程晉龍,劉蒙蒙,胡楠,張國(guó)中
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,北京海淀100193;2.北京市畜牧總站,北京朝陽(yáng)100107)
ClassⅠ新城疫病毒BJ 1株微基因組的構(gòu)建及功能鑒定
程晉龍1,劉蒙蒙1,胡楠2,張國(guó)中1
(1.中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物醫(yī)學(xué)院,北京海淀100193;2.北京市畜牧總站,北京朝陽(yáng)100107)
將以綠色熒光蛋白(EGFP)為報(bào)告基因的ClassⅠ類(lèi)新城疫病毒(NDV)BJ1株微基因組質(zhì)粒pOK-M和3個(gè)輔助蛋白表達(dá)質(zhì)粒pCI-NP、pCI-P、pCI-L共轉(zhuǎn)染BSR T7/5細(xì)胞,轉(zhuǎn)染24 h即可見(jiàn)到明顯的綠色熒光,表明微基因組及其3種輔助質(zhì)粒均獲得了表達(dá),并具有各自的生物學(xué)功能,為進(jìn)一步建立該毒株的反向遺傳操作系統(tǒng)奠定了基礎(chǔ)。
新城疫病毒;ClassⅠ;微基因組;反向遺傳;輔助質(zhì)粒
新城疫病毒(NDV)為副黏病毒科(Paramyxoviridae)、副黏病毒亞科(Paramyxovirinae)、禽腮腺炎病毒屬(Rubulavirus)成員,是禽Ⅰ型副黏病毒的代表株。病毒核酸為單股負(fù)鏈RNA,根據(jù)基因組長(zhǎng)度NDV分為ClassⅠ和ClassⅡ兩類(lèi)[1],其中ClassⅠ型NDV基因組長(zhǎng)15 198 nt[2],廣泛存在于野鳥(niǎo)和家禽中,多為無(wú)致病性或致病性較弱的毒株;ClassⅡ類(lèi)NDV基因組包括兩種長(zhǎng)度:15 186 nt或15 192 nt[3],其中既包括強(qiáng)毒株也包括弱毒株。因?yàn)殡u群暴發(fā)的致死性新城疫通常是由ClassⅡNDV中的強(qiáng)毒株引起[4-5],所以人們對(duì)ClassⅡNDV研究較早。ClassⅠ類(lèi)NDV因其通常沒(méi)有致病性所以研究較少,但該類(lèi)病毒在各種鳥(niǎo)類(lèi)中廣泛存在。有研究表明,ClassⅠ類(lèi)NDV在傳代過(guò)程中毒力有增強(qiáng)的可能性[6],因此該類(lèi)NDV對(duì)養(yǎng)禽業(yè)有潛在的威脅。
NDV的微基因組是包含了病毒全長(zhǎng)基因組3′和5′末端UTR(非編碼區(qū))序列,并用反向互補(bǔ)的EGFP(綠色熒光蛋白)替代其間的編碼區(qū)序列所構(gòu)成的一種缺損病毒,因其需要輔助蛋白的幫助才能完成編碼區(qū)蛋白(EGFP)的表達(dá),所以人們往往把其作為檢測(cè)輔助質(zhì)粒的重要工具。本研究構(gòu)建了ClassⅠ類(lèi)NDV BJ1株的微基因組及其3種輔助質(zhì)粒,并對(duì)他們的功能進(jìn)行了驗(yàn)證,為建立該毒株全基因組反向遺傳操作系統(tǒng)和開(kāi)展功能基因組研究奠定了基礎(chǔ)。
1.1毒株本研究所用ClassⅠNDV毒株系本實(shí)驗(yàn)室于2014年從北京某活禽市場(chǎng)分離獲得,通過(guò)接種SPF雞胚進(jìn)行病毒傳代。
1.2質(zhì)粒和細(xì)胞真核表達(dá)載體pCI-neo,購(gòu)自英濰捷基(上海)貿(mào)易有限公司;表達(dá)T7 RNA聚合酶的BSR T7/5細(xì)胞由本實(shí)驗(yàn)室保存。含有增強(qiáng)型綠色熒光蛋白(EGFP)基因的質(zhì)粒pEGFPN1,購(gòu)自北京六合通經(jīng)貿(mào)有限公司。
1.3分子生物學(xué)試劑M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶、T4連接酶,購(gòu)自Promega公司;dNTP,購(gòu)自TaKaRa公司;Lipofectamine 2000、限制性?xún)?nèi)切酶以及TRIZol抽提試劑,購(gòu)自Invitrogen公司;Plasmid Mini Kit,購(gòu)自天根生化科技(北京)有限公司;DMEM細(xì)胞培養(yǎng)基,購(gòu)自Gibco公司。
