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花生AhDGAT2a基因啟動子的克隆和功能驗證

2016-09-18 06:44史靈敏田海瑩萬書波彭振英
作物學(xué)報 2016年7期
關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)基因元件克隆

鄭 玲 史靈敏 田?,摗巍±住∵叀§场」》濉⌒帯∪f書波,* 彭振英,3,*

1山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究中心 / 山東省作物遺傳改良與生態(tài)生理重點實驗室, 山東濟南 250100;2山東大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山東濟南 250100;3新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院, 新疆烏魯木齊 830000

花生AhDGAT2a基因啟動子的克隆和功能驗證

鄭玲1,2史靈敏1,3田?,?,2單雷1,2邊斐1郭峰1宣寧1萬書波1,2,*彭振英1,2,3,*

1山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究中心 / 山東省作物遺傳改良與生態(tài)生理重點實驗室, 山東濟南 250100;2山東大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,山東濟南 250100;3新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院, 新疆烏魯木齊 830000

二酰甘油?;D(zhuǎn)移酶(DGAT)是三酰甘油(TAG)合成途徑的限速酶, 對脂肪酸合成的調(diào)節(jié)具有關(guān)鍵作用。為了研究AhDGAT2a的表達調(diào)控, 利用GenomeWalking方法從魯花14基因組中克隆了AhDGAT2a上游5'側(cè)翼調(diào)控區(qū)1200 bp序列, 即AhDGAT2a啟動子(pAhDGAT2a)序列, 并利用生物信息學(xué)軟件分析其包含的調(diào)控元件, 發(fā)現(xiàn)其含有多個TATA-box和CAAT-box、光調(diào)控元件、脅迫防御相關(guān)元件和激素響應(yīng)元件。用pAhDGAT2a構(gòu)建pAhDGAT2a:GUS植物表達載體并轉(zhuǎn)化煙草品種SR1。利用組織染色法鑒定轉(zhuǎn)基因煙草的GUS表達模式, 發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)基因煙草的各個器官均有GUS酶活, 在柱頭、花藥和幼嫩種子中表達量較高, 說明pAhDGAT2a具有一定的組成型啟動子活性。

花生; AhDGAT2a基因; 啟動子; 功能驗證

植物油是食用油的主要來源, 約占全世界脂類消耗的75%[1]。植物油是由脂肪酸和甘油化合而成的天然化合物。脂肪酸, 是指一端含有一個羧基的長的脂肪族碳氫鏈,是機體主要能量來源之一。植物油的不飽和脂肪酸含量比較高, 作為食用油, 可以降低人體血液中膽固醇的含量,降低動脈硬化發(fā)生的幾率[2]。三酰甘油(triacylgycerol, TAG)是大多數(shù)植物和動物體內(nèi)最重要的油脂貯藏形式,具有重要的社會經(jīng)濟價值。?;o酶A:二酰甘油?;D(zhuǎn)移酶(acyl-CoA diacylgycerol acyltransferase, DGAT)是一種內(nèi)質(zhì)網(wǎng)細胞微粒體酶, 其主要作用是催化二酰甘油(diacylglycerol, DAG)加上?;舅嵝纬蒚AG[3]。該基因不僅與脂肪酸合成相關(guān), 在種子萌發(fā)和葉片衰老等過程中也有一定的作用[4-7]。

1956年DGAT基因首次被發(fā)現(xiàn)[8], 并很快引起研究人員的廣泛關(guān)注。根據(jù)結(jié)構(gòu)和細胞定位的差異, DGAT被分為DGAT1、DGAT2、WS/DGAT和胞質(zhì)DGAT四種類型[9-10]。DGAT1屬于包括酰基輔酶A膽固醇?;D(zhuǎn)移酶ACAT1和ACAT2在內(nèi)的膜結(jié)合?;D(zhuǎn)移酶(membrane-bound O-acyltransferases, NBOAT)家族的一部分[11]。DGAT2是一個蛋白超級家族, 在動物[12]、植物[13]和酵母[14]中都存在, 但是與DGAT1蛋白家族沒有明顯的相關(guān)性。WS/DGAT和胞質(zhì)DGAT是近幾年發(fā)現(xiàn)的DGAT基因家族的新成員, 目前相關(guān)研究較少。胞質(zhì)DGAT (Cyto DGAT)是從花生未成熟種子中獲得的一類新型二酰甘油?;D(zhuǎn)移酶基因[9], 該基因沒有跨膜結(jié)構(gòu), 與WS/DGAT具有13%的一致性, 與DGAT1和DGAT2家族具有不到10%的相似性。DGAT1和DGAT2大多被定位于內(nèi)質(zhì)網(wǎng)[15-16], 而胞質(zhì)DGAT是一種定位于細胞質(zhì)中的可溶性蛋白[9]。

