河北農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科技學(xué)院河北保定07000
食品科學(xué) 2016年4期
關(guān)鍵詞:內(nèi)源外源轉(zhuǎn)基因

章晶晶,王 贊,張翠俠,馬超峰,周 巍,2,,張 巖(.河北省食品檢驗(yàn)研究院,河北省食品安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河北 石家莊 05007;2.河北農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科技學(xué)院,河北 保定 07000)

應(yīng)用依賴(lài)解旋酶DNA擴(kuò)增技術(shù)檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆

章晶晶1,王 贊1,張翠俠1,馬超峰1,周 巍1,2,*,張 巖1
(1.河北省食品檢驗(yàn)研究院,河北省食品安全重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河北 石家莊 050071;2.河北農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科技學(xué)院,河北 保定 071000)

目的:基于依賴(lài)解旋酶DNA恒溫?cái)U(kuò)增(helicase-dependent isothermal DNA amplifi cation,HDA)技術(shù),建立快速檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的方法。方法:采用以CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS 3 種外源基因和內(nèi)源基因Lectin(大豆凝集素基因)為目的片段設(shè)計(jì)4 對(duì)特異引物,建立反應(yīng)體系,通過(guò)HDA方法對(duì)內(nèi)源基因和3 種外源基因的檢測(cè)特異性和靈敏度進(jìn)行實(shí)驗(yàn),并對(duì)結(jié)果進(jìn)行同源性分析。結(jié)果:建立了轉(zhuǎn)基因大豆HDA檢測(cè)法,檢測(cè)特異性良好,3 種外源基因的檢出限為0.2%。結(jié)論:轉(zhuǎn)基因大豆的HDA檢測(cè)方法具有普通聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的特異、靈敏等特點(diǎn),并且對(duì)儀器要求更低,極適合基層實(shí)驗(yàn)室使用,具有廣闊的應(yīng)用前景。

依賴(lài)解旋酶DNA擴(kuò)增;轉(zhuǎn)基因大豆;檢測(cè)

隨著現(xiàn)代科技在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中的應(yīng)用,轉(zhuǎn)基因作物近年來(lái)得到迅速發(fā)展。轉(zhuǎn)基因食品在傳統(tǒng)食品市場(chǎng)中份額不斷加大并進(jìn)入了食物鏈。轉(zhuǎn)基因大豆是較早商業(yè)化生產(chǎn)的轉(zhuǎn)基因作物之一,與非轉(zhuǎn)基因大豆相比,轉(zhuǎn)基因大豆在提高產(chǎn)量、抗逆能力、品質(zhì)改良、解決人類(lèi)面臨的環(huán)境污染、溫飽問(wèn)題及資源短缺等方面日益顯出巨大作用。同時(shí),轉(zhuǎn)基因作物的安全性也逐漸成為人們關(guān)注的焦點(diǎn),具體包括食用安全性和生態(tài)安全性[1-2]。由于轉(zhuǎn)基因食品的安全性短時(shí)間內(nèi)難以確定,各國(guó)對(duì)轉(zhuǎn)基因食品使用標(biāo)簽制度進(jìn)行管理[3],所以急需建立一套準(zhǔn)確、快速檢測(cè)轉(zhuǎn)基因食品的方法。

目前,對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)包括基于核酸的檢測(cè)技術(shù)主要有聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)方法[4]和基于PCR原理的其他檢測(cè)方法如實(shí)時(shí)熒光PCR[5-7]、多重PCR[8]、巢式PCR[9-10]、等溫環(huán)介導(dǎo)PCR[11-12],這些方法檢測(cè)速度快,特異性高,但需要特定儀器,難以普及應(yīng)用并且檢測(cè)費(fèi)用昂貴?;诘鞍讬z測(cè)的方法主要是酶聯(lián)免疫法[13],此方法需要的抗體和抗原制備較為困難,價(jià)格昂貴。