1.4微型基因組的構(gòu)建微基因組包括4部分:T7啟動(dòng)子和cDNA的3′UTR、EGFP、cDNA的5′UTR、核酶序列和T7終止子,分別命名為M1、M2、M3、M4。大小分別為211 bp、720 bp、121 bp和136 bp。設(shè)計(jì)引物(表1)PCR擴(kuò)增得到4個(gè)目的片段,再使用融合PCR的方法得到完整的微基因組片段。用限制性?xún)?nèi)切酶EcoRⅠ和PstⅠ對(duì)微基因組和pOK進(jìn)行酶切,電泳鑒定后進(jìn)行膠回收純化,然后進(jìn)行連接轉(zhuǎn)化,挑取菌落做菌液PCR鑒定,將陽(yáng)性克隆送北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司測(cè)序鑒定,得到陽(yáng)性質(zhì)粒pOK-M。
表1用于擴(kuò)增微基因組片段的引物
1.5輔助質(zhì)粒的構(gòu)建設(shè)計(jì)引物(表2)利用PCR方法獲得3種輔助蛋白NP、P、L的目的片段,用特定的限制性?xún)?nèi)切酶對(duì)目的片段和表達(dá)載體pCI-neo進(jìn)行酶切,酶切后對(duì)目的片段進(jìn)行膠回收純化,然后將相應(yīng)的目的片段與載體進(jìn)行連接轉(zhuǎn)化,挑取菌落做菌液PCR鑒定,將陽(yáng)性克隆進(jìn)行測(cè)序鑒定。其中對(duì)NP、P和pCI-neo載體用XholⅠ和EcoRⅠ進(jìn)行酶切。由于L基因組較長(zhǎng),采用了分段克隆的方式進(jìn)行拼接并轉(zhuǎn)移到pCI載體中。將得到陽(yáng)性質(zhì)粒分別命名為pCI-NP、pCI-P和 pCI-L。
1.6輔助質(zhì)粒功能的鑒定采用Lipofectamine 2 000轉(zhuǎn)染試劑盒說(shuō)明書(shū)方法,將pOK-M、pCINP、pCI-P和pCI-L 4種質(zhì)粒共2 μg按照2∶2∶1∶1轉(zhuǎn)染培養(yǎng)于6孔板的BSR T7/5細(xì)胞,設(shè)置缺少pCI-L轉(zhuǎn)染的陰性對(duì)照,37℃下作用5 h,更換含有10%胎牛血清的DMEM。37℃、5%CO2條件下繼續(xù)培養(yǎng)24 h,在熒光顯微鏡下觀察報(bào)告基因的表達(dá)情況。
表2用于擴(kuò)增NP、P、L的引物
2.1微型基因組的構(gòu)建NDV的微基因組分為四部分,其中M1片段包括EcoRⅠ酶切位點(diǎn)、T7啟動(dòng)子和cDNA的3′UTR,M2為反向互補(bǔ)的EGFP,M3為cDNA的5′UTR,M4包含核酶序列、T7終止子和PstⅠ酶切位點(diǎn),M為上述4個(gè)片段經(jīng)融合PCR后的產(chǎn)物,PCR產(chǎn)物經(jīng)膠回收測(cè)序比對(duì)后,序列正確,PCR擴(kuò)增結(jié)果如圖1所示。
圖1微基因組4部分及融合PCR產(chǎn)物的電泳鑒定
2.2輔助質(zhì)粒的構(gòu)建PCR擴(kuò)增得到的NP、P、L1、L2、L3基因片段大小分別為1.5 kb、1.2 kb、1.5 kb、2.2 kb和2.8 kb,PCR產(chǎn)物膠回收后測(cè)序,與原測(cè)序結(jié)果比對(duì),序列正確,無(wú)突變,電泳鑒定結(jié)果如圖2所示。采用常規(guī)連接轉(zhuǎn)化的方法克隆到pCI-neo載體中,經(jīng)測(cè)序鑒定后得到3種輔助質(zhì)粒,命名為pCI-NP、pCI-P、pCI-L。
圖2NP、P和L基因PCR產(chǎn)物的電泳鑒定
2.3輔助質(zhì)粒功能的鑒定pOK-M、pCI-NP、pCIP和pCI-L 4種質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染BSR T7/5細(xì)胞24 h后,通過(guò)倒置熒光顯微鏡觀察,在轉(zhuǎn)染的細(xì)胞中可觀察到明顯的特異性綠色熒光(圖3A),表明報(bào)告基因EGFP得到表達(dá),說(shuō)明輔助質(zhì)粒的表達(dá)產(chǎn)物具有功能活性,可以啟動(dòng)微基因組的復(fù)制和轉(zhuǎn)錄。而在陰性對(duì)照組中未觀察到熒光(圖3B)。
圖3轉(zhuǎn)染BSR T7/5細(xì)胞24 h后特異性熒光的觀察結(jié)果
ClassⅠ型NDV毒株多是弱毒株或無(wú)致病性的毒株,主要存在于野生鳥(niǎo)或水禽中。近年來(lái),在我國(guó)大陸、香港、臺(tái)灣等活禽市場(chǎng)中均能分離到ClassⅠ型NDV毒株,而Yu等的研究證明,某些ClassⅠ型弱毒株在雞體內(nèi)經(jīng)過(guò)傳代會(huì)發(fā)生毒力增強(qiáng)的現(xiàn)象[7],可能造成ND的流行。由于該類(lèi)病毒在各種鳥(niǎo)類(lèi)中廣泛存在,不同毒株混合感染還可能會(huì)造成不同毒株的重組,使得ND的防治變得更加復(fù)雜。