DGAT1和DGAT2對于種子油脂合成非常重要[17-18],是Kennedy途徑中唯一的限速酶。在擬南芥中過量表達DGAT1基因可使種子含油量顯著提高, 而且可使轉(zhuǎn)基因擬南芥種子內(nèi)的DGAT活性比野生型提高10%~70%[19]。在玉米中過量表達DGAT1不僅可使轉(zhuǎn)基因玉米種子含油量提高, 而且改變了油脂組成[20]。DGAT2在大豆等轉(zhuǎn)基因油料作物中過量表達均能提高種子的含油量[21-22]。

DGAT基因一直是油料作物的研究熱點?;ㄉ谖覈姆N植面積已超過460萬公頃, 總產(chǎn)量居世界首位[23]?;ㄉ讶蚀种竞?0%左右, 僅次于芝麻[24]。由于DGAT在植物種子發(fā)育過程中影響種子油分含量、脂肪酸組成等,對于油料作物花生DGAT的研究具有重要經(jīng)濟意義。目前花生的DGAT基因也有一些研究成果[9,25-27], 但是對DGAT基因啟動子的研究卻很少。

我們前期從花生中克隆得到了AhDGAT2a基因(GenBank登錄號為JF897614), 該基因編碼區(qū)為1005 bp,將該基因在煙草中過表達, 發(fā)現(xiàn)其能改變轉(zhuǎn)基因煙草葉片的總脂肪酸含量和組成[25]。將AhDGAT2a基因在大腸桿菌Rosetta (DE3)表達, 能使大腸桿菌的體積增大2.4~2.5倍, 同時提高大腸桿菌的總脂肪酸含量[26]。為進一步研究AhDGAT2a基因的表達模式和基因組信息, 我們通過GenomeWalking方法從花生中克隆了AhDGAT2a基因的啟動子序列(pAhDGAT2a), 并通過農(nóng)桿菌介導(dǎo)的遺傳轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化煙草進行功能驗證。這為我們研究植物DGAT2的功能和油料作物TAG的合成及調(diào)控提供了依據(jù), 為我們培育油料作物新品種奠定了基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 試驗材料及菌液

花生品種魯花14由實驗室保存, 室內(nèi)培育后取幼葉,液氮速凍保存在–80℃。煙草品種SR1由實驗室保存。大腸桿菌(Escherichia coil) DH5α, 根癌農(nóng)桿菌(Agrobacterium tumefaciens)菌株LBA4404, 表達載體pCAMBIA2301均由本實驗室保存。

1.2生化試劑及試劑盒

材料基因組DNA提取試劑盒、凝膠回收試劑盒和質(zhì)粒DNA提取試劑盒為TIANGEN公司產(chǎn)品。Genome Walking試劑盒購自TaKaRa。T4 DNA連接酶及限制性內(nèi)切酶購自Fermentas。其他化學(xué)試劑為國藥產(chǎn)品。引物合成和測序由生工生物工程(上海)股份有限公司完成。