近年來(lái),一種新型核酸恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)依賴(lài)解旋酶DNA恒溫?cái)U(kuò)增(helicase-dependent isothermal DNA amplification,HDA)技術(shù)因其操作簡(jiǎn)單、結(jié)果準(zhǔn)確、反應(yīng)靈敏、無(wú)需特殊儀器、便于普及而廣泛受到關(guān)注。HDA技術(shù)是核酸等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)的一種,主要利用解旋酶在恒溫條件下解開(kāi)DNA雙鏈,同時(shí)DNA單鏈結(jié)合蛋白穩(wěn)定解開(kāi)的單鏈為引物提供結(jié)合的模板,之后由DNA聚合酶催化合成互補(bǔ)鏈。新合成的雙鏈在解旋酶作用下又解成單鏈,并作為下一輪合成的模板進(jìn)入上述循環(huán)擴(kuò)增反應(yīng),最終實(shí)現(xiàn)靶序列的指數(shù)式增長(zhǎng)[14]。HDA法目前已經(jīng)應(yīng)用于一些致病菌的檢測(cè)[15-19]以及轉(zhuǎn)基因成分檢測(cè)[20],本研究擬采用以35S啟動(dòng)子(cauliflower mosaic virus 35S,CaMV35S)、NOS終止子(nopaline synthase,NOS)、5-烯醇丙酮酸莽草酸-3-磷酸合成酶(5-enolpyruvylshikimate-3-phosphate synthase,CP4-EPSPS)3 種外源基因和內(nèi)標(biāo)基因Lectin為目的片段設(shè)計(jì)4 對(duì)特異引物,建立快速檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的新方法。

1 材料與方法

1.1 材料與試劑

非轉(zhuǎn)基因大豆、轉(zhuǎn)基因大豆 國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)中心。

十六烷三甲基溴化銨(hexadecyltrimethylammonium bromide,CTAB) 天津市科密歐化學(xué)試劑有限公司;三羥甲基氨基甲烷(tirs hydroxymethyl aminomethane,Tris) 天津市博迪化工有限公司;乙二胺四乙酸二鈉(ethylene diaminetetraacetic acid disodium,Na2EDTA)北京鼎國(guó)昌盛生物技術(shù)有限責(zé)任公司;三氯甲烷、異戊醇、無(wú)水乙醇、氯化鈉(均為分析純) 天津市永大化學(xué)試劑有限公司;大腸桿菌解旋酶Ⅱ(UvrD) 上海富眾生物科學(xué)有限公司;MutL蛋白、T4噬菌體基因32編碼蛋白(T4 gp 32)、Bst聚合酶 美國(guó)NEB公司;dNTP,100 bp DNA Ladder Marker、三磷酸腺苷 大連寶生物技術(shù)公司。

1.2 儀器與設(shè)備

DXY-33A型電泳儀 北京市六一廠;Gel Doc XR凝膠成像系統(tǒng) 美國(guó)伯樂(lè)公司;6400型恒溫金屬浴 上海東升儀器有限公司。

1.3 方法

1.3.1 大豆DNA的提取

將大豆研磨成粉末狀,稱(chēng)取100 mg大豆粉末,加入2 mL離心管中;加入1 000 μL CTAB提取液和2 μL RNase酶溶液,充分混勻,65 ℃孵育30 min,不時(shí)振蕩;12 000 r/min室溫離心5 min,將上清液轉(zhuǎn)移至另一干凈的2 mL離心管中;加入三氯甲烷-異戊醇(24∶1,V/V)溶液,輕緩顛倒數(shù)次后室溫靜置5 min,12 000 r/min室溫離心10 min,將上清液轉(zhuǎn)移至另一干凈的1.5 mL離心管中;加入2 倍體積CTAB沉淀液,顛倒混勻后,室溫靜置1 h;加入400 μL 1 mol/L氯化鈉溶解沉淀,56 ℃孵育15 min,期間輕搖離心管數(shù)次助溶,加入800 μL經(jīng)-20 ℃預(yù)冷的無(wú)水乙醇,顛倒混勻后-20 ℃靜置 1 h,15 000 r/min,室溫離心10 min,小心棄去上清液;體積分?jǐn)?shù)70%乙醇溶液洗滌沉淀2~3 次,干燥DNA;50 μL 0.1×TE溶解沉淀,4 ℃保存?zhèn)溆肹21]。