反向遺傳技術(shù)已經(jīng)成為NDV研究不可或缺的技術(shù)平臺(tái),也被稱(chēng)為“病毒拯救”[7]。NDV的拯救首先要構(gòu)建3種輔助質(zhì)粒,分別為表達(dá)NP、P、L蛋白的質(zhì)粒,這3種質(zhì)粒對(duì)NDV的復(fù)制、轉(zhuǎn)錄起著重要作用,而微基因組一般作為檢測(cè)輔助質(zhì)粒生物活性的工具。本研究通過(guò)PCR技術(shù)擴(kuò)增出NP、P、L基因,并分別成功克隆到pCI-neo載體上,經(jīng)測(cè)序鑒定,擴(kuò)增的目的片段序列正確。其中L片段分3段進(jìn)行克隆。為了檢測(cè)這3種輔助質(zhì)粒的活性,本研究又構(gòu)建了NDV的微基因組。NDV的微基因組是包含了病毒全長(zhǎng)基因組3′和5′末端UTR(非編碼區(qū))序列,并用反向互補(bǔ)的EGFP(綠色熒光蛋白)替代其間的編碼區(qū)序列所構(gòu)成的一種缺損病毒,需要輔助蛋白的幫助才能完成編碼區(qū)蛋白(EGFP)的表達(dá)。因此,微基因組中EGFP的表達(dá)可以說(shuō)明構(gòu)建的輔助質(zhì)粒具有表達(dá)活性。
本研究利用構(gòu)建的微基因組質(zhì)粒pOK-M對(duì)構(gòu)建的3個(gè)輔助質(zhì)?;钚赃M(jìn)行鑒定。結(jié)果表明,共轉(zhuǎn)染的BSR T7/5細(xì)胞中可觀察到特異性熒光,說(shuō)明3個(gè)輔助質(zhì)粒均有表達(dá)活性,為進(jìn)一步建立該病毒的反向遺傳操作平臺(tái)奠定了基礎(chǔ)。
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Construction and Identification of Mini-genomeof ClassⅠNewcastleDiseaseVirus Strain BJ 1
CHENG Jin-long1,LIU Meng-meng1,HU Nan2,ZHANG Guo-zhong1
(1.College of Veterinary Medicine,China Agricultural University,Beijing 100193,China;2.Beijing Animal Husbandry Station,Beijing 100107,China)
To examine the efficiency of the mini-genome rescue system,BSR-T7/5 cells were co-transfected with pOK-M,pCI-NP,pCI-P,pCI-L.The results showed that the green fluorescence was observed in the co-transfected group,but there was no green fluorescence in the control groups in 24 h.The result indicated that the NP,P and L proteins were all expressed.In conclusion,we established a mini-genome system that could be applied to the recovery of NDV BJ1 strain.
NDV;ClassⅠ;Mini-genome;Reverse genetics;Helper plasmids
ZHANG Guo-zhong
S852.65+9.5
A
0529-6005(2016)08-0009-03
2015-05-05
現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系北京市家禽創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)專(zhuān)項(xiàng)資金(CARS-PSTP)
程晉龍(1993-),男,本科生,就讀于預(yù)防獸醫(yī)學(xué)專(zhuān)業(yè),E-mail:15611528256@163.com
張國(guó)中,E-mail:zhanggz@cau.edu.cn