1.3pAhDGAT2a克隆與序列測定

pAhDGAT2a的克隆按照GenomeWalking試劑盒進行3輪擴增。用到的引物SP1: 5'-GGAGAGAGGTAGAA AGAGAAG-3', SP2: 5'-CGCAAGCGCCAGCGTCGTTTT GAAGC-3', SP3: 5'-CCGCCGGCGGCGCCACCGTGACG TT-3'從上海生工合成。反應(yīng)體系含基因組DNA 1 μg、2.5 mmol L–1dNTPs混合物8 μL、10×LA PCR buffer II 5 μL、5 U TaKaRa LA Taq 0.5 μL、100 μmol L–1AP1 Primer 1 μL、10 μmol L–1SP1 Primer 1 μL, ddH2O加到總體積50 μL。反應(yīng)條件為94℃ 1 min, 98℃ 1 min, 5個循環(huán)的94℃ 30 s, 65℃ 1 min, 72℃ 2 min, 然后94℃ 30 s; 25℃ 3 min; 72℃ 2 min, 15個循環(huán)的94℃ 30 s; 65℃ 1 min; 72℃ 2 min; 94℃ 30 s; 65℃ 1 min; 72℃ 2 min; 94℃ 30 s;44℃ 1 min; 72℃ 2 min, 最后72℃延伸10 min。第1輪產(chǎn)物稀釋100倍后取1 μL作為第2輪模板, 以AP1 Primer為上游引物, SP2為下游引物, 其余同第1輪擴增體系。反應(yīng)條件為15個循環(huán)的94℃ 30 s; 65℃ 1 min; 72℃ 2 min; 94℃ 30 s; 65℃ 1 min; 72℃ 2 min; 94℃ 30 s; 44℃1 min; 72℃ 2 min, 最后72℃延伸10 min。第2輪產(chǎn)物稀釋100倍后取1 μL作為第3輪模板, 以AP1 Primer為上游引物, SP3為下游引物其余同第1輪擴增體系, 反應(yīng)條件同第2輪。第2輪和第3輪PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測, 回收純化目的條帶, 連接到pMD18-T載體測序。測序完成后用PlantCARE軟件分析其調(diào)控元件。

1.4pAhDGAT2a:GUS植物表達載體構(gòu)建

將得到的pAhDGAT2a序列用引物PD2F/PD2R擴增,引物序列為PD2F: 5'-TCTAGA ACGACTGCCACATTATA CATTCTAGC-3', PD2R: 5'-CCATGGTTTGGATTCGGTGG CTGTTG-3', 引物兩側(cè)分別添加Xba I和Nco I酶切位點。提取花生幼葉的基因組DNA, 用基因組DNA為模板進行PCR擴增, 得到的序列進行雙酶切, 利用T4連接酶連接到pCAMBIA2301載體, 替換pCAMBIA2301載體上的CaMV35S啟動子。連接體系為PCR片段6 μL, 載體DNA 2 μL, 10×T4連接酶1 μL, T4 DNA連接酶1 μL。上述體系于16℃過夜連接, 連接體系轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài),測序確定pAhDGAT2a:GUS表達載體構(gòu)建成功。將構(gòu)建好的pAhDGAT2a:GUS表達載體轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌LBA4404感受態(tài)細胞, 挑取單菌落進行PCR驗證, 陽性克隆保存菌液待用。

1.5煙草遺傳轉(zhuǎn)化

煙草種子經(jīng)75%乙醇和次氯酸鈉消毒, 無菌水洗凈后播于1/2 MS0基本培養(yǎng)基上生長4~5周, 利用葉盤法轉(zhuǎn)化煙草。將攜帶pAhDGAT2a:GUS表達載體的農(nóng)桿菌于28℃, 200轉(zhuǎn) min–1振蕩培養(yǎng)至對數(shù)生長期。取煙草葉片,剪成小塊(0.5 cm × 0.5 cm)置MS0重懸的菌液中15 min,取出后用無菌濾紙吸干水分。在MS分化培養(yǎng)基上暗培養(yǎng)2 d后取出, 于MS選擇培養(yǎng)基(含100 mg L–1kanamycin)上誘導(dǎo)長出叢生芽, 將叢生芽切下放入伸長培養(yǎng)基長至3~5 cm時, 轉(zhuǎn)移到生根培養(yǎng)基使其生根。將生根后的幼苗移入盛有無菌土的花盆, 溫室常規(guī)管理。