1.3.2 引物設(shè)計(jì)

根據(jù)抗除草劑草甘膦的轉(zhuǎn)基因大豆,轉(zhuǎn)入外源基因有CaMV35S、NOS和CP4-EPSPS基因,以此類(lèi)基因?yàn)闄z測(cè)目的片段,以Lectin基因作為內(nèi)源基因檢測(cè)DNA的提取質(zhì)量,本實(shí)驗(yàn)就轉(zhuǎn)基因成分的引物設(shè)計(jì)一般遵循目的靶序列較小控制在100~200 bp,一定程度上克服了深加工食品高溫蒸煮等加工工藝對(duì)檢測(cè)方法的限制。根據(jù)美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心公布的外源基因和內(nèi)源基因的準(zhǔn)確序列,使用Primer Premier 5.0引物設(shè)計(jì)軟件,并進(jìn)行BLAST比對(duì),設(shè)計(jì)4 對(duì)特異性擴(kuò)增引物如表1所示。

表1 引物序列與目的擴(kuò)增產(chǎn)物大小Table 1 Primer sequences and corresponding lengths of PCR products

1.3.3 HDA擴(kuò)增體系的建立

[22]優(yōu)化并建立反應(yīng)體系,反應(yīng)體系為50 μL,采用兩步法反應(yīng)。

反應(yīng)液Ⅰ:2 μL模板DNA,引物(10 μmol/L)各2 μL,用ddH2O補(bǔ)至25 μL。

反應(yīng)液Ⅱ:10×buffer(100 mmol/L 二硫蘇糖醇、350 mmol/L Tris-HAc、100 mmol/L MgSO4、1 mg/mL牛血清白蛋白)5 μL,dNTPs(10 mmol/L)4 μL,ATP(100 mmol/L)2 μL,Bst polymerase(8 000 U/mL)2 μL,UvrD helicase(100 mg/L)1 μL,MutL蛋白(600 mg/L)1 μL,T4 gp32(10 mg/mL)0.6 μL,海藻糖(5 mol/L)5 μL,用ddH2O補(bǔ)至25 μL。

反應(yīng)液Ⅰ在95 ℃水浴5 min然后于55 ℃水浴退火3 min,取出后于室溫將反應(yīng)液Ⅱ加入反應(yīng)液Ⅰ混勻,置65 ℃恒溫?cái)U(kuò)增90 min。質(zhì)量分?jǐn)?shù)2%瓊脂糖凝膠電泳(100 V)45 min檢測(cè)產(chǎn)物。

1.3.4 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆特異性

利用表1所列外源基因CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS的3 組引物和內(nèi)源基因Lectin的一組引物,分別對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆和非轉(zhuǎn)基因大豆進(jìn)行HDA法檢測(cè)。按照1.3.3節(jié)建立的HDA反應(yīng)體系進(jìn)行HDA法檢測(cè),驗(yàn)證HDA法檢測(cè)的特異性。

1.3.5 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的產(chǎn)物分析

按照1.3.3節(jié)建立的HDA反應(yīng)體系,分別配制外源基因CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS和內(nèi)源基因Lectin的反應(yīng)體系進(jìn)行HDA擴(kuò)增反應(yīng),反應(yīng)結(jié)束后對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行純化并送專(zhuān)業(yè)測(cè)序機(jī)構(gòu)測(cè)序,測(cè)序結(jié)果通過(guò)NCBI進(jìn)行在線BLAST從而驗(yàn)證擴(kuò)增產(chǎn)物的同源性。

1.3.6 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的檢出限

將非轉(zhuǎn)基因大豆和轉(zhuǎn)基因大豆按比例混合,混合后使轉(zhuǎn)基因大豆所占比例為100%、10%、5%、2.5%、1%、0.5%、0.2%、0.1%、0.01%,使用高速粉碎機(jī)從低濃度到高濃度粉碎大豆樣品,按照1.3.1節(jié)方法提取大豆基因組,并依據(jù)1.3.3節(jié)建立的HDA擴(kuò)增體系進(jìn)行PCR,確定非轉(zhuǎn)基因大豆和轉(zhuǎn)基因大豆混合樣的檢出限。

2 結(jié)果與分析

如圖1所示,由于內(nèi)源基因植物凝集素Lectin基因是大豆內(nèi)源基因,轉(zhuǎn)基因大豆和非轉(zhuǎn)基因大豆均能夠擴(kuò)增出來(lái)409 bp的植物凝集素Lectin基因,符合理論要求,通過(guò)電泳結(jié)果證明與理論相符,因此,植物凝集素Lectin可以作為檢測(cè)大豆轉(zhuǎn)基因?qū)嶒?yàn)的內(nèi)源參照基因,來(lái)達(dá)到檢測(cè)整個(gè)檢測(cè)體系是否正常運(yùn)行的目的。

只有轉(zhuǎn)基因大豆能夠擴(kuò)增出單一且清晰的191 bp的CaMV35S基因、101 bp的NOS基因、255 bp的CP4-EPSPS基因,而非轉(zhuǎn)基因大豆沒(méi)有擴(kuò)增出相應(yīng)的電泳條帶,并且電泳條帶清晰、無(wú)非特異性擴(kuò)增現(xiàn)象,說(shuō)明轉(zhuǎn)基因大豆根據(jù)CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS基因設(shè)計(jì)的引物特異性較強(qiáng),可以用于轉(zhuǎn)基因大豆的轉(zhuǎn)基因成分的檢測(cè)。

2.2 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆產(chǎn)物分析結(jié)果

擴(kuò)增產(chǎn)物由上海生物工程公司進(jìn)行測(cè)序,利用美國(guó)州立生物技術(shù)信息中心生物信息平臺(tái)進(jìn)行在線BLAST,對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行同源性分析,結(jié)果均為100%,如表2所示,證明外源基因CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS和內(nèi)源基因Lectin的擴(kuò)增產(chǎn)物為符合轉(zhuǎn)基因大豆特異性要求的靶標(biāo)基因,符合檢測(cè)需要。

表2 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆擴(kuò)增片斷的比對(duì)結(jié)果Table 2 Homology analysis of HDA amplified fragments from genetically modified soybean by BLAST (basic local alignment search tool)

2.1 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的特異性

利用設(shè)計(jì)的針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆中常見(jiàn)的CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS 3 種外源基因和大豆內(nèi)源基因植物凝集素Lectin基因的4 對(duì)特異性引物進(jìn)行HDA法檢測(cè),以非轉(zhuǎn)基因大豆DNA作為陰性對(duì)照,檢測(cè)這4 對(duì)引物的特異性。

圖1 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的特異性Fig.1 Specificity of HDA for the detection of transgenetic soybean

2.3 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的檢出限

將已知的轉(zhuǎn)基因大豆和已知的非轉(zhuǎn)基因大豆按照不同比例混合,轉(zhuǎn)基因大豆所占的比例分別為100%、10%、5%、2.5%、1%、0.5%、0.2%、0.1%、0.01%,按照1.3.1節(jié)建立的大豆基因組DNA提取方法提取大豆基因組,并配以非轉(zhuǎn)基因大豆對(duì)照和陰性對(duì)照,按1.3.3節(jié)建立的HDA擴(kuò)增體系進(jìn)行擴(kuò)增,確定大豆不同外源基因的檢出限。

圖2 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆外源基因CaMV35S(A)、NOS(B)、CP4 EPSPS(C)的檢出限Fig.2 Electrophorograms showing the detection limit of HDA for CaMV35S (A), NOS (B) and CP4-EPSPS (C) genes

表3 HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的最出限Table 3 The detection limit of HDA for genetically modified soybean