1.6 陽性植株的分子檢測

利用CTAB法提取轉(zhuǎn)基因煙草葉片的DNA, 利用引物PD2F/PD2R進行PCR檢測。將陽性煙草的幼苗和其他組織器官加入GUS染液, 37℃保溫16 h。用70%乙醇沖洗浸泡, 在體視解剖鏡下觀察染色情況并照相。

2 結(jié)果與分析

2.1pAhDGAT2a啟動子克隆與測序

利用GenomeWalking試劑盒, 經(jīng)過3輪擴增得到pAhDGAT2a的核苷酸片段(圖1), 長度1200 bp左右。將該序列連接到pMD18-T載體上測序表明, 該序列為AhDGAT2a基因的啟動子序列。

圖1 pAhDGAT2a的兩輪擴增結(jié)果Fig. 1 PCR products of pAhDGAT2a promoterM: DL2000; A: 第2輪擴增結(jié)果; B: 第3輪擴增結(jié)果。M: DL2000; A: products of the second round PCR; B: products of the third round PCR.

2.2pAhDGAT2a啟動子的序列分析

PlantCARE分析顯示該序列含有126個TATA-box和22個CAAT-box元件, 符合啟動子的一般特點。該啟動子序列含有多個與脅迫和防御相關(guān)的順式作用元件, 主要包括一個參與干旱應(yīng)答反應(yīng)的MBS元件, 3個參與高溫應(yīng)答反應(yīng)的HSE元件, 2個參與脅迫和防御應(yīng)答反應(yīng)的TC-rich repeats。另外還含有3種激素應(yīng)答元件, 包括2個激素應(yīng)答元件TGA-元件, 2個茉莉酸應(yīng)答元件CGTCA-motif和TGACG-motif, 一個赤霉素應(yīng)答元件GARE-motif。該啟動子還含有真菌激活子應(yīng)答元件W1-box及一些光應(yīng)答元件(Sp1、I-box、GT1-motif、ACE和MNF1)。這表明AhDGAT2a的表達調(diào)控可能受多種因素的影響。

2.3煙草的遺傳轉(zhuǎn)化與分子檢測

先利用卡那霉素初步篩選, 再利用PCR方法檢測轉(zhuǎn)基因煙草株系(圖2)。結(jié)果表明, 有14個株系在1200 bp左右出現(xiàn)條帶, 該片段與目的條帶大小一致, 表明我們得到了陽性轉(zhuǎn)基因煙草株系。

2.4轉(zhuǎn)基因煙草的GUS染色

利用GUS染色方法檢測GUS基因在T2代轉(zhuǎn)基因煙草的各組織器官表達的結(jié)果表明(圖3), GUS在轉(zhuǎn)基因煙草的營養(yǎng)和生殖器官均有表達, 其中在柱頭、花藥和幼嫩種子中表達量較高(圖3-G, H), 而在花絲和花柱中則基本不表達(圖3-F, G)。

圖2 PCR檢測轉(zhuǎn)基因煙草Fig. 2 PCR detection of the transgenic tobacco lines1~18: 轉(zhuǎn)基因煙草株系; M: DL2000; +: 陽性對照; –: 陰性對照; WT: 野生型煙草。1–18: transgenic tobacco lines; M: DL2000; +: positive control; –: negative control; WT: wide type tobacco.

3 討論

TAG是大多數(shù)植物和動物體內(nèi)最重要的油脂貯藏形式, DGAT是TAG合成反應(yīng)的限速酶, 對于種子油脂合成非常重要[17-18]。在擬南芥等多種植物中過量表達DGAT基因均能顯著提高種子的含油量[17,19,28-30]。我們實驗室前期從花生中克隆得到了DGAT2基因, 將其與CaMV35S啟動子相連接, 構(gòu)建植物表達載體轉(zhuǎn)化煙草并對其進行了功能驗證, 發(fā)現(xiàn)其能提高轉(zhuǎn)基因煙草的總脂肪酸含量[25]。