由圖2和表3可知,轉(zhuǎn)基因大豆含量在100%、10%、5%、2.5%、1%、0.5%、0.2%時(shí),外源基因CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS均能夠產(chǎn)生單一、清晰的目的基因片段條帶,長(zhǎng)度分別約為191、101、255 bp,符合特異性引物設(shè)計(jì)目的,而轉(zhuǎn)基因大豆含量在0.1%、0.01%時(shí)則無(wú)清晰可見(jiàn)的目的電泳條帶產(chǎn)生,因此,可以證明HDA法檢測(cè)大豆不同外源基因的檢出限為0.2%。

3 討 論

目前轉(zhuǎn)基因大豆的檢測(cè)已經(jīng)有了許多相關(guān)研究,黃昆侖等[9]用巢式和半巢式對(duì)大豆中的內(nèi)源基因Lectin和轉(zhuǎn)基因大豆中的外源基因進(jìn)行了定量檢測(cè);勵(lì)建榮等[4]通過(guò)設(shè)計(jì)特異性引物和探針對(duì)豆粕中外源基因CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS進(jìn)行了定性檢測(cè);王華[5]、葉可萍[7]等采用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù),通過(guò)使用特異的引物和探針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆外源基因進(jìn)行檢測(cè);Thongsri等[23]使用巢式PCR針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆顆粒中提取的DNA作為模板梯度稀釋成不同濃度梯度的DNA溶液進(jìn)行擴(kuò)增反應(yīng),但經(jīng)典的半巢式PCR操作繁瑣,還需進(jìn)行兩輪PCR反應(yīng),會(huì)大大增加污染的可能性;張秀豐等[8]建立了五重PCR反應(yīng)體系用于檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆;邵碧英等[11]據(jù)轉(zhuǎn)基因大豆A2704-12品系的特異序列設(shè)計(jì)環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增引物建立了轉(zhuǎn)基因大豆A2704-12品系的LAMP檢測(cè)方法,袁瑛娜等[12]以CP4-EPSPS基因的保守區(qū)域設(shè)計(jì)內(nèi)、外引物和環(huán)引物通過(guò)采用改良環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)檢測(cè)抗草甘膦轉(zhuǎn)基因大豆;曾有研究[24]報(bào)道使用HDA法可用于檢測(cè)人乳頭瘤病毒導(dǎo)致的宮頸癌;Zahradnik等[25]針對(duì)幾種常用等溫?cái)U(kuò)增方法在檢測(cè)轉(zhuǎn)基因木薯方面進(jìn)行比較,發(fā)現(xiàn)針對(duì)轉(zhuǎn)基因木薯的CaMV35S基因設(shè)計(jì)引物,使用HDA和環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增方法并進(jìn)行檢測(cè)效果較好,并且HDA法檢測(cè)限可以達(dá)到0.5%[25]。

目前常用的轉(zhuǎn)基因大豆檢測(cè)方法是實(shí)時(shí)熒光PCR技術(shù),通過(guò)在線實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)PCR反應(yīng)并捕捉熒光信號(hào)強(qiáng)度來(lái)實(shí)現(xiàn)即時(shí)定量地檢測(cè)待檢樣品中轉(zhuǎn)基因成分,并且無(wú)需打開(kāi)擴(kuò)增體系這樣封閉操作,也不會(huì)造成氣溶膠污染的潛在污染情況的發(fā)生,毫無(wú)疑問(wèn)是檢測(cè)行業(yè)首推的檢測(cè)方法;環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)雖然也具備不需要昂貴的儀器設(shè)備這樣的優(yōu)勢(shì),但因其引物的靈敏度極高很容易造成假陽(yáng)性,因此實(shí)際檢測(cè)過(guò)程中也很難得到應(yīng)用。在檢測(cè)效率以及防止交叉污染方面,本研究建立HDA技術(shù)檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆方法無(wú)法與熒光定量PCR相媲美,但HDA技術(shù)因其不需要昂貴的PCR儀,引物設(shè)計(jì)簡(jiǎn)單無(wú)需熒光探針,且操作簡(jiǎn)便,僅需要恒溫水浴槽就能進(jìn)行反應(yīng),所以在很多條件受限的基層檢驗(yàn)檢測(cè)機(jī)構(gòu)還是有一定應(yīng)用前景[26],同時(shí)HDA法假陽(yáng)性率相對(duì)較低,很好地保證了檢測(cè)結(jié)果的可信性。隨著轉(zhuǎn)基因技術(shù)的發(fā)展,轉(zhuǎn)基因植物品系確實(shí)越來(lái)越多,本實(shí)驗(yàn)應(yīng)用HDA技術(shù)檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆成分只是針對(duì)CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS等外源基因的篩查檢測(cè),無(wú)法做到品系鑒定,確實(shí)滯后于當(dāng)前轉(zhuǎn)基因檢測(cè)技術(shù)的發(fā)展要求,相信通過(guò)篩查檢測(cè)的實(shí)驗(yàn)積累和條件優(yōu)化摸索可以為實(shí)現(xiàn)品系鑒定打下一定的技術(shù)基礎(chǔ)。隨著轉(zhuǎn)基因作物種植面積的日益增加以及消費(fèi)者對(duì)轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品關(guān)注度的日漸提高,使得轉(zhuǎn)基因的檢測(cè)任務(wù)也將日趨繁重,這就要求檢測(cè)方法具備高特異性、高靈敏度和操作簡(jiǎn)便,因此HDA法用于轉(zhuǎn)基因大豆的檢測(cè)工作將會(huì)有很廣泛的應(yīng)用前景。

4 結(jié) 論

針對(duì)轉(zhuǎn)基因大豆外源調(diào)控序列CaMV35S、NOS、CP4-EPSPS基因和目的基因Lectin序列設(shè)計(jì)引物,成功建立了檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆中轉(zhuǎn)基因成分的HDA方法。HDA法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆的特異性強(qiáng),無(wú)非特異性擴(kuò)增,方法檢測(cè)檢出限為0.2%。

參考文獻(xiàn):

[1] 劉佳, 劉志華, 徐廣惠, 等. 抗草甘膦轉(zhuǎn)基因大豆(RRS)根際微生物和土壤氮素轉(zhuǎn)化的影響[J]. 農(nóng)業(yè)環(huán)境科學(xué)學(xué)報(bào), 2010, 29(7): 1341-1345.

[2] 陳笑蕓, 汪小福, 周育, 等. 轉(zhuǎn)基因大豆深加工食品DNA鑒定技術(shù)研究[J]. 中國(guó)食品學(xué)報(bào), 2013, 13(4): 156-162.

[3] 劉欣, 張國(guó)叢, 周興虎, 等. 轉(zhuǎn)基因大豆MON89788實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)方法的建立[J]. 食品科學(xué), 2015, 36(4): 193-197. DOI:10.7506/ spkx1002-6630-201504038.

[4] 勵(lì)建榮, 余春燕. 豆粕中轉(zhuǎn)基因成分檢測(cè)技術(shù)研究[J]. 中國(guó)糧油學(xué)報(bào), 2007, 22(1): 114-117. DOI:10.3321/j.issn1003-0174.2007.01.029.

[5] 王華, 梁懷宇, 李華. SYBR Green實(shí)時(shí)熒光PCR高通量檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆油[J]. 生物技術(shù)通報(bào), 2011(8): 103-107. DOI:10.13560/j.cnki. biotech.bull.1985.2011.08.009.

[6] LERAT S, ENGLAND L S, VINCENT M L, et al. Real-time polymerase chain reaction quantification of the transgenes for roundup ready corn and roundup ready soybean in soil samples[J]. Journal of Agricultural and Food Chemistry, 2005, 53(5): 1337-1342. DOI:10.1021/jf048830.

[7] 葉可萍, 祝長(zhǎng)青, 周光宏. 利用Taqman實(shí)時(shí)熒光PCR檢測(cè)市售肉制品中轉(zhuǎn)基因大豆成分[J]. 食品與發(fā)酵工業(yè), 2010, 36(12): 160-164. DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.2010.12.037.

[8] 張秀豐, 蘇旭東, 張偉, 等. 五重PCR檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆[J]. 中國(guó)糧油學(xué)報(bào), 2009, 23(3): 194-198.