啟動子是一段位于結(jié)構(gòu)基因5'端上游區(qū)的DNA序列,能夠使RNA聚合酶與之結(jié)合并起始目標基因轉(zhuǎn)錄, 是轉(zhuǎn)錄水平上基因表達調(diào)控的關(guān)鍵部位。啟動子上的順式作用元件通常含有TATA-box、CAAT-box和GC-box元件, 其中TATA-box是啟動子上最具特征的序列。本研究的pAhDGAT2a中含有126個TATA-box和22個CAAT-box元件, 表明其具有典型啟動子的特征。

不同的啟動子都具有自己特異的調(diào)節(jié)序列, 如USE、MSP等。大多數(shù)綠色植物都包含若干個光應(yīng)答元件(light response element), 如G-box[31-32]、I-box[31]、GT1元件(或GATA元件)[33]、AT富含元件[34-35]、Z-box[36]等, 這些作用元件對光調(diào)控的轉(zhuǎn)錄激活是必需的[37]。在pAhDGAT2a中也含有一些光應(yīng)答元件, 而前期研究表明AhDGAT2基因在花生葉片中具有一定的表達量[25], 這些結(jié)果表明AhDGAT2的表達調(diào)控可能會受到光信號的影響。pAhDGAT2a還包含激素響應(yīng)元件和脅迫誘導(dǎo)元件, 預(yù)示AhDGAT2a的表達受激素誘導(dǎo), 并且在脅迫響應(yīng)中起一定的作用。我們前期分析了AhDGAT2基因在不同脅迫(冷、干旱、鹽、紫外照射、ABA、機械損傷和病害)下的表達模式, 結(jié)果表明AhDGAT2基因在受到機械損傷時表達下調(diào)最明顯, 在冷、干旱、鹽和紫外照射脅迫下表達量略有下降, 而在ABA處理和病害脅迫下表達顯著上調(diào)[25]。這恰好與pAhDGAT2a含有多種脅迫相關(guān)元件相吻合。在他人研究中也有類似報道, 如麻風(fēng)樹的種子特異性啟動子JcMFT1受脫落酸誘導(dǎo), 是由于其含有ABA應(yīng)答元件、G-box、RY repeat等元件[38]; Xu等[39]在中國華東野生葡萄中克隆了一個受白粉病和赤星病誘導(dǎo)表達的VpSTS誘導(dǎo)型啟動子, 通過序列分析發(fā)現(xiàn)該啟動子含有Box-W1、TC-rich element、ABRE、MBS、LTR等特殊元件。

圖3 轉(zhuǎn)基因煙草的GUS染色圖Fig. 3 GUS staining of the transformed tobacco linesA~D: 野生型煙草; E~H: 轉(zhuǎn)基因煙草; A, E: 煙草幼苗; B, F: 花;C, G: 花藥和柱頭; D, H: 未成熟的種子。A~C, E~G比例尺為1 cm; D, H比例尺為1 mm。A–D, wild type tobacco; E–H, transgenic tobacco. A and E: seedlings; B and F: flowers; C and G: anthers and stigmas;D and H: immature seeds. Bars = 1 cm in A–C and E–G; bars = 1 mm in D, H.