[9] 黃昆侖, 羅云波. 用巢式和半巢式PCR檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆Roundup Ready及其深加工食品[J]. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào), 2003, 11(5): 461-466. DOI:10.3969/j.issn.1674-7968.2003.05.005.

[10] 閆偉, 徐楨惠, 龍麗坤, 等. 應(yīng)用單管半巢式PCR技術(shù)篩查轉(zhuǎn)基因食品[J]. 食品科學(xué), 2015, 36(2): 194-197. DOI:10.7506/spkx1002-6630-201502037.

[11] 邵碧英, 陳文炳, 曾瑩, 等. LA MP法檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆A2704-12品系[J].食品科學(xué), 2013, 34(24): 202-207. DOI:10.7506/spkx1002-6630-201324042.

[12] 袁瑛娜, 單瀟瀟, 王宗德, 等. 應(yīng)用LAMP實(shí)時(shí)濁度法檢測(cè)轉(zhuǎn)基 因大豆[J]. 現(xiàn)代食品科技, 2011, 27(10): 1264-1267. DOI:10.13982/ j.mfst.1673-9078.2011.10.004.

[13] 白衛(wèi)濱, 孫建霞, 姜桂傳, 等. ELISA方法定量檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆及其產(chǎn)品的研究[J]. 食品與發(fā)酵工業(yè), 2008, 33(11): 103-106. DOI:10.13995/j.cnki.11-1802/ts.2007.11.029.

[14] CAO Y, KIM H J, LI Y, et al. Helica se-dependent amplification of nucleic acids[J]. Current Protocols in Molecular Biology, 2013, 104: 1511-1512. DOI:10.1002/04711427 27.mb1511s104.

[15] CHEN X, WU X, GAN M, et al. Rapid detection of Staphylococcus aureus in dairy and meat foods by combination of capture with silicacoate d magnetic nanoparticles and thermophilic helicase-dependent isothermal amplification[J]. Journal of Dairy Science, 2015, 98(3): 1563-70. DOI:10.3168/jds.2014-8828.

[16] BARREDA-GARCIA S, GONZALEZ-ALVAREZ M J, DELOS-SANTOS-ALVAREZ N, et al. Attomolar quantitation of Mycobac terium tuberculosis by asymmetric helicase-dependent isothermal DNA-amplification and electrochemical detection[J]. Biosens Bioelectron, 2014, 68: 122-128. DOI:10.101 6/ j.bios.2014.12.029.

[17] LI Y, KUMAR N, GOPALAKRISHNAN A, et al. Detection and species ide ntification of malaria parasites by isothermal tHDA amplification directly from human blood without sample preparation[J]. Journal of Molecular Diagnostics, 2013, 15( 5): 634-641. DOI:10.1016/j.jmoldx.2013.05.005.

[18] HUANG S, DO J, MAHALANABIS M, et al. Low cost extraction and isothermal amplification of DNA for infectious diarrhea diagnosis[J]. PLoS One, 2013, 8(3): e60059. DOI:10.1371/journal.pone.0060059.

[19] ECKERT C, HOLSCHER E, PETI T A, et al. Molecular test based on isothermal helicase-dependent amplification for detection of the Clostridium difficile toxin A gene[J]. Journal of Cl inical Microbiology, 2014, 52(7): 2386-2389. DOI:10.1128/JCM.00353-14.

[20] MOURA-MELO S, MIRANDA-CASTRO R, DE-LOS-SANTOSALVAREZ N, et al. Targeting helicase-depe ndent amplification products with an electrochemical genosensor for reliable and sensitive screening of genetically-modified organisms[J]. Analytical Chemistry, 2015, 87(16): 8547-8554. DOI:10.1021/acs.analchem.5b02271.

[21] 山東出入境檢驗(yàn)檢疫局, 汕頭出入境檢驗(yàn)檢疫局, 廣州出入境檢驗(yàn)檢疫局, 等. GB/T 19495.3—2004 轉(zhuǎn)基因產(chǎn)品檢測(cè): 核酸提取純化方法[S].

[22] 王建廣, 雷質(zhì)文, 劉云國(guó), 等. 志賀菌依賴(lài)解旋酶DNA恒溫?cái)U(kuò)增技術(shù)建立[J]. 中國(guó)公共衛(wèi)生, 2012, 28(4): 550-552.

[23] THONGSRI Y, WONGLAKORN L, CHAIPRASERT A, et al. Evaluation for the clinical diagnosis of Pythium insidiosu m using a single-tube nested PCR[J]. Mycopathologia, 2013, 176(5/6): 369-376. DOI:10.1007/s11046-013-9695-3.

[24] BARBIERI D, VENTUROLI S, ROSL F, et al. Detection of high-risk human papillomavirus type 16 and 18 using isothermal helicase-dependent amplification[J]. Diagnostic Microbiology and Infe ctious Disease, 2014, 79(2): 178-182. DOI:10.1016/ j.diagmicrobio.2014.02.012.

[25] ZAHRADNIK C, KOLM C, MARTZY R, et al. Detection of the 35S promoter in transgenic maize via various isothermal amplification techniques: a practical approach[J]. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2014, 406(27): 6835-6842. DOI:10.1007/s00216-014-7889-2.

[26] YANG Z, MCLENDON C, HUTTER D, et al. Helicase-dependent isothermal amplification of DNA and RNA by using self-avoiding molecular recogni tion systems[J]. Chembiochem, 2015, 16(9): 1365-1370. DOI:10.1002/cbic.201500135.

Detection of Genetically Modified Soybean by Helicase-Dependent Isothermal DNA Amplification Assay

ZHANG Jingjing1, WANG Zan1, ZHANG Cuixia1, MA Chaofeng1, ZHOU Wei1,2,*, ZHANG Yan1
(1. Hebei Food Safety Key Laboratory, Hebei Food Inspection and Research Institute, Shijiazhuang 050071, China; 2. College of Food Science and Technology, Agricultural University of Hebei, Baoding 071000, China)

Objective: To establish a new rapid method to detect genetically modifi ed soybean based on helicase-dependent isothermal DNA amplification (HDA). Methods: With four highly specific sets of primers synthesized to target genes including Lectin in soybean and CaMV35S, NOS and CP4-EPSPS foreign genes, PCR reaction system was established. The specifi city and sensitivity of the PCR method were tested based on HDA and homology analysis was performed. Results: The helicase-dependent isothermal DNA amplifi cation method for the rapid detection of genetically modifi ed soybean has been established. The detection limits of CaMV35S, NOS and CP4-EPSPS genes in genetically modifi ed soybeans by HDA were all 0.2%. Conclusion: HDA is a rapid, user-friendly, specifi c and sensitive method for the detection of genetically modifi ed soybean, and is very suitable for use in grassroots laboratories with a broad prospect.

helicase-dependent isothermal DNA amplifi cation (HDA); genetically modifi ed soybean; detection

10.7506/spkx1002-6630-201604029

TS207.3

A

1002-6630(2016)04-0164-05

章晶晶, 王贊, 張翠俠, 等. 應(yīng)用依賴(lài)解旋酶DNA擴(kuò)增技術(shù)檢測(cè)轉(zhuǎn)基因大豆[J]. 食品科學(xué), 2016, 37(4): 164-168.

DOI:10.7506/spkx1002-6630-201604029. http://www.spkx.net.cn

ZHANG Jingjing, WANG Zan, ZHANG Cuixia, et al. Detection on genetically modified soybean by helicase-dependent isothermal DNA amplification assay[J]. Food Science, 2016, 37(4): 164-168. (in Chinese with English abstract) DOI:10.7506/spkx1002-6630-201604029. http://www.spkx.net.cn

2015-06-07

國(guó)家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(31401584)

章晶晶(1988—),女,助理工程師,碩士,研究方向?yàn)樯锘瘜W(xué)與分子生物學(xué)。E-mail:zhangjj@qibebt.ac.cn

*通信作者:周巍(1983—),男,高級(jí)工程師,博士研究生,研究方向?yàn)檗r(nóng)產(chǎn)品加工及貯藏工程。E-mail:zhouwei0311@163.com

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