目前關(guān)于植物DGAT1基因組織特異性表達的研究有較多報道, 而關(guān)于植物DGAT2基因的組織器官特異性表達的研究較少。普遍認為大多數(shù)高等植物的DGAT1基因在各組織器官中均表達, 而DGAT2則與植物種子中特殊脂肪酸的積累有關(guān)。擬南芥DGAT1在發(fā)育中的種子、花瓣、花芽中表達量高, 而在葉和莖中表達量低[19], 大多數(shù)雙子葉植物例如大豆、斑鳩菊、油菜的表達模式與擬南芥相似[14,17,40], 而旱金蓮DGAT1只在發(fā)育的種子中表達[41]。桐樹DGAT2基因在種子發(fā)育中期被較強誘導(dǎo)表達, 而在其他器官中表達量很低, 表明桐樹DGAT2與種子中脂肪酸積累直接相關(guān)[28]。斑鳩菊、大戟、琉璃苣和蓖麻的DGAT2基因在種子發(fā)育早期高表達, 而大豆DGAT2基因在種子中的表達量很低。相反, 大豆DGAT1基因在種子中表達量較高[42]。我們前期關(guān)于AhDGAT2基因組織器官特異性表達模式研究表明, 該基因在花生的各個器官都表達, 但是在葉、花以及種子發(fā)育前期表達量較高[25]。本研究中將pAhDGAT2a構(gòu)建GUS植物表達載體并轉(zhuǎn)化煙草, 結(jié)果發(fā)現(xiàn)該序列不僅能正確啟動GUS基因表達, 而且在轉(zhuǎn)基因煙草的各個器官中都表達, 與我們前期研究結(jié)果一致, 但是與桐樹DGAT2和大豆DGAT2的表達特點顯著不同。本研究中GUS活性在轉(zhuǎn)基因煙草柱頭和花藥中較強表達, 顯示出AhDGAT2a基因在花生授粉中的重要性, 這一點在其他文獻中未見報道。這些研究均表明,DGAT1與DGAT2基因的組織器官特異性表達模式因物種而異。二者不僅在植物種子脂肪酸合成中具有重要作用,同時對于其他組織器官內(nèi)的脂肪酸合成(比如維持細胞膜脂類的動態(tài)平衡), 甚至對于植物個體的整個發(fā)育過程都具有十分重要的作用。

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Cloning and Functional Analysis of Peanut AhDGAT2a Promoter

ZHENG Ling1,2, SHI Ling-Min1,3, TIAN Hai-Ying1,2, SHAN Lei1,2, BIAN Fei1, GUO Feng1, XUAN Ning1,WAN Shuo-Bo1,2,*, and PENG Zhen-Ying1,2,3,*

1Biotechnology Research Center, Shandong Academy of Agricultural Sciences / Shandong Provincial Key Laboratory of Crop Genetic Improvement,Ecology and Physiology, Jinan 250100, China;2College of Life Science, Shandong University, Jinan 250100, China;3College of Agronomy, Xinjiang Agricultural University, Urumqi 830000, China

Diacylglycerol acyltransferase (DGAT) is a rate-limiting enzyme in triacylglycerol (TAG) biosynthesis pathway. In this study, GenomeWalking method was used for cloning the promoter sequence of AhDGAT2a gene from Luhua 14, and finally a 1200 bp fragment flanking 5′-upstream of AhDGAT2a was obtained and named as pAhDGAT2a. The crucial regulatory elements in pAhDGAT2a were further analyzed with software PlantCARE. There were many TATA-box, CAAT-box, light regulation, stress and defense response and hormone response elements. To assess the activity of pAhDGAT2a, we constructed pAhDGAT2a:GUS cassettes and introduced it into the tobacco SR1 genome by Agrobacterium-mediated transformation. Expression pattern was monitored by histochemical staining. Results showed that GUS activity driven by the pAhDGAT2a was detected in almost all vegetative and reproductive tissues, with a higher expression level in stigma, anther and young seeds than in the other organs,indicating that pAhDGAT2a has a constitutive promoter activity.

Arachis hypogaea L.; AhDGAT2a gene; Promoter; Function analysis

10.3724/SP.J.1006.2016.01094

本研究由山東省自然科學(xué)基金項目(ZR2013CM036)和山東省良種工程項目(2014-2017)資助。

This study was supported by Natural Science Foundation of Shandong (ZR2013CM036) and Shandong Province Germplasm Innovation and Utilization Project (2014–2017).

(Corresponding authors): 萬書波, E-mail: wansb@saas.ac.cn, Tel: 0531-83178335; 彭振英, E-mail: pengzhenying2005@126.com

聯(lián)系方式: E-mail: zhengling0000@sina.com, Tel: 0531-83178083

Received(): 2016-01-11; Accepted(接受日期): 2016-05-09; Published online(網(wǎng)絡(luò)出版日期): 2016-05-11.

URL: http://www.cnki.net/kcms/detail/11.1809.S.20160511.1551.006.html